45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_1801 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012917  PC1_1801  glutaredoxin 2  100 
 
 		 215 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.690184  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2078  glutaredoxin 2  95.81 
 
 		 215 aa  428  1e-119  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.504039  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2207  glutaredoxin 2  70.7 
 
 		 215 aa  328  4e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.158739 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2023  glutaredoxin 2  70.7 
 
 		 215 aa  328  4e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1233  glutaredoxin 2  70.7 
 
 		 215 aa  328  4e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.929078  normal  0.25689 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2582  glutaredoxin, GrxB family  69.3 
 
 		 215 aa  325  3e-88  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.427911  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01068  hypothetical protein  69.3 
 
 		 215 aa  325  3e-88  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.557548  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1443  glutaredoxin 2  69.3 
 
 		 215 aa  325  3e-88  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.89922  hitchhiker  0.00478743 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1277  glutaredoxin 2  70.23 
 
 		 215 aa  325  3e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0995017  normal  0.525696 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2262  glutaredoxin 2  69.3 
 
 		 215 aa  325  3e-88  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2065  glutaredoxin 2  69.3 
 
 		 215 aa  325  3e-88  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.111207 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2536  glutaredoxin 2  69.3 
 
 		 215 aa  325  3e-88  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.154666  normal  0.170282 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1187  glutaredoxin 2  69.3 
 
 		 215 aa  325  3e-88  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1187  glutaredoxin 2  69.3 
 
 		 215 aa  325  3e-88  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01060  glutaredoxin 2 (Grx2)  69.3 
 
 		 215 aa  325  3e-88  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.762215  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1262  glutaredoxin 2  69.77 
 
 		 215 aa  325  4.0000000000000003e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.224556 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1578  glutaredoxin 2  69.3 
 
 		 215 aa  318  5e-86  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2277  glutaredoxin, GrxB family  63.33 
 
 		 215 aa  288  3e-77  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2182  glutaredoxin, GrxB family  59.81 
 
 		 215 aa  284  5.999999999999999e-76  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.497266  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2798  glutaredoxin 2  63.81 
 
 		 215 aa  284  9e-76  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.848662  normal  0.112338 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3458  GrxB family glutaredoxin  45.12 
 
 		 231 aa  194  6e-49  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0142149  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3221  glutaredoxin 2  41.86 
 
 		 211 aa  182  2.0000000000000003e-45  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1106  glutaredoxin 2  40.47 
 
 		 211 aa  175  5e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2608  glutaredoxin 2  41.43 
 
 		 211 aa  168  5e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.24478 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1961  glutaredoxin 2  38.71 
 
 		 216 aa  166  2e-40  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0519203  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2549  glutaredoxin 2  41.94 
 
 		 226 aa  164  6.9999999999999995e-40  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.511119 
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_38124  predicted protein  32.22 
 
 		 305 aa  114  7.999999999999999e-25  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000623  glutaredoxin 2  28.1 
 
 		 209 aa  95.1  6e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0245  glutaredoxin 2  29.82 
 
 		 218 aa  95.1  7e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06497  glutaredoxin 2  30.7 
 
 		 209 aa  93.2  3e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1437  glutathione S-transferase domain-containing protein  28.37 
 
 		 202 aa  49.3  0.00005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00000241692  hitchhiker  0.000981469 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0190  Glutaredoxin 2-like protein  23.35 
 
 		 227 aa  47.8  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3483  glutathione S-transferase domain-containing protein  29.21 
 
 		 230 aa  43.9  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.541048  normal  0.515016 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2474  maleylacetoacetate isomerase  32.94 
 
 		 222 aa  43.5  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.388492  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2262  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.51 
 
 		 223 aa  43.1  0.003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0073858  normal  0.576131 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4039  glutathione S-transferase domain-containing protein  29.21 
 
 		 230 aa  43.1  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2253  hypothetical protein  26.95 
 
 		 213 aa  42.7  0.004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.867065  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2760  glutathione S-transferase-like  31.25 
 
 		 215 aa  42.4  0.005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2771  Glutathione S-transferase domain protein  25.95 
 
 		 225 aa  42.4  0.006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.00309034  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3750  Glutathione S-transferase domain protein  34.33 
 
 		 221 aa  42.4  0.006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0525726  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1043  glutathione S-transferase domain-containing protein  33.85 
 
 		 213 aa  42.4  0.006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4827  Glutathione S-transferase domain  34.33 
 
 		 221 aa  42.4  0.006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.7966  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2077  maleylacetoacetate isomerase  31.71 
 
 		 222 aa  42  0.007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.238722  normal  0.903317 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1678  maleylacetoacetate isomerase  31.71 
 
 		 222 aa  41.6  0.008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.914893  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27941  glutathione S-transferase N terminus protein  36.76 
 
 		 333 aa  41.6  0.01  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>