More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_2142 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008048  Sala_2142  glutathione S-transferase-like protein  100 
 
 
223 aa  464  9.999999999999999e-131  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.142397  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3080  glutathione S-transferase-like  72.07 
 
 
223 aa  333  1e-90  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4722  glutathione S-transferase domain-containing protein  67.26 
 
 
223 aa  325  3e-88  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.247027  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2825  glutathione S-transferase-like  45.74 
 
 
221 aa  214  8e-55  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0500  Glutathione S-transferase domain  47.98 
 
 
222 aa  214  9.999999999999999e-55  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0342057 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0275  glutathione S-transferase-like  46.19 
 
 
221 aa  211  4.9999999999999996e-54  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0888177 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0022  glutathione S-transferase-like protein  46.64 
 
 
222 aa  209  3e-53  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.428941  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1977  glutathione S-transferase domain-containing protein  46.64 
 
 
222 aa  209  4e-53  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.290176  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2805  glutathione S-transferase domain-containing protein  45.74 
 
 
225 aa  206  2e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.383982  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2783  glutathione S-transferase domain-containing protein  44.84 
 
 
225 aa  204  8e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD1058  glutathione S-transferase family protein  43.89 
 
 
217 aa  202  3e-51  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.407682  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3308  glutathione S-transferase  44.39 
 
 
221 aa  197  7.999999999999999e-50  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0117  glutathione S-transferase-like protein  46.22 
 
 
225 aa  197  1.0000000000000001e-49  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.851725  normal  0.725895 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3133  glutathione S-transferase domain-containing protein  45.45 
 
 
230 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.05587  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1144  glutathione S-transferase  45.93 
 
 
241 aa  194  1e-48  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2289  glutathione S-transferase domain-containing protein  42.53 
 
 
252 aa  192  2e-48  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.497964  normal  0.298446 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2343  Glutathione S-transferase domain  45.45 
 
 
230 aa  192  3e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.77446  normal  0.656048 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4945  glutathione S-transferase domain-containing protein  45.95 
 
 
232 aa  192  3e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.25103 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0439  glutathione S-transferase-like  43.72 
 
 
230 aa  192  3e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1808  glutathione S-transferase domain-containing protein  45.61 
 
 
280 aa  190  2e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0584047  normal  0.113332 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2386  glutathione S-transferase domain-containing protein  45.02 
 
 
230 aa  188  5.999999999999999e-47  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.10495  normal  0.984704 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0847  glutathione S-transferase family protein  39.37 
 
 
221 aa  188  5.999999999999999e-47  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.33451  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2663  Glutathione S-transferase domain  45.02 
 
 
230 aa  188  5.999999999999999e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.657394  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0662  glutathione S-transferase-like protein  43.72 
 
 
230 aa  186  3e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.165169 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0171  glutathione S-transferase-like  44.4 
 
 
230 aa  186  3e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0044  Glutathione S-transferase domain  42.42 
 
 
230 aa  184  9e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0241  glutathione S- transferase, N-terminal  38.91 
 
 
225 aa  184  1.0000000000000001e-45  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0164  glutathione S-transferase  42.67 
 
 
230 aa  182  3e-45  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3681  Glutathione S-transferase domain protein  44.16 
 
 
230 aa  182  4.0000000000000006e-45  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.158502 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0199  glutathione S-transferase domain-containing protein  44.49 
 
 
226 aa  181  5.0000000000000004e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0222  putative glutathione S-transferase family protein  41.81 
 
 
230 aa  179  2.9999999999999997e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0185  glutathione S-transferase-like  41.81 
 
 
230 aa  179  4e-44  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4320  Glutathione S-transferase domain  45.02 
 
 
230 aa  177  8e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4583  Glutathione S-transferase domain protein  45.02 
 
 
230 aa  177  9e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.293882 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1050  glutathione S-transferase  42.86 
 
 
230 aa  177  9e-44  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.087398  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0341  glutathione S-transferase  45.45 
 
 
230 aa  177  1e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.575191  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0214  glutathione S-transferase domain-containing protein  47.19 
 
 
230 aa  177  2e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.163491  normal  0.307378 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1338  glutathione S-transferase domain-containing protein  43.29 
 
 
230 aa  174  9e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3535  glutathione S-transferase domain-containing protein  45.92 
 
 
230 aa  174  9.999999999999999e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3313  glutathione S-transferase domain-containing protein  43.29 
 
 
229 aa  172  2.9999999999999996e-42  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.03107  normal  0.604378 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5423  Glutathione S-transferase domain protein  45.45 
 
 
230 aa  171  5.999999999999999e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.361864  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0982  glutathione S-transferase family protein  42.86 
 
 
230 aa  168  5e-41  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1044  glutathione S-transferase family protein  42.86 
 
 
230 aa  167  1e-40  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3599  glutathione S-transferase-like  42.61 
 
 
229 aa  149  4e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1914  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.48 
 
 
220 aa  87.8  1e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0652856  normal  0.568324 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27580  putative glutathione S-transferase  29.9 
 
 
220 aa  82.4  0.000000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.08808  decreased coverage  0.00115097 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2334  glutathione S-transferase  30.39 
 
 
220 aa  82.4  0.000000000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0381359  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2890  glutathione S-transferase-like  28.97 
 
 
215 aa  77.8  0.0000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6850  Glutathione S-transferase domain protein  26.76 
 
 
213 aa  76.6  0.0000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.226481 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0557  glutathione S-transferase domain-containing protein  25 
 
