More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnec_1512 on replicon NC_010531
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010531  Pnec_1512  Glutathione S-transferase domain  100 
 
 
210 aa  432  1e-120  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.553363 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1795  glutathione S-transferase domain-containing protein  91.9 
 
 
221 aa  399  9.999999999999999e-111  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.277101  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4668  glutathione S-transferase domain-containing protein  62.07 
 
 
204 aa  267  8e-71  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0212  glutathione S-transferase-like  61.39 
 
 
205 aa  266  1e-70  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0663  glutathione S-transferase domain-containing protein  61.39 
 
 
205 aa  266  1e-70  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0696  glutathione S-transferase domain-containing protein  61.39 
 
 
205 aa  266  1e-70  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0624  glutathione S-transferase  63.18 
 
 
206 aa  265  2.9999999999999995e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.531247  normal  0.512939 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0589  glutathione S-transferase domain-containing protein  60.1 
 
 
204 aa  265  4e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0615  glutathione S-transferase domain-containing protein  60.1 
 
 
203 aa  264  5.999999999999999e-70  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.715776  normal  0.218032 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2548  glutathione S-transferase domain-containing protein  62 
 
 
202 aa  264  7e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.24256  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4661  glutathione S-transferase-like  62.07 
 
 
204 aa  263  1e-69  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.39586  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3336  Glutathione S-transferase domain  62.69 
 
 
204 aa  263  1e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.287023  normal  0.088058 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2965  Glutathione S-transferase domain  58.71 
 
 
202 aa  263  2e-69  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3623  putative glutathione S-transferase protein  60.68 
 
 
206 aa  263  2e-69  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0893077  normal  0.362102 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2688  glutathione S-transferase domain-containing protein  60.7 
 
 
204 aa  263  2e-69  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.761571  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0319  glutathione S-transferase domain-containing protein  59.71 
 
 
206 aa  262  3e-69  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3913  glutathione S-transferase domain-containing protein  62.69 
 
 
204 aa  261  6e-69  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0846475  normal  0.026606 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2721  putative glutathione S-transferase protein  59.2 
 
 
202 aa  261  6.999999999999999e-69  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.199713 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1255  glutathione S-transferase  58.71 
 
 
203 aa  260  8.999999999999999e-69  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2555  Glutathione S-transferase domain protein  58.21 
 
 
202 aa  259  1e-68  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.736156 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3375  Glutathione S-transferase domain protein  62.56 
 
 
204 aa  259  3e-68  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4025  glutathione S-transferase domain-containing protein  62.56 
 
 
204 aa  259  3e-68  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.638139  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2361  glutathione S-transferase  57.71 
 
 
203 aa  258  4e-68  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2542  glutathione S-transferase  57.71 
 
 
203 aa  258  4e-68  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0276  glutathione S-transferase  57.71 
 
 
202 aa  258  4e-68  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3398  glutathione S-transferase  57.71 
 
 
202 aa  258  4e-68  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3356  glutathione S-transferase family protein  57.71 
 
 
203 aa  258  4e-68  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1137  glutathione S-transferase  57.71 
 
 
203 aa  258  4e-68  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3392  glutathione S-transferase family protein  57.71 
 
 
203 aa  258  4e-68  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1159  glutathione S-transferase domain-containing protein  58.33 
 
 
206 aa  256  2e-67  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3782  glutathione S-transferase-like protein  59.2 
 
 
204 aa  254  5e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5166  Glutathione S-transferase domain protein  58.62 
 
 
203 aa  251  6e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.699876  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4050  glutathione S-transferase-like  58.62 
 
 
204 aa  249  3e-65  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.767967  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2820  glutathione S-transferase  59.31 
 
 
204 aa  239  2e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.294123  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0851  glutathione S-transferase domain-containing protein  57.35 
 
 
206 aa  238  6.999999999999999e-62  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.451549 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3289  glutathione S-transferase  53.23 
 
 
202 aa  234  1.0000000000000001e-60  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2957  glutathione S-transferase-like protein  58.91 
 
 
204 aa  232  2.0000000000000002e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2242  glutathione S-transferase-like protein  55.72 
 
 
202 aa  231  7.000000000000001e-60  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.025244  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0846  glutathione S-transferase  50.25 
 
 
202 aa  211  7e-54  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.289081  normal  0.806951 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2116  glutathione S-transferase-like protein  46.27 
 
 
203 aa  194  8.000000000000001e-49  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.489753  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3883  Glutathione S-transferase domain protein  42.16 
 
 
203 aa  170  2e-41  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0139  putative glutathione S-transferase  42.65 
 
 
202 aa  157  1e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0226  glutathione S-transferase domain-containing protein  41.95 
 
 
201 aa  154  1e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03447  predicted glutathione S-transferase  40.69 
 
 
202 aa  146  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0116  Glutathione S-transferase domain protein  40.69 
 
 
202 aa  146  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4090  putative glutathione S-transferase  40.69 
 
 
202 aa  146  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4007  putative glutathione S-transferase  40.69 
 
 
202 aa  146  2.0000000000000003e-34  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.6966  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0121  putative glutathione S-transferase  40.69 
 
 
202 aa  146  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03398  hypothetical protein  40.69 
 
 
202 aa  146  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3920  putative glutathione S-transferase  40.69 
 
