267 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_3279 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009952  Dshi_3279  putative glutathione S-transferase family protein  100 
 
 
203 aa  409  1e-113  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.970815  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1397  glutathione S-transferase  58.21 
 
 
202 aa  229  1e-59  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0064  glutathione S-transferase  58.21 
 
 
202 aa  229  2e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.876217  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2804  glutathione S-transferase-like protein  58.71 
 
 
202 aa  228  5e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.719824  normal  0.515361 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0322  glutathione S-transferase-like  56 
 
 
204 aa  227  9e-59  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.672766 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2815  glutathione S-transferase-like  55 
 
 
200 aa  208  5e-53  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.370194 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0226  glutathione S-transferase domain-containing protein  49.76 
 
 
201 aa  171  5e-42  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0335  glutathione S-transferase family protein  45.32 
 
 
207 aa  167  1e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.213964 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0363  glutathione S-transferase domain-containing protein  45.32 
 
 
207 aa  166  2e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.115928 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1545  glutathione S-transferase domain-containing protein  49.76 
 
 
201 aa  164  9e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0116241 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0360  glutathione S-transferase domain-containing protein  44.83 
 
 
207 aa  163  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.215038  normal  0.528653 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4868  glutathione S-transferase domain-containing protein  44.39 
 
 
207 aa  163  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.895586  normal  0.31649 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5192  glutathione S-transferase-like protein  46.08 
 
 
221 aa  159  4e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.355066  normal  0.248772 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1835  Glutathione S-transferase domain protein  42.93 
 
 
203 aa  159  4e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.583884  normal  0.161209 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0572  hypothetical protein  47.06 
 
 
206 aa  154  1e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06120  hypothetical protein  46.04 
 
 
206 aa  152  2e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.352199  decreased coverage  0.0055796 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3647  Glutathione S-transferase domain  44.06 
 
 
203 aa  152  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0997379 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0448  glutathione S-transferase, putative  42.36 
 
 
204 aa  149  2e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4727  glutathione S-transferase, putative  43.63 
 
 
209 aa  148  6e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.981894  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3449  glutathione S-transferase domain-containing protein  42.08 
 
 
203 aa  145  3e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.124589 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1878  glutathione S-transferase domain-containing protein  42.65 
 
 
200 aa  145  3e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.277157 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3758  Glutathione S-transferase domain  42.44 
 
 
203 aa  145  6e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.177098  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3535  glutathione S-transferase domain-containing protein  43.14 
 
 
204 aa  142  4e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3681  glutathione S-transferase domain-containing protein  39.02 
 
 
200 aa  140  9.999999999999999e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6331  glutathione S-transferase domain-containing protein  43.07 
 
 
200 aa  138  3.9999999999999997e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.295541  hitchhiker  0.00751047 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7162  Glutathione S-transferase domain protein  42.08 
 
 
200 aa  135  5e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2167  glutathione S-transferase domain-containing protein  40.8 
 
 
199 aa  133  1.9999999999999998e-30  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.366461  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3228  glutathione S-transferase domain-containing protein  48.04 
 
 
202 aa  130  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.864486  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1346  glutathione S-transferase-like  38.92 
 
 
204 aa  129  4.0000000000000003e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.462561  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1795  glutathione S-transferase domain-containing protein  39.91 
 
 
221 aa  126  2.0000000000000002e-28  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.277101  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4661  glutathione S-transferase-like  40 
 
 
204 aa  126  2.0000000000000002e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.39586  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1512  Glutathione S-transferase domain  39.44 
 
 
210 aa  126  2.0000000000000002e-28  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.553363 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2729  glutathione S-transferase domain-containing protein  43.85 
 
 
227 aa  125  5e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0624  glutathione S-transferase  39.71 
 
 
206 aa  124  6e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.531247  normal  0.512939 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3336  Glutathione S-transferase domain  39.71 
 
 
204 aa  124  9e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.287023  normal  0.088058 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2111  glutathione S-transferase domain-containing protein  40.89 
 
 
199 aa  124  1e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2721  putative glutathione S-transferase protein  40.65 
 
 
202 aa  123  2e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.199713 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2181  glutathione S-transferase domain-containing protein  39.8 
 
 
204 aa  122  3e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.592473 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3913  glutathione S-transferase domain-containing protein  40 
 
 
204 aa  120  9.999999999999999e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0846475  normal  0.026606 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2361  glutathione S-transferase  36.54 
 
 
203 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1137  glutathione S-transferase  36.54 
 
 
203 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0785  glutathione S-transferase domain-containing protein  36.08 
 
 
202 aa  120  1.9999999999999998e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.238617  normal  0.0753849 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3392  glutathione S-transferase family protein  36.54 
 
 
203 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1255  glutathione S-transferase  37.02 
 
 
203 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3356  glutathione S-transferase family protein  36.54 
 
 
203 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2542  glutathione S-transferase  36.54 
 
 
203 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2965  Glutathione S-transferase domain  38.28 
 
 
202 aa  119  3e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3289  glutathione S-transferase  37.8 
 
 
202 aa  119  3.9999999999999996e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4668  glutathione S-transferase domain-containing protein  39.07 
 
 
204 aa  117  7.999999999999999e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3398  glutathione S-transferase  36.23 
 
