More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_0341 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011989  Avi_0341  glutathione S-transferase  100 
 
 
230 aa  473  1e-133  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.575191  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4583  Glutathione S-transferase domain protein  83.04 
 
 
230 aa  415  9.999999999999999e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.293882 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4320  Glutathione S-transferase domain  83.04 
 
 
230 aa  416  9.999999999999999e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3535  glutathione S-transferase domain-containing protein  83.04 
 
 
230 aa  395  1e-109  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1338  glutathione S-transferase domain-containing protein  65.22 
 
 
230 aa  322  2e-87  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1044  glutathione S-transferase family protein  65.65 
 
 
230 aa  317  1e-85  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0982  glutathione S-transferase family protein  65.22 
 
 
230 aa  314  6e-85  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1050  glutathione S-transferase  57.83 
 
 
230 aa  299  3e-80  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.087398  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3599  glutathione S-transferase-like  60 
 
 
229 aa  266  2e-70  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3133  glutathione S-transferase domain-containing protein  50.87 
 
 
230 aa  251  5.000000000000001e-66  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.05587  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2343  Glutathione S-transferase domain  51.74 
 
 
230 aa  251  9.000000000000001e-66  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.77446  normal  0.656048 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2663  Glutathione S-transferase domain  51.74 
 
 
230 aa  250  1e-65  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.657394  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2386  glutathione S-transferase domain-containing protein  51.74 
 
 
230 aa  250  1e-65  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.10495  normal  0.984704 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1808  glutathione S-transferase domain-containing protein  51.54 
 
 
280 aa  247  8e-65  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0584047  normal  0.113332 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3681  Glutathione S-transferase domain protein  51.74 
 
 
230 aa  246  1e-64  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.158502 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3313  glutathione S-transferase domain-containing protein  52.61 
 
 
229 aa  246  2e-64  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.03107  normal  0.604378 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0662  glutathione S-transferase-like protein  51.3 
 
 
230 aa  240  1e-62  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.165169 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0164  glutathione S-transferase  49.57 
 
 
230 aa  239  2.9999999999999997e-62  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0185  glutathione S-transferase-like  49.13 
 
 
230 aa  239  2.9999999999999997e-62  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0171  glutathione S-transferase-like  50.43 
 
 
230 aa  238  6.999999999999999e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0214  glutathione S-transferase domain-containing protein  53.91 
 
 
230 aa  237  1e-61  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.163491  normal  0.307378 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0044  Glutathione S-transferase domain  50.43 
 
 
230 aa  237  1e-61  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0222  putative glutathione S-transferase family protein  50.43 
 
 
230 aa  235  5.0000000000000005e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5423  Glutathione S-transferase domain protein  53.04 
 
 
230 aa  234  7e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.361864  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0439  glutathione S-transferase-like  50.87 
 
 
230 aa  233  2.0000000000000002e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0500  Glutathione S-transferase domain  46.09 
 
 
222 aa  205  4e-52  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0342057 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0199  glutathione S-transferase domain-containing protein  47.83 
 
 
226 aa  202  3e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0022  glutathione S-transferase-like protein  43.91 
 
 
222 aa  199  1.9999999999999998e-50  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.428941  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0275  glutathione S-transferase-like  43.48 
 
 
221 aa  192  3e-48  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0888177 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1977  glutathione S-transferase domain-containing protein  43.91 
 
 
222 aa  191  7e-48  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.290176  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2825  glutathione S-transferase-like  43.91 
 
 
221 aa  190  1e-47  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD1058  glutathione S-transferase family protein  38.77 
 
 
217 aa  181  9.000000000000001e-45  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.407682  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2805  glutathione S-transferase domain-containing protein  42.61 
 
 
225 aa  180  1e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.383982  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2783  glutathione S-transferase domain-containing protein  41.3 
 
 
225 aa  179  4e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2142  glutathione S-transferase-like protein  45.45 
 
 
223 aa  177  2e-43  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.142397  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4945  glutathione S-transferase domain-containing protein  44.59 
 
 
232 aa  175  6e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.25103 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3308  glutathione S-transferase  41.74 
 
 
221 aa  175  7e-43  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2289  glutathione S-transferase domain-containing protein  40.53 
 
 
252 aa  167  1e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.497964  normal  0.298446 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1144  glutathione S-transferase  41.55 
 
 
241 aa  166  2e-40  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0117  glutathione S-transferase-like protein  41.2 
 
 
225 aa  166  2.9999999999999998e-40  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.851725  normal  0.725895 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0847  glutathione S-transferase family protein  34.35 
 
 
221 aa  161  8.000000000000001e-39  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.33451  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3080  glutathione S-transferase-like  43.48 
 
 
223 aa  161  1e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4722  glutathione S-transferase domain-containing protein  42.42 
 
 
223 aa  160  1e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.247027  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0241  glutathione S- transferase, N-terminal  33.48 
 
 
225 aa  153  2.9999999999999998e-36  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1914  glutathione S-transferase domain-containing protein  27.15 
 
 
220 aa  77  0.0000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0652856  normal  0.568324 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2334  glutathione S-transferase  29.02 
 
 
220 aa  75.9  0.0000000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0381359  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3314  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.75 
 
 
248 aa  72.8  0.000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.443514  normal  0.158342 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0183  glutathione S-transferase-like protein  29.49 
 
 
219 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.220885 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5390  glutathione S-transferase-like  30.28 
 
