More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_5354 on replicon NC_010552
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010552  BamMC406_5354  glutathione S-transferase domain-containing protein  100 
 
 
219 aa  444  1.0000000000000001e-124  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4813  glutathione S-transferase domain-containing protein  99.09 
 
 
219 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0488854  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4798  glutathione S-transferase domain-containing protein  92.24 
 
 
219 aa  411  1e-114  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.427555  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0183  glutathione S-transferase-like protein  91.78 
 
 
219 aa  409  1e-113  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.220885 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5390  glutathione S-transferase-like  92.24 
 
 
219 aa  410  1e-113  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.602647  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5471  glutathione S-transferase domain-containing protein  92.24 
 
 
219 aa  410  1e-113  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.375006 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3314  glutathione S-transferase domain-containing protein  88.58 
 
 
248 aa  393  1e-109  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.443514  normal  0.158342 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3446  putative glutathione S-transferase  79 
 
 
219 aa  362  2e-99  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1033  Glutathione S-transferase domain  77.63 
 
 
219 aa  354  5.999999999999999e-97  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.372971 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5453  glutathione S-transferase domain-containing protein  77.63 
 
 
217 aa  347  9e-95  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0448477 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1768  glutathione S-transferase, putative  68.04 
 
 
219 aa  297  1e-79  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00268696  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3491  glutathione S-transferase  67.91 
 
 
217 aa  295  3e-79  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0044  putative glutathione S-transferase  66.67 
 
 
303 aa  294  9e-79  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000000000123051  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0827  putative glutathione S-transferase  66.67 
 
 
219 aa  293  2e-78  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.000433785  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1576  putative glutathione S-transferase  66.67 
 
 
219 aa  293  2e-78  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00035479  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1312  putative glutathione S-transferase  67.91 
 
 
246 aa  291  4e-78  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.503911  normal  0.626751 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0858  putative glutathione S-transferase  66.21 
 
 
303 aa  291  5e-78  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.211682  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0951  putative glutathione S-transferase  66.21 
 
 
219 aa  290  1e-77  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000000550052  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2204  glutathione S-transferase-like protein  65.75 
 
 
219 aa  288  5.0000000000000004e-77  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  unclonable  0.0000000000939621  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3839  glutathione S-transferase domain-containing protein  60.47 
 
 
226 aa  266  2e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.595735  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2930  glutathione S-transferase domain-containing protein  60.73 
 
 
217 aa  265  4e-70  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000195248  hitchhiker  0.000964394 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3110  putative glutathione S-transferase  60 
 
 
218 aa  263  1e-69  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  decreased coverage  0.000803235  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5294  glutathione S-transferase domain-containing protein  52.05 
 
 
219 aa  236  3e-61  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.95189  normal  0.556954 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2570  glutathione S-transferase domain-containing protein  58.06 
 
 
228 aa  233  2.0000000000000002e-60  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00976958 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3477  glutathione S-transferase domain-containing protein  55.3 
 
 
217 aa  231  6e-60  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2818  Glutathione S-transferase domain protein  51.6 
 
 
219 aa  227  1e-58  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3436  glutathione S-transferase domain-containing protein  53.27 
 
 
215 aa  215  5e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.226272  normal  0.877498 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2062  Glutathione S-transferase domain  47.2 
 
 
228 aa  199  3.9999999999999996e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0009  glutathione S-transferase-like protein  51.11 
 
 
220 aa  198  6e-50  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.607663  normal  0.0509198 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2295  Glutathione S-transferase domain protein  49.07 
 
 
228 aa  190  1e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.902832 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1953  glutathione S-transferase domain-containing protein  50.47 
 
 
224 aa  187  9e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.428029  normal  0.0851297 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6889  putative glutathione S-transferase  48.13 
 
 
391 aa  184  9e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0839725  normal  0.0391413 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2887  glutathione S-transferase-like  43.26 
 
 
226 aa  172  2.9999999999999996e-42  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.862789  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5077  Glutathione S-transferase domain protein  42.16 
 
 
211 aa  139  4.999999999999999e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3548  glutathione S-transferase  38.46 
 
 
217 aa  105  5e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4215  Glutathione S-transferase domain protein  32.74 
 
 
215 aa  98.6  7e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4390  glutathione S-transferase domain-containing protein  32.74 
 
 
215 aa  98.6  7e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0126  glutathione S-transferase domain-containing protein  32.74 
 
 
215 aa  98.2  9e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4254  glutathione S-transferase domain-containing protein  33.33 
 
 
215 aa  98.2  9e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0089  glutathione S-transferase domain-containing protein  32.74 
 
 
215 aa  96.7  2e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0148  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.35 
 
 
216 aa  94  2e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.959935  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3840  glutathione S-transferase domain-containing protein  33.14 
 
 
215 aa  92.4  5e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4049  glutathione S-transferase domain-containing protein  33.73 
 
 
215 aa  91.3  1e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3933  glutathione S-transferase domain-containing protein  32.54 
 
 
215 aa  89.7  3e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0027  glutathione S-transferase domain-containing protein  32.14 
 
 
215 aa  89  6e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0450096  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4697  glutathione S-transferase  32.54 
 
 
215 aa  88.6  7e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0127  glutathione S-transferase domain-containing protein  33.14 
 
 
217 aa  87  2e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4063  glutathione S-transferase domain-containing protein  32.12 
 
 
233 aa  84  0.000000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0803873  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2820  glutathione S-transferase  27.86 
 
