82 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_2797 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_2797  hypothetical protein  100 
 
 		 118 aa  243  6.999999999999999e-64  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2487  glutaredoxin  92.37 
 
 		 118 aa  226  6e-59  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0780124  normal  0.16751 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2417  glutaredoxin  92.37 
 
 		 118 aa  226  6e-59  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.656384  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2579  glutaredoxin  91.53 
 
 		 118 aa  225  2e-58  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.201508 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1562  glutaredoxin  88.98 
 
 		 118 aa  219  9e-57  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1710  glutaredoxin  88.14 
 
 		 118 aa  216  7e-56  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.382993  normal  0.506968 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1688  glutaredoxin  87.29 
 
 		 118 aa  216  8.999999999999998e-56  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1673  glutaredoxin  87.29 
 
 		 118 aa  214  2e-55  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2669  glutaredoxin  87.29 
 
 		 118 aa  214  2e-55  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0368347  normal  0.0510929 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1830  glutaredoxin  73.73 
 
 		 118 aa  193  8.000000000000001e-49  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0383849  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2758  glutaredoxin  72.88 
 
 		 118 aa  190  5e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.334545  normal  0.0243575 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1598  glutaredoxin  71.19 
 
 		 118 aa  190  5e-48  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.328495  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1501  glutaredoxin  69.49 
 
 		 118 aa  180  5.0000000000000004e-45  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.676522  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3628  glutaredoxin  71.19 
 
 		 118 aa  177  4e-44  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1594  glutaredoxin  68.64 
 
 		 118 aa  171  2.9999999999999996e-42  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2005  glutaredoxin  66.95 
 
 		 118 aa  166  1e-40  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.916013  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001457  glutaredoxin  59.66 
 
 		 119 aa  156  9e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05393  hypothetical protein  57.14 
 
 		 119 aa  150  7e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0816  putative glutaredoxin  50.85 
 
 		 119 aa  133  7.000000000000001e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3634  hypothetical protein  54.78 
 
 		 124 aa  131  3e-30  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.466049  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1540  ATP-dependent helicase HrpB  56.9 
 
 		 121 aa  126  9.000000000000001e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2745  glutaredoxin  52.59 
 
 		 122 aa  124  3e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0841717  normal  0.856746 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3567  hypothetical protein  51.72 
 
 		 123 aa  124  6e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42020  hypothetical protein  51.72 
 
 		 123 aa  123  9e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1430  glutaredoxin  49.14 
 
 		 123 aa  120  5e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.11658  normal  0.297548 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1822  glutaredoxin  49.14 
 
 		 123 aa  118  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0545572  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3889  glutaredoxin  49.14 
 
 		 123 aa  118  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.280842 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1400  glutaredoxin  48.28 
 
 		 123 aa  118  3e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.111122  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1899  glutaredoxin  47.86 
 
 		 123 aa  116  9.999999999999999e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.508072 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2410  glutaredoxin  47.11 
 
 		 123 aa  116  9.999999999999999e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.786564  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1103  glutaredoxin family protein  47.01 
 
 		 130 aa  115  1.9999999999999998e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000207624  normal  0.596308 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0951  glutaredoxin  48 
 
 		 147 aa  114  3.9999999999999997e-25  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.40724  normal  0.0261252 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1714  hypothetical protein  49.59 
 
 		 123 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0167  glutaredoxin family protein  44.92 
 
 		 130 aa  108  2.0000000000000002e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.08495 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4059  glutaredoxin  46.15 
 
 		 130 aa  107  8.000000000000001e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1032  glutaredoxin  45.69 
 
 		 130 aa  104  5e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.783959  normal  0.67876 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2034  hypothetical protein  44.54 
 
 		 125 aa  102  1e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.144107  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2379  glutaredoxin family protein  45.3 
 
 		 130 aa  102  2e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.272824  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1844  hypothetical protein  43.7 
 
 		 121 aa  99  2e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.322707 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3222  glutaredoxin  48.31 
 
 		 115 aa  95.1  3e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0827  putative glutaredoxin  50 
 
 		 89 aa  81.6  0.000000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0213  glutaredoxin  42.86 
 