 
221 aa  75.1  0.0000000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3323  glutathione S-transferase domain-containing protein  29.41 
 
 
227 aa  75.1  0.0000000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0187385  normal  0.129432 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2721  putative glutathione S-transferase protein  29.02 
 
 
202 aa  74.3  0.000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.199713 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3289  glutathione S-transferase  26.94 
 
 
202 aa  73.2  0.000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0846  glutathione S-transferase  29.9 
 
 
202 aa  73.6  0.000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.289081  normal  0.806951 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2555  Glutathione S-transferase domain protein  28.93 
 
 
202 aa  72.8  0.000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.736156 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2965  Glutathione S-transferase domain  28.93 
 
 
202 aa  72.8  0.000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3883  Glutathione S-transferase domain protein  29.38 
 
 
203 aa  71.2  0.00000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3821  Glutathione S-transferase domain  27.94 
 
 
203 aa  69.3  0.00000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.563101  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3623  Glutathione S-transferase domain  29.59 
 
 
211 aa  68.9  0.00000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2548  glutathione S-transferase domain-containing protein  27.98 
 
 
202 aa  68.6  0.00000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.24256  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49100  glutathione S-transferase  31.12 
 
 
209 aa  68.6  0.00000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000404937 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4952  Glutathione S-transferase domain  28.1 
 
 
208 aa  67.8  0.0000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.624143  normal  0.246161 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3693  glutathione S-transferase domain-containing protein  25.45 
 
 
203 aa  67.8  0.0000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.986206 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5366  Glutathione S-transferase domain protein  30.33 
 
 
207 aa  67  0.0000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.230494  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0089  putative glutathione S-transferase  29.52 
 
 
201 aa  67  0.0000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0716  glutathione S-transferase domain-containing protein  25.12 
 
 
203 aa  67  0.0000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.258047 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1203  Glutathione S-transferase domain protein  25.58 
 
 
203 aa  67.4  0.0000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5500  glutathione S-transferase domain-containing protein  25.45 
 
 
203 aa  67.4  0.0000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.212095 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2088  glutathione S-transferase-like protein  28.64 
 
 
216 aa  67  0.0000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.828063  normal  0.835222 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3932  glutathione S-transferase domain-containing protein  25.58 
 
 
203 aa  67  0.0000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.336565 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2295  Glutathione S-transferase domain protein  28.1 
 
 
228 aa  66.6  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.902832 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0296  glutathione S-transferase-like protein  32.08 
 
 
214 aa  66.6  0.0000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.351442  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0792  glutathione S-transferase domain-containing protein  25.45 
 
 
203 aa  66.6  0.0000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.654502  normal  0.227233 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0755  Glutathione S-transferase domain protein  25.45 
 
 
203 aa  66.6  0.0000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4194  glutathione S-transferase  28.79 
 
 
209 aa  66.2  0.0000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.718748  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3532  Glutathione S-transferase domain protein  25.49 
 
 
217 aa  65.9  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.150118 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1878  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.03 
 
 
200 aa  65.9  0.0000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.277157 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3102  glutathione S-transferase domain-containing protein  27.72 
 
 
205 aa  65.1  0.0000000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.480753  normal  0.323994 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2820  glutathione S-transferase  27.54 
 
 
204 aa  64.7  0.000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.294123  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2967  glutathione S-transferase-like  25.12 
 
 
203 aa  64.7  0.000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.191887  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4050  glutathione S-transferase-like  25.64 
 
 
204 aa  64.7  0.000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.767967  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4617  glutathione S-transferase domain-containing protein  26.24 
 
 
194 aa  64.7  0.000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.236523  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0824  glutathione S-transferase-like  25.12 
 
 
203 aa  64.7  0.000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.317861  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5058  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.92 
 
 
207 aa  64.7  0.000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000892035 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03447  predicted glutathione S-transferase  31.14 
 
 
202 aa  63.5  0.000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0116  Glutathione S-transferase domain protein  31.14 
 
 
202 aa  63.5  0.000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3798  putative glutathione S-transferase  31.14 
 
 
202 aa  63.5  0.000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.783281  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4007  putative glutathione S-transferase  31.14 
 
 
202 aa  63.5  0.000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.6966  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3634  glutathione S-transferase domain protein  28.24 
 
 
219 aa  63.9  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0121  putative glutathione S-transferase  31.14 
 
 
202 aa  63.5  0.000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03398  hypothetical protein  31.14 
 
 
202 aa  63.5  0.000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6309  glutathione S-transferase domain-containing protein  26.81 
 
 
267 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4963  putative glutathione S-transferase  31.14 
 
 
202 aa  63.9  0.000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.805647  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0809  Glutathione S-transferase domain protein  27.36 
 
 
224 aa  63.9  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.803645  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3920  putative glutathione S-transferase  31.14 
 
 
202 aa  63.9  0.000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.430255 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4090  putative glutathione S-transferase  31.14 
 
 
202 aa  63.5  0.000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1196  glutathione S-transferase domain-containing protein  26.83 
 
 
209 aa  63.5  0.000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2474  Glutathione S-transferase domain protein  28.24 
 
 
219 aa  62.8  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2451  Glutathione S-transferase domain protein  27.62 
 
 
224 aa  62.4  0.000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00188128  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5417  glutathione S-transferase domain-containing protein  27.31 
 
 
214 aa  62.4  0.000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.556283  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>