143 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_4134 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_4134  glutathione S-transferase-like  100 
 
 		 231 aa  474  1e-133  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4143  glutathione S-transferase-like protein  73.59 
 
 		 231 aa  363  1e-99  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.595769  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4820  Glutathione S-transferase domain  73.16 
 
 		 231 aa  361  6e-99  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.651391  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1788  putative glutathione S-transferase (GST)  70.31 
 
 		 229 aa  343  2e-93  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2357  glutathione S-transferase domain-containing protein  60.53 
 
 		 238 aa  285  4e-76  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.396368  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4017  glutathione S-transferase-like  51.07 
 
 		 232 aa  256  2e-67  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.678212 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7062  Glutathione S-transferase domain protein  53.7 
 
 		 229 aa  231  6e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00932246  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2618  glutathione S-transferase domain protein  49.11 
 
 		 236 aa  225  5.0000000000000005e-58  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3099  glutathione S-transferase domain-containing protein  48.65 
 
 		 232 aa  222  3e-57  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.937068  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0774  glutathione S-transferase domain-containing protein  48.66 
 
 		 229 aa  215  5e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.264601 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6243  glutathione S-transferase domain-containing protein  50.47 
 
 		 229 aa  211  9e-54  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.247558 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1223  Glutathione S-transferase domain protein  48.39 
 
 		 229 aa  210  1e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000515515 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1550  lignin degradation protein  47.2 
 
 		 226 aa  208  6e-53  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.355245  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1078  Glutathione S-transferase domain  46.43 
 
 		 229 aa  207  8e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000010734 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2685  glutathione S-transferase-like protein  45.58 
 
 		 236 aa  200  1.9999999999999998e-50  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.702474  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1948  glutathione S-transferase domain-containing protein  40.35 
 
 		 232 aa  174  9.999999999999999e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2863  putative lignin beta-etherase  36.65 
 
 		 222 aa  150  2e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.300835  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1652  hypothetical protein  32.72 
 
 		 237 aa  138  7.999999999999999e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.887044  normal  0.0204387 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05770  Glutathione S-transferase-like protein  43.39 
 
 		 230 aa  134  9.999999999999999e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.765948  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1599  glutathione S-transferase domain-containing protein  35.89 
 
 		 226 aa  131  6.999999999999999e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0946501 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2405  glutathione S-transferase-like  33.65 
 
 		 279 aa  130  2.0000000000000002e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI00480  expressed protein  26.29 
 
 		 252 aa  69.3  0.00000000005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5058  glutathione S-transferase domain-containing protein  41.07 
 
 		 207 aa  62  0.000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000892035 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27580  putative glutathione S-transferase  35.92 
 
 		 220 aa  59.3  0.00000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.08808  decreased coverage  0.00115097 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1907  glutathione S-transferase-like protein  27.13 
 
 		 263 aa  58.9  0.00000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0464392  normal  0.0635336 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1478  glutathione S-transferase domain-containing protein  26.56 
 
 		 263 aa  57.4  0.0000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.204587  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1914  glutathione S-transferase domain-containing protein  27.91 
 
 		 220 aa  57  0.0000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0652856  normal  0.568324 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1350  Glutathione S-transferase domain protein  31.44 
 
 		 206 aa  57.8  0.0000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5366  Glutathione S-transferase domain protein  36.52 
 
 		 207 aa  56.6  0.0000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.230494  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2334  glutathione S-transferase  38.3 
 
 		 220 aa  56.2  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0381359  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6309  glutathione S-transferase domain-containing protein  35.87 
 
 		 267 aa  55.5  0.0000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0839  glutathione S-transferase family protein  33.64 
 
 		 215 aa  53.5  0.000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2474  Glutathione S-transferase domain protein  36.13 
 
 		 219 aa  53.1  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3634  glutathione S-transferase domain protein  36.13 
 
 		 219 aa  53.5  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02948  glutathione S-transferase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G07930)  21.43 
 
 		 268 aa  52.8  0.000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0022  glutathione S-transferase-like protein  41.3 
 
 		 222 aa  52.8  0.000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.428941  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0788  glutathione S-transferase  32.22 
 
 		 264 aa  51.6  0.000009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.200068 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1843  Glutathione S-transferase domain protein  30.95 
 
 		 217 aa  51.6  0.00001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00779491 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2873  Glutathione S-transferase domain  35.23 
 
 		 260 aa  51.2  0.00001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.606982  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4998  glutathione S-transferase-like protein  37.36 
 
 		 223 aa  50.4  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0183331  normal  0.221223 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2563  putative glutathione S-transferase-related protein  27.91 
 
 		 312 aa  50.8  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.569618  normal  0.331421 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0819  maleylacetoacetate isomerase  36.61 
 
 		 210 aa  50.4  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0241  glutathione S- transferase, N-terminal  26.87 
 
 		 225 aa  50.1  0.00003  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1555  glutathione S-transferase-like  28.86 
 
 		 203 aa  50.1  0.00003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3308  glutathione S-transferase  34.07 
 
 		 221 aa  50.1  0.00003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1282  Glutathione S-transferase domain protein  22.94 
 
 		 225 aa  49.7  0.00004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0831  glutathione S-transferase family protein  32.71 
 
 		 294 aa  49.3  0.00005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2385  glutathione S-transferase domain-containing protein  26.44 
 
 		 216 aa  49.3  0.00005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.167846  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2090  maleylacetoacetate isomerase  37.36 
 
