250 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_0448 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004578  PSPTO_0448  glutathione S-transferase, putative  100 
 
 
204 aa  416  9.999999999999999e-116  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4727  glutathione S-transferase, putative  92.61 
 
 
209 aa  388  1e-107  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.981894  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5192  glutathione S-transferase-like protein  72.06 
 
 
221 aa  315  4e-85  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.355066  normal  0.248772 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06120  hypothetical protein  68.5 
 
 
206 aa  290  1e-77  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.352199  decreased coverage  0.0055796 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0572  hypothetical protein  67.5 
 
 
206 aa  287  6e-77  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0363  glutathione S-transferase domain-containing protein  64.71 
 
 
207 aa  274  5e-73  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.115928 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0335  glutathione S-transferase family protein  63.73 
 
 
207 aa  268  5e-71  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.213964 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0360  glutathione S-transferase domain-containing protein  63.73 
 
 
207 aa  268  5.9999999999999995e-71  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.215038  normal  0.528653 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4868  glutathione S-transferase domain-containing protein  62.38 
 
 
207 aa  265  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.895586  normal  0.31649 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1545  glutathione S-transferase domain-containing protein  47.52 
 
 
201 aa  190  9e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0116241 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1835  Glutathione S-transferase domain protein  46.08 
 
 
203 aa  184  8e-46  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.583884  normal  0.161209 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0226  glutathione S-transferase domain-containing protein  48.51 
 
 
201 aa  182  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3647  Glutathione S-transferase domain  45.59 
 
 
203 aa  181  8.000000000000001e-45  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0997379 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3449  glutathione S-transferase domain-containing protein  44.12 
 
 
203 aa  174  6e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.124589 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3758  Glutathione S-transferase domain  44.12 
 
 
203 aa  174  9.999999999999999e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.177098  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3535  glutathione S-transferase domain-containing protein  44.88 
 
 
204 aa  166  2e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2815  glutathione S-transferase-like  43.56 
 
 
200 aa  164  5.9999999999999996e-40  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.370194 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7162  Glutathione S-transferase domain protein  43.84 
 
 
200 aa  160  1e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6331  glutathione S-transferase domain-containing protein  42.57 
 
 
200 aa  156  2e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.295541  hitchhiker  0.00751047 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2804  glutathione S-transferase-like protein  44.12 
 
 
202 aa  156  3e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.719824  normal  0.515361 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1397  glutathione S-transferase  44.17 
 
 
202 aa  151  5e-36  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0064  glutathione S-transferase  44.17 
 
 
202 aa  150  8.999999999999999e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.876217  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1878  glutathione S-transferase domain-containing protein  38.24 
 
 
200 aa  150  1e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.277157 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3279  putative glutathione S-transferase family protein  42.36 
 
 
203 aa  149  2e-35  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.970815  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4086  glutathione S-transferase-like  39.71 
 
 
205 aa  147  7e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4913  Glutathione S-transferase domain  39.02 
 
 
205 aa  147  8e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.413564  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3228  glutathione S-transferase domain-containing protein  44.55 
 
 
202 aa  147  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.864486  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2181  glutathione S-transferase domain-containing protein  39.8 
 
 
204 aa  146  2.0000000000000003e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.592473 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4235  glutathione S-transferase-like protein  38.73 
 
 
205 aa  145  3e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.814895 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0322  glutathione S-transferase-like  41.09 
 
 
204 aa  145  3e-34  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.672766 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2167  glutathione S-transferase domain-containing protein  41 
 
 
199 aa  146  3e-34  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.366461  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3681  glutathione S-transferase domain-containing protein  39.71 
 
 
200 aa  145  4.0000000000000006e-34  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3271  glutathione S-transferase family protein  39.6 
 
 
212 aa  142  4e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1346  glutathione S-transferase-like  38.73 
 
 
204 aa  140  9.999999999999999e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.462561  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2111  glutathione S-transferase domain-containing protein  38.24 
 
 
199 aa  139  3e-32  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1206  putative glutathione S-transferase  35.29 
 
 
204 aa  139  3.9999999999999997e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2729  glutathione S-transferase domain-containing protein  40.2 
 
 
227 aa  136  2e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5879  Glutathione S-transferase domain protein  37.81 
 
 
201 aa  135  4e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6155  Glutathione S-transferase domain protein  38.61 
 
 
205 aa  133  1.9999999999999998e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1204  glutathione S-transferase domain-containing protein  35.32 
 
 
204 aa  130  1.0000000000000001e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0615  glutathione S-transferase domain-containing protein  35.75 
 
 
203 aa  128  5.0000000000000004e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.715776  normal  0.218032 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0589  glutathione S-transferase domain-containing protein  35.75 
 
 
204 aa  127  9.000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3336  Glutathione S-transferase domain  37.07 
 
 
204 aa  125  3e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.287023  normal  0.088058 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1512  Glutathione S-transferase domain  34.78 
 
 
210 aa  125  3e-28  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.553363 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1590  Glutathione S-transferase domain protein  42.78 
 
 
198 aa  125  3e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0806366 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2721  putative glutathione S-transferase protein  36.59 
 
 
202 aa  124  1e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.199713 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2548  glutathione S-transferase domain-containing protein  33.33 
 
