192 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_0148 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_0148  glutathione S-transferase domain-containing protein  100 
 
 		 216 aa  444  1.0000000000000001e-124  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.959935  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0127  glutathione S-transferase domain-containing protein  73.73 
 
 		 217 aa  329  2e-89  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0027  glutathione S-transferase domain-containing protein  59.72 
 
 		 215 aa  259  2e-68  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0450096  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0089  glutathione S-transferase domain-containing protein  56.02 
 
 		 215 aa  239  2e-62  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3840  glutathione S-transferase domain-containing protein  55.76 
 
 		 215 aa  237  1e-61  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3933  glutathione S-transferase domain-containing protein  55.76 
 
 		 215 aa  236  2e-61  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4049  glutathione S-transferase domain-containing protein  56.22 
 
 		 215 aa  236  3e-61  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4254  glutathione S-transferase domain-containing protein  54.63 
 
 		 215 aa  232  4.0000000000000004e-60  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4215  Glutathione S-transferase domain protein  54.17 
 
 		 215 aa  229  2e-59  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4390  glutathione S-transferase domain-containing protein  54.17 
 
 		 215 aