More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_2825 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008044  TM1040_2825  glutathione S-transferase-like  100 
 
 
221 aa  451  1.0000000000000001e-126  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2783  glutathione S-transferase domain-containing protein  77.38 
 
 
225 aa  362  2e-99  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2805  glutathione S-transferase domain-containing protein  78.28 
 
 
225 aa  362  2e-99  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.383982  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3308  glutathione S-transferase  73.3 
 
 
221 aa  350  1e-95  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1144  glutathione S-transferase  77.1 
 
 
241 aa  345  4e-94  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0275  glutathione S-transferase-like  72.4 
 
 
221 aa  339  2e-92  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0888177 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2289  glutathione S-transferase domain-containing protein  69.86 
 
 
252 aa  318  3.9999999999999996e-86  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.497964  normal  0.298446 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0500  Glutathione S-transferase domain  57.21 
 
 
222 aa  270  9e-72  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0342057 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1977  glutathione S-transferase domain-containing protein  50.45 
 
 
222 aa  235  4e-61  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.290176  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0022  glutathione S-transferase-like protein  50.45 
 
 
222 aa  228  8e-59  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.428941  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0199  glutathione S-transferase domain-containing protein  51.77 
 
 
226 aa  221  4.9999999999999996e-57  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4945  glutathione S-transferase domain-containing protein  49.55 
 
 
232 aa  220  1.9999999999999999e-56  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.25103 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2343  Glutathione S-transferase domain  46.96 
 
 
230 aa  216  2.9999999999999998e-55  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.77446  normal  0.656048 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2142  glutathione S-transferase-like protein  45.74 
 
 
223 aa  214  8e-55  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.142397  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2663  Glutathione S-transferase domain  46.52 
 
 
230 aa  213  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.657394  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3133  glutathione S-transferase domain-containing protein  45.65 
 
 
230 aa  213  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.05587  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2386  glutathione S-transferase domain-containing protein  46.52 
 
 
230 aa  213  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.10495  normal  0.984704 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0117  glutathione S-transferase-like protein  48.44 
 
 
225 aa  212  2.9999999999999995e-54  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.851725  normal  0.725895 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0214  glutathione S-transferase domain-containing protein  48.26 
 
 
230 aa  199  3e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.163491  normal  0.307378 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1808  glutathione S-transferase domain-containing protein  45.81 
 
 
280 aa  198  6e-50  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0584047  normal  0.113332 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5423  Glutathione S-transferase domain protein  46.52 
 
 
230 aa  197  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.361864  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1058  glutathione S-transferase family protein  42.92 
 
 
217 aa  194  7e-49  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.407682  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4583  Glutathione S-transferase domain protein  45.65 
 
 
230 aa  194  7e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.293882 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0847  glutathione S-transferase family protein  42.53 
 
 
221 aa  194  8.000000000000001e-49  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.33451  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4320  Glutathione S-transferase domain  45.65 
 
 
230 aa  193  1e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3313  glutathione S-transferase domain-containing protein  46.29 
 
 
229 aa  194  1e-48  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.03107  normal  0.604378 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0341  glutathione S-transferase  43.91 
 
 
230 aa  190  1e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.575191  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0241  glutathione S- transferase, N-terminal  41.63 
 
 
225 aa  189  2e-47  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4722  glutathione S-transferase domain-containing protein  42.6 
 
 
223 aa  189  2e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.247027  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0222  putative glutathione S-transferase family protein  43.04 
 
 
230 aa  189  4e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0044  Glutathione S-transferase domain  43.91 
 
 
230 aa  188  5e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1338  glutathione S-transferase domain-containing protein  43.91 
 
 
230 aa  188  5e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0662  glutathione S-transferase-like protein  42.61 
 
 
230 aa  187  8e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.165169 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0164  glutathione S-transferase  43.48 
 
 
230 aa  187  9e-47  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0185  glutathione S-transferase-like  42.61 
 
 
230 aa  187  1e-46  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3080  glutathione S-transferase-like  42.79 
 
 
223 aa  186  2e-46  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0171  glutathione S-transferase-like  42.17 
 
 
230 aa  184  7e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0439  glutathione S-transferase-like  40.87 
 
 
230 aa  183  1.0000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1044  glutathione S-transferase family protein  43.91 
 
 
230 aa  183  2.0000000000000003e-45  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3681  Glutathione S-transferase domain protein  44.78 
 
 
230 aa  182  5.0000000000000004e-45  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.158502 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3535  glutathione S-transferase domain-containing protein  45.22 
 
 
230 aa  181  7e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0982  glutathione S-transferase family protein  43.48 
 
 
230 aa  181  9.000000000000001e-45  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1050  glutathione S-transferase  41.13 
 
 
230 aa  177  1e-43  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.087398  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3599  glutathione S-transferase-like  41.92 
 
 
229 aa  157  1e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2334  glutathione S-transferase  33.17 
 
 
220 aa  106  3e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0381359  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27580  putative glutathione S-transferase  33.33 
 
 
220 aa  106  3e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.08808  decreased coverage  0.00115097 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2890  glutathione S-transferase-like  28.43 
 
