More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lferr_0356 on replicon NC_011206
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011761  AFE_0177  glutathione S-transferase family protein  100 
 
 
200 aa  405  1.0000000000000001e-112  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0356  Glutathione S-transferase domain  100 
 
 
200 aa  405  1.0000000000000001e-112  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.326677  normal  0.746823 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2116  glutathione S-transferase-like protein  38.81 
 
 
203 aa  127  1.0000000000000001e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.489753  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0089  putative glutathione S-transferase  38.24 
 
 
201 aa  122  4e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2242  glutathione S-transferase-like protein  37.5 
 
 
202 aa  119  3e-26  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.025244  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3681  glutathione S-transferase domain-containing protein  38.42 
 
 
200 aa  119  3.9999999999999996e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0139  putative glutathione S-transferase  37.07 
 
 
202 aa  118  4.9999999999999996e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0846  glutathione S-transferase  34.31 
 
 
202 aa  116  1.9999999999999998e-25  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.289081  normal  0.806951 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3883  Glutathione S-transferase domain protein  37.8 
 
 
203 aa  115  3e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3898  putative glutathione S-transferase  38.46 
 
 
202 aa  115  3e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3884  putative glutathione S-transferase  37.38 
 
 
231 aa  115  5e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0796916  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3962  putative glutathione S-transferase  36.23 
 
 
202 aa  115  5e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.470719  normal  0.386103 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4007  putative glutathione S-transferase  36.89 
 
 
202 aa  115  6e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.228817 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4069  putative glutathione S-transferase  36.1 
 
 
202 aa  115  6e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3920  putative glutathione S-transferase  36.89 
 
 
202 aa  114  8.999999999999998e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.430255 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3289  glutathione S-transferase  35.29 
 
 
202 aa  114  1.0000000000000001e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1512  Glutathione S-transferase domain  37.25 
 
 
210 aa  112  3e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.553363 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1795  glutathione S-transferase domain-containing protein  36.76 
 
 
221 aa  112  3e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.277101  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4963  putative glutathione S-transferase  36.41 
 
 
202 aa  112  3e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.805647  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03447  predicted glutathione S-transferase  36.41 
 
 
202 aa  112  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0116  Glutathione S-transferase domain protein  36.41 
 
 
202 aa  112  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0121  putative glutathione S-transferase  36.41 
 
 
202 aa  112  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4007  putative glutathione S-transferase  36.41 
 
 
202 aa  112  4.0000000000000004e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.6966  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3798  putative glutathione S-transferase  36.41 
 
 
202 aa  112  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.783281  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4090  putative glutathione S-transferase  36.41 
 
 
202 aa  112  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0319  glutathione S-transferase domain-containing protein  37.2 
 
 
206 aa  112  4.0000000000000004e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03398  hypothetical protein  36.41 
 
 
202 aa  112  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4661  glutathione S-transferase-like  36.41 
 
 
204 aa  110  1.0000000000000001e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.39586  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0226  glutathione S-transferase domain-containing protein  37.38 
 
 
201 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1878  glutathione S-transferase domain-containing protein  36.95 
 
 
200 aa  108  4.0000000000000004e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.277157 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1159  glutathione S-transferase domain-containing protein  36.06 
 
 
206 aa  107  2e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4050  glutathione S-transferase-like  36.23 
 
 
204 aa  107  2e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.767967  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6155  Glutathione S-transferase domain protein  36.1 
 
 
205 aa  106  3e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5166  Glutathione S-transferase domain protein  34.47 
 
 
203 aa  105  4e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.699876  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0663  glutathione S-transferase domain-containing protein  35.29 
 
 
205 aa  104  8e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0212  glutathione S-transferase-like  35.29 
 
 
205 aa  104  8e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0696  glutathione S-transferase domain-containing protein  35.29 
 
 
205 aa  104  8e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2957  glutathione S-transferase-like protein  39.22 
 
 
204 aa  103  1e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2167  glutathione S-transferase domain-containing protein  35.53 
 
 
199 aa  103  1e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.366461  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3913  glutathione S-transferase domain-containing protein  36.82 
 
 
204 aa  103  2e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0846475  normal  0.026606 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3336  Glutathione S-transferase domain  35.47 
 
 
204 aa  103  2e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.287023  normal  0.088058 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2688  glutathione S-transferase domain-containing protein  33 
 
 
204 aa  102  3e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.761571  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0589  glutathione S-transferase domain-containing protein  32.67 
 
 
204 aa  102  3e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2820  glutathione S-transferase  36.59 
 
 
204 aa  102  4e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.294123  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0615  glutathione S-transferase domain-containing protein  32.67 
 
 
203 aa  102  5e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.715776  normal  0.218032 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2721  putative glutathione S-transferase protein  35.61 
 
 
202 aa  101  8e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.199713 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2555  Glutathione S-transferase domain protein  35.61 
 
 
202 aa  101  8e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.736156 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3782  glutathione S-transferase-like protein  33 
 
 
204 aa  100  1e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3623  putative glutathione S-transferase protein  36.1 
 
 
206 aa  100  1e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0893077  normal  0.362102 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2965  Glutathione S-transferase domain  35.61 
 
 
202 aa  100  1e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1835  Glutathione S-transferase domain protein  36.92 
 