 
202 aa  117  9e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0276  glutathione S-transferase  36.23 
 
 
202 aa  117  9e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6155  Glutathione S-transferase domain protein  37.25 
 
 
205 aa  117  9e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3623  putative glutathione S-transferase protein  40 
 
 
206 aa  117  9.999999999999999e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0893077  normal  0.362102 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3271  glutathione S-transferase family protein  39.9 
 
 
212 aa  117  9.999999999999999e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2688  glutathione S-transferase domain-containing protein  37.02 
 
 
204 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.761571  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0589  glutathione S-transferase domain-containing protein  36.71 
 
 
204 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2555  Glutathione S-transferase domain protein  37.8 
 
 
202 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.736156 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4025  glutathione S-transferase domain-containing protein  39.91 
 
 
204 aa  116  1.9999999999999998e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.638139  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0089  putative glutathione S-transferase  37.98 
 
 
201 aa  115  3e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0663  glutathione S-transferase domain-containing protein  37.68 
 
 
205 aa  115  3.9999999999999997e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0212  glutathione S-transferase-like  37.68 
 
 
205 aa  115  3.9999999999999997e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1590  Glutathione S-transferase domain protein  40.69 
 
 
198 aa  115  3.9999999999999997e-25  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0806366 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2548  glutathione S-transferase domain-containing protein  37.86 
 
 
202 aa  115  3.9999999999999997e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.24256  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0696  glutathione S-transferase domain-containing protein  37.68 
 
 
205 aa  115  3.9999999999999997e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0615  glutathione S-transferase domain-containing protein  36.41 
 
 
203 aa  115  5e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.715776  normal  0.218032 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0171  glutathione S-transferase domain-containing protein  40.19 
 
 
200 aa  115  6e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.627306 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3375  Glutathione S-transferase domain protein  38.97 
 
 
204 aa  115  6e-25  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0139  putative glutathione S-transferase  38.35 
 
 
202 aa  115  6e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4913  Glutathione S-transferase domain  36.27 
 
 
205 aa  114  7.999999999999999e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.413564  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3782  glutathione S-transferase-like protein  36.84 
 
 
204 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2116  glutathione S-transferase-like protein  37.85 
 
 
203 aa  113  2.0000000000000002e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.489753  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5166  Glutathione S-transferase domain protein  39.44 
 
 
203 aa  112  3e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.699876  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4086  glutathione S-transferase-like  34.63 
 
 
205 aa  112  3e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3884  putative glutathione S-transferase  37.5 
 
 
231 aa  112  3e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0796916  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2584  glutathione S-transferase domain-containing protein  37.5 
 
 
199 aa  112  5e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4007  putative glutathione S-transferase  37.56 
 
 
202 aa  111  6e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.228817 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3920  putative glutathione S-transferase  35.92 
 
 
202 aa  111  6e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.430255 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4963  putative glutathione S-transferase  35.92 
 
 
202 aa  111  6e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.805647  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4069  putative glutathione S-transferase  37.56 
 
 
202 aa  111  7.000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3962  putative glutathione S-transferase  37.56 
 
 
202 aa  111  7.000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.470719  normal  0.386103 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03447  predicted glutathione S-transferase  35.92 
 
 
202 aa  111  8.000000000000001e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0116  Glutathione S-transferase domain protein  35.92 
 
 
202 aa  111  8.000000000000001e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03398  hypothetical protein  35.92 
 
 
202 aa  111  8.000000000000001e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4007  putative glutathione S-transferase  35.92 
 
 
202 aa  111  8.000000000000001e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.6966  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3798  putative glutathione S-transferase  35.92 
 
 
202 aa  111  8.000000000000001e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.783281  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0121  putative glutathione S-transferase  35.92 
 
 
202 aa  111  8.000000000000001e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4090  putative glutathione S-transferase  35.92 
 
 
202 aa  111  8.000000000000001e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2242  glutathione S-transferase-like protein  38.71 
 
 
202 aa  111  9e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.025244  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2820  glutathione S-transferase  38.5 
 
 
204 aa  110  2.0000000000000002e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.294123  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4235  glutathione S-transferase-like protein  32.68 
 
 
205 aa  109  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.814895 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3898  putative glutathione S-transferase  37.56 
 
 
202 aa  110  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1159  glutathione S-transferase domain-containing protein  39.71 
 
 
206 aa  109  3e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0702  glutathione S-transferase family protein  36.46 
 
 
199 aa  108  7.000000000000001e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0693  glutathione S-transferase family protein  36.46 
 
 
199 aa  108  7.000000000000001e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4050  glutathione S-transferase-like  36.92 
 
 
204 aa  107  9.000000000000001e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.767967  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0846  glutathione S-transferase  34.6 
 
 
202 aa  106  3e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.289081  normal  0.806951 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1206  putative glutathione S-transferase  33.98 
 
 
204 aa  105  4e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0994  glutathione S-transferase domain-containing protein  34.45 
 
 
198 aa  104  9e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00317376 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1562  glutathione S-transferase related protein  35.6 
 
 
198 aa  104  9e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.572147  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3883  Glutathione S-transferase domain protein  37.14 
 
 
203 aa  102  3e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>