113 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_2771 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011901  Tgr7_2771  Glutathione S-transferase domain protein  100 
 
 
225 aa  461  1e-129  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.00309034  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0780  glutaredoxin 2-like protein  61.79 
 
 
225 aa  273  2.0000000000000002e-72  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00620206  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0190  Glutaredoxin 2-like protein  33.18 
 
 
227 aa  107  1e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1550  lignin degradation protein  28.08 
 
 
226 aa  57.4  0.0000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.355245  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0702  glutathione S-transferase family protein  29.82 
 
 
199 aa  51.2  0.00001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0788  glutathione S-transferase  37 
 
 
264 aa  51.6  0.00001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.200068 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0693  glutathione S-transferase family protein  29.82 
 
 
199 aa  51.2  0.00001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2411  maleylacetoacetate isomerase  30.14 
 
 
214 aa  51.2  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.305846  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3289  glutathione S-transferase  28.97 
 
 
202 aa  50.4  0.00002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0819  maleylacetoacetate isomerase  29.03 
 
 
210 aa  50.8  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1223  Glutathione S-transferase domain protein  26.39 
 
 
229 aa  50.1  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000515515 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2366  maleylacetoacetate isomerase  36.89 
 
 
214 aa  50.1  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.145042  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2322  maleylacetoacetate isomerase  36.89 
 
 
214 aa  50.1  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2523  maleylacetoacetate isomerase  36.89 
 
 
214 aa  50.1  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2415  maleylacetoacetate isomerase  38.27 
 
 
214 aa  49.3  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.540262  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2584  glutathione S-transferase domain-containing protein  28.95 
 
 
199 aa  48.9  0.00006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4733  glutathione S-transferase domain-containing protein  33.33 
 
 
210 aa  48.9  0.00007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.813265  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1652  hypothetical protein  24.73 
 
 
237 aa  48.9  0.00007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.887044  normal  0.0204387 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6243  glutathione S-transferase domain-containing protein  36.26 
 
 
229 aa  48.9  0.00007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.247558 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05770  Glutathione S-transferase-like protein  32.45 
 
 
230 aa  48.5  0.00007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.765948  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0333  maleylacetoacetate isomerase  24.89 
 
 
215 aa  48.5  0.00008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1437  maleylacetoacetate isomerase  26.91 
 
 
210 aa  48.1  0.00009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.979094 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2674  maleylacetoacetate isomerase  26.46 
 
 
213 aa  48.5  0.00009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.944295  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0500  Glutathione S-transferase domain  30.69 
 
 
222 aa  47.8  0.0001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0342057 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6114  Glutathione S-transferase domain  38.36 
 
 
201 aa  48.1  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.564135  normal  0.67703 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4619  maleylacetoacetate isomerase  31.3 
 
 
210 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2721  putative glutathione S-transferase protein  33.7 
 
 
202 aa  47.4  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.199713 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0912  maleylacetoacetate isomerase  31.36 
 
 
212 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0022  glutathione S-transferase-like protein  33.33 
 
 
222 aa  47.4  0.0002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.428941  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1268  glutathione S-transferase  37.21 
 
 
215 aa  47  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.652561  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4479  maleylacetoacetate isomerase  31.3 
 
 
210 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.28654  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2965  Glutathione S-transferase domain  33.7 
 
 
202 aa  47.4  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7062  Glutathione S-transferase domain protein  28.96 
 
 
229 aa  47.4  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00932246  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2549  glutaredoxin 2  29.08 
 
 
226 aa  47  0.0003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.511119 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4581  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.58 
 
 
210 aa  46.6  0.0003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4603  maleylacetoacetate isomerase  33.04 
 
 
210 aa  46.6  0.0003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0833073  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1448  maleylacetoacetate isomerase  31.37 
 
 
217 aa  46.2  0.0004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1478  glutathione S-transferase domain-containing protein  32.71 
 
 
263 aa  46.2  0.0004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.204587  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2357  glutathione S-transferase domain-containing protein  27.84 
 
 
238 aa  46.2  0.0004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.396368  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1078  Glutathione S-transferase domain  27.81 
 
 
229 aa  46.2  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000010734 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2431  maleylacetoacetate isomerase  34.18 
 
 
214 aa  45.8  0.0005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5328  Glutathione S-transferase domain  29.34 
 
 
215 aa  46.2  0.0005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0310623  normal  0.952299 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38550  maleylacetoacetate isomerase  28.26 
 
 
212 aa  45.4  0.0007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000321346  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0734  maleylacetoacetate isomerase  34.26 
 
 
214 aa  45.4  0.0008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000589238 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0174  maleylacetoacetate isomerase  32.99 
 
 
217 aa  45.1  0.0009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.974523  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1262  glutaredoxin 2  28.04 
 
 
215 aa  45.1  0.0009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.224556 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01060  glutaredoxin 2 (Grx2)  32.1 
 
 
215 aa  45.1  0.001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.762215  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2582  glutaredoxin, GrxB family  32.1 
 
 
215 aa  45.1  0.001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.427911  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0847  glutathione S-transferase family protein  32.32 
 
 
221 aa  44.7  0.001  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.33451  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0881  glutathione S-transferase domain protein  31.31 
 
