More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc2721 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc2721  putative glutathione S-transferase protein  100 
 
 		 202 aa  421  1e-117  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.199713 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2965  Glutathione S-transferase domain  90.59 
 
 		 202 aa  392  1e-108  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2555  Glutathione S-transferase domain protein  90.1 
 
 		 202 aa  390  1e-108  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.736156 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1255  glutathione S-transferase  67.33 
 
 		 203 aa  301  4.0000000000000003e-81  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0624  glutathione S-transferase  68.66 
 
 		 206 aa  300  9e-81  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.531247  normal  0.512939 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2361  glutathione S-transferase  66.34 
 
 		 203 aa  299  2e-80  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2542  glutathione S-transferase  66.34 
 
 		 203 aa  299  2e-80  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3356  glutathione S-transferase family protein  66.34 
 
 		 203 aa  299  2e-80  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1137  glutathione S-transferase  66.34 
 
 		 203 aa  299  2e-80  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3392  glutathione S-transferase family protein  66.34 
 
 		 203 aa  299  2e-80  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2548  glutathione S-transferase domain-containing protein  67 
 
 		 202 aa  298  3e-80  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.24256  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3398  glutathione S-transferase  66.34 
 
 		 202 aa  298  3e-80  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0276  glutathione S-transferase  66.34 
 
 		 202 aa  298  3e-80  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3782  glutathione S-transferase-like protein  66.34 
 
 		 204 aa  294  7e-79  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0615  glutathione S-transferase domain-containing protein  66.67 
 
 		 203 aa  293  9e-79  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.715776  normal  0.218032 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3336  Glutathione S-transferase domain  67.16 
 
 		 204 aa  293  1e-78  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.287023  normal  0.088058 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0589  glutathione S-transferase domain-containing protein  66.67 
 
 		 204 aa  293  1e-78  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0212  glutathione S-transferase-like  67.66 
 
 		 205 aa  292  2e-78  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2688  glutathione S-transferase domain-containing protein  66.83 
 
 		 204 aa  292  2e-78  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.761571  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0663  glutathione S-transferase domain-containing protein  67.66 
 
 		 205 aa  292  2e-78  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0696  glutathione S-transferase domain-containing protein  67.66 
 
 		 205 aa  292  2e-78  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3623  putative glutathione S-transferase protein  65.02 
 
 		 206 aa  283  8e-76  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0893077  normal  0.362102 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2957  glutathione S-transferase-like protein  71.14 
 
 		 204 aa  283  1.0000000000000001e-75  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2820  glutathione S-transferase  66.67 
 
 		 204 aa  276  2e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.294123  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5166  Glutathione S-transferase domain protein  62.56 
 
 		 203 aa  273  1.0000000000000001e-72  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.699876  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4661  glutathione S-transferase-like  63.05 
 
 		 204 aa  270  1e-71  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.39586  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3913  glutathione S-transferase domain-containing protein  61.69 
 
 		 204 aa  268  4e-71  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0846475  normal  0.026606 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4050  glutathione S-transferase-like  62.07 
 
 		 204 aa  263  1e-69  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.767967  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1512  Glutathione S-transferase domain  59.2 
 
 		 210 aa  261  6e-69  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.553363 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4668  glutathione S-transferase domain-containing protein  59.31 
 
 		 204 aa  257  7e-68  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4025  glutathione S-transferase domain-containing protein  60.78 
 
 		 204 aa  255  3e-67  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.638139  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1795  glutathione S-transferase domain-containing protein  58.21 
 
 		 221 aa  254  5e-67  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.277101  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3375  Glutathione S-transferase domain protein  59.8 
 
 		 204 aa  254  9e-67  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1159  glutathione S-transferase domain-containing protein  59.11 
 
 		 206 aa  250  8.000000000000001e-66  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0319  glutathione S-transferase domain-containing protein  58.13 
 
 		 206 aa  246  2e-64  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2242  glutathione S-transferase-like protein  56.44 
 
 		 202 aa  245  3e-64  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.025244  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3289  glutathione S-transferase  55.45 
 
 		 202 aa  239  2.9999999999999997e-62  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0851  glutathione S-transferase domain-containing protein  57.64 
 
 		 206 aa  238  4e-62  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.451549 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0846  glutathione S-transferase  52.24 
 
 		 202 aa  213  1.9999999999999998e-54  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.289081  normal  0.806951 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3883  Glutathione S-transferase domain protein  48.26 
 
 		 203 aa  187  5.999999999999999e-47  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2116  glutathione S-transferase-like protein  48.02 
 
 		 203 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.489753  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0089  putative glutathione S-transferase  41.79 
 
 		 201 aa  162  2.0000000000000002e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0139  putative glutathione S-transferase  41.29 
 
 		 202 aa  151  8e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3920  putative glutathione S-transferase  39.3 
 
 		 202 aa  148  6e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.430255 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03447  predicted glutathione S-transferase  39.3 
 
 		 202 aa  147  7e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0116  Glutathione S-transferase domain protein  39.3 
 
 		 202 aa  147  7e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3798  putative glutathione S-transferase  39.3 
 
 		 202 aa  147  7e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.783281  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0121  putative glutathione S-transferase  39.3 
 
 		 202 aa  147  7e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4007  putative glutathione S-transferase  39.3 
 
 		 202 aa  147  7e-35  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.6966  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4963  putative glutathione S-transferase  39.3 
 
