More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_2289 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008686  Pden_2289  glutathione S-transferase domain-containing protein  100 
 
 
252 aa  521  1e-147  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.497964  normal  0.298446 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2783  glutathione S-transferase domain-containing protein  70.32 
 
 
225 aa  320  9.999999999999999e-87  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0275  glutathione S-transferase-like  68.49 
 
 
221 aa  318  5e-86  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0888177 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2805  glutathione S-transferase domain-containing protein  70.32 
 
 
225 aa  318  6e-86  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.383982  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2825  glutathione S-transferase-like  69.86 
 
 
221 aa  318  6e-86  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3308  glutathione S-transferase  65.3 
 
 
221 aa  313  9.999999999999999e-85  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1144  glutathione S-transferase  71.01 
 
 
241 aa  306  2.0000000000000002e-82  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0500  Glutathione S-transferase domain  54.34 
 
 
222 aa  236  2e-61  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0342057 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1977  glutathione S-transferase domain-containing protein  52.05 
 
 
222 aa  221  7e-57  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.290176  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0022  glutathione S-transferase-like protein  50 
 
 
222 aa  217  1e-55  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.428941  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4945  glutathione S-transferase domain-containing protein  47.75 
 
 
232 aa  207  1e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.25103 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0117  glutathione S-transferase-like protein  50.45 
 
 
225 aa  204  8e-52  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.851725  normal  0.725895 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0199  glutathione S-transferase domain-containing protein  51.34 
 
 
226 aa  204  1e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2343  Glutathione S-transferase domain  47.14 
 
 
230 aa  194  1e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.77446  normal  0.656048 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2142  glutathione S-transferase-like protein  42.53 
 
 
223 aa  192  3e-48  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.142397  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2386  glutathione S-transferase domain-containing protein  46.7 
 
 
230 aa  191  1e-47  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.10495  normal  0.984704 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2663  Glutathione S-transferase domain  46.7 
 
 
230 aa  191  1e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.657394  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3133  glutathione S-transferase domain-containing protein  46.52 
 
 
230 aa  189  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.05587  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0214  glutathione S-transferase domain-containing protein  48.9 
 
 
230 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.163491  normal  0.307378 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5423  Glutathione S-transferase domain protein  47.58 
 
 
230 aa  182  4.0000000000000006e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.361864  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3313  glutathione S-transferase domain-containing protein  45.61 
 
 
229 aa  180  2e-44  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.03107  normal  0.604378 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0044  Glutathione S-transferase domain  44.49 
 
 
230 aa  180  2e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1808  glutathione S-transferase domain-containing protein  42.37 
 
 
280 aa  177  1e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0584047  normal  0.113332 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0222  putative glutathione S-transferase family protein  44.05 
 
 
230 aa  176  2e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0847  glutathione S-transferase family protein  39.45 
 
 
221 aa  175  5e-43  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.33451  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0662  glutathione S-transferase-like protein  44.05 
 
 
230 aa  174  8e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.165169 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0164  glutathione S-transferase  44.05 
 
 
230 aa  174  9.999999999999999e-43  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0171  glutathione S-transferase-like  44.05 
 
 
230 aa  174  9.999999999999999e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD1058  glutathione S-transferase family protein  40.64 
 
 
217 aa  173  1.9999999999999998e-42  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.407682  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0439  glutathione S-transferase-like  42.54 
 
 
230 aa  173  1.9999999999999998e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0241  glutathione S- transferase, N-terminal  38.53 
 
 
225 aa  172  3.9999999999999995e-42  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1338  glutathione S-transferase domain-containing protein  43.67 
 
 
230 aa  172  3.9999999999999995e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0185  glutathione S-transferase-like  43.17 
 
 
230 aa  171  1e-41  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3681  Glutathione S-transferase domain protein  44.98 
 
 
230 aa  170  3e-41  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.158502 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1044  glutathione S-transferase family protein  43.67 
 
 
230 aa  169  4e-41  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3535  glutathione S-transferase domain-containing protein  43.17 
 
 
230 aa  169  5e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0982  glutathione S-transferase family protein  43.67 
 
 
230 aa  169  5e-41  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4583  Glutathione S-transferase domain protein  40.53 
 
 
230 aa  168  6e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.293882 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4722  glutathione S-transferase domain-containing protein  40.09 
 
 
223 aa  168  6e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.247027  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4320  Glutathione S-transferase domain  40.53 
 
 
230 aa  168  7e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0341  glutathione S-transferase  40.53 
 
 
230 aa  167  1e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.575191  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3080  glutathione S-transferase-like  38.71 
 
 
223 aa  164  1.0000000000000001e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1050  glutathione S-transferase  40.17 
 
 
230 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.087398  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3599  glutathione S-transferase-like  40.35 
 
 
229 aa  139  3.9999999999999997e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2334  glutathione S-transferase  34.13 
 
 
220 aa  94.7  1e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0381359  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4050  glutathione S-transferase-like  31.34 
 
 
204 aa  93.2  4e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.767967  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3336  Glutathione S-transferase domain  35.83 
 
 
204 aa  92  9e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.287023  normal  0.088058 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2721  putative glutathione S-transferase protein  33.17 
 