 		 118 aa  74.3  0.0000000000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.989623  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12420  glutaredoxin-like protein  41.56 
 
 		 82 aa  63.9  0.0000000006  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1950  glutaredoxin  45.83 
 
 		 80 aa  60.1  0.000000009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.0000181605  normal  0.405053 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5304  glutaredoxin  39.19 
 
 		 148 aa  55.8  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0976  glutaredoxin  38.27 
 
 		 105 aa  55.8  0.0000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2195  glutathione S-transferase domain-containing protein  39.02 
 
 		 284 aa  54.7  0.0000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2423  glutaredoxin  30.38 
 
 		 85 aa  51.6  0.000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1787  glutaredoxin  33.75 
 
 		 84 aa  51.2  0.000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.75758  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1387  glutaredoxin  34.72 
 
 		 77 aa  50.4  0.000008  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.252635  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119472  Carotenoid dioxygenase plastidic fusion protein, putative  37.35 
 
 		 914 aa  49.3  0.00002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0452333  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_29383  predicted protein  30.61 
 
 		 309 aa  48.5  0.00003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.066564  normal  0.454968 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0847  glutaredoxin  31.65 
 
 		 84 aa  48.5  0.00003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.352603  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11170  glutaredoxin  38.16 
 
 		 78 aa  48.1  0.00004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0256  glutaredoxin  31.65 
 
 		 86 aa  47.8  0.00005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.296093  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1175  glutaredoxin  29.11 
 
 		 82 aa  47.8  0.00006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07400  glutaredoxin-like protein  37.66 
 
 		 82 aa  47.4  0.00006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0886  glutaredoxin  32.5 
 
 		 87 aa  47  0.00009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.289839  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1084  glutaredoxin  36 
 
 		 103 aa  47  0.00009  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2053  hypothetical protein  31.82 
 
 		 87 aa  46.6  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1250  glutaredoxin  32.89 
 
 		 83 aa  47  0.0001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.461543  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0245  glutaredoxin 2  41.33 
 
 		 218 aa  43.9  0.0007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2348  glutaredoxin  32.5 
 
 		 79 aa  42.7  0.002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0181488 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2182  glutaredoxin, GrxB family  34.21 
 
 		 215 aa  42.4  0.002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.497266  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2798  glutaredoxin 2  31.65 
 
 		 215 aa  42.7  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.848662  normal  0.112338 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01251  putative glutathione S-transferase  31.08 
 
 		 241 aa  42.4  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.621374 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000623  glutaredoxin 2  40 
 
 		 209 aa  42  0.003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06497  glutaredoxin 2  41.33 
 
 		 209 aa  42  0.003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2023  glutaredoxin 2  31.65 
 
 		 215 aa  41.6  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2207  glutaredoxin 2  31.65 
 
 		 215 aa  41.6  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.158739 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01231  putative glutathione S-transferase  28.95 
 
 		 241 aa  41.6  0.004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.168526  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1233  glutaredoxin 2  31.65 
 
 		 215 aa  41.6  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.929078  normal  0.25689 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3458  GrxB family glutaredoxin  32.91 
 
 		 231 aa  41.2  0.005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0142149  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1578  glutaredoxin 2  29.11 
 
 		 215 aa  41.2  0.005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0296  glutathione S-transferase-like protein  27.63 
 
 		 214 aa  41.2  0.005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.351442  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1277  glutaredoxin 2  31.65 
 
 		 215 aa  41.2  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0995017  normal  0.525696 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2277  glutaredoxin, GrxB family  30.38 
 
 		 215 aa  40.8  0.006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2608  glutaredoxin 2  33.78 
 
 		 211 aa  40.8  0.007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.24478 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01261  putative glutathione S-transferase  28.95 
 
 		 241 aa  40.4  0.008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.991625  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1262  glutaredoxin 2  30.38 
 
 		 215 aa  40.4  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.224556 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0343  putative glutathione S-transferase  30.26 
 
 		 241 aa  40.4  0.008  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.889809  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1402  glutaredoxin 3  28.99 
 
 		 85 aa  40  0.01  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>