More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_0178 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_0178  glutathione S-transferase-like protein  100 
 
 		 229 aa  465  9.999999999999999e-131  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.413822 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0221  glutathione S-transferase  78.51 
 
 		 229 aa  372  1e-102  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3341  Glutathione S-transferase domain protein  75 
 
 		 229 aa  352  2e-96  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3664  Glutathione S-transferase domain  74.55 
 
 		 229 aa  351  5e-96  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0086  hypothetical protein  74.09 
 
 		 229 aa  343  8.999999999999999e-94  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.851127  normal  0.63256 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3297  hypothetical protein  52.86 
 
 		 234 aa  240  1e-62  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.210866  normal  0.103895 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0507  glutathione S-transferase domain-containing protein  52.44 
 
 		 228 aa  239  2e-62  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.911631  normal  0.0384549 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0523  Glutathione S-transferase domain protein  52.44 
 
 		 228 aa  239  2e-62  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1089  glutathione S-transferase-like  50.66 
 
 		 227 aa  226  3e-58  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4787  putative glutathione S-transferase (GST)  54.11 
 
 		 219 aa  225  5.0000000000000005e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2898  glutathione S-transferase domain-containing protein  56.07 
 
 		 215 aa  224  8e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.474988  normal  0.112272 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3027  glutathione S-transferase domain-containing protein  54.84 
 
 		 215 aa  224  8e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.890622 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0700  Glutathione S-transferase domain protein  53.95 
 
 		 214 aa  224  8e-58  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1259  glutathione S-transferase domain-containing protein  50 
 
 		 229 aa  223  2e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0374  glutathione S-transferase domain-containing protein  48.83 
 
 		 217 aa  223  2e-57  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0814599  normal  0.0308009 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3912  hypothetical protein  49.56 
 
 		 230 aa  221  4.9999999999999996e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.874335  normal  0.368309 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3568  Glutathione S-transferase domain  53.43 
 
 		 218 aa  221  7e-57  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6379  glutathione S-transferase-like protein  54.42 
 
 		 215 aa  221  8e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2428  glutathione S-transferase-like  53.4 
 
 		 218 aa  220  1.9999999999999999e-56  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.470962  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0990  Glutathione S-transferase domain protein  51.56 
 
 		 227 aa  219  1.9999999999999999e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2384  glutathione S-transferase-like protein  53.92 
 
 		 218 aa  219  3e-56  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  hitchhiker  0.00711866  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2943  glutathione S-transferase domain-containing protein  54.88 
 
 		 215 aa  218  5e-56  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.561118  normal  0.706349 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3077  glutathione S-transferase domain-containing protein  54.42 
 
 		 215 aa  218  7e-56  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2418  glutathione S-transferase-like  53.02 
 
 		 215 aa  218  7.999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3032  glutathione S-transferase domain-containing protein  53.02 
 
 		 215 aa  218  7.999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.865066  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3316  glutathione S-transferase domain-containing protein  53 
 
 		 218 aa  216  2e-55  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2106  glutathione S-transferase domain-containing protein  53 
 
 		 218 aa  216  2e-55  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3051  glutathione S-transferase domain-containing protein  53.49 
 
 		 215 aa  216  2e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0255759 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0456  glutathione S-transferase domain-containing protein  53 
 
 		 218 aa  216  2e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57200  putative glutathione S-transferase  50.97 
 
 		 211 aa  216  2e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3070  glutathione S-transferase-like  53.43 
 
 		 218 aa  217  2e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.15979  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3467  glutathione S-transferase domain-containing protein  48.48 
 
 		 231 aa  216  2e-55  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.616657  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3362  glutathione S-transferase domain-containing protein  53 
 
 		 215 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0271  glutathione S-transferase domain-containing protein  53 
 
 		 215 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.791762  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2986  glutathione S-transferase domain-containing protein  53 
 
 		 215 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0235  glutathione S-transferase domain-containing protein  53 
 
 		 234 aa  214  8e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0259  glutathione S-transferase domain-containing protein  52.53 
 
 		 215 aa  214  9e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.118169  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0933  glutathione S-transferase domain-containing protein  52.38 
 
 		 210 aa  213  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.250168 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1470  glutathione S-transferase domain-containing protein  48.68 
 
 		 229 aa  213  2.9999999999999995e-54  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4206  glutathione S-transferase domain-containing protein  52.65 
 
 		 228 aa  212  3.9999999999999995e-54  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.779157 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3336  glutathione S-transferase-like  52.94 
 
 		 218 aa  211  5.999999999999999e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0012  glutathione S-transferase family protein  46.3 
 
 		 220 aa  211  7e-54  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4972  glutathione S-transferase domain-containing protein  49.03 
 
 		 209 aa  209  3e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3193  glutathione S-transferase-like protein  52.71 
 
 		 222 aa  209  3e-53  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1706  glutathione S-transferase  51.94 
 
 		 218 aa  208  6e-53  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.644809  normal  0.447888 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0763  glutathione S-transferase  52.2 
 
 		 217 aa  205  4e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3154  glutathione S-transferase domain-containing protein  52.83 
 
 		 227 aa  205  5e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.861762  normal  0.107503 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0424  glutathione S-transferase domain-containing protein  45.58 
 
 		 219 aa  204  9e-52  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0005  glutathione S-transferase domain-containing protein  46.3 
 
 		 220 aa  204  1e-51  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0005  glutathione S-transferase domain-containing protein  45.83 
 
