More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A3446 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007951  Bxe_A3446  putative glutathione S-transferase  100 
 
 
219 aa  444  1.0000000000000001e-124  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1033  Glutathione S-transferase domain  91.78 
 
 
219 aa  414  9.999999999999999e-116  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.372971 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4798  glutathione S-transferase domain-containing protein  81.48 
 
 
219 aa  368  1e-101  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.427555  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5390  glutathione S-transferase-like  80.56 
 
 
219 aa  365  1e-100  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.602647  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5471  glutathione S-transferase domain-containing protein  80.56 
 
 
219 aa  365  1e-100  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.375006 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5354  glutathione S-transferase domain-containing protein  79 
 
 
219 aa  362  2e-99  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4813  glutathione S-transferase domain-containing protein  78.54 
 
 
219 aa  359  2e-98  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0488854  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0183  glutathione S-transferase-like protein  78.7 
 
 
219 aa  357  7e-98  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.220885 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3314  glutathione S-transferase domain-containing protein  78.7 
 
 
248 aa  348  4e-95  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.443514  normal  0.158342 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5453  glutathione S-transferase domain-containing protein  74.43 
 
 
217 aa  331  7.000000000000001e-90  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0448477 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1312  putative glutathione S-transferase  67.43 
 
 
246 aa  300  1e-80  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.503911  normal  0.626751 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1768  glutathione S-transferase, putative  66.67 
 
 
219 aa  296  2e-79  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00268696  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3491  glutathione S-transferase  66.36 
 
 
217 aa  293  2e-78  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0044  putative glutathione S-transferase  65.3 
 
 
303 aa  292  2e-78  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000000000123051  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0858  putative glutathione S-transferase  65.3 
 
 
303 aa  291  5e-78  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.211682  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0827  putative glutathione S-transferase  65.3 
 
 
219 aa  291  6e-78  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.000433785  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1576  putative glutathione S-transferase  65.3 
 
 
219 aa  291  6e-78  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00035479  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0951  putative glutathione S-transferase  65.3 
 
 
219 aa  290  2e-77  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000000550052  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2204  glutathione S-transferase-like protein  64.84 
 
 
219 aa  287  9e-77  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  unclonable  0.0000000000939621  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2930  glutathione S-transferase domain-containing protein  61.64 
 
 
217 aa  268  5e-71  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000195248  hitchhiker  0.000964394 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3110  putative glutathione S-transferase  59.91 
 
 
218 aa  263  1e-69  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  decreased coverage  0.000803235  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3839  glutathione S-transferase domain-containing protein  59.91 
 
 
226 aa  263  2e-69  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.595735  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5294  glutathione S-transferase domain-containing protein  49.77 
 
 
219 aa  229  3e-59  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.95189  normal  0.556954 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3477  glutathione S-transferase domain-containing protein  53.46 
 
 
217 aa  226  2e-58  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2570  glutathione S-transferase domain-containing protein  55.96 
 
 
228 aa  226  3e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00976958 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3436  glutathione S-transferase domain-containing protein  56.54 
 
 
215 aa  222  4e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.226272  normal  0.877498 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2818  Glutathione S-transferase domain protein  50.7 
 
 
219 aa  214  9.999999999999999e-55  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2062  Glutathione S-transferase domain  50.93 
 
 
228 aa  209  2e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2295  Glutathione S-transferase domain protein  51.4 
 
 
228 aa  195  5.000000000000001e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.902832 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0009  glutathione S-transferase-like protein  49.78 
 
 
220 aa  193  1e-48  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.607663  normal  0.0509198 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6889  putative glutathione S-transferase  50.93 
 
 
391 aa  191  6e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0839725  normal  0.0391413 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2887  glutathione S-transferase-like  45.16 
 
 
226 aa  182  5.0000000000000004e-45  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.862789  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1953  glutathione S-transferase domain-containing protein  49.07 
 
 
224 aa  181  7e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.428029  normal  0.0851297 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5077  Glutathione S-transferase domain protein  41.26 
 
 
211 aa  140  9.999999999999999e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3548  glutathione S-transferase  39.18 
 
 
217 aa  102  3e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4390  glutathione S-transferase domain-containing protein  34.71 
 
 
215 aa  102  4e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4215  Glutathione S-transferase domain protein  34.71 
 
 
215 aa  102  4e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3840  glutathione S-transferase domain-containing protein  34.71 
 
 
215 aa  102  5e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0126  glutathione S-transferase domain-containing protein  34.71 
 
 
215 aa  102  6e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4254  glutathione S-transferase domain-containing protein  34.71 
 
 
215 aa  101  7e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0089  glutathione S-transferase domain-containing protein  34.71 
 
 
215 aa  101  1e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4697  glutathione S-transferase  34.71 
 
 
215 aa  100  2e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4049  glutathione S-transferase domain-containing protein  34.71 
 
 
215 aa  100  2e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3933  glutathione S-transferase domain-containing protein  34.12 
 
 
215 aa  99.4  4e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0647  glutathione S-transferase domain-containing protein  32.85 
 
 
230 aa  98.6  7e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.474841  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0027  glutathione S-transferase domain-containing protein  32.94 
 
 
215 aa  94.4  1e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0450096  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0148  glutathione S-transferase domain-containing protein  34.12 
 
 
216 aa  92.4  4e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.959935  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0127  glutathione S-transferase domain-containing protein  33.14 
 
