39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_1106 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013421  Pecwa_1106  glutaredoxin 2  100 
 
 		 211 aa  431  1e-120  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3221  glutaredoxin 2  92.89 
 
 		 211 aa  403  1.0000000000000001e-112  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2608  glutaredoxin 2  50 
 
 		 211 aa  215  5e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.24478 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2277  glutaredoxin, GrxB family  45.33 
 
 		 215 aa  183  2.0000000000000003e-45  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1262  glutaredoxin 2  43.06 
 
 		 215 aa  182  3e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.224556 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2798  glutaredoxin 2  44.6 
 
 		 215 aa  182  4.0000000000000006e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.848662  normal  0.112338 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2582  glutaredoxin, GrxB family  42.59 
 
 		 215 aa  180  1e-44  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.427911  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01068  hypothetical protein  42.59 
 
 		 215 aa  180  1e-44  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.557548  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1443  glutaredoxin 2  42.59 
 
 		 215 aa  180  1e-44  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.89922  hitchhiker  0.00478743 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2207  glutaredoxin 2  42.59 
 
 		 215 aa  181  1e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.158739 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2023  glutaredoxin 2  42.59 
 
 		 215 aa  181  1e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1233  glutaredoxin 2  42.59 
 
 		 215 aa  181  1e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.929078  normal  0.25689 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2262  glutaredoxin 2  42.59 
 
 		 215 aa  180  1e-44  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2065  glutaredoxin 2  42.59 
 
 		 215 aa  180  1e-44  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.111207 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2536  glutaredoxin 2  42.59 
 
 		 215 aa  180  1e-44  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.154666  normal  0.170282 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1187  glutaredoxin 2  42.59 
 
 		 215 aa  180  1e-44  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1187  glutaredoxin 2  42.59 
 
 		 215 aa  180  1e-44  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01060  glutaredoxin 2 (Grx2)  42.59 
 
 		 215 aa  180  1e-44  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.762215  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1578  glutaredoxin 2  41.2 
 
 		 215 aa  179  2e-44  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1277  glutaredoxin 2  42.13 
 
 		 215 aa  177  1e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0995017  normal  0.525696 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2182  glutaredoxin, GrxB family  43.46 
 
 		 215 aa  177  1e-43  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.497266  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2078  glutaredoxin 2  40 
 
 		 215 aa  175  5e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.504039  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1801  glutaredoxin 2  40.47 
 
 		 215 aa  175  5e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.690184  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1961  glutaredoxin 2  37.67 
 
 		 216 aa  148  7e-35  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0519203  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3458  GrxB family glutaredoxin  38.14 
 
 		 231 aa  144  7.0000000000000006e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0142149  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2549  glutaredoxin 2  35.19 
 
 		 226 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.511119 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0245  glutaredoxin 2  28.44 
 
 		 218 aa  103  2e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06497  glutaredoxin 2  30.48 
 
 		 209 aa  102  3e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000623  glutaredoxin 2  30.48 
 
 		 209 aa  99  5e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_38124  predicted protein  29.18 
 
 		 305 aa  92  6e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0190  Glutaredoxin 2-like protein  23.89 
 
 		 227 aa  57.4  0.0000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2525  glutathione S-transferase domain-containing protein  20.77 
 
 		 241 aa  45.8  0.0004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0678  glutathione S-transferase domain-containing protein  26 
 
 		 215 aa  45.4  0.0005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3597  maleylacetoacetate isomerase  29.23 
 
 		 221 aa  43.9  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0169924  normal  0.0485989 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2760  glutathione S-transferase-like  30.77 
 
 		 215 aa  43.5  0.003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2474  maleylacetoacetate isomerase  30.77 
 
 		 222 aa  42.4  0.005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.388492  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1830  glutaredoxin  34.62 
 
 		 118 aa  42.4  0.005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0383849  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2367  glutathione S-transferase domain-containing protein  26.14 
 
 		 218 aa  42.4  0.005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00131044  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2379  glutathione S-transferase domain-containing protein  24.84 
 
 		 218 aa  42  0.008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0241136  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>