More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_3308 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_3308  glutathione S-transferase  100 
 
 		 221 aa  462  1e-129  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2783  glutathione S-transferase domain-containing protein  76.02 
 
 		 225 aa  365  1e-100  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2805  glutathione S-transferase domain-containing protein  75.57 
 
 		 225 aa  361  4e-99  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.383982  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2825  glutathione S-transferase-like  73.3 
 
 		 221 aa  350  1e-95  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0275  glutathione S-transferase-like  73.3 
 
 		 221 aa  345  2e-94  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0888177 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1144  glutathione S-transferase  74.65 
 
 		 241 aa  345  4e-94  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2289  glutathione S-transferase domain-containing protein  65.3 
 
 		 252 aa  313  9.999999999999999e-85  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.497964  normal  0.298446 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0500  Glutathione S-transferase domain  54.95 
 
 		 222 aa  258  4e-68  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0342057 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1977  glutathione S-transferase domain-containing protein  50 
 
 		 222 aa  228  7e-59  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.290176  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0117  glutathione S-transferase-like protein  50.22 
 
 		 225 aa  223  2e-57  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.851725  normal  0.725895 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0022  glutathione S-transferase-like protein  49.1 
 
 		 222 aa  219  3.9999999999999997e-56  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.428941  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0199  glutathione S-transferase domain-containing protein  48.23 
 
 		 226 aa  215  4e-55  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2386  glutathione S-transferase domain-containing protein  47.39 
 
 		 230 aa  213  9.999999999999999e-55  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.10495  normal  0.984704 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2663  Glutathione S-transferase domain  47.39 
 
 		 230 aa  213  9.999999999999999e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.657394  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2343  Glutathione S-transferase domain  46.96 
 
 		 230 aa  210  1e-53  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.77446  normal  0.656048 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4945  glutathione S-transferase domain-containing protein  47.75 
 
 		 232 aa  207  1e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.25103 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3133  glutathione S-transferase domain-containing protein  43.91 
 
 		 230 aa  199  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.05587  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2142  glutathione S-transferase-like protein  44.39 
 
 		 223 aa  197  7.999999999999999e-50  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.142397  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0214  glutathione S-transferase domain-containing protein  45.65 
 
 		 230 aa  193  2e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.163491  normal  0.307378 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5423  Glutathione S-transferase domain protein  44.78 
 
 		 230 aa  192  3e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.361864  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3313  glutathione S-transferase domain-containing protein  44.54 
 
 		 229 aa  190  2e-47  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.03107  normal  0.604378 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1808  glutathione S-transferase domain-containing protein  41.85 
 
 		 280 aa  188  5.999999999999999e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0584047  normal  0.113332 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0847  glutathione S-transferase family protein  40.72 
 
 		 221 aa  187  1e-46  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.33451  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1058  glutathione S-transferase family protein  42.01 
 
 		 217 aa  187  2e-46  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.407682  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0044  Glutathione S-transferase domain  42.17 
 
 		 230 aa  186  3e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0241  glutathione S- transferase, N-terminal  39.82 
 
 		 225 aa  184  7e-46  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0164  glutathione S-transferase  42.17 
 
 		 230 aa  183  2.0000000000000003e-45  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4583  Glutathione S-transferase domain protein  43.91 
 
 		 230 aa  183  2.0000000000000003e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.293882 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1338  glutathione S-transferase domain-containing protein  43.48 
 
 		 230 aa  182  4.0000000000000006e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0439  glutathione S-transferase-like  41.99 
 
 		 230 aa  182  4.0000000000000006e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4320  Glutathione S-transferase domain  44.35 
 
 		 230 aa  182  4.0000000000000006e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0662  glutathione S-transferase-like protein  41.74 
 
 		 230 aa  181  6e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.165169 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0222  putative glutathione S-transferase family protein  41.3 
 
 		 230 aa  181  7e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0185  glutathione S-transferase-like  41.3 
 
 		 230 aa  180  1e-44  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0171  glutathione S-transferase-like  41.74 
 
 		 230 aa  180  2e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1044  glutathione S-transferase family protein  43.48 
 
 		 230 aa  177  1e-43  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1050  glutathione S-transferase  42.17 
 
 		 230 aa  176  2e-43  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.087398  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0982  glutathione S-transferase family protein  43.48 
 
 		 230 aa  176  2e-43  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0341  glutathione S-transferase  41.74 
 
 		 230 aa  175  6e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.575191  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4722  glutathione S-transferase domain-containing protein  41.07 
 
 		 223 aa  174  9e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.247027  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3535  glutathione S-transferase domain-containing protein  43.04 
 
 		 230 aa  169  3e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3681  Glutathione S-transferase domain protein  42.17 
 
 		 230 aa  168  6e-41  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.158502 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3080  glutathione S-transferase-like  40.36 
 
 		 223 aa  167  1e-40  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3599  glutathione S-transferase-like  41.05 
 
 		 229 aa  151  5.9999999999999996e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27580  putative glutathione S-transferase  32.67 
 
 		 220 aa  102  6e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.08808  decreased coverage  0.00115097 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2890  glutathione S-transferase-like  29.9 
 
 		 215 aa  101  1e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2334  glutathione S-transferase  32.51 
 
 		 220 aa  100  2e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0381359  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6850  Glutathione S-transferase domain protein  30.43 
 
 		 213 aa  99.8  3e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.226481 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2555  Glutathione S-transferase domain protein  33.67 
 
