More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_0335 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_0335  glutathione S-transferase family protein  100 
 
 		 207 aa  423  1e-118  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.213964 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0360  glutathione S-transferase domain-containing protein  99.03 
 
 		 207 aa  418  1e-116  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.215038  normal  0.528653 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0363  glutathione S-transferase domain-containing protein  95.17 
 
 		 207 aa  404  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.115928 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4868  glutathione S-transferase domain-containing protein  91.71 
 
 		 207 aa  381  1e-105  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.895586  normal  0.31649 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06120  hypothetical protein  67.82 
 
 		 206 aa  281  4.0000000000000003e-75  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.352199  decreased coverage  0.0055796 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5192  glutathione S-transferase-like protein  65.85 
 
 		 221 aa  276  2e-73  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.355066  normal  0.248772 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0572  hypothetical protein  67.33 
 
 		 206 aa  274  7e-73  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4727  glutathione S-transferase, putative  63.05 
 
 		 209 aa  269  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.981894  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0448  glutathione S-transferase, putative  63.73 
 
 		 204 aa  268  5e-71  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1545  glutathione S-transferase domain-containing protein  50.5 
 
 		 201 aa  202  3e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0116241 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3647  Glutathione S-transferase domain  49.02 
 
 		 203 aa  182  4.0000000000000006e-45  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0997379 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3758  Glutathione S-transferase domain  48.53 
 
 		 203 aa  179  4e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.177098  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3449  glutathione S-transferase domain-containing protein  48.54 
 
 		 203 aa  177  8e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.124589 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0226  glutathione S-transferase domain-containing protein  47.06 
 
 		 201 aa  177  8e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3535  glutathione S-transferase domain-containing protein  47.09 
 
 		 204 aa  175  4e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1835  Glutathione S-transferase domain protein  46.04 
 
 		 203 aa  175  4e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.583884  normal  0.161209 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2815  glutathione S-transferase-like  47.03 
 
 		 200 aa  174  9.999999999999999e-43  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.370194 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3279  putative glutathione S-transferase family protein  45.32 
 
 		 203 aa  167  1e-40  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.970815  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7162  Glutathione S-transferase domain protein  46.04 
 
 		 200 aa  164  5.9999999999999996e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6331  glutathione S-transferase domain-containing protein  46.57 
 
 		 200 aa  164  5.9999999999999996e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.295541  hitchhiker  0.00751047 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0322  glutathione S-transferase-like  44.12 
 
 		 204 aa  162  4.0000000000000004e-39  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.672766 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3228  glutathione S-transferase domain-containing protein  46.53 
 
 		 202 aa  161  7e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.864486  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2181  glutathione S-transferase domain-containing protein  43.84 
 
 		 204 aa  159  3e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.592473 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2111  glutathione S-transferase domain-containing protein  43.63 
 
 		 199 aa  159  4e-38  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2804  glutathione S-transferase-like protein  47.37 
 
 		 202 aa  158  5e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.719824  normal  0.515361 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1397  glutathione S-transferase  45.89 
 
 		 202 aa  154  9e-37  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0064  glutathione S-transferase  45.89 
 
 		 202 aa  153  1e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.876217  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1878  glutathione S-transferase domain-containing protein  43.14 
 
 		 200 aa  154  1e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.277157 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2167  glutathione S-transferase domain-containing protein  41.79 
 
 		 199 aa  143  2e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.366461  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3271  glutathione S-transferase family protein  42.08 
 
 		 212 aa  142  3e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3681  glutathione S-transferase domain-containing protein  38.61 
 
 		 200 aa  138  4.999999999999999e-32  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5879  Glutathione S-transferase domain protein  42.86 
 
 		 201 aa  136  2e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6155  Glutathione S-transferase domain protein  40 
 
 		 205 aa  135  3.0000000000000003e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1346  glutathione S-transferase-like  38.42 
 
 		 204 aa  131  6e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.462561  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1206  putative glutathione S-transferase  33.33 
 
 		 204 aa  129  3e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4235  glutathione S-transferase-like protein  35.29 
 
 		 205 aa  129  4.0000000000000003e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.814895 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2548  glutathione S-transferase domain-containing protein  38.92 
 
 		 202 aa  128  6e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.24256  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4086  glutathione S-transferase-like  35.78 
 
 		 205 aa  128  7.000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2965  Glutathione S-transferase domain  39.02 
 
 		 202 aa  126  2.0000000000000002e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2721  putative glutathione S-transferase protein  38.05 
 
 		 202 aa  124  1e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.199713 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2555  Glutathione S-transferase domain protein  38.54 
 
 		 202 aa  123  2e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.736156 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4913  Glutathione S-transferase domain  33.01 
 
 		 205 aa  123  2e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.413564  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0589  glutathione S-transferase domain-containing protein  36.71 
 
 		 204 aa  122  3e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2361  glutathione S-transferase  36.59 
 
 		 203 aa  121  8e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1137  glutathione S-transferase  36.59 
 
 		 203 aa  121  8e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3398  glutathione S-transferase  36.59 
 
 		 202 aa  121  8e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2542  glutathione S-transferase  36.59 
 
 		 203 aa  121  8e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0276  glutathione S-transferase  36.59 
 
 		 202 aa  121  8e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3392  glutathione S-transferase family protein  36.59 
 
 		 203 aa  121  8e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3356  glutathione S-transferase family protein  36.59 
 
