More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_1744 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_1744  Glutathione S-transferase domain protein  100 
 
 		 221 aa  452  1.0000000000000001e-126  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.662899  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7480  glutathione S-transferase-like protein  61.75 
 
 		 220 aa  254  7e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5691  glutathione S-transferase domain-containing protein  58.99 
 
 		 220 aa  240  1e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.719443 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1651  glutathione S-transferase domain-containing protein  45.1 
 
 		 261 aa  82.8  0.000000000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.491053  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3634  glutathione S-transferase domain protein  31.28 
 
 		 219 aa  79.3  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1914  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.22 
 
 		 220 aa  78.2  0.00000000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0652856  normal  0.568324 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2474  Glutathione S-transferase domain protein  30.77 
 
 		 219 aa  77.8  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2873  Glutathione S-transferase domain  34.16 
 
 		 260 aa  75.5  0.0000000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.606982  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0579  putative glutathione S-transferase  33.14 
 
 		 249 aa  74.7  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06190  putative glutathione S-transferase  32.75 
 
 		 249 aa  74.3  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0166402 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0275  glutathione S-transferase-like  39.02 
 
 		 221 aa  71.6  0.00000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0888177 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3532  Glutathione S-transferase domain protein  26.9 
 
 		 217 aa  70.9  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.150118 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4998  glutathione S-transferase-like protein  27.7 
 
 		 223 aa  69.7  0.00000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0183331  normal  0.221223 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0291  glutathione S-transferase-like protein  26.99 
 
 		 218 aa  69.3  0.00000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.278783  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0117  glutathione S-transferase-like protein  32.62 
 
 		 225 aa  68.9  0.00000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.851725  normal  0.725895 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5058  glutathione S-transferase domain-containing protein  32.08 
 
 		 207 aa  68.9  0.00000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000892035 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2890  glutathione S-transferase-like  30.48 
 
 		 215 aa  68.6  0.00000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3090  glutathione S-transferase  27.5 
 
 		 203 aa  68.2  0.00000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.840634  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3227  glutathione S-transferase-like protein  27.5 
 
 		 203 aa  68.2  0.00000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2926  putative transcription modulator protein  27 
 
 		 203 aa  67.8  0.0000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4617  glutathione S-transferase domain-containing protein  27.5 
 
 		 194 aa  67.4  0.0000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.236523  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0500  Glutathione S-transferase domain  31.1 
 
 		 222 aa  68.2  0.0000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0342057 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0371  glutathione S-transferase domain-containing protein  27 
 
 		 203 aa  67  0.0000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.322532  normal  0.452731 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2856  Glutathione S-transferase domain protein  27 
 
 		 203 aa  67  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.438523 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3542  glutathione S-transferase  27 
 
 		 203 aa  67  0.0000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.412867 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0444  glutathione S-transferase domain-containing protein  27 
 
 		 203 aa  67  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3203  Glutathione S-transferase domain  27 
 
 		 203 aa  67  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.802093 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0347  glutathione S-transferase domain-containing protein  27 
 
 		 203 aa  67  0.0000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0423  glutathione S-transferase domain-containing protein  27 
 
 		 203 aa  67  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.102515  hitchhiker  0.00000408677 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2663  glutathione S-transferase-like  27 
 
 		 203 aa  67  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.763542  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0362  glutathione S-transferase domain-containing protein  27 
 
 		 203 aa  67  0.0000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0609511  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3259  stringent starvation protein A  26.5 
 
 		 203 aa  66.6  0.0000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2695  stringent starvation protein A  26.5 
 
 		 203 aa  66.6  0.0000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3647  stringent starvation protein A  26.5 
 
 		 203 aa  66.6  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.48548  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3672  stringent starvation protein A  26.5 
 
 		 203 aa  66.6  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.381091  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2974  stringent starvation protein A  26.5 
 
 		 203 aa  66.6  0.0000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.904673  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3704  stringent starvation protein A  26.5 
 
 		 203 aa  66.6  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.885565  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1688  Glutathione S-transferase domain protein  31.22 
 
 		 243 aa  66.6  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.423888 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1808  stringent starvation protein A  26.5 
 
 		 203 aa  66.6  0.0000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2745  stringent starvation protein A  26.5 
 
 		 203 aa  66.6  0.0000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1405  Glutathione S-transferase domain protein  26.37 
 
 		 198 aa  66.6  0.0000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2740  glutathione S-transferase domain-containing protein  26.5 
 
 		 203 aa  65.9  0.0000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0417  stringent starvation protein A, SspA  26.5 
 
 		 203 aa  65.9  0.0000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3541  Glutathione S-transferase domain  26.5 
 
 		 203 aa  65.9  0.0000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.468115  normal  0.06049 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1002  glutathione S-transferase-like protein  27.98 
 
 		 199 aa  65.5  0.0000000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.110038  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3308  glutathione S-transferase  27.97 
 
 		 221 aa  65.5  0.0000000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2334  glutathione S-transferase  30.32 
 
 		 220 aa  65.1  0.0000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0381359  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27580  putative glutathione S-transferase  30.19 
 
 		 220 aa  65.1  0.0000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.08808  decreased coverage  0.00115097 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0138  Glutathione S-transferase domain  26.5 
 
 		 203 aa  64.7  0.000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.46453  normal  0.0861112 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6850  Glutathione S-transferase domain protein  27.27 
 
 		 213 aa  64.7  0.000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.226481 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2967  glutathione S-transferase-like  27 
 
