More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_0846 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007404  Tbd_0846  glutathione S-transferase  100 
 
 
202 aa  413  1e-114  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.289081  normal  0.806951 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2242  glutathione S-transferase-like protein  54 
 
 
202 aa  230  1e-59  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.025244  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2688  glutathione S-transferase domain-containing protein  55.72 
 
 
204 aa  225  3e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.761571  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3782  glutathione S-transferase-like protein  55.72 
 
 
204 aa  224  6e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0589  glutathione S-transferase domain-containing protein  55.17 
 
 
204 aa  224  9e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0615  glutathione S-transferase domain-containing protein  55.17 
 
 
203 aa  223  1e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.715776  normal  0.218032 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3289  glutathione S-transferase  53.5 
 
 
202 aa  221  4.9999999999999996e-57  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0624  glutathione S-transferase  54.95 
 
 
206 aa  221  4.9999999999999996e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.531247  normal  0.512939 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0696  glutathione S-transferase domain-containing protein  55.22 
 
 
205 aa  221  7e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0212  glutathione S-transferase-like  55.22 
 
 
205 aa  221  7e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0663  glutathione S-transferase domain-containing protein  55.22 
 
 
205 aa  221  7e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3336  Glutathione S-transferase domain  55.22 
 
 
204 aa  220  9.999999999999999e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.287023  normal  0.088058 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1255  glutathione S-transferase  53.23 
 
 
203 aa  219  3e-56  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3356  glutathione S-transferase family protein  53.23 
 
 
203 aa  218  3.9999999999999997e-56  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2361  glutathione S-transferase  53.23 
 
 
203 aa  218  3.9999999999999997e-56  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1137  glutathione S-transferase  53.23 
 
 
203 aa  218  3.9999999999999997e-56  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3398  glutathione S-transferase  53.23 
 
 
202 aa  218  3.9999999999999997e-56  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2542  glutathione S-transferase  53.23 
 
 
203 aa  218  3.9999999999999997e-56  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0276  glutathione S-transferase  53.23 
 
 
202 aa  218  3.9999999999999997e-56  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3392  glutathione S-transferase family protein  53.23 
 
 
203 aa  218  3.9999999999999997e-56  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2965  Glutathione S-transferase domain  52.24 
 
 
202 aa  214  9e-55  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2548  glutathione S-transferase domain-containing protein  51.76 
 
 
202 aa  213  9.999999999999999e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.24256  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2721  putative glutathione S-transferase protein  52.24 
 
 
202 aa  213  1.9999999999999998e-54  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.199713 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1512  Glutathione S-transferase domain  50.25 
 
 
210 aa  211  7e-54  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.553363 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2555  Glutathione S-transferase domain protein  51.74 
 
 
202 aa  211  7.999999999999999e-54  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.736156 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5166  Glutathione S-transferase domain protein  52.71 
 
 
203 aa  209  2e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.699876  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3623  putative glutathione S-transferase protein  52.22 
 
 
206 aa  207  8e-53  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0893077  normal  0.362102 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1795  glutathione S-transferase domain-containing protein  49.75 
 
 
221 aa  205  5e-52  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.277101  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4668  glutathione S-transferase domain-containing protein  51.72 
 
 
204 aa  203  1e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1159  glutathione S-transferase domain-containing protein  50.74 
 
 
206 aa  202  2e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4050  glutathione S-transferase-like  52.94 
 
 
204 aa  203  2e-51  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.767967  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2820  glutathione S-transferase  53.73 
 
 
204 aa  201  7e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.294123  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0319  glutathione S-transferase domain-containing protein  51.23 
 
 
206 aa  199  1.9999999999999998e-50  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4661  glutathione S-transferase-like  49.75 
 
 
204 aa  198  3.9999999999999996e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.39586  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4025  glutathione S-transferase domain-containing protein  50.74 
 
 
204 aa  194  7e-49  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.638139  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3375  Glutathione S-transferase domain protein  50.74 
 
 
204 aa  194  9e-49  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3913  glutathione S-transferase domain-containing protein  51.01 
 
 
204 aa  193  1e-48  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0846475  normal  0.026606 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2116  glutathione S-transferase-like protein  48.76 
 
 
203 aa  193  1e-48  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.489753  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0851  glutathione S-transferase domain-containing protein  52.22 
 
 
206 aa  193  1e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.451549 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2957  glutathione S-transferase-like protein  51.24 
 
 
204 aa  186  2e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3883  Glutathione S-transferase domain protein  45.54 
 
 
203 aa  180  1e-44  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1084  glutathione S-transferase domain-containing protein  43.28 
 
 
215 aa  171  9e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0089  putative glutathione S-transferase  45.5 
 
 
201 aa  165  4e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0139  putative glutathione S-transferase  39.5 
 
 
202 aa  135  4e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1545  glutathione S-transferase domain-containing protein  40.98 
 
 
201 aa  134  6.0000000000000005e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0116241 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0226  glutathione S-transferase domain-containing protein  39.32 
 
 
201 aa  130  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3681  glutathione S-transferase domain-containing protein  39.6 
 
 
200 aa  130  1.0000000000000001e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03447  predicted glutathione S-transferase  37.5 
 
 
202 aa  129  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0116  Glutathione S-transferase domain protein  37.5 
 