 
215 aa  91.7  8e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2088  glutathione S-transferase-like protein  31.88 
 
 
216 aa  90.9  1e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.828063  normal  0.835222 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2965  Glutathione S-transferase domain  31.61 
 
 
202 aa  89  5e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6850  Glutathione S-transferase domain protein  28.5 
 
 
213 aa  88.6  6e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.226481 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1914  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.03 
 
 
220 aa  88.2  8e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0652856  normal  0.568324 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3782  glutathione S-transferase-like protein  30.58 
 
 
204 aa  87.8  1e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2548  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.09 
 
 
202 aa  87  2e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.24256  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2721  putative glutathione S-transferase protein  32.12 
 
 
202 aa  86.3  3e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.199713 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0846  glutathione S-transferase  32.67 
 
 
202 aa  86.3  3e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.289081  normal  0.806951 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2555  Glutathione S-transferase domain protein  31.09 
 
 
202 aa  86.3  3e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.736156 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0523  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.28 
 
 
220 aa  85.9  4e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000118067 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2957  glutathione S-transferase-like protein  33 
 
 
204 aa  85.9  4e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0589  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.33 
 
 
204 aa  85.9  4e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1255  glutathione S-transferase  30.33 
 
 
203 aa  85.5  6e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3536  glutathione S-transferase domain-containing protein  28.57 
 
 
205 aa  85.1  8e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2688  glutathione S-transferase domain-containing protein  29.86 
 
 
204 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.761571  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0696  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.14 
 
 
205 aa  83.6  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2361  glutathione S-transferase  29.38 
 
 
203 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1137  glutathione S-transferase  29.38 
 
 
203 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3392  glutathione S-transferase family protein  29.38 
 
 
203 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0615  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.2 
 
 
203 aa  83.6  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.715776  normal  0.218032 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2542  glutathione S-transferase  29.38 
 
 
203 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0663  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.14 
 
 
205 aa  83.6  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0212  glutathione S-transferase-like  30.14 
 
 
205 aa  83.6  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3356  glutathione S-transferase family protein  29.38 
 
 
203 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3398  glutathione S-transferase  29.7 
 
 
202 aa  83.2  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0624  glutathione S-transferase  31.87 
 
 
206 aa  83.2  0.000000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.531247  normal  0.512939 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0276  glutathione S-transferase  29.7 
 
 
202 aa  83.2  0.000000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3336  Glutathione S-transferase domain  31.87 
 
 
204 aa  82.8  0.000000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.287023  normal  0.088058 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5058  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.1 
 
 
207 aa  82.8  0.000000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000892035 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2820  glutathione S-transferase  30.5 
 
 
204 aa  82.4  0.000000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.294123  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0824  glutathione S-transferase-like  30.54 
 
 
203 aa  81.6  0.000000000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.317861  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3289  glutathione S-transferase  30.05 
 
 
202 aa  80.5  0.00000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0716  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.54 
 
 
203 aa  79  0.00000000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.258047 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3932  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.03 
 
 
203 aa  78.6  0.00000000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.336565 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1203  Glutathione S-transferase domain protein  30.54 
 
 
203 aa  77.8  0.0000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1011  gst-related protein  28.44 
 
 
213 aa  77.4  0.0000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3532  Glutathione S-transferase domain protein  29.61 
 
 
217 aa  77.4  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.150118 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0933  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.03 
 
 
204 aa  77  0.0000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5500  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.05 
 
 
203 aa  76.3  0.0000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.212095 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2967  glutathione S-transferase-like  29.35 
 
 
203 aa  76.6  0.0000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.191887  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01821  putative glutathione S-transferase  27.41 
 
 
239 aa  76.3  0.0000000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0879846  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3984  glutathione S-transferase-like  29.91 
 
 
202 aa  76.6  0.0000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.10217  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4930  glutathione S-transferase domain-containing protein  28.57 
 
 
214 aa  76.6  0.0000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6309  glutathione S-transferase domain-containing protein  27.2 
 
 
267 aa  76.3  0.0000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3203  Glutathione S-transferase domain  28.5 
 
 
203 aa  76.3  0.0000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.802093 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2856  Glutathione S-transferase domain protein  28.5 
 
 
203 aa  76.3  0.0000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.438523 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3693  glutathione S-transferase domain-containing protein  29.21 
 
 
203 aa  75.5  0.0000000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.986206 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0792  glutathione S-transferase domain-containing protein  28.71 
 
 
203 aa  75.1  0.0000000000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.654502  normal  0.227233 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0755  Glutathione S-transferase domain protein  28.71 
 
 
203 aa  75.1  0.0000000000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2922  glutathione S-transferase domain-containing protein  27.67 
 
 
207 aa  75.1  0.0000000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.894063  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0113  glutathione S-transferase domain-containing protein  33.18 
 
 
211 aa  74.7  0.0000000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.118782  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2740  glutathione S-transferase domain-containing protein  27.14 
 
 
203 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0417  stringent starvation protein A, SspA  27.14 
 
 
203 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>