 		 202 aa  147  7e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.805647  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4090  putative glutathione S-transferase  39.3 
 
 		 202 aa  147  7e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03398  hypothetical protein  39.3 
 
 		 202 aa  147  7e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3898  putative glutathione S-transferase  40 
 
 		 202 aa  146  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1084  glutathione S-transferase domain-containing protein  40 
 
 		 215 aa  145  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4007  putative glutathione S-transferase  39.5 
 
 		 202 aa  143  1e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.228817 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3884  putative glutathione S-transferase  39 
 
 		 231 aa  143  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0796916  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0226  glutathione S-transferase domain-containing protein  42.93 
 
 		 201 aa  142  3e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4069  putative glutathione S-transferase  39 
 
 		 202 aa  142  4e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3962  putative glutathione S-transferase  39 
 
 		 202 aa  141  5e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.470719  normal  0.386103 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3681  glutathione S-transferase domain-containing protein  41.38 
 
 		 200 aa  136  2e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1878  glutathione S-transferase domain-containing protein  39.41 
 
 		 200 aa  135  6.0000000000000005e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.277157 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1545  glutathione S-transferase domain-containing protein  40.67 
 
 		 201 aa  134  8e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0116241 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2111  glutathione S-transferase domain-containing protein  39.41 
 
 		 199 aa  132  3e-30  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0363  glutathione S-transferase domain-containing protein  39.51 
 
 		 207 aa  132  3e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.115928 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5192  glutathione S-transferase-like protein  36.41 
 
 		 221 aa  131  6.999999999999999e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.355066  normal  0.248772 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3647  Glutathione S-transferase domain  38.83 
 
 		 203 aa  130  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0997379 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2167  glutathione S-transferase domain-containing protein  40.3 
 
 		 199 aa  129  3e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.366461  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3758  Glutathione S-transferase domain  38.83 
 
 		 203 aa  127  8.000000000000001e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.177098  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3535  glutathione S-transferase domain-containing protein  36.95 
 
 		 204 aa  127  1.0000000000000001e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3449  glutathione S-transferase domain-containing protein  38.35 
 
 		 203 aa  126  3e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.124589 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4868  glutathione S-transferase domain-containing protein  38.35 
 
 		 207 aa  125  5e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.895586  normal  0.31649 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4727  glutathione S-transferase, putative  36.1 
 
 		 209 aa  125  6e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.981894  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0335  glutathione S-transferase family protein  38.05 
 
 		 207 aa  124  1e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.213964 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0448  glutathione S-transferase, putative  36.59 
 
 		 204 aa  124  1e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0360  glutathione S-transferase domain-containing protein  38.05 
 
 		 207 aa  124  1e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.215038  normal  0.528653 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3279  putative glutathione S-transferase family protein  40.65 
 
 		 203 aa  123  2e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.970815  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2804  glutathione S-transferase-like protein  38.79 
 
 		 202 aa  122  5e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.719824  normal  0.515361 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7162  Glutathione S-transferase domain protein  37.5 
 
 		 200 aa  120  9.999999999999999e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6331  glutathione S-transferase domain-containing protein  37.98 
 
 		 200 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.295541  hitchhiker  0.00751047 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1835  Glutathione S-transferase domain protein  38.1 
 
 		 203 aa  117  7.999999999999999e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.583884  normal  0.161209 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0572  hypothetical protein  37.62 
 
 		 206 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2181  glutathione S-transferase domain-containing protein  38 
 
 		 204 aa  116  3e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.592473 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06120  hypothetical protein  37.62 
 
 		 206 aa  115  3e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.352199  decreased coverage  0.0055796 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2815  glutathione S-transferase-like  33.65 
 
 		 200 aa  115  5e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.370194 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1397  glutathione S-transferase  37.32 
 
 		 202 aa  115  6e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0064  glutathione S-transferase  37.38 
 
 		 202 aa  115  6e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.876217  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2729  glutathione S-transferase domain-containing protein  37.13 
 
 		 227 aa  114  6.9999999999999995e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0746  glutathione S-transferase family protein  34.8 
 
 		 198 aa  113  2.0000000000000002e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3637  Glutathione S-transferase domain protein  33.98 
 
 		 198 aa  113  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.455595 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3695  glutathione S-transferase domain-containing protein  33.98 
 
 		 198 aa  113  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0042182  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4086  glutathione S-transferase-like  36.89 
 
 		 205 aa  113  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3819  glutathione S-transferase domain-containing protein  33.98 
 
 		 198 aa  113  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.538317 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0810  glutathione S-transferase domain-containing protein  33.98 
 
 		 198 aa  113  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4913  Glutathione S-transferase domain  35.92 
 
 		 205 aa  112  3e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.413564  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0322  glutathione S-transferase-like  33.98 
 
 		 204 aa  112  5e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.672766 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0664  glutathione S-transferase family protein  32.34 
 
 		 200 aa  112  5e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0473248  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3271  glutathione S-transferase family protein  34.48 
 
 		 212 aa  110  1.0000000000000001e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0944  glutathione S-transferase domain-containing protein  35.96 
 
 		 197 aa  109  2.0000000000000002e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.148191  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1322  glutathione S-transferase-like protein  37.93 
 
 		 196 aa  107  9.000000000000001e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0363606  normal  0.491489 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4235  glutathione S-transferase-like protein  34.47 
 
 		 205 aa  107  1e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.814895 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>