 
203 aa  99.8  2e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.583884  normal  0.161209 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4025  glutathione S-transferase domain-containing protein  36.1 
 
 
204 aa  99.8  3e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.638139  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3375  Glutathione S-transferase domain protein  36.1 
 
 
204 aa  99.4  3e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4668  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.88 
 
 
204 aa  98.6  5e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0624  glutathione S-transferase  35.47 
 
 
206 aa  98.2  6e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.531247  normal  0.512939 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2548  glutathione S-transferase domain-containing protein  34.63 
 
 
202 aa  98.6  6e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.24256  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1545  glutathione S-transferase domain-containing protein  36.06 
 
 
201 aa  98.2  7e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0116241 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3271  glutathione S-transferase family protein  34.13 
 
 
212 aa  98.2  8e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2729  glutathione S-transferase domain-containing protein  34.21 
 
 
227 aa  97.8  9e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2361  glutathione S-transferase  32.35 
 
 
203 aa  95.5  4e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3398  glutathione S-transferase  32.35 
 
 
202 aa  95.5  4e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0276  glutathione S-transferase  32.35 
 
 
202 aa  95.5  4e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3392  glutathione S-transferase family protein  32.35 
 
 
203 aa  95.5  4e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2542  glutathione S-transferase  32.35 
 
 
203 aa  95.5  4e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3356  glutathione S-transferase family protein  32.35 
 
 
203 aa  95.5  4e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1137  glutathione S-transferase  32.35 
 
 
203 aa  95.5  4e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5192  glutathione S-transferase-like protein  34.78 
 
 
221 aa  93.2  2e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.355066  normal  0.248772 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1255  glutathione S-transferase  34.09 
 
 
203 aa  93.6  2e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2111  glutathione S-transferase domain-containing protein  29.41 
 
 
199 aa  93.2  2e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1910  glutathione S-transferase family protein  31.37 
 
 
201 aa  92  5e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5879  Glutathione S-transferase domain protein  32.52 
 
 
201 aa  91.3  8e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1397  glutathione S-transferase  35.44 
 
 
202 aa  90.5  2e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0064  glutathione S-transferase  35.44 
 
 
202 aa  90.5  2e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.876217  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1590  Glutathione S-transferase domain protein  31.53 
 
 
198 aa  90.1  2e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0806366 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0851  glutathione S-transferase domain-containing protein  33.8 
 
 
206 aa  89  4e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.451549 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1084  glutathione S-transferase domain-containing protein  34.98 
 
 
215 aa  87.8  9e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4868  glutathione S-transferase domain-containing protein  33.97 
 
 
207 aa  87.4  1e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.895586  normal  0.31649 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1935  glutathione S-transferase-like protein  31.22 
 
 
201 aa  85.9  4e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00060998  normal  0.487054 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7162  Glutathione S-transferase domain protein  30.77 
 
 
200 aa  85.1  7e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2815  glutathione S-transferase-like  31.58 
 
 
200 aa  84.7  8e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.370194 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2804  glutathione S-transferase-like protein  33.98 
 
 
202 aa  84  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.719824  normal  0.515361 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2584  glutathione S-transferase domain-containing protein  34.87 
 
 
199 aa  82.4  0.000000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3279  putative glutathione S-transferase family protein  33.65 
 
 
203 aa  81.6  0.000000000000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.970815  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0363  glutathione S-transferase domain-containing protein  32.06 
 
 
207 aa  80.5  0.00000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.115928 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0360  glutathione S-transferase domain-containing protein  32.54 
 
 
207 aa  80.1  0.00000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.215038  normal  0.528653 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1562  glutathione S-transferase related protein  32.37 
 
 
198 aa  80.1  0.00000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.572147  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6331  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.29 
 
 
200 aa  79.7  0.00000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.295541  hitchhiker  0.00751047 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3758  Glutathione S-transferase domain  30.92 
 
 
203 aa  79.3  0.00000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.177098  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3647  Glutathione S-transferase domain  30 
 
 
203 aa  78.6  0.00000000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0997379 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0322  glutathione S-transferase-like  31.6 
 
 
204 aa  78.6  0.00000000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.672766 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3449  glutathione S-transferase domain-containing protein  29.95 
 
 
203 aa  77.8  0.0000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.124589 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0335  glutathione S-transferase family protein  32.06 
 
 
207 aa  77  0.0000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.213964 
 
 
-
 
NC_004310  BR0702  glutathione S-transferase family protein  33.33 
 
 
199 aa  75.9  0.0000000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4727  glutathione S-transferase, putative  30.81 
 
 
209 aa  76.3  0.0000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.981894  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0693  glutathione S-transferase family protein  33.33 
 
 
199 aa  75.9  0.0000000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0448  glutathione S-transferase, putative  30.81 
 
 
204 aa  75.9  0.0000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1204  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.86 
 
 
204 aa  75.9  0.0000000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4324  Glutathione S-transferase domain protein  32.38 
 
 
202 aa  75.5  0.0000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0572  hypothetical protein  31.6 
 
 
206 aa  75.1  0.0000000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1322  glutathione S-transferase-like protein  31.03 
 
 
196 aa  75.1  0.0000000000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0363606  normal  0.491489 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>