 
202 aa  129  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4007  putative glutathione S-transferase  37.5 
 
 
202 aa  129  2.0000000000000002e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.6966  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0121  putative glutathione S-transferase  37.5 
 
 
202 aa  129  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3798  putative glutathione S-transferase  37.5 
 
 
202 aa  129  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.783281  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4090  putative glutathione S-transferase  37.5 
 
 
202 aa  129  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3920  putative glutathione S-transferase  37.5 
 
 
202 aa  130  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.430255 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4963  putative glutathione S-transferase  37.5 
 
 
202 aa  130  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.805647  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03398  hypothetical protein  37.5 
 
 
202 aa  129  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4007  putative glutathione S-transferase  38.97 
 
 
202 aa  127  9.000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.228817 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3884  putative glutathione S-transferase  38.46 
 
 
231 aa  127  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0796916  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3898  putative glutathione S-transferase  38.46 
 
 
202 aa  126  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4069  putative glutathione S-transferase  38.46 
 
 
202 aa  126  3e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3962  putative glutathione S-transferase  38.46 
 
 
202 aa  125  4.0000000000000003e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.470719  normal  0.386103 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1878  glutathione S-transferase domain-containing protein  36.06 
 
 
200 aa  124  7e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.277157 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1835  Glutathione S-transferase domain protein  37.5 
 
 
203 aa  120  9.999999999999999e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.583884  normal  0.161209 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7162  Glutathione S-transferase domain protein  36.1 
 
 
200 aa  120  9.999999999999999e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3535  glutathione S-transferase domain-containing protein  36.23 
 
 
204 aa  118  4.9999999999999996e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6331  glutathione S-transferase domain-containing protein  36.89 
 
 
200 aa  118  6e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.295541  hitchhiker  0.00751047 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2167  glutathione S-transferase domain-containing protein  36.84 
 
 
199 aa  118  6e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.366461  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5192  glutathione S-transferase-like protein  36.06 
 
 
221 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.355066  normal  0.248772 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0356  Glutathione S-transferase domain  34.31 
 
 
200 aa  116  1.9999999999999998e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.326677  normal  0.746823 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2729  glutathione S-transferase domain-containing protein  36.59 
 
 
227 aa  117  1.9999999999999998e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3271  glutathione S-transferase family protein  35.29 
 
 
212 aa  116  1.9999999999999998e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0177  glutathione S-transferase family protein  34.31 
 
 
200 aa  116  1.9999999999999998e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0335  glutathione S-transferase family protein  37.98 
 
 
207 aa  112  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.213964 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0363  glutathione S-transferase domain-containing protein  37.5 
 
 
207 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.115928 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3647  Glutathione S-transferase domain  36.67 
 
 
203 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0997379 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1397  glutathione S-transferase  36.84 
 
 
202 aa  107  1e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0360  glutathione S-transferase domain-containing protein  37.5 
 
 
207 aa  107  1e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.215038  normal  0.528653 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0064  glutathione S-transferase  36.84 
 
 
202 aa  107  1e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.876217  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1322  glutathione S-transferase-like protein  33.82 
 
 
196 aa  107  1e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0363606  normal  0.491489 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3449  glutathione S-transferase domain-containing protein  36.67 
 
 
203 aa  107  2e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.124589 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3279  putative glutathione S-transferase family protein  34.6 
 
 
203 aa  106  3e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.970815  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4727  glutathione S-transferase, putative  33.98 
 
 
209 aa  105  6e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.981894  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0448  glutathione S-transferase, putative  34.91 
 
 
204 aa  104  9e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0322  glutathione S-transferase-like  33.01 
 
 
204 aa  104  9e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.672766 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2804  glutathione S-transferase-like protein  36.49 
 
 
202 aa  103  1e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.719824  normal  0.515361 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4868  glutathione S-transferase domain-containing protein  35.92 
 
 
207 aa  103  1e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.895586  normal  0.31649 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3758  Glutathione S-transferase domain  35.71 
 
 
203 aa  104  1e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.177098  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6155  Glutathione S-transferase domain protein  35.92 
 
 
205 aa  102  5e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1590  Glutathione S-transferase domain protein  38.38 
 
 
198 aa  101  6e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0806366 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2111  glutathione S-transferase domain-containing protein  34.57 
 
 
199 aa  101  8e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4913  Glutathione S-transferase domain  30.92 
 
 
205 aa  100  1e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.413564  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4086  glutathione S-transferase-like  31.71 
 
 
205 aa  99.8  2e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1346  glutathione S-transferase-like  32.85 
 
 
204 aa  99.8  3e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.462561  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2815  glutathione S-transferase-like  32.85 
 
 
200 aa  99.4  4e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.370194 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3206  glutathione S-transferase, putative  32.68 
 
 
205 aa  98.6  5e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2181  glutathione S-transferase domain-containing protein  34.31 
 
 
204 aa  97.8  1e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.592473 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5879  Glutathione S-transferase domain protein  35.5 
 
 
201 aa  97.1  2e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06120  hypothetical protein  33.5 
 
 
206 aa  96.7  2e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.352199  decreased coverage  0.0055796 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0572  hypothetical protein  33 
 
 
206 aa  96.3  3e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4235  glutathione S-transferase-like protein  31.07 
 
 
205 aa  95.5  4e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.814895 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>