219 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A3271 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007643  Rru_A3271  glutathione S-transferase family protein  100 
 
 
212 aa  422  1e-117  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1545  glutathione S-transferase domain-containing protein  47.03 
 
 
201 aa  159  2e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0116241 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3681  glutathione S-transferase domain-containing protein  42.29 
 
 
200 aa  160  2e-38  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3647  Glutathione S-transferase domain  46.57 
 
 
203 aa  157  1e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0997379 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6331  glutathione S-transferase domain-containing protein  45.54 
 
 
200 aa  153  1e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.295541  hitchhiker  0.00751047 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2111  glutathione S-transferase domain-containing protein  41.29 
 
 
199 aa  154  1e-36  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3449  glutathione S-transferase domain-containing protein  45.59 
 
 
203 aa  153  2e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.124589 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1878  glutathione S-transferase domain-containing protein  41.29 
 
 
200 aa  152  4e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.277157 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2167  glutathione S-transferase domain-containing protein  45.6 
 
 
199 aa  151  5.9999999999999996e-36  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.366461  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6155  Glutathione S-transferase domain protein  46.08 
 
 
205 aa  151  7e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3758  Glutathione S-transferase domain  45.59 
 
 
203 aa  151  8e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.177098  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7162  Glutathione S-transferase domain protein  44.55 
 
 
200 aa  149  2e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5192  glutathione S-transferase-like protein  41.55 
 
 
221 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.355066  normal  0.248772 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1835  Glutathione S-transferase domain protein  43.63 
 
 
203 aa  147  1.0000000000000001e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.583884  normal  0.161209 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4727  glutathione S-transferase, putative  39.81 
 
 
209 aa  144  8.000000000000001e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.981894  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0335  glutathione S-transferase family protein  42.08 
 
 
207 aa  142  3e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.213964 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0363  glutathione S-transferase domain-containing protein  41.58 
 
 
207 aa  142  3e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.115928 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0448  glutathione S-transferase, putative  39.6 
 
 
204 aa  142  4e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0226  glutathione S-transferase domain-containing protein  42.08 
 
 
201 aa  141  7e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0572  hypothetical protein  43.22 
 
 
206 aa  140  9.999999999999999e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06120  hypothetical protein  43.22 
 
 
206 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.352199  decreased coverage  0.0055796 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0360  glutathione S-transferase domain-containing protein  41.58 
 
 
207 aa  138  4.999999999999999e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.215038  normal  0.528653 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4868  glutathione S-transferase domain-containing protein  41 
 
 
207 aa  137  2e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.895586  normal  0.31649 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4324  Glutathione S-transferase domain protein  44.9 
 
 
202 aa  132  3e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2729  glutathione S-transferase domain-containing protein  43.09 
 
 
227 aa  131  6e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5879  Glutathione S-transferase domain protein  40.7 
 
 
201 aa  130  1.0000000000000001e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2181  glutathione S-transferase domain-containing protein  39.8 
 
 
204 aa  129  3e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.592473 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2804  glutathione S-transferase-like protein  42.08 
 
 
202 aa  128  6e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.719824  normal  0.515361 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3289  glutathione S-transferase  35.64 
 
 
202 aa  127  1.0000000000000001e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3883  Glutathione S-transferase domain protein  39.51 
 
 
203 aa  125  4.0000000000000003e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3623  putative glutathione S-transferase protein  37.86 
 
 
206 aa  123  3e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0893077  normal  0.362102 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3713  glutathione S-transferase domain-containing protein  40.5 
 
 
213 aa  122  4e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2815  glutathione S-transferase-like  38.12 
 
 
200 aa  122  4e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.370194 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0589  glutathione S-transferase domain-containing protein  36.59 
 
 
204 aa  122  5e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0615  glutathione S-transferase domain-containing protein  36.59 
 
 
203 aa  121  7e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.715776  normal  0.218032 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0171  glutathione S-transferase domain-containing protein  41.18 
 
 
200 aa  120  1.9999999999999998e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.627306 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3782  glutathione S-transferase-like protein  37.44 
 
 
204 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0663  glutathione S-transferase domain-containing protein  36.76 
 
 
205 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0212  glutathione S-transferase-like  36.76 
 
 
205 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0696  glutathione S-transferase domain-containing protein  36.76 
 
 
205 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2242  glutathione S-transferase-like protein  35.15 
 
 
202 aa  118  7.999999999999999e-26  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.025244  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3206  glutathione S-transferase, putative  35.12 
 
 
205 aa  117  9.999999999999999e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3279  putative glutathione S-transferase family protein  39.9 
 
 
203 aa  117  9.999999999999999e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.970815  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1204  glutathione S-transferase domain-containing protein  37.31 
 
 
204 aa  117  9.999999999999999e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0846  glutathione S-transferase  35.29 
 
 
202 aa  116  1.9999999999999998e-25  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.289081  normal  0.806951 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0322  glutathione S-transferase-like  36.89 
 
 
204 aa  116  3e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.672766 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4661  glutathione S-transferase-like  36.59 
 
 
204 aa  116  3e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.39586  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2688  glutathione S-transferase domain-containing protein  35.96 
 
 
204 aa  115  3.9999999999999997e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.761571  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4050  glutathione S-transferase-like  35.12 
 
