86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_2034 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_2034  hypothetical protein  100 
 
 		 125 aa  260  4.999999999999999e-69  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.144107  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1844  hypothetical protein  93.39 
 
 		 121 aa  216  7.999999999999999e-56  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.322707 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1714  hypothetical protein  76.42 
 
 		 123 aa  190  5e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1822  glutaredoxin  69.11 
 
 		 123 aa  186  5.999999999999999e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0545572  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1400  glutaredoxin  68.29 
 
 		 123 aa  186  1e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.111122  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3889  glutaredoxin  68.29 
 
 		 123 aa  185  2e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.280842 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1430  glutaredoxin  68.29 
 
 		 123 aa  182  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.11658  normal  0.297548 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2745  glutaredoxin  65.57 
 
 		 122 aa  178  2e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0841717  normal  0.856746 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42020  hypothetical protein  60.33 
 
 		 123 aa  158  3e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3567  hypothetical protein  60.33 
 
 		 123 aa  157  4e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2410  glutaredoxin  53.66 
 
 		 123 aa  146  8e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.786564  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1899  glutaredoxin  51.22 
 
 		 123 aa  143  6e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.508072 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0816  putative glutaredoxin  50 
 
 		 119 aa  134  5e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05393  hypothetical protein  46.22 
 
 		 119 aa  122  2e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2758  glutaredoxin  47.06 
 
 		 118 aa  118  1.9999999999999998e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.334545  normal  0.0243575 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1598  glutaredoxin  44.54 
 
 		 118 aa  118  1.9999999999999998e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.328495  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2005  glutaredoxin  45.38 
 
 		 118 aa  118  3e-26  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.916013  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1594  glutaredoxin  44.54 
 
 		 118 aa  118  3e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3628  glutaredoxin  46.22 
 
 		 118 aa  117  3.9999999999999996e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001457  glutaredoxin  46.22 
 
 		 119 aa  117  4.9999999999999996e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1501  glutaredoxin  47.06 
 
 		 118 aa  115  3e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.676522  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0951  glutaredoxin  45.83 
 
 		 147 aa  114  6e-25  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.40724  normal  0.0261252 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2579  glutaredoxin  44.54 
 
 		 118 aa  111  3e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.201508 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0167  glutaredoxin family protein  44.72 
 
 		 130 aa  111  4.0000000000000004e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.08495 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2487  glutaredoxin  44.54 
 
 		 118 aa  110  5e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0780124  normal  0.16751 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2417  glutaredoxin  44.54 
 
 		 118 aa  110  5e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.656384  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1830  glutaredoxin  43.7 
 
 		 118 aa  110  7.000000000000001e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0383849  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1540  ATP-dependent helicase HrpB  48.28 
 
 		 121 aa  110  8.000000000000001e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2379  glutaredoxin family protein  43.09 
 
 		 130 aa  109  1.0000000000000001e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.272824  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1688  glutaredoxin  43.7 
 
 		 118 aa  108  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2669  glutaredoxin  44.07 
 
 		 118 aa  108  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0368347  normal  0.0510929 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1710  glutaredoxin  43.7 
 
 		 118 aa  109  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.382993  normal  0.506968 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1673  glutaredoxin  44.07 
 
 		 118 aa  108  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1032  glutaredoxin  45 
 
 		 130 aa  108  3e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.783959  normal  0.67876 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2797  hypothetical protein  44.54 
 
 		 118 aa  106  8.000000000000001e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4059  glutaredoxin  45.83 
 
 		 130 aa  105  2e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1562  glutaredoxin  41.18 
 
 		 118 aa  105  3e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1103  glutaredoxin family protein  42.98 
 
 		 130 aa  105  3e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000207624  normal  0.596308 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3634  hypothetical protein  42.74 
 
 		 124 aa  103  1e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.466049  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3222  glutaredoxin  46.32 
 
 		 115 aa  98.6  3e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0827  putative glutaredoxin  41.77 
 
 		 89 aa  73.6  0.0000000000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0213  glutaredoxin  36.17 
 
 		 118 aa  63.9  0.0000000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.989623  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0976  glutaredoxin  37.8 
 
 		 105 aa  56.2  0.0000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_29383  predicted protein  28.32 
 