 		 213 aa  49.3  0.00005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0881  glutathione S-transferase domain protein  25 
 
 		 263 aa  48.9  0.00006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0898679  normal  0.46136 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0854  Glutathione S-transferase domain protein  25 
 
 		 263 aa  48.9  0.00006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1744  Glutathione S-transferase domain protein  34.34 
 
 		 221 aa  48.9  0.00007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.662899  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3536  glutathione S-transferase domain-containing protein  42.86 
 
 		 205 aa  47.8  0.0001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26121  putative glutathione S-transferase  30.43 
 
 		 241 aa  47.8  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.551591 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2783  glutathione S-transferase domain-containing protein  32.97 
 
 		 225 aa  47.8  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1144  glutathione S-transferase  30.77 
 
 		 241 aa  47.4  0.0002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0343  putative glutathione S-transferase  32.26 
 
 		 241 aa  47.4  0.0002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.889809  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0847  glutathione S-transferase family protein  27.41 
 
 		 221 aa  47.8  0.0002  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.33451  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2825  glutathione S-transferase-like  34.04 
 
 		 221 aa  47.4  0.0002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2760  glutathione S-transferase-like  24.73 
 
 		 215 aa  47  0.0002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2805  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.77 
 
 		 225 aa  47  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.383982  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0927  glutathione S-transferase domain-containing protein  35.23 
 
 		 207 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1688  Glutathione S-transferase domain protein  33.33 
 
 		 243 aa  47  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.423888 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01821  putative glutathione S-transferase  22.29 
 
 		 239 aa  47  0.0003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0879846  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1872  maleylacetoacetate isomerase  37.63 
 
 		 213 aa  47  0.0003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.169833 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4118  glutathione S-transferase  32.08 
 
 		 205 aa  46.2  0.0004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.824347  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0261  maleylacetoacetate isomerase  26.4 
 
 		 214 aa  46.2  0.0004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0523  Glutathione S-transferase domain protein  33.7 
 
 		 228 aa  46.2  0.0004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0240  maleylacetoacetate isomerase  26.4 
 
 		 216 aa  46.2  0.0004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4424  stringent starvation protein A  32.08 
 
 		 205 aa  45.8  0.0005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.339627  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5862  maleylacetoacetate isomerase  28.98 
 
 		 213 aa  45.8  0.0005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.123467  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0507  glutathione S-transferase domain-containing protein  33.7 
 
 		 228 aa  46.2  0.0005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.911631  normal  0.0384549 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4404  glutathione S-transferase domain-containing protein  35.23 
 
 		 207 aa  46.2  0.0005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.213346 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7480  glutathione S-transferase-like protein  31.63 
 
 		 220 aa  45.8  0.0006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3821  Glutathione S-transferase domain  27.37 
 
 		 203 aa  45.8  0.0006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.563101  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2422  glutathione S-transferase-like protein  26.54 
 
 		 210 aa  45.4  0.0007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0594947 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4689  glutathione S-transferase-like protein  31.13 
 
 		 205 aa  45.1  0.0009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.111203  normal  0.0217381 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0275  glutathione S-transferase-like  29.67 
 
 		 221 aa  45.1  0.0009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0888177 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06190  putative glutathione S-transferase  36.56 
 
 		 249 aa  45.1  0.0009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0166402 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1320  stringent starvation protein A  31.87 
 
 		 207 aa  44.7  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.264365  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0384  maleylacetoacetate isomerase (glutathione transferase zeta 1) protein  31.36 
 
 		 216 aa  44.7  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.593741 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0992  glutathione S-transferase-like transmembrane protein  36.36 
 
 		 360 aa  44.3  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.644569  normal  0.256398 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5804  maleylacetoacetate isomerase  28.9 
 
 		 213 aa  45.1  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2348  putative glutathione S-transferase  31.18 
 
 		 246 aa  44.7  0.001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0465  maleylacetoacetate isomerase  27.47 
 
 		 214 aa  44.7  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2167  putative GST-related protein  28.57 
 
 		 217 aa  45.1  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0415103  normal  0.0855354 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0579  putative glutathione S-transferase  36.56 
 
 		 249 aa  45.1  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5000  stringent starvation protein A  31.82 
 
 		 205 aa  45.1  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0261594  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4529  glutathione S-transferase domain-containing protein  34.09 
 
 		 207 aa  45.1  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3335  glutathione S-transferase domain-containing protein  27.66 
 
 		 205 aa  44.7  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.55179 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2771  Glutathione S-transferase domain protein  28.19 
 
 		 225 aa  43.9  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.00309034  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3554  maleylacetoacetate isomerase  37.97 
 
 		 211 aa  44.3  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.469077  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3954  glutathione S-transferase domain-containing protein  27.95 
 
 		 205 aa  43.9  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.251267 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6140  maleylacetoacetate isomerase  27.78 
 
 		 214 aa  44.3  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1887  maleylacetoacetate isomerase  29.83 
 
 		 213 aa  44.3  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.450292 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57530  stringent starvation protein A  32.97 
 
 		 205 aa  43.9  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0482  maleylacetoacetate isomerase  24.32 
 
 		 222 aa  43.9  0.002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4479  maleylacetoacetate isomerase  32.2 
 
 		 210 aa  43.9  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.28654  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0647  glutathione S-transferase domain-containing protein  34.31 
 
 		 230 aa  43.9  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.474841  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1651  glutathione S-transferase domain-containing protein  33.33 
 
 		 261 aa  44.3  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.491053  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>