 
204 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.767967  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1935  glutathione S-transferase-like protein  37.13 
 
 
201 aa  114  1.0000000000000001e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00060998  normal  0.487054 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2555  Glutathione S-transferase domain protein  35.96 
 
 
202 aa  113  2.0000000000000002e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.736156 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1397  glutathione S-transferase  39.71 
 
 
202 aa  113  2.0000000000000002e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2548  glutathione S-transferase domain-containing protein  35.32 
 
 
202 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.24256  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0064  glutathione S-transferase  39.71 
 
 
202 aa  113  2.0000000000000002e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.876217  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2116  glutathione S-transferase-like protein  34.16 
 
 
203 aa  112  3e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.489753  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1590  Glutathione S-transferase domain protein  40.2 
 
 
198 aa  113  3e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0806366 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3913  glutathione S-transferase domain-containing protein  37.5 
 
 
204 aa  112  4.0000000000000004e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0846475  normal  0.026606 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4668  glutathione S-transferase domain-containing protein  34.63 
 
 
204 aa  112  5e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4025  glutathione S-transferase domain-containing protein  36.59 
 
 
204 aa  112  6e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.638139  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2721  putative glutathione S-transferase protein  34.48 
 
 
202 aa  110  1.0000000000000001e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.199713 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2965  Glutathione S-transferase domain  35.47 
 
 
202 aa  110  1.0000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0319  glutathione S-transferase domain-containing protein  33.98 
 
 
206 aa  110  1.0000000000000001e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3336  Glutathione S-transferase domain  36.95 
 
 
204 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.287023  normal  0.088058 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2361  glutathione S-transferase  34.98 
 
 
203 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3398  glutathione S-transferase  34.98 
 
 
202 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1322  glutathione S-transferase-like protein  35.15 
 
 
196 aa  110  2.0000000000000002e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0363606  normal  0.491489 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0276  glutathione S-transferase  34.98 
 
 
202 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1137  glutathione S-transferase  34.98 
 
 
203 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3356  glutathione S-transferase family protein  34.98 
 
 
203 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3392  glutathione S-transferase family protein  34.98 
 
 
203 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2542  glutathione S-transferase  34.98 
 
 
203 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3375  Glutathione S-transferase domain protein  35.61 
 
 
204 aa  109  3e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3535  glutathione S-transferase domain-containing protein  38.05 
 
 
204 aa  109  4.0000000000000004e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1255  glutathione S-transferase  34.98 
 
 
203 aa  108  5e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1512  Glutathione S-transferase domain  33.66 
 
 
210 aa  108  5e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.553363 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4913  Glutathione S-transferase domain  34.6 
 
 
205 aa  108  6e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.413564  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0624  glutathione S-transferase  35.96 
 
 
206 aa  108  6e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.531247  normal  0.512939 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3228  glutathione S-transferase domain-containing protein  40.89 
 
 
202 aa  108  7.000000000000001e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.864486  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2820  glutathione S-transferase  35.78 
 
 
204 aa  106  2e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.294123  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0944  glutathione S-transferase domain-containing protein  36.32 
 
 
197 aa  106  2e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.148191  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0851  glutathione S-transferase domain-containing protein  35.58 
 
 
206 aa  107  2e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.451549 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1159  glutathione S-transferase domain-containing protein  34.15 
 
 
206 aa  107  2e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1795  glutathione S-transferase domain-containing protein  34.15 
 
 
221 aa  105  4e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.277101  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1084  glutathione S-transferase domain-containing protein  36.59 
 
 
215 aa  105  6e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2957  glutathione S-transferase-like protein  35.78 
 
 
204 aa  104  8e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0089  putative glutathione S-transferase  33.99 
 
 
201 aa  103  1e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0994  glutathione S-transferase domain-containing protein  36.95 
 
 
198 aa  103  1e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00317376 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5166  Glutathione S-transferase domain protein  33.17 
 
 
203 aa  103  2e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.699876  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0859  glutathione S-transferase domain-containing protein  35.47 
 
 
199 aa  102  3e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4086  glutathione S-transferase-like  34.8 
 
 
205 aa  101  8e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0356  Glutathione S-transferase domain  34.13 
 
 
200 aa  98.2  9e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.326677  normal  0.746823 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0177  glutathione S-transferase family protein  34.13 
 
 
200 aa  98.2  9e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1206  putative glutathione S-transferase  30.88 
 
 
204 aa  97.8  1e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4235  glutathione S-transferase-like protein  33.82 
 
 
205 aa  96.7  3e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.814895 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3229  glutathione S-transferase domain-containing protein  33 
 
 
198 aa  94.4  1e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0664  glutathione S-transferase family protein  33.85 
 
 
200 aa  94.4  1e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0473248  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0139  putative glutathione S-transferase  30.69 
 
 
202 aa  92.4  4e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1346  glutathione S-transferase-like  34.31 
 
 
204 aa  92  6e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.462561  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0785  glutathione S-transferase domain-containing protein  32.83 
 
 
202 aa  91.7  7e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.238617  normal  0.0753849 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3637  Glutathione S-transferase domain protein  32.5 
 
 
198 aa  90.9  1e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.455595 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>