 		 309 aa  50.1  0.000009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.066564  normal  0.454968 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2107  glutaredoxin  33.33 
 
 		 94 aa  49.7  0.00001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.367569  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2195  glutathione S-transferase domain-containing protein  33.33 
 
 		 284 aa  49.3  0.00002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2423  glutaredoxin  28.75 
 
 		 85 aa  48.9  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1282  Glutathione S-transferase domain protein  34.15 
 
 		 225 aa  48.1  0.00003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07400  glutaredoxin-like protein  37.18 
 
 		 82 aa  48.1  0.00004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1175  glutaredoxin  29.63 
 
 		 82 aa  48.1  0.00004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0886  glutaredoxin  35.44 
 
 		 87 aa  47.4  0.00006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.289839  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5304  glutaredoxin  34.67 
 
 		 148 aa  47.4  0.00007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12420  glutaredoxin-like protein  35.9 
 
 		 82 aa  47  0.00009  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11170  glutaredoxin  36.84 
 
 		 78 aa  46.6  0.0001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3239  hypothetical protein  29.89 
 
 		 90 aa  45.4  0.0003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1787  glutaredoxin  30.86 
 
 		 84 aa  44.7  0.0004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.75758  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0847  glutaredoxin  29.27 
 
 		 84 aa  45.1  0.0004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.352603  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0256  glutaredoxin  31.25 
 
 		 86 aa  44.3  0.0006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.296093  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2798  glutaredoxin 2  34.18 
 
 		 215 aa  43.9  0.0008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.848662  normal  0.112338 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_26662  predicted protein  32.5 
 
 		 317 aa  43.1  0.001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0406  glutaredoxin  30.38 
 
 		 86 aa  43.1  0.001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.394009  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2277  glutaredoxin, GrxB family  32.91 
 
 		 215 aa  43.1  0.001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0048  glutaredoxin  29.55 
 
 		 105 aa  42.4  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2347  Glutathione S-transferase domain protein  32.22 
 
 		 237 aa  42.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2182  glutaredoxin, GrxB family  33.33 
 
 		 215 aa  42.4  0.002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.497266  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119472  Carotenoid dioxygenase plastidic fusion protein, putative  29.49 
 
 		 914 aa  41.2  0.004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0452333  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2078  glutaredoxin 2  33.33 
 
 		 215 aa  41.2  0.005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.504039  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5192  glutathione S-transferase-like protein  32.14 
 
 		 221 aa  41.2  0.005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.355066  normal  0.248772 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45400  predicted protein  26.51 
 
 		 342 aa  41.2  0.005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1950  glutaredoxin  41.03 
 
 		 80 aa  41.2  0.005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.0000181605  normal  0.405053 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01060  glutaredoxin 2 (Grx2)  31.65 
 
 		 215 aa  40.8  0.006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.762215  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1712  glutaredoxin  30 
 
 		 114 aa  40.8  0.006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.266402  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01068  hypothetical protein  31.65 
 
 		 215 aa  40.8  0.006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.557548  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1443  glutaredoxin 2  31.65 
 
 		 215 aa  40.8  0.006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.89922  hitchhiker  0.00478743 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2207  glutaredoxin 2  32.91 
 
 		 215 aa  40.8  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.158739 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2023  glutaredoxin 2  32.91 
 
 		 215 aa  40.8  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1233  glutaredoxin 2  32.91 
 
 		 215 aa  40.8  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.929078  normal  0.25689 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2262  glutaredoxin 2  31.65 
 
 		 215 aa  40.8  0.006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2065  glutaredoxin 2  31.65 
 
 		 215 aa  40.8  0.006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.111207 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2536  glutaredoxin 2  31.65 
 
 		 215 aa  40.8  0.006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.154666  normal  0.170282 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1187  glutaredoxin 2  31.65 
 
 		 215 aa  40.8  0.006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1187  glutaredoxin 2  31.65 
 
 		 215 aa  40.8  0.006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2582  glutaredoxin, GrxB family  31.65 
 
 		 215 aa  40.8  0.006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.427911  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1277  glutaredoxin 2  32.91 
 
 		 215 aa  40.8  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0995017  normal  0.525696 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1961  glutaredoxin 2  32.47 
 
 		 216 aa  40  0.01  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0519203  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0859  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.67 
 
 		 199 aa  40  0.01  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>