More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_3568 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011004  Rpal_3568  Glutathione S-transferase domain  100 
 
 
218 aa  447  1e-125  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2384  glutathione S-transferase-like protein  88.07 
 
 
218 aa  401  1e-111  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  hitchhiker  0.00711866  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3070  glutathione S-transferase-like  86.7 
 
 
218 aa  399  9.999999999999999e-111  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.15979  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3336  glutathione S-transferase-like  75.69 
 
 
218 aa  339  2e-92  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2428  glutathione S-transferase-like  72.02 
 
 
218 aa  339  2e-92  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.470962  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1706  glutathione S-transferase  69.27 
 
 
218 aa  325  4.0000000000000003e-88  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.644809  normal  0.447888 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4787  putative glutathione S-transferase (GST)  64.98 
 
 
219 aa  298  3e-80  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3193  glutathione S-transferase-like protein  56.81 
 
 
222 aa  241  7e-63  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0753  Glutathione S-transferase domain protein  53 
 
 
217 aa  234  8e-61  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00015348 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57200  putative glutathione S-transferase  57.21 
 
 
211 aa  231  7.000000000000001e-60  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3154  glutathione S-transferase domain-containing protein  56.74 
 
 
227 aa  229  3e-59  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.861762  normal  0.107503 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1672  glutathione S-transferase domain-containing protein  49.54 
 
 
217 aa  222  4e-57  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.252264 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0178  glutathione S-transferase-like protein  53.43 
 
 
229 aa  221  6e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.413822 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0235  glutathione S-transferase domain-containing protein  55.19 
 
 
234 aa  219  3e-56  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4972  glutathione S-transferase domain-containing protein  53.85 
 
 
209 aa  218  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3341  Glutathione S-transferase domain protein  52.94 
 
 
229 aa  216  2e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2106  glutathione S-transferase domain-containing protein  54.72 
 
 
218 aa  216  2e-55  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3120  glutathione S-transferase domain-containing protein  52.36 
 
 
215 aa  216  2e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2986  glutathione S-transferase domain-containing protein  54.72 
 
 
215 aa  216  2e-55  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3316  glutathione S-transferase domain-containing protein  54.72 
 
 
218 aa  216  2e-55  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0456  glutathione S-transferase domain-containing protein  54.72 
 
 
218 aa  216  2e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3362  glutathione S-transferase domain-containing protein  54.72 
 
 
215 aa  216  2e-55  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0259  glutathione S-transferase domain-containing protein  54.72 
 
 
215 aa  216  2e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.118169  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0271  glutathione S-transferase domain-containing protein  54.72 
 
 
215 aa  216  2e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.791762  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6379  glutathione S-transferase-like protein  53.99 
 
 
215 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0086  hypothetical protein  50.49 
 
 
229 aa  212  2.9999999999999995e-54  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.851127  normal  0.63256 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2418  glutathione S-transferase-like  53.05 
 
 
215 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3032  glutathione S-transferase domain-containing protein  53.05 
 
 
215 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.865066  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3664  Glutathione S-transferase domain  52.91 
 
 
229 aa  211  4.9999999999999996e-54  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3051  glutathione S-transferase domain-containing protein  53.05 
 
 
215 aa  210  1e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0255759 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3027  glutathione S-transferase domain-containing protein  51.64 
 
 
215 aa  209  3e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.890622 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3077  glutathione S-transferase domain-containing protein  52.09 
 
 
215 aa  208  4e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2943  glutathione S-transferase domain-containing protein  51.63 
 
 
215 aa  208  6e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.561118  normal  0.706349 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0523  Glutathione S-transferase domain protein  52.36 
 
 
228 aa  207  7e-53  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4340  glutathione S-transferase  51.15 
 
 
219 aa  207  1e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0507  glutathione S-transferase domain-containing protein  51.4 
 
 
228 aa  205  5e-52  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.911631  normal  0.0384549 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3297  hypothetical protein  50.46 
 
 
234 aa  205  5e-52  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.210866  normal  0.103895 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4154  Glutathione S-transferase domain protein  51.63 
 
 
215 aa  204  6e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.930839 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0200  glutathione S-transferase  52.83 
 
 
217 aa  204  8e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2921  Glutathione S-transferase domain protein  49.77 
 
 
228 aa  202  3e-51  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0700  Glutathione S-transferase domain protein  52.88 
 
 
214 aa  202  3e-51  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3619  glutathione S-transferase domain-containing protein  48.17 
 
 
224 aa  201  7e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.429528 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2898  glutathione S-transferase domain-containing protein  50.7 
 
 
215 aa  201  8e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.474988  normal  0.112272 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0933  glutathione S-transferase domain-containing protein  50.72 
 
 
210 aa  200  9.999999999999999e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.250168 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1541  Glutathione S-transferase domain protein  49.3 
 
 
228 aa  200  9.999999999999999e-51  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.684419  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0221  glutathione S-transferase  50.98 
 
 
229 aa  198  5e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0374  glutathione S-transferase domain-containing protein  44.6 
 
 
217 aa  196  2.0000000000000003e-49  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0814599  normal  0.0308009 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3826  Glutathione S-transferase domain  49.07 
 
 
215 aa  196  2.0000000000000003e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13360  glutathione S-transferase family protein  50 
 
 
214 aa  196  3e-49  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1089  glutathione S-transferase-like  48.85 
 
