45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_2182 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012880  Dd703_2182  glutaredoxin, GrxB family  100 
 
 		 215 aa  441  1e-123  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.497266  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2277  glutaredoxin, GrxB family  74.88 
 
 		 215 aa  333  7.999999999999999e-91  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2078  glutaredoxin 2  59.81 
 
 		 215 aa  285  2.9999999999999996e-76  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.504039  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1801  glutaredoxin 2  59.81 
 
 		 215 aa  284  5.999999999999999e-76  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.690184  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2023  glutaredoxin 2  59.35 
 
 		 215 aa  275  3e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1233  glutaredoxin 2  59.35 
 
 		 215 aa  275  3e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.929078  normal  0.25689 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2207  glutaredoxin 2  59.35 
 
 		 215 aa  275  3e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.158739 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1262  glutaredoxin 2  58.88 
 
 		 215 aa  274  6e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.224556 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1277  glutaredoxin 2  58.88 
 
 		 215 aa  272  3e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0995017  normal  0.525696 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2798  glutaredoxin 2  60.93 
 
 		 215 aa  271  4.0000000000000004e-72  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.848662  normal  0.112338 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1443  glutaredoxin 2  57.01 
 
 		 215 aa  262  2e-69  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.89922  hitchhiker  0.00478743 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2582  glutaredoxin, GrxB family  57.01 
 
 		 215 aa  262  2e-69  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.427911  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01068  hypothetical protein  57.01 
 
 		 215 aa  262  2e-69  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.557548  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2262  glutaredoxin 2  57.01 
 
 		 215 aa  262  2e-69  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2065  glutaredoxin 2  57.01 
 
 		 215 aa  262  2e-69  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.111207 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2536  glutaredoxin 2  57.01 
 
 		 215 aa  262  2e-69  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.154666  normal  0.170282 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1187  glutaredoxin 2  57.01 
 
 		 215 aa  262  2e-69  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1187  glutaredoxin 2  57.01 
 
 		 215 aa  262  2e-69  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01060  glutaredoxin 2 (Grx2)  57.01 
 
 		 215 aa  262  2e-69  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.762215  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1578  glutaredoxin 2  56.54 
 
 		 215 aa  263  2e-69  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3458  GrxB family glutaredoxin  43.98 
 
 		 231 aa  199  1.9999999999999998e-50  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0142149  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3221  glutaredoxin 2  44.86 
 
 		 211 aa  188  5e-47  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2608  glutaredoxin 2  45.79 
 
 		 211 aa  187  1e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.24478 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1106  glutaredoxin 2  43.46 
 
 		 211 aa  177  1e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1961  glutaredoxin 2  40.76 
 
 		 216 aa  169  4e-41  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0519203  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2549  glutaredoxin 2  40.54 
 
 		 226 aa  152  4e-36  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.511119 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000623  glutaredoxin 2  30.95 
 
 		 209 aa  108  5e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_38124  predicted protein  33.47 
 
 		 305 aa  106  3e-22  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0245  glutaredoxin 2  28.44 
 
 		 218 aa  99  5e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06497  glutaredoxin 2  28.57 
 
 		 209 aa  97.1  2e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1830  glutaredoxin  36.11 
 
 		 118 aa  47.4  0.0002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0383849  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2758  glutaredoxin  36.49 
 
 		 118 aa  46.6  0.0003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.334545  normal  0.0243575 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1759  glutathione S-transferase domain-containing protein  25 
 
 		 223 aa  45.8  0.0006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.296868  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0507  glutathione S-transferase-like protein  26.36 
 
 		 205 aa  45.1  0.0008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01251  putative glutathione S-transferase  26.04 
 
 		 241 aa  45.1  0.0008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.621374 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1837  glutathione S-transferase domain-containing protein  26.6 
 
 		 223 aa  44.7  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.189454  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2379  glutathione S-transferase domain-containing protein  25.81 
 
 		 218 aa  43.9  0.002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0241136  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2771  Glutathione S-transferase domain protein  29.41 
 
 		 225 aa  43.5  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.00309034  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3567  hypothetical protein  32.89 
 
 		 123 aa  43.9  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42020  hypothetical protein  31.58 
 
 		 123 aa  42.7  0.004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2797  hypothetical protein  34.21 
 
 		 118 aa  42.4  0.005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1437  glutathione S-transferase domain-containing protein  26.05 
 
 		 202 aa  42.4  0.005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00000241692  hitchhiker  0.000981469 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0816  putative glutaredoxin  32.88 
 
 		 119 aa  41.6  0.008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2034  hypothetical protein  33.33 
 
 		 125 aa  41.6  0.009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.144107  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2579  glutaredoxin  34.21 
 
 		 118 aa  41.6  0.01  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.201508 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>