 		 203 aa  121  8e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0615  glutathione S-transferase domain-containing protein  36.23 
 
 		 203 aa  121  9e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.715776  normal  0.218032 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2688  glutathione S-transferase domain-containing protein  36.1 
 
 		 204 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.761571  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1255  glutathione S-transferase  36.1 
 
 		 203 aa  119  3e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4661  glutathione S-transferase-like  37.98 
 
 		 204 aa  118  4.9999999999999996e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.39586  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0624  glutathione S-transferase  35.89 
 
 		 206 aa  118  7e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.531247  normal  0.512939 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0663  glutathione S-transferase domain-containing protein  35.12 
 
 		 205 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0212  glutathione S-transferase-like  35.12 
 
 		 205 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0696  glutathione S-transferase domain-containing protein  35.12 
 
 		 205 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0171  glutathione S-transferase domain-containing protein  42.72 
 
 		 200 aa  116  1.9999999999999998e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.627306 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3913  glutathione S-transferase domain-containing protein  37.44 
 
 		 204 aa  116  1.9999999999999998e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0846475  normal  0.026606 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1512  Glutathione S-transferase domain  34.76 
 
 		 210 aa  117  1.9999999999999998e-25  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.553363 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1204  glutathione S-transferase domain-containing protein  35.32 
 
 		 204 aa  116  1.9999999999999998e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3782  glutathione S-transferase-like protein  35.12 
 
 		 204 aa  115  3.9999999999999997e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3336  Glutathione S-transferase domain  35.61 
 
 		 204 aa  115  3.9999999999999997e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.287023  normal  0.088058 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2116  glutathione S-transferase-like protein  37.98 
 
 		 203 aa  115  3.9999999999999997e-25  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.489753  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2820  glutathione S-transferase  37.5 
 
 		 204 aa  114  1.0000000000000001e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.294123  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2729  glutathione S-transferase domain-containing protein  37.56 
 
 		 227 aa  112  3e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0846  glutathione S-transferase  37.98 
 
 		 202 aa  112  4.0000000000000004e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.289081  normal  0.806951 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0139  putative glutathione S-transferase  36.27 
 
 		 202 aa  111  6e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0319  glutathione S-transferase domain-containing protein  35.27 
 
 		 206 aa  110  1.0000000000000001e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5166  Glutathione S-transferase domain protein  36.23 
 
 		 203 aa  109  2.0000000000000002e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.699876  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3289  glutathione S-transferase  35.12 
 
 		 202 aa  110  2.0000000000000002e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3623  putative glutathione S-transferase protein  36.71 
 
 		 206 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0893077  normal  0.362102 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1590  Glutathione S-transferase domain protein  40 
 
 		 198 aa  109  3e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0806366 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1159  glutathione S-transferase domain-containing protein  37.68 
 
 		 206 aa  108  4.0000000000000004e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0851  glutathione S-transferase domain-containing protein  36.23 
 
 		 206 aa  107  9.000000000000001e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.451549 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4007  putative glutathione S-transferase  37.02 
 
 		 202 aa  107  9.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.228817 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1795  glutathione S-transferase domain-containing protein  34.62 
 
 		 221 aa  107  1e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.277101  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4963  putative glutathione S-transferase  35.1 
 
 		 202 aa  106  2e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.805647  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3898  putative glutathione S-transferase  36.54 
 
 		 202 aa  106  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3920  putative glutathione S-transferase  34.8 
 
 		 202 aa  106  2e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.430255 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3884  putative glutathione S-transferase  36.54 
 
 		 231 aa  107  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0796916  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4069  putative glutathione S-transferase  36.54 
 
 		 202 aa  106  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03447  predicted glutathione S-transferase  35.1 
 
 		 202 aa  105  4e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0116  Glutathione S-transferase domain protein  35.1 
 
 		 202 aa  105  4e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3798  putative glutathione S-transferase  35.1 
 
 		 202 aa  105  4e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.783281  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0121  putative glutathione S-transferase  35.1 
 
 		 202 aa  105  4e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4007  putative glutathione S-transferase  35.1 
 
 		 202 aa  105  4e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.6966  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4668  glutathione S-transferase domain-containing protein  34.13 
 
 		 204 aa  105  4e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4090  putative glutathione S-transferase  35.1 
 
 		 202 aa  105  4e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3962  putative glutathione S-transferase  36.54 
 
 		 202 aa  105  4e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.470719  normal  0.386103 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03398  hypothetical protein  35.1 
 
 		 202 aa  105  4e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2957  glutathione S-transferase-like protein  35.12 
 
 		 204 aa  105  6e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0944  glutathione S-transferase domain-containing protein  33.66 
 
 		 197 aa  104  9e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.148191  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4025  glutathione S-transferase domain-containing protein  35.27 
 
 		 204 aa  103  2e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.638139  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0785  glutathione S-transferase domain-containing protein  34.2 
 
 		 202 aa  102  4e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.238617  normal  0.0753849 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4324  Glutathione S-transferase domain protein  36.32 
 
 		 202 aa  102  5e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3375  Glutathione S-transferase domain protein  34.3 
 
 		 204 aa  101  7e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3883  Glutathione S-transferase domain protein  36.23 
 
 		 203 aa  100  2e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0859  glutathione S-transferase domain-containing protein  33.33 
 
 		 199 aa  100  2e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>