 
217 aa  88.6  6e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3634  glutathione S-transferase domain protein  32.16 
 
 
219 aa  84.7  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2474  Glutathione S-transferase domain protein  31.66 
 
 
219 aa  83.2  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4063  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.95 
 
 
233 aa  81.3  0.00000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0803873  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0291  glutathione S-transferase-like protein  30 
 
 
218 aa  76.3  0.0000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.278783  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4617  glutathione S-transferase domain-containing protein  29.31 
 
 
194 aa  75.5  0.0000000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.236523  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5058  glutathione S-transferase domain-containing protein  32.04 
 
 
207 aa  75.1  0.0000000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000892035 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5366  Glutathione S-transferase domain protein  33.01 
 
 
207 aa  74.7  0.0000000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.230494  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0839  glutathione S-transferase family protein  27.52 
 
 
215 aa  73.2  0.000000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1800  glutathione S-transferase domain-containing protein  27.88 
 
 
232 aa  73.2  0.000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1922  Glutathione S-transferase domain protein  27.95 
 
 
232 aa  72.4  0.000000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0108  stringent starvation protein A  30.88 
 
 
211 aa  71.2  0.00000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0236194  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1939  stringent starvation protein A  28.37 
 
 
209 aa  70.9  0.00000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000191065  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2757  hypothetical protein  30.14 
 
 
206 aa  70.5  0.00000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0254  stringent starvation protein A  28.37 
 
 
220 aa  70.9  0.00000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0916387  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3505  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.63 
 
 
229 aa  70.1  0.00000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4552  Glutathione S-transferase domain protein  31.8 
 
 
227 aa  70.1  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0663368  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0831  glutathione S-transferase family protein  27.06 
 
 
294 aa  69.7  0.00000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1924  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.02 
 
 
202 aa  69.3  0.00000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.896239 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2630  hypothetical protein  29.67 
 
 
206 aa  68.6  0.00000000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2557  glutathione S-transferase-like protein  31.84 
 
 
205 aa  68.2  0.00000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.630075 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3478  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.84 
 
 
205 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.556825  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2922  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.28 
 
 
207 aa  68.2  0.0000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.894063  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2200  Glutathione S-transferase domain  30.48 
 
 
202 aa  67.8  0.0000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3702  Glutathione S-transferase domain protein  32.38 
 
 
226 aa  67.8  0.0000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2873  Glutathione S-transferase domain  31.21 
 
 
260 aa  67  0.0000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.606982  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4031  putative glutathione S-transferase  32.55 
 
 
213 aa  66.6  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.39864  normal  0.426189 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3532  Glutathione S-transferase domain protein  25.25 
 
 
217 aa  67.4  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.150118 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5300  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.84 
 
 
205 aa  66.6  0.0000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.217524  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1830  stringent starvation protein a  26.44 
 
 
199 aa  65.9  0.0000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.855376  normal  0.188895 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3702  stringent starvation protein A  29.9 
 
 
212 aa  65.9  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.711785  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3640  stringent starvation protein A  29.9 
 
 
212 aa  65.9  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0516172  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3535  stringent starvation protein A  29.9 
 
 
212 aa  65.9  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00187434  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3533  stringent starvation protein A  29.9 
 
 
212 aa  65.9  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000186075  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3605  stringent starvation protein A  29.9 
 
 
212 aa  65.9  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0584302  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5247  putative glutathione S-transferase GSTF2 (GST-II)  31.88 
 
 
219 aa  66.2  0.0000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.743687  normal  0.155796 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2385  glutathione S-transferase domain-containing protein  25.69 
 
 
216 aa  65.5  0.0000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.167846  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004506  stringent starvation protein A  29.41 
 
 
211 aa  65.5  0.0000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000234692  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0089  putative glutathione S-transferase  28.64 
 
 
201 aa  65.1  0.0000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00886  stringent starvation protein A  29.27 
 
 
211 aa  65.1  0.0000000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1329  glutathione S-transferase domain-containing protein  26.47 
 
 
208 aa  64.3  0.000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.923957  normal  0.630065 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0477  Glutathione S-transferase domain protein  29.41 
 
 
212 aa  63.5  0.000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000149407  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0523  glutathione S-transferase domain-containing protein  33.94 
 
 
220 aa  63.5  0.000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000118067 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2012  gst-related protein  30.72 
 
 
218 aa  63.5  0.000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.844191  normal  0.0196648 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0477  stringent starvation protein A  29.41 
 
 
212 aa  63.5  0.000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000183333  normal  0.261267 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3712  stringent starvation protein A  29.41 
 
 
212 aa  63.5  0.000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000104882  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1002  glutathione S-transferase-like protein  26.96 
 
 
199 aa  63.5  0.000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.110038  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4546  stringent starvation protein A  29.41 
 
 
212 aa  63.5  0.000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000354095  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0500  Glutathione S-transferase domain  29.33 
 
 
222 aa  63.9  0.000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0342057 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3418  stringent starvation protein A  29.41 
 
 
212 aa  63.5  0.000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000267382  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3547  stringent starvation protein A  29.41 
 
 
212 aa  63.5  0.000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000170112  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3664  stringent starvation protein A  29.13 
 
 
212 aa  63.5  0.000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0432438  normal  0.165471 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03040  hypothetical protein  29.41 
 
 
212 aa  63.5  0.000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00103064  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>