 		 220 aa  203  2e-51  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0120161 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1672  glutathione S-transferase domain-containing protein  47.8 
 
 		 217 aa  203  2e-51  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.252264 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0005  Glutathione S-transferase domain protein  45.83 
 
 		 220 aa  202  3e-51  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000759122 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0005  glutathione S-transferase domain-containing protein  45.83 
 
 		 220 aa  202  4e-51  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0005  glutathione S-transferase domain-containing protein  46.26 
 
 		 218 aa  201  7e-51  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000152518 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0200  glutathione S-transferase  52.15 
 
 		 217 aa  201  8e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0013  glutathione S-transferase domain-containing protein  46.26 
 
 		 218 aa  201  9e-51  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000975013 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6895  Glutathione S-transferase domain  50.25 
 
 		 217 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.134635  normal  0.66105 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4092  glutathione S-transferase  49.76 
 
 		 208 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.886958 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0241  glutathione S-transferase domain-containing protein  50.46 
 
 		 227 aa  199  3e-50  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0753  Glutathione S-transferase domain protein  49.26 
 
 		 217 aa  199  3e-50  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00015348 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05534  glutathione S-transferase  46.48 
 
 		 215 aa  199  3e-50  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2940  glutathione S-transferase  49.26 
 
 		 217 aa  198  5e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0005  glutathione S-transferase domain-containing protein  45.79 
 
 		 218 aa  198  7e-50  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0533093 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4314  glutathione S-transferase domain-containing protein  48.78 
 
 		 221 aa  197  9e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3437  glutathione S-transferase domain-containing protein  48.54 
 
 		 208 aa  197  1.0000000000000001e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.303772  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13360  glutathione S-transferase family protein  45.97 
 
 		 214 aa  195  6e-49  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2700  glutathione S-transferase-like protein  50.49 
 
 		 218 aa  192  5e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.302839  normal  0.422305 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4398  glutathione S-transferase family protein  47.78 
 
 		 260 aa  189  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2135  glutathione S-transferase domain-containing protein  49.02 
 
 		 216 aa  189  4e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3736  glutathione S-transferase  50.7 
 
 		 217 aa  188  5e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.110407  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0107  glutathione S-transferase domain-containing protein  46.86 
 
 		 241 aa  186  2e-46  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000372034 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4995  glutathione S-transferase domain-containing protein  49.28 
 
 		 218 aa  186  2e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000401874 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2755  glutathione S-transferase-like protein  48.04 
 
 		 218 aa  185  5e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.155229 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1840  glutathione S-transferase-like  48.54 
 
 		 244 aa  184  9e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0573301 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0580  glutathione S-transferase-like  47.17 
 
 		 224 aa  183  2.0000000000000003e-45  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.724559  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1217  glutathione S-transferase domain-containing protein  46.6 
 
 		 219 aa  182  3e-45  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04608  glutathione S-transferase  50.73 
 
 		 213 aa  181  7e-45  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.549894  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6278  putative maleylacetoacetate isomerase (MAAI) (glutathione S- transferase)  48.26 
 
 		 217 aa  181  7e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1900  glutathione S-transferase-like protein  46.31 
 
 		 218 aa  179  4e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4377  glutathione S-transferase domain-containing protein  45.85 
 
 		 210 aa  177  1e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.707138  normal  0.0169284 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1684  glutathione S-transferase-like protein  47.06 
 
 		 218 aa  177  1e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.511087  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1959  glutathione S-transferase domain-containing protein  46.8 
 
 		 217 aa  177  2e-43  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.399077  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1566  glutathione S-transferase  47.32 
 
 		 219 aa  176  3e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0453975  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4215  glutathione S-transferase domain-containing protein  47.57 
 
 		 220 aa  175  4e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0158899 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4502  glutathione S-transferase domain-containing protein  45.37 
 
 		 210 aa  175  5e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.282964  normal  0.694536 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2921  Glutathione S-transferase domain protein  46.97 
 
 		 228 aa  174  9.999999999999999e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1541  Glutathione S-transferase domain protein  47.47 
 
 		 228 aa  173  1.9999999999999998e-42  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.684419  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4154  Glutathione S-transferase domain protein  45.97 
 
 		 215 aa  172  3.9999999999999995e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.930839 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4340  glutathione S-transferase  45.16 
 
 		 219 aa  171  5.999999999999999e-42  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3120  glutathione S-transferase domain-containing protein  45.54 
 
 		 215 aa  171  6.999999999999999e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2405  Glutathione S-transferase domain protein  47.32 
 
 		 227 aa  171  6.999999999999999e-42  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.720241  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2500  Glutathione S-transferase domain protein  49.76 
 
 		 228 aa  170  1e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0954  glutathione S-transferase domain-containing protein  43.9 
 
 		 210 aa  169  2e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.428451  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2364  glutathione S-transferase-like protein  46.12 
 
 		 220 aa  169  2e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0709999  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0002  glutathione S-transferase-like protein  47.62 
 
 		 223 aa  170  2e-41  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0515777 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0624  Glutathione S-transferase domain protein  43.35 
 
 		 217 aa  168  5e-41  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0101229 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4426  glutathione S-transferase-like protein  43.41 
 
 		 210 aa  168  7e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3732  glutathione S-transferase domain-containing protein  45.15 
 
 		 239 aa  167  1e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0407787 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4632  glutathione S-transferase-like  45.15 
 
 		 239 aa  167  1e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.517858  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3023  glutathione S-transferase family protein  43 
 
 		 294 aa  166  2e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0554434  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>