 		 203 aa  63.9  0.000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.191887  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1203  Glutathione S-transferase domain protein  27.09 
 
 		 203 aa  63.5  0.000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0263  glutathione S-transferase-like protein  27.09 
 
 		 199 aa  63.9  0.000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000123388  hitchhiker  0.00483772 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0716  glutathione S-transferase domain-containing protein  26.6 
 
 		 203 aa  63.2  0.000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.258047 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1873  Glutathione S-transferase domain protein  28.77 
 
 		 200 aa  63.2  0.000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3932  glutathione S-transferase domain-containing protein  27 
 
 		 203 aa  63.5  0.000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.336565 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0812  glutathione S-transferase  29.21 
 
 		 198 aa  62.4  0.000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000181934  hitchhiker  0.000010543 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3693  glutathione S-transferase domain-containing protein  26.5 
 
 		 203 aa  62  0.000000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.986206 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3962  putative glutathione S-transferase  28.44 
 
 		 223 aa  62  0.000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0755  Glutathione S-transferase domain protein  26.5 
 
 		 203 aa  61.6  0.000000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0792  glutathione S-transferase domain-containing protein  26.5 
 
 		 203 aa  61.6  0.000000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.654502  normal  0.227233 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0128  glutathione S-transferase domain-containing protein  26.5 
 
 		 203 aa  61.6  0.000000008  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.037659  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1977  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.9 
 
 		 222 aa  61.6  0.000000009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.290176  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5500  glutathione S-transferase domain-containing protein  26.87 
 
 		 203 aa  61.2  0.00000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.212095 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4424  stringent starvation protein A  34.95 
 
 		 205 aa  60.8  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.339627  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0523  Glutathione S-transferase domain protein  41.77 
 
 		 228 aa  60.8  0.00000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43530  hypothetical protein  31.03 
 
 		 220 aa  61.6  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5079  Glutathione S-transferase domain  29.5 
 
 		 213 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.242731  hitchhiker  0.00740675 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1069  glutathione S-transferase domain-containing protein  29.38 
 
 		 203 aa  61.2  0.00000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3568  Glutathione S-transferase domain  36.26 
 
 		 218 aa  60.8  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4118  glutathione S-transferase  34.95 
 
 		 205 aa  60.8  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.824347  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3092  glutathione S-transferase domain-containing protein  28.86 
 
 		 205 aa  60.5  0.00000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.061874 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2570  glutathione S-transferase domain-containing protein  29.46 
 
 		 228 aa  60.5  0.00000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00976958 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0507  glutathione S-transferase domain-containing protein  41.77 
 
 		 228 aa  60.5  0.00000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.911631  normal  0.0384549 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0824  glutathione S-transferase-like  25.5 
 
 		 203 aa  60.1  0.00000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.317861  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3580  glutathione S-transferase domain-containing protein  35.58 
 
 		 198 aa  60.8  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0483717 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2825  glutathione S-transferase-like  28.37 
 
 		 221 aa  60.5  0.00000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0254  stringent starvation protein A  33.33 
 
 		 220 aa  60.5  0.00000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0916387  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0557  glutathione S-transferase domain-containing protein  28.77 
 
 		 221 aa  60.1  0.00000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1939  stringent starvation protein A  33.33 
 
 		 209 aa  60.1  0.00000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000191065  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1959  stringent starvation protein A  28.85 
 
 		 217 aa  60.1  0.00000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.110879  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4689  glutathione S-transferase-like protein  33.98 
 
 		 205 aa  60.1  0.00000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.111203  normal  0.0217381 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1320  stringent starvation protein A  34.95 
 
 		 207 aa  59.3  0.00000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.264365  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3798  glutathione S-transferase domain-containing protein  28.7 
 
 		 236 aa  59.7  0.00000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.59415  normal  0.718162 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3491  glutathione S-transferase  29.38 
 
 		 217 aa  59.3  0.00000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0005  glutathione S-transferase domain-containing protein  24.71 
 
 		 220 aa  59.3  0.00000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0753  Glutathione S-transferase domain protein  37.65 
 
 		 217 aa  59.3  0.00000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00015348 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0108  stringent starvation protein A  36.08 
 
 		 211 aa  59.3  0.00000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0236194  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4404  glutathione S-transferase domain-containing protein  35.92 
 
 		 207 aa  59.3  0.00000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.213346 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0005  glutathione S-transferase domain-containing protein  24.71 
 
 		 220 aa  58.9  0.00000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0120161 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3650  hypothetical protein  30.54 
 
 		 220 aa  58.9  0.00000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.328113  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4972  glutathione S-transferase domain-containing protein  37.36 
 
 		 209 aa  58.5  0.00000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2778  Glutathione S-transferase domain protein  33.33 
 
 		 261 aa  58.5  0.00000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4529  glutathione S-transferase domain-containing protein  36 
 
 		 207 aa  58.5  0.00000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1830  stringent starvation protein a  24.5 
 
 		 199 aa  58.5  0.00000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.855376  normal  0.188895 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0178  glutathione S-transferase-like protein  37.25 
 
 		 229 aa  58.5  0.00000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.413822 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3362  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.1 
 
 		 215 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5247  putative glutathione S-transferase GSTF2 (GST-II)  28.83 
 
 		 219 aa  57.8  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.743687  normal  0.155796 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2384  glutathione S-transferase-like protein  32.32 
 
 		 218 aa  57.8  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  hitchhiker  0.00711866  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1349  Glutathione S-transferase domain protein  28.64 
 
 		 236 aa  58.2  0.0000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>