43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_000623 on replicon NC_013457
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013457  VEA_000623  glutaredoxin 2  100 
 
 		 209 aa  429  1e-119  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06497  glutaredoxin 2  74.52 
 
 		 209 aa  329  2e-89  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0245  glutaredoxin 2  63.94 
 
 		 218 aa  287  9e-77  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2608  glutaredoxin 2  33.49 
 
 		 211 aa  119  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.24478 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2277  glutaredoxin, GrxB family  28.91 
 
 		 215 aa  109  3e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2182  glutaredoxin, GrxB family  30.95 
 
 		 215 aa  108  4.0000000000000004e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.497266  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1578  glutaredoxin 2  27.62 
 
 		 215 aa  102  4e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2582  glutaredoxin, GrxB family  28.57 
 
 		 215 aa  101  9e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.427911  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01068  hypothetical protein  28.57 
 
 		 215 aa  101  9e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.557548  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1443  glutaredoxin 2  28.57 
 
 		 215 aa  101  9e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.89922  hitchhiker  0.00478743 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1262  glutaredoxin 2  28.1 
 
 		 215 aa  101  9e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.224556 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2262  glutaredoxin 2  28.57 
 
 		 215 aa  101  9e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2065  glutaredoxin 2  28.57 
 
 		 215 aa  101  9e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.111207 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2536  glutaredoxin 2  28.57 
 
 		 215 aa  101  9e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.154666  normal  0.170282 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1187  glutaredoxin 2  28.57 
 
 		 215 aa  101  9e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01060  glutaredoxin 2 (Grx2)  28.57 
 
 		 215 aa  101  9e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.762215  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1187  glutaredoxin 2  28.57 
 
 		 215 aa  101  9e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1233  glutaredoxin 2  27.62 
 
 		 215 aa  99.4  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.929078  normal  0.25689 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2023  glutaredoxin 2  27.62 
 
 		 215 aa  99.4  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2207  glutaredoxin 2  27.62 
 
 		 215 aa  99.4  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.158739 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1106  glutaredoxin 2  30.48 
 
 		 211 aa  99  4e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2798  glutaredoxin 2  30.48 
 
 		 215 aa  97.8  1e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.848662  normal  0.112338 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3221  glutaredoxin 2  28.97 
 
 		 211 aa  95.9  3e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1277  glutaredoxin 2  27.14 
 
 		 215 aa  96.3  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0995017  normal  0.525696 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2078  glutaredoxin 2  28.57 
 
 		 215 aa  95.9  4e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.504039  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1801  glutaredoxin 2  28.1 
 
 		 215 aa  95.1  6e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.690184  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3458  GrxB family glutaredoxin  31.13 
 
 		 231 aa  95.1  7e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0142149  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1961  glutaredoxin 2  29.19 
 
 		 216 aa  94  2e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0519203  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2549  glutaredoxin 2  30.98 
 
 		 226 aa  89.4  3e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.511119 
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_38124  predicted protein  33.33 
 
 		 305 aa  69.3  0.00000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3434  glutathione S-transferase domain-containing protein  28.67 
 
 		 210 aa  54.3  0.000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.398692  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1562  glutaredoxin  42.67 
 
 		 118 aa  45.8  0.0004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2760  glutathione S-transferase-like  29.69 
 
 		 215 aa  45.1  0.0007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0190  Glutaredoxin 2-like protein  33.33 
 
 		 227 aa  45.1  0.0008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0507  glutathione S-transferase-like protein  34.29 
 
 		 205 aa  43.9  0.002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0976  glutaredoxin  35.23 
 
 		 105 aa  43.1  0.003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2262  glutathione S-transferase domain-containing protein  32.94 
 
 		 223 aa  42.4  0.005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0073858  normal  0.576131 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0630  glutathione S-transferase  33.85 
 
 		 219 aa  42.4  0.005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.731897  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2965  Glutathione S-transferase domain protein  26.24 
 
 		 208 aa  42  0.006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0279406  normal  0.0713112 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2797  hypothetical protein  40 
 
 		 118 aa  42  0.007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1089  Glutathione S-transferase domain  29.49 
 
 		 198 aa  41.6  0.008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.600559  hitchhiker  0.000151531 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1830  glutaredoxin  35.62 
 
 		 118 aa  41.6  0.008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0383849  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1378  glutathione S-transferase domain-containing protein  26.24 
 
 		 208 aa  41.2  0.01  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>