 
227 aa  195  4.0000000000000005e-49  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2500  Glutathione S-transferase domain protein  51.63 
 
 
228 aa  192  3e-48  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0580  glutathione S-transferase-like  45.41 
 
 
224 aa  191  7e-48  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.724559  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4092  glutathione S-transferase  46.89 
 
 
208 aa  191  8e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.886958 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0424  glutathione S-transferase domain-containing protein  43.93 
 
 
219 aa  191  9e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1259  glutathione S-transferase domain-containing protein  48.36 
 
 
229 aa  189  4e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0012  glutathione S-transferase family protein  45.58 
 
 
220 aa  188  5.999999999999999e-47  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0005  glutathione S-transferase domain-containing protein  45.58 
 
 
218 aa  188  5.999999999999999e-47  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000000152518 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2405  Glutathione S-transferase domain protein  48.37 
 
 
227 aa  187  8e-47  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.720241  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0002  glutathione S-transferase-like protein  51.39 
 
 
223 aa  187  8e-47  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.0515777 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1470  glutathione S-transferase domain-containing protein  50 
 
 
229 aa  187  8e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0013  glutathione S-transferase domain-containing protein  45.28 
 
 
218 aa  186  3e-46  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000975013 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3912  hypothetical protein  47.44 
 
 
230 aa  185  4e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.874335  normal  0.368309 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6895  Glutathione S-transferase domain  44.65 
 
 
217 aa  185  5e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.134635  normal  0.66105 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0763  glutathione S-transferase  46.54 
 
 
217 aa  184  1.0000000000000001e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3467  glutathione S-transferase domain-containing protein  46.76 
 
 
231 aa  184  1.0000000000000001e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.616657  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3437  glutathione S-transferase domain-containing protein  46.63 
 
 
208 aa  182  3e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.303772  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0005  glutathione S-transferase domain-containing protein  45.97 
 
 
220 aa  182  3e-45  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0120161 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0005  glutathione S-transferase domain-containing protein  44.65 
 
 
218 aa  182  3e-45  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0533093 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4502  glutathione S-transferase domain-containing protein  47.6 
 
 
210 aa  182  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.282964  normal  0.694536 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4206  glutathione S-transferase domain-containing protein  52.51 
 
 
228 aa  182  4.0000000000000006e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.779157 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4377  glutathione S-transferase domain-containing protein  47.6 
 
 
210 aa  181  6e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.707138  normal  0.0169284 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0005  glutathione S-transferase domain-containing protein  45.5 
 
 
220 aa  181  7e-45  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4314  glutathione S-transferase domain-containing protein  43.72 
 
 
221 aa  181  8.000000000000001e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1217  glutathione S-transferase domain-containing protein  45.62 
 
 
219 aa  181  8.000000000000001e-45  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2940  glutathione S-transferase  44.19 
 
 
217 aa  181  9.000000000000001e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4426  glutathione S-transferase-like protein  46.41 
 
 
210 aa  180  1e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0005  glutathione S-transferase domain-containing protein  45.02 
 
 
220 aa  180  1e-44  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0005  Glutathione S-transferase domain protein  45.02 
 
 
220 aa  180  1e-44  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000759122 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0954  glutathione S-transferase domain-containing protein  46.63 
 
 
210 aa  178  4e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.428451  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4398  glutathione S-transferase family protein  46.31 
 
 
260 aa  177  8e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0990  Glutathione S-transferase domain protein  46.73 
 
 
227 aa  177  8e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0564  glutathione S-transferase-like  44.75 
 
 
227 aa  177  8e-44  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1840  glutathione S-transferase-like  45.83 
 
 
244 aa  177  1e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0573301 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2700  glutathione S-transferase-like protein  43.98 
 
 
218 aa  177  1e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.302839  normal  0.422305 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05534  glutathione S-transferase  43.93 
 
 
215 aa  176  2e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3736  glutathione S-transferase  48.56 
 
 
217 aa  172  1.9999999999999998e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.110407  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2755  glutathione S-transferase-like protein  44.55 
 
 
218 aa  173  1.9999999999999998e-42  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.155229 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2127  glutathione S-transferase-like protein  45.58 
 
 
226 aa  173  1.9999999999999998e-42  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0682  putative glutathione S-transferase  45.83 
 
 
224 aa  172  5e-42  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4215  glutathione S-transferase domain-containing protein  45.16 
 
 
220 aa  170  2e-41  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0158899 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2364  glutathione S-transferase-like protein  43.52 
 
 
220 aa  169  3e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0709999  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4995  glutathione S-transferase domain-containing protein  45.21 
 
 
218 aa  169  4e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000401874 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3789  glutathione S-transferase domain-containing protein  43.32 
 
 
220 aa  168  5e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.181151  normal  0.0204408 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1684  glutathione S-transferase-like protein  42.59 
 
 
218 aa  168  6e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.511087  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2698  glutathione S-transferase-like protein  44.75 
 
 
227 aa  167  8e-41  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3614  glutathione S-transferase domain-containing protein  43.52 
 
 
220 aa  167  1e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.922528  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4632  glutathione S-transferase-like  42.86 
 
 
239 aa  167  1e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.517858  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3732  glutathione S-transferase domain-containing protein  42.86 
 
 
239 aa  167  1e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0407787 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2135  glutathione S-transferase domain-containing protein  45.63 
 
 
216 aa  166  2e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1566  glutathione S-transferase  44.24 
 
 
219 aa  166  4e-40  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0453975  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>