 
202 aa  90.9  2e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.199713 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27580  putative glutathione S-transferase  32.21 
 
 
220 aa  90.9  2e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.08808  decreased coverage  0.00115097 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0624  glutathione S-transferase  36.31 
 
 
206 aa  90.5  3e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.531247  normal  0.512939 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2957  glutathione S-transferase-like protein  34.74 
 
 
204 aa  89.4  5e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2548  glutathione S-transferase domain-containing protein  33.67 
 
 
202 aa  89.4  5e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.24256  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0589  glutathione S-transferase domain-containing protein  33.17 
 
 
204 aa  89.4  5e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2555  Glutathione S-transferase domain protein  32.2 
 
 
202 aa  89  6e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.736156 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2890  glutathione S-transferase-like  28.29 
 
 
215 aa  88.6  8e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2965  Glutathione S-transferase domain  32.2 
 
 
202 aa  88.6  8e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2688  glutathione S-transferase domain-containing protein  33.17 
 
 
204 aa  88.6  1e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.761571  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2361  glutathione S-transferase  33.33 
 
 
203 aa  87  2e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3398  glutathione S-transferase  33.33 
 
 
202 aa  87  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0615  glutathione S-transferase domain-containing protein  32.68 
 
 
203 aa  87.8  2e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.715776  normal  0.218032 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3392  glutathione S-transferase family protein  33.33 
 
 
203 aa  87  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2542  glutathione S-transferase  33.33 
 
 
203 aa  87  2e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3356  glutathione S-transferase family protein  33.33 
 
 
203 aa  87  2e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1137  glutathione S-transferase  33.33 
 
 
203 aa  87  2e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0276  glutathione S-transferase  33.33 
 
 
202 aa  87  2e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2820  glutathione S-transferase  32.04 
 
 
204 aa  87  3e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.294123  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1255  glutathione S-transferase  32.84 
 
 
203 aa  87  3e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3623  putative glutathione S-transferase protein  32.08 
 
 
206 aa  86.3  4e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0893077  normal  0.362102 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3289  glutathione S-transferase  30.35 
 
 
202 aa  86.3  5e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4025  glutathione S-transferase domain-containing protein  32.97 
 
 
204 aa  86.3  5e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.638139  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3782  glutathione S-transferase-like protein  31.28 
 
 
204 aa  85.9  6e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3375  Glutathione S-transferase domain protein  32.43 
 
 
204 aa  85.5  7e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2116  glutathione S-transferase-like protein  31.53 
 
 
203 aa  84.3  0.000000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.489753  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6850  Glutathione S-transferase domain protein  27.83 
 
 
213 aa  84.3  0.000000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.226481 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5166  Glutathione S-transferase domain protein  31.22 
 
 
203 aa  82.8  0.000000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.699876  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4668  glutathione S-transferase domain-containing protein  29.85 
 
 
204 aa  82.8  0.000000000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2088  glutathione S-transferase-like protein  30.2 
 
 
216 aa  82  0.000000000000009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.828063  normal  0.835222 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0319  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.71 
 
 
206 aa  81.6  0.00000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0663  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.71 
 
 
205 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4661  glutathione S-transferase-like  30.73 
 
 
204 aa  81.6  0.00000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.39586  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0696  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.71 
 
 
205 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0212  glutathione S-transferase-like  31.71 
 
 
205 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5058  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.25 
 
 
207 aa  81.6  0.00000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000892035 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0846  glutathione S-transferase  30.24 
 
 
202 aa  79  0.00000000000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.289081  normal  0.806951 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1159  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.9 
 
 
206 aa  77.8  0.0000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3913  glutathione S-transferase domain-containing protein  29.35 
 
 
204 aa  78.2  0.0000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0846475  normal  0.026606 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3883  Glutathione S-transferase domain protein  32.04 
 
 
203 aa  77.8  0.0000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6309  glutathione S-transferase domain-containing protein  28.88 
 
 
267 aa  77  0.0000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0824  glutathione S-transferase-like  28.93 
 
 
203 aa  77  0.0000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.317861  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2242  glutathione S-transferase-like protein  30.35 
 
 
202 aa  76.3  0.0000000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.025244  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1512  Glutathione S-transferase domain  28.23 
 
 
210 aa  76.3  0.0000000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.553363 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0851  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.62 
 
 
206 aa  76.3  0.0000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.451549 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0907  putative glutathione S-transferase  29.63 
 
 
216 aa  76.3  0.0000000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.58191  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0523  glutathione S-transferase domain-containing protein  28.71 
 
 
220 aa  75.5  0.0000000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000118067 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3102  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.31 
 
 
205 aa  75.5  0.0000000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.480753  normal  0.323994 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3932  glutathione S-transferase domain-containing protein  28.43 
 
 
203 aa  75.5  0.0000000000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.336565 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0089  putative glutathione S-transferase  29.31 
 
 
201 aa  75.1  0.000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1203  Glutathione S-transferase domain protein  28.43 
 
 
203 aa  74.7  0.000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3984  glutathione S-transferase-like  27.27 
 
 
202 aa  75.1  0.000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.10217  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5366  Glutathione S-transferase domain protein  30.92 
 
 
207 aa  74.7  0.000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.230494  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>