 
202 aa  124  1e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.24256  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2688  glutathione S-transferase domain-containing protein  35.12 
 
 
204 aa  123  2e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.761571  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0212  glutathione S-transferase-like  34.47 
 
 
205 aa  123  2e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0696  glutathione S-transferase domain-containing protein  34.47 
 
 
205 aa  123  2e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0663  glutathione S-transferase domain-containing protein  34.47 
 
 
205 aa  123  2e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0624  glutathione S-transferase  36.59 
 
 
206 aa  122  3e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.531247  normal  0.512939 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2555  Glutathione S-transferase domain protein  35.61 
 
 
202 aa  121  6e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.736156 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3782  glutathione S-transferase-like protein  33.66 
 
 
204 aa  121  8e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2965  Glutathione S-transferase domain  35.61 
 
 
202 aa  120  9e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3623  putative glutathione S-transferase protein  36.54 
 
 
206 aa  120  9.999999999999999e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0893077  normal  0.362102 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3913  glutathione S-transferase domain-containing protein  34.48 
 
 
204 aa  118  7.999999999999999e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0846475  normal  0.026606 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0319  glutathione S-transferase domain-containing protein  36.06 
 
 
206 aa  117  9e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2361  glutathione S-transferase  33.17 
 
 
203 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3398  glutathione S-transferase  33.17 
 
 
202 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3356  glutathione S-transferase family protein  33.17 
 
 
203 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1795  glutathione S-transferase domain-containing protein  33.82 
 
 
221 aa  117  9.999999999999999e-26  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.277101  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3392  glutathione S-transferase family protein  33.17 
 
 
203 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2542  glutathione S-transferase  33.17 
 
 
203 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1137  glutathione S-transferase  33.17 
 
 
203 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0276  glutathione S-transferase  33.17 
 
 
202 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1255  glutathione S-transferase  33.17 
 
 
203 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4661  glutathione S-transferase-like  34.3 
 
 
204 aa  115  5e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.39586  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2116  glutathione S-transferase-like protein  35.12 
 
 
203 aa  115  6.9999999999999995e-25  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.489753  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0859  glutathione S-transferase domain-containing protein  35.29 
 
 
199 aa  112  3e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4050  glutathione S-transferase-like  35.75 
 
 
204 aa  112  5e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.767967  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5166  Glutathione S-transferase domain protein  34.3 
 
 
203 aa  112  5e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.699876  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1159  glutathione S-transferase domain-containing protein  37.98 
 
 
206 aa  111  6e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0851  glutathione S-transferase domain-containing protein  35.58 
 
 
206 aa  111  6e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.451549 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0944  glutathione S-transferase domain-containing protein  33.82 
 
 
197 aa  109  3e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.148191  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3289  glutathione S-transferase  31.22 
 
 
202 aa  106  2e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2242  glutathione S-transferase-like protein  32.68 
 
 
202 aa  106  2e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.025244  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4668  glutathione S-transferase domain-containing protein  33.33 
 
 
204 aa  106  2e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0994  glutathione S-transferase domain-containing protein  32.18 
 
 
198 aa  105  3e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00317376 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0785  glutathione S-transferase domain-containing protein  32.98 
 
 
202 aa  105  4e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.238617  normal  0.0753849 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4025  glutathione S-transferase domain-containing protein  35.27 
 
 
204 aa  104  8e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.638139  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0846  glutathione S-transferase  34.91 
 
 
202 aa  104  9e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.289081  normal  0.806951 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3375  Glutathione S-transferase domain protein  34.78 
 
 
204 aa  103  1e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0171  glutathione S-transferase domain-containing protein  37.86 
 
 
200 aa  103  2e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.627306 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4324  Glutathione S-transferase domain protein  36.27 
 
 
202 aa  102  3e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2957  glutathione S-transferase-like protein  34.47 
 
 
204 aa  103  3e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2820  glutathione S-transferase  34.95 
 
 
204 aa  102  4e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.294123  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3883  Glutathione S-transferase domain protein  34.78 
 
 
203 aa  100  1e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1322  glutathione S-transferase-like protein  33.33 
 
 
196 aa  98.6  5e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0363606  normal  0.491489 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3206  glutathione S-transferase, putative  32.85 
 
 
205 aa  96.3  3e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0139  putative glutathione S-transferase  31.71 
 
 
202 aa  95.5  5e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3962  putative glutathione S-transferase  32.04 
 
 
202 aa  94.4  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.470719  normal  0.386103 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1562  glutathione S-transferase related protein  32.45 
 
 
198 aa  94  1e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.572147  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2584  glutathione S-transferase domain-containing protein  32.97 
 
 
199 aa  92.8  3e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4963  putative glutathione S-transferase  29.76 
 
 
202 aa  92  5e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.805647  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3920  putative glutathione S-transferase  29.76 
 
 
202 aa  92  6e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.430255 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4069  putative glutathione S-transferase  31.55 
 
 
202 aa  91.7  7e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4007  putative glutathione S-transferase  29.76 
 
 
202 aa  91.3  8e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.6966  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3798  putative glutathione S-transferase  29.76 
 
 
202 aa  91.3  8e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.783281  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4090  putative glutathione S-transferase  29.76 
 
 
202 aa  91.3  8e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>