 
219 aa  67  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.602647  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5471  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.28 
 
 
219 aa  67  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.375006 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4798  glutathione S-transferase domain-containing protein  29.49 
 
 
219 aa  66.2  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.427555  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27580  putative glutathione S-transferase  26.55 
 
 
220 aa  66.2  0.0000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.08808  decreased coverage  0.00115097 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2762  glutathione S-transferase-like  27.6 
 
 
206 aa  65.1  0.0000000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3336  Glutathione S-transferase domain  28.57 
 
 
204 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.287023  normal  0.088058 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2721  putative glutathione S-transferase protein  27.75 
 
 
202 aa  63.2  0.000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.199713 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1203  Glutathione S-transferase domain protein  26.01 
 
 
203 aa  63.2  0.000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2965  Glutathione S-transferase domain  26.79 
 
 
202 aa  62.4  0.000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2555  Glutathione S-transferase domain protein  26.79 
 
 
202 aa  62.4  0.000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.736156 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3932  glutathione S-transferase domain-containing protein  25.56 
 
 
203 aa  62  0.000000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.336565 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3693  glutathione S-transferase domain-containing protein  24.77 
 
 
203 aa  61.2  0.00000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.986206 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0933  glutathione S-transferase domain-containing protein  26.01 
 
 
204 aa  61.6  0.00000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3839  glutathione S-transferase domain-containing protein  26.98 
 
 
226 aa  61.6  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.595735  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5500  glutathione S-transferase domain-containing protein  25.23 
 
 
203 aa  60.5  0.00000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.212095 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2967  glutathione S-transferase-like  24.66 
 
 
203 aa  60.8  0.00000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.191887  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4125  glutathione S-transferase domain-containing protein  26.92 
 
 
203 aa  60.8  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2548  glutathione S-transferase domain-containing protein  25.23 
 
 
202 aa  60.1  0.00000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.24256  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2926  putative transcription modulator protein  24.77 
 
 
203 aa  59.7  0.00000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1830  stringent starvation protein a  24.32 
 
 
199 aa  59.3  0.00000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.855376  normal  0.188895 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3203  Glutathione S-transferase domain  24.77 
 
 
203 aa  59.3  0.00000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.802093 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2856  Glutathione S-transferase domain protein  24.77 
 
 
203 aa  59.3  0.00000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.438523 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2245  glutathione S-transferase-like  28.38 
 
 
220 aa  59.7  0.00000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.556118  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2930  glutathione S-transferase domain-containing protein  29.72 
 
 
217 aa  59.3  0.00000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000195248  hitchhiker  0.000964394 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2820  glutathione S-transferase  25.93 
 
 
204 aa  59.3  0.00000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.294123  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3090  glutathione S-transferase  26.13 
 
 
203 aa  59.3  0.00000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.840634  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3227  glutathione S-transferase-like protein  26.13 
 
 
203 aa  59.3  0.00000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2695  stringent starvation protein A  25.68 
 
 
203 aa  58.9  0.00000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3704  stringent starvation protein A  25.68 
 
 
203 aa  58.9  0.00000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.885565  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3672  stringent starvation protein A  25.68 
 
 
203 aa  58.9  0.00000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.381091  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2745  stringent starvation protein A  25.68 
 
 
203 aa  58.9  0.00000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3647  stringent starvation protein A  25.68 
 
 
203 aa  58.9  0.00000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.48548  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0716  glutathione S-transferase domain-containing protein  24.22 
 
 
203 aa  58.9  0.00000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.258047 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3259  stringent starvation protein A  25.68 
 
 
203 aa  58.9  0.00000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2974  stringent starvation protein A  25.68 
 
 
203 aa  58.9  0.00000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.904673  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5354  glutathione S-transferase domain-containing protein  29.03 
 
 
219 aa  58.9  0.00000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1808  stringent starvation protein A  25.68 
 
 
203 aa  58.9  0.00000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4813  glutathione S-transferase domain-containing protein  28.7 
 
 
219 aa  58.9  0.00000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0488854  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3110  putative glutathione S-transferase  26.51 
 
 
218 aa  58.5  0.00000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  decreased coverage  0.000803235  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0792  glutathione S-transferase domain-containing protein  25 
 
 
203 aa  58.5  0.00000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.654502  normal  0.227233 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0824  glutathione S-transferase-like  24.22 
 
 
203 aa  58.5  0.00000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.317861  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0624  glutathione S-transferase  26.6 
 
 
206 aa  58.5  0.00000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.531247  normal  0.512939 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1405  Glutathione S-transferase domain protein  23.42 
 
 
198 aa  58.5  0.00000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0755  Glutathione S-transferase domain protein  25 
 
 
203 aa  58.5  0.00000009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0347  glutathione S-transferase domain-containing protein  25.68 
 
 
203 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0423  glutathione S-transferase domain-containing protein  25.68 
 
 
203 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.102515  hitchhiker  0.00000408677 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3542  glutathione S-transferase  25.68 
 
 
203 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.412867 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3433  glutathione S-transferase family protein  26.44 
 
 
214 aa  57.8  0.0000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000000284771 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2663  glutathione S-transferase-like  25.68 
 
 
203 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.763542  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0371  glutathione S-transferase domain-containing protein  25.68 
 
 
203 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.322532  normal  0.452731 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0362  glutathione S-transferase domain-containing protein  25.68 
 
 
203 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0609511  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0444  glutathione S-transferase domain-containing protein  25.68 
 
 
203 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>