49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SNSL254_A1262 on replicon NC_011080
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011080  SNSL254_A1262  glutaredoxin 2  100 
 
 		 215 aa  446  1.0000000000000001e-124  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.224556 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2207  glutaredoxin 2  99.07 
 
 		 215 aa  443  1e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.158739 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2023  glutaredoxin 2  99.07 
 
 		 215 aa  443  1e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1233  glutaredoxin 2  99.07 
 
 		 215 aa  443  1e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.929078  normal  0.25689 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1277  glutaredoxin 2  98.6 
 
 		 215 aa  440  1e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0995017  normal  0.525696 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2582  glutaredoxin, GrxB family  85.58 
 
 		 215 aa  387  1e-107  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.427911  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01068  hypothetical protein  85.58 
 
 		 215 aa  387  1e-107  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.557548  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1443  glutaredoxin 2  85.58 
 
 		 215 aa  387  1e-107  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.89922  hitchhiker  0.00478743 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2262  glutaredoxin 2  85.58 
 
 		 215 aa  387  1e-107  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2065  glutaredoxin 2  85.58 
 
 		 215 aa  387  1e-107  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.111207 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2536  glutaredoxin 2  85.58 
 
 		 215 aa  387  1e-107  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.154666  normal  0.170282 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1187  glutaredoxin 2  85.58 
 
 		 215 aa  387  1e-107  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1187  glutaredoxin 2  85.58 
 
 		 215 aa  387  1e-107  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01060  glutaredoxin 2 (Grx2)  85.58 
 
 		 215 aa  387  1e-107  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.762215  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1578  glutaredoxin 2  82.79 
 
 		 215 aa  377  1e-104  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2078  glutaredoxin 2  70.23 
 
 		 215 aa  325  3e-88  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.504039  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1801  glutaredoxin 2  69.77 
 
 		 215 aa  325  4.0000000000000003e-88  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.690184  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2798  glutaredoxin 2  66.2 
 
 		 215 aa  294  9e-79  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.848662  normal  0.112338 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2182  glutaredoxin, GrxB family  58.88 
 
 		 215 aa  274  6e-73  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.497266  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2277  glutaredoxin, GrxB family  59.35 
 
 		 215 aa  274  8e-73  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3458  GrxB family glutaredoxin  48.37 
 
 		 231 aa  198  6e-50  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0142149  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3221  glutaredoxin 2  45.37 
 
 		 211 aa  192  5e-48  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1106  glutaredoxin 2  43.06 
 
 		 211 aa  182  3e-45  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1961  glutaredoxin 2  42.2 
 
 		 216 aa  174  6e-43  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0519203  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2549  glutaredoxin 2  42.86 
 
 		 226 aa  166  2e-40  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.511119 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2608  glutaredoxin 2  39.25 
 
 		 211 aa  162  3e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.24478 
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_38124  predicted protein  31.38 
 
 		 305 aa  111  1.0000000000000001e-23  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06497  glutaredoxin 2  30.48 
 
 		 209 aa  107  1e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0245  glutaredoxin 2  29.38 
 
 		 218 aa  106  2e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000623  glutaredoxin 2  28.1 
 
 		 209 aa  101  1e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1437  glutathione S-transferase domain-containing protein  26.24 
 
 		 202 aa  47  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00000241692  hitchhiker  0.000981469 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1830  glutaredoxin  32 
 
 		 118 aa  45.4  0.0006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0383849  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2771  Glutathione S-transferase domain protein  28.04 
 
 		 225 aa  45.1  0.0008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.00309034  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5304  glutaredoxin  32.94 
 
 		 148 aa  44.7  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3567  hypothetical protein  31.58 
 
 		 123 aa  44.3  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2758  glutaredoxin  32 
 
 		 118 aa  43.9  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.334545  normal  0.0243575 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1032  glutaredoxin  38.67 
 
 		 130 aa  43.9  0.002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.783959  normal  0.67876 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0062  glutathione S-transferase domain-containing protein  29.55 
 
 		 231 aa  43.1  0.003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01251  putative glutathione S-transferase  26.58 
 
 		 241 aa  43.1  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.621374 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42020  hypothetical protein  30.26 
 
 		 123 aa  43.1  0.003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2760  glutathione S-transferase-like  26.92 
 
 		 215 aa  42.7  0.004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2005  glutaredoxin  32 
 
 		 118 aa  42.4  0.005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.916013  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1759  glutathione S-transferase domain-containing protein  26.34 
 
 		 223 aa  42.4  0.005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.296868  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05393  hypothetical protein  33.78 
 
 		 119 aa  42.4  0.005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001457  glutaredoxin  32.43 
 
 		 119 aa  42.4  0.005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0827  putative glutaredoxin  33.77 
 
 		 89 aa  41.6  0.009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3634  hypothetical protein  33.33 
 
 		 124 aa  41.6  0.009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.466049  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2101  glutathione S-transferase-like protein  25.64 
 
 		 242 aa  41.6  0.009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1555  glutathione S-transferase-like  29.41 
 
 		 203 aa  41.6  0.01  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>