 
202 aa  146  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.430255 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0089  putative glutathione S-transferase  39.6 
 
 
201 aa  146  2.0000000000000003e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3798  putative glutathione S-transferase  40.69 
 
 
202 aa  146  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.783281  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3898  putative glutathione S-transferase  41.18 
 
 
202 aa  145  3e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4963  putative glutathione S-transferase  40.69 
 
 
202 aa  145  4.0000000000000006e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.805647  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3884  putative glutathione S-transferase  40.69 
 
 
231 aa  144  9e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0796916  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4007  putative glutathione S-transferase  40.2 
 
 
202 aa  143  1e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.228817 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4069  putative glutathione S-transferase  39.71 
 
 
202 aa  142  5e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3962  putative glutathione S-transferase  39.71 
 
 
202 aa  141  8e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.470719  normal  0.386103 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1545  glutathione S-transferase domain-containing protein  38.54 
 
 
201 aa  137  1e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0116241 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2111  glutathione S-transferase domain-containing protein  37.86 
 
 
199 aa  136  2e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1084  glutathione S-transferase domain-containing protein  39.11 
 
 
215 aa  135  4e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3647  Glutathione S-transferase domain  36.71 
 
 
203 aa  135  5e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0997379 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3758  Glutathione S-transferase domain  37.2 
 
 
203 aa  134  7.000000000000001e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.177098  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3681  glutathione S-transferase domain-containing protein  39.32 
 
 
200 aa  134  9.999999999999999e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3449  glutathione S-transferase domain-containing protein  36.71 
 
 
203 aa  132  5e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.124589 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4086  glutathione S-transferase-like  41.15 
 
 
205 aa  131  6e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1878  glutathione S-transferase domain-containing protein  38.05 
 
 
200 aa  131  6e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.277157 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3535  glutathione S-transferase domain-containing protein  35.75 
 
 
204 aa  131  6.999999999999999e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5192  glutathione S-transferase-like protein  36.71 
 
 
221 aa  130  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.355066  normal  0.248772 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2167  glutathione S-transferase domain-containing protein  37.81 
 
 
199 aa  130  2.0000000000000002e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.366461  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7162  Glutathione S-transferase domain protein  38.54 
 
 
200 aa  129  3e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2729  glutathione S-transferase domain-containing protein  38.05 
 
 
227 aa  129  4.0000000000000003e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4913  Glutathione S-transferase domain  39.42 
 
 
205 aa  128  8.000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.413564  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3279  putative glutathione S-transferase family protein  39.44 
 
 
203 aa  126  2.0000000000000002e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.970815  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0448  glutathione S-transferase, putative  34.78 
 
 
204 aa  125  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4727  glutathione S-transferase, putative  34.47 
 
 
209 aa  123  2e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.981894  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6331  glutathione S-transferase domain-containing protein  36.59 
 
 
200 aa  123  2e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.295541  hitchhiker  0.00751047 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0363  glutathione S-transferase domain-containing protein  37.2 
 
 
207 aa  122  3e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.115928 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4235  glutathione S-transferase-like protein  36.84 
 
 
205 aa  122  3e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.814895 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1835  Glutathione S-transferase domain protein  38.16 
 
 
203 aa  120  9.999999999999999e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.583884  normal  0.161209 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2181  glutathione S-transferase domain-containing protein  38 
 
 
204 aa  120  1.9999999999999998e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.592473 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1346  glutathione S-transferase-like  36.36 
 
 
204 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.462561  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4868  glutathione S-transferase domain-containing protein  35.1 
 
 
207 aa  119  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.895586  normal  0.31649 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1206  putative glutathione S-transferase  34.43 
 
 
204 aa  117  9.999999999999999e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0335  glutathione S-transferase family protein  34.76 
 
 
207 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.213964 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0360  glutathione S-transferase domain-containing protein  34.76 
 
 
207 aa  116  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.215038  normal  0.528653 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0572  hypothetical protein  34.31 
 
 
206 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0177  glutathione S-transferase family protein  37.25 
 
 
200 aa  112  3e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0356  Glutathione S-transferase domain  37.25 
 
 
200 aa  112  3e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.326677  normal  0.746823 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2815  glutathione S-transferase-like  33.82 
 
 
200 aa  112  4.0000000000000004e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.370194 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06120  hypothetical protein  34.31 
 
 
206 aa  112  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.352199  decreased coverage  0.0055796 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1397  glutathione S-transferase  36.97 
 
 
202 aa  112  6e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2804  glutathione S-transferase-like protein  36.19 
 
 
202 aa  111  6e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.719824  normal  0.515361 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0064  glutathione S-transferase  36.97 
 
 
202 aa  111  6e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.876217  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0785  glutathione S-transferase domain-containing protein  34.43 
 
 
202 aa  110  1.0000000000000001e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.238617  normal  0.0753849 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6155  Glutathione S-transferase domain protein  37.56 
 
 
205 aa  109  2.0000000000000002e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3271  glutathione S-transferase family protein  33.66 
 
 
212 aa  108  5e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5879  Glutathione S-transferase domain protein  34.31 
 
 
201 aa  107  1e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2584  glutathione S-transferase domain-containing protein  32.84 
 
 
199 aa  105  3e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3228  glutathione S-transferase domain-containing protein  36.97 
 
 
202 aa  105  4e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.864486  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>