 
204 aa  74.7  0.0000000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.294123  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0647  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.1 
 
 
230 aa  74.3  0.000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.474841  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2957  glutathione S-transferase-like protein  27.86 
 
 
204 aa  70.9  0.00000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0291  glutathione S-transferase-like protein  30.3 
 
 
218 aa  70.1  0.00000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.278783  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5247  putative glutathione S-transferase GSTF2 (GST-II)  32.37 
 
 
219 aa  70.1  0.00000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.743687  normal  0.155796 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3634  glutathione S-transferase domain protein  27.92 
 
 
219 aa  68.9  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4320  Glutathione S-transferase domain  31.43 
 
 
230 aa  68.9  0.00000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1800  glutathione S-transferase domain-containing protein  26.2 
 
 
232 aa  68.2  0.00000000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2757  hypothetical protein  30.77 
 
 
206 aa  68.2  0.0000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1922  Glutathione S-transferase domain protein  25.76 
 
 
232 aa  67.4  0.0000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3505  glutathione S-transferase domain-containing protein  32.24 
 
 
229 aa  67.8  0.0000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2721  putative glutathione S-transferase protein  27.75 
 
 
202 aa  67.4  0.0000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.199713 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2630  hypothetical protein  30.77 
 
 
206 aa  67  0.0000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1830  stringent starvation protein a  26.6 
 
 
199 aa  67.4  0.0000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.855376  normal  0.188895 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5058  glutathione S-transferase domain-containing protein  29.9 
 
 
207 aa  67  0.0000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000892035 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2474  Glutathione S-transferase domain protein  27.41 
 
 
219 aa  67.4  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2922  glutathione S-transferase domain-containing protein  29.05 
 
 
207 aa  65.5  0.0000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.894063  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1002  glutathione S-transferase-like protein  26.63 
 
 
199 aa  65.5  0.0000000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.110038  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3702  Glutathione S-transferase domain protein  31.25 
 
 
226 aa  65.1  0.0000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0839  glutathione S-transferase family protein  26.85 
 
 
215 aa  65.1  0.0000000009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4583  Glutathione S-transferase domain protein  30 
 
 
230 aa  64.7  0.0000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.293882 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3706  glutathione S-transferase domain-containing protein  32.08 
 
 
210 aa  64.3  0.000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2873  Glutathione S-transferase domain  31.58 
 
 
260 aa  63.9  0.000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.606982  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2555  Glutathione S-transferase domain protein  26.7 
 
 
202 aa  63.9  0.000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.736156 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4617  glutathione S-transferase domain-containing protein  26.44 
 
 
194 aa  63.9  0.000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.236523  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4661  glutathione S-transferase-like  26.11 
 
 
204 aa  63.9  0.000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.39586  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2965  Glutathione S-transferase domain  26.7 
 
 
202 aa  63.2  0.000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0044  Glutathione S-transferase domain  30.99 
 
 
230 aa  63.2  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4552  Glutathione S-transferase domain protein  30.56 
 
 
227 aa  62  0.000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0663368  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0263  glutathione S-transferase-like protein  25.62 
 
 
199 aa  62  0.000000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000123388  hitchhiker  0.00483772 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0724  glutathione S-transferase-like  27.23 
 
 
222 aa  62  0.000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.4337 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5366  Glutathione S-transferase domain protein  29.76 
 
 
207 aa  61.6  0.000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.230494  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0089  putative glutathione S-transferase  28.5 
 
 
201 aa  61.6  0.000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1405  Glutathione S-transferase domain protein  27.32 
 
 
198 aa  61.6  0.000000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2385  glutathione S-transferase domain-containing protein  25.93 
 
 
216 aa  61.6  0.000000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.167846  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0831  glutathione S-transferase family protein  26.39 
 
 
294 aa  61.6  0.000000009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1084  glutathione S-transferase domain-containing protein  32.5 
 
 
215 aa  61.6  0.000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0663  glutathione S-transferase domain-containing protein  26.02 
 
 
205 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0275  glutathione S-transferase-like  26.63 
 
 
221 aa  61.2  0.00000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0888177 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0212  glutathione S-transferase-like  26.02 
 
 
205 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0696  glutathione S-transferase domain-containing protein  26.02 
 
 
205 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2548  glutathione S-transferase domain-containing protein  28.1 
 
 
202 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.24256  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5500  glutathione S-transferase domain-containing protein  25.63 
 
 
203 aa  60.8  0.00000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.212095 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2334  glutathione S-transferase  27.88 
 
 
220 aa  60.5  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0381359  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3782  glutathione S-transferase-like protein  25.44 
 
 
204 aa  60.1  0.00000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2242  glutathione S-transferase-like protein  26.13 
 
 
202 aa  60.1  0.00000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.025244  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0268  glutathione S-transferase domain-containing protein  25.91 
 
 
221 aa  60.1  0.00000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1651  glutathione S-transferase domain-containing protein  25.24 
 
 
261 aa  59.7  0.00000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.491053  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2967  glutathione S-transferase-like protein  29.88 
 
 
214 aa  60.1  0.00000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3203  Glutathione S-transferase domain  27.14 
 
 
203 aa  59.3  0.00000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.802093 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2967  glutathione S-transferase-like  27 
 
 
203 aa  59.3  0.00000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.191887  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2856  Glutathione S-transferase domain protein  27.14 
 
 
203 aa  59.3  0.00000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.438523 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>