42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ent638_1578 on replicon NC_009436
Organism: Enterobacter sp. 638



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009436  Ent638_1578  glutaredoxin 2  100 
 
 
215 aa  444  1.0000000000000001e-124  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2582  glutaredoxin, GrxB family  85.12 
 
 
215 aa  387  1e-107  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.427911  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2262  glutaredoxin 2  85.12 
 
 
215 aa  387  1e-107  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1443  glutaredoxin 2  85.12 
 
 
215 aa  387  1e-107  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.89922  hitchhiker  0.00478743 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2065  glutaredoxin 2  85.12 
 
 
215 aa  387  1e-107  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.111207 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2536  glutaredoxin 2  85.12 
 
 
215 aa  387  1e-107  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.154666  normal  0.170282 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1187  glutaredoxin 2  85.12 
 
 
215 aa  387  1e-107  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1187  glutaredoxin 2  85.12 
 
 
215 aa  387  1e-107  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01068  hypothetical protein  85.12 
 
 
215 aa  387  1e-107  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.557548  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01060  glutaredoxin 2 (Grx2)  85.12 
 
 
215 aa  387  1e-107  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.762215  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2207  glutaredoxin 2  83.26 
 
 
215 aa  380  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.158739 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2023  glutaredoxin 2  83.26 
 
 
215 aa  380  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1233  glutaredoxin 2  83.26 
 
 
215 aa  380  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.929078  normal  0.25689 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1262  glutaredoxin 2  82.79 
 
 
215 aa  377  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.224556 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1277  glutaredoxin 2  82.79 
 
 
215 aa  376  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0995017  normal  0.525696 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1801  glutaredoxin 2  69.3 
 
 
215 aa  318  5e-86  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.690184  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2078  glutaredoxin 2  68.84 
 
 
215 aa  316  1e-85  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.504039  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2798  glutaredoxin 2  66.67 
 
 
215 aa  297  9e-80  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.848662  normal  0.112338 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2277  glutaredoxin, GrxB family  57.94 
 
 
215 aa  262  2e-69  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2182  glutaredoxin, GrxB family  56.54 
 
 
215 aa  263  2e-69  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.497266  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3458  GrxB family glutaredoxin  46.92 
 
 
231 aa  194  8.000000000000001e-49  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0142149  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3221  glutaredoxin 2  43.06 
 
 
211 aa  188  5e-47  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1106  glutaredoxin 2  41.2 
 
 
211 aa  179  2e-44  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2608  glutaredoxin 2  41.59 
 
 
211 aa  172  5e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.24478 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1961  glutaredoxin 2  40.09 
 
 
216 aa  170  2e-41  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0519203  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2549  glutaredoxin 2  41.47 
 
 
226 aa  160  1e-38  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.511119 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06497  glutaredoxin 2  29.52 
 
 
209 aa  107  1e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0245  glutaredoxin 2  29.38 
 
 
218 aa  107  2e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_38124  predicted protein  32.37 
 
 
305 aa  106  3e-22  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000623  glutaredoxin 2  27.62 
 
 
209 aa  102  5e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0190  Glutaredoxin 2-like protein  25.11 
 
 
227 aa  53.5  0.000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1437  glutathione S-transferase domain-containing protein  28.04 
 
 
202 aa  50.4  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00000241692  hitchhiker  0.000981469 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0062  glutathione S-transferase domain-containing protein  32.95 
 
 
231 aa  48.9  0.00006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1830  glutaredoxin  33.77 
 
 
118 aa  46.2  0.0004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0383849  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2771  Glutathione S-transferase domain protein  28.04 
 
 
225 aa  44.7  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.00309034  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3483  glutathione S-transferase domain-containing protein  33.33 
 
 
230 aa  44.7  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.541048  normal  0.515016 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1032  glutaredoxin  40 
 
 
130 aa  43.5  0.002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.783959  normal  0.67876 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4039  glutathione S-transferase domain-containing protein  32.18 
 
 
230 aa  42.7  0.004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2005  glutaredoxin  33.78 
 
 
118 aa  42.7  0.004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.916013  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3567  hypothetical protein  30.67 
 
 
123 aa  42  0.007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2579  glutaredoxin  29.11 
 
 
118 aa  42  0.008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.201508 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1594  glutaredoxin  33.33 
 
 
118 aa  41.6  0.009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>