 		 202 aa  96.7  2e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.736156 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2965  Glutathione S-transferase domain  33.67 
 
 		 202 aa  96.3  4e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2721  putative glutathione S-transferase protein  33.5 
 
 		 202 aa  92  7e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.199713 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4050  glutathione S-transferase-like  31.79 
 
 		 204 aa  90.1  2e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.767967  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5058  glutathione S-transferase domain-containing protein  32.08 
 
 		 207 aa  89.7  3e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000892035 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2922  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.1 
 
 		 207 aa  89.4  4e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.894063  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3332  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.5 
 
 		 210 aa  88.6  7e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2088  glutathione S-transferase-like protein  30.29 
 
 		 216 aa  88.2  9e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.828063  normal  0.835222 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1132  glutathione S-transferase family protein  30 
 
 		 224 aa  88.2  1e-16  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0885  glutathione S-transferase  30 
 
 		 224 aa  87  2e-16  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0233753  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2957  glutathione S-transferase-like protein  31.55 
 
 		 204 aa  87.4  2e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1914  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.73 
 
 		 220 aa  86.7  2e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0652856  normal  0.568324 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0589  glutathione S-transferase domain-containing protein  29.86 
 
 		 204 aa  86.7  2e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3782  glutathione S-transferase-like protein  29.13 
 
 		 204 aa  86.3  3e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3336  Glutathione S-transferase domain  32.97 
 
 		 204 aa  85.9  5e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.287023  normal  0.088058 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6309  glutathione S-transferase domain-containing protein  28.39 
 
 		 267 aa  85.9  5e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2820  glutathione S-transferase  29.5 
 
 		 204 aa  85.5  6e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.294123  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0824  glutathione S-transferase-like  31 
 
 		 203 aa  85.1  7e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.317861  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2688  glutathione S-transferase domain-containing protein  29.38 
 
 		 204 aa  85.1  7e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.761571  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0615  glutathione S-transferase domain-containing protein  29.7 
 
 		 203 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.715776  normal  0.218032 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3932  glutathione S-transferase domain-containing protein  31 
 
 		 203 aa  84.7  0.000000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.336565 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0907  putative glutathione S-transferase  30.52 
 
 		 216 aa  84.7  0.000000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.58191  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0696  glutathione S-transferase domain-containing protein  29.19 
 
 		 205 aa  83.6  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0663  glutathione S-transferase domain-containing protein  29.19 
 
 		 205 aa  83.6  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0624  glutathione S-transferase  32.8 
 
 		 206 aa  83.6  0.000000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.531247  normal  0.512939 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0212  glutathione S-transferase-like  29.19 
 
 		 205 aa  83.6  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0716  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.5 
 
 		 203 aa  83.2  0.000000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.258047 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2548  glutathione S-transferase domain-containing protein  29.02 
 
 		 202 aa  83.2  0.000000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.24256  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1255  glutathione S-transferase  31.22 
 
 		 203 aa  82.8  0.000000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2361  glutathione S-transferase  30.73 
 
 		 203 aa  82.4  0.000000000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3356  glutathione S-transferase family protein  30.73 
 
 		 203 aa  82.4  0.000000000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3392  glutathione S-transferase family protein  30.73 
 
 		 203 aa  82.4  0.000000000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1137  glutathione S-transferase  30.73 
 
 		 203 aa  82.4  0.000000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2542  glutathione S-transferase  30.73 
 
 		 203 aa  82.4  0.000000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3398  glutathione S-transferase  31.12 
 
 		 202 aa  82  0.000000000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0276  glutathione S-transferase  31.12 
 
 		 202 aa  82  0.000000000000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0933  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.5 
 
 		 204 aa  81.6  0.000000000000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3693  glutathione S-transferase domain-containing protein  30 
 
 		 203 aa  81.3  0.00000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.986206 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1203  Glutathione S-transferase domain protein  30.5 
 
 		 203 aa  81.3  0.00000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2967  glutathione S-transferase-like  30 
 
 		 203 aa  80.9  0.00000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.191887  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0755  Glutathione S-transferase domain protein  30 
 
 		 203 aa  80.9  0.00000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0792  glutathione S-transferase domain-containing protein  30 
 
 		 203 aa  80.9  0.00000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.654502  normal  0.227233 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3623  putative glutathione S-transferase protein  29.23 
 
 		 206 aa  80.9  0.00000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0893077  normal  0.362102 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5366  Glutathione S-transferase domain protein  29.38 
 
 		 207 aa  80.1  0.00000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.230494  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3289  glutathione S-transferase  30.2 
 
 		 202 aa  79.7  0.00000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3532  Glutathione S-transferase domain protein  29.25 
 
 		 217 aa  79.7  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.150118 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5500  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.5 
 
 		 203 aa  79  0.00000000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.212095 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0523  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.2 
 
 		 220 aa  78.6  0.00000000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000118067 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0846  glutathione S-transferase  29.76 
 
 		 202 aa  77.8  0.0000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.289081  normal  0.806951 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5166  Glutathione S-transferase domain protein  29.21 
 
 		 203 aa  77.4  0.0000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.699876  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3536  glutathione S-transferase domain-containing protein  28.16 
 
 		 205 aa  76.3  0.0000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3984  glutathione S-transferase-like  28.99 
 
 		 202 aa  76.6  0.0000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.10217  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>