 
263 aa  44.7  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0898679  normal  0.46136 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1848  putative glutathione S-transferase-related protein  32.5 
 
 
315 aa  44.3  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.417859 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1578  glutaredoxin 2  28.04 
 
 
215 aa  44.7  0.001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0748  putative glutathione S-transferase  29.36 
 
 
226 aa  44.7  0.001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.206898  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1788  putative glutathione S-transferase (GST)  27.62 
 
 
229 aa  44.7  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2555  Glutathione S-transferase domain protein  32.61 
 
 
202 aa  44.7  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.736156 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3282  maleylacetoacetate isomerase  30.05 
 
 
212 aa  44.7  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.318368  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1187  glutaredoxin 2  32.1 
 
 
215 aa  45.1  0.001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1187  glutaredoxin 2  32.1 
 
 
215 aa  45.1  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2536  glutaredoxin 2  32.1 
 
 
215 aa  45.1  0.001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.154666  normal  0.170282 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2065  glutaredoxin 2  32.1 
 
 
215 aa  45.1  0.001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.111207 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01068  hypothetical protein  32.1 
 
 
215 aa  45.1  0.001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.557548  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2262  glutaredoxin 2  32.1 
 
 
215 aa  45.1  0.001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1443  glutaredoxin 2  32.1 
 
 
215 aa  45.1  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.89922  hitchhiker  0.00478743 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3268  maleylacetoacetate isomerase  32.91 
 
 
214 aa  45.1  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.230799 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0854  Glutathione S-transferase domain protein  31.31 
 
 
263 aa  44.7  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3554  maleylacetoacetate isomerase  32.48 
 
 
211 aa  43.9  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.469077  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1907  glutathione S-transferase-like protein  36.71 
 
 
263 aa  44.3  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0464392  normal  0.0635336 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4134  glutathione S-transferase-like  28.19 
 
 
231 aa  43.9  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2077  maleylacetoacetate isomerase  41.1 
 
 
222 aa  44.3  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.238722  normal  0.903317 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01231  putative glutathione S-transferase  24.38 
 
 
241 aa  43.9  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.168526  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1977  glutathione S-transferase domain-containing protein  27.27 
 
 
222 aa  44.3  0.002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.290176  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3058  maleylacetoacetate isomerase  33.33 
 
 
206 aa  43.5  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0213018 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3331  maleylacetoacetate isomerase  24.22 
 
 
212 aa  43.9  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1277  glutaredoxin 2  27.1 
 
 
215 aa  43.9  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0995017  normal  0.525696 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1233  glutaredoxin 2  27.1 
 
 
215 aa  43.9  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.929078  normal  0.25689 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2023  glutaredoxin 2  27.1 
 
 
215 aa  43.9  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2207  glutaredoxin 2  27.1 
 
 
215 aa  43.9  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.158739 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1678  maleylacetoacetate isomerase  41.1 
 
 
222 aa  44.3  0.002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.914893  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1671  glutathione S-transferase family protein  35.35 
 
 
216 aa  43.5  0.003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2272  maleylacetoacetate isomerase  35.71 
 
 
211 aa  43.5  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0111358  normal  0.280223 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3984  glutathione S-transferase-like  29.41 
 
 
202 aa  43.5  0.003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.10217  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1935  glutathione S-transferase-like protein  34.57 
 
 
201 aa  43.5  0.003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00060998  normal  0.487054 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3821  maleylacetoacetate isomerase  33.33 
 
 
222 aa  43.5  0.003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.101505 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0261  maleylacetoacetate isomerase  25.13 
 
 
214 aa  43.1  0.003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0113  glutathione S-transferase domain-containing protein  35.23 
 
 
211 aa  43.5  0.003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.118782  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2608  glutaredoxin 2  24.77 
 
 
211 aa  43.5  0.003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.24478 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0240  maleylacetoacetate isomerase  25.13 
 
 
216 aa  43.5  0.003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2182  glutaredoxin, GrxB family  29.41 
 
 
215 aa  43.5  0.003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.497266  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2563  putative glutathione S-transferase-related protein  31.25 
 
 
312 aa  43.1  0.004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.569618  normal  0.331421 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2078  glutaredoxin 2  32.58 
 
 
215 aa  43.1  0.004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.504039  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0245  glutaredoxin 2  30.84 
 
 
218 aa  42.7  0.004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0482  maleylacetoacetate isomerase  34.52 
 
 
222 aa  43.1  0.004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1961  glutaredoxin 2  21.88 
 
 
216 aa  42.7  0.004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0519203  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1058  glutathione S-transferase family protein  32.38 
 
 
217 aa  42.7  0.005  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.407682  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0241  glutathione S- transferase, N-terminal  31.31 
 
 
225 aa  42.7  0.005  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4143  glutathione S-transferase-like protein  28.41 
 
 
231 aa  42.4  0.005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.595769  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3536  glutathione S-transferase domain-containing protein  29.76 
 
 
205 aa  42.7  0.005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2474  maleylacetoacetate isomerase  36.47 
 
 
222 aa  42.7  0.005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.388492  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0372  glutathione S-transferase domain-containing protein  32.05 
 
 
211 aa  42.4  0.006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.360497  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0523  glutathione S-transferase domain-containing protein  38.2 
 
 
220 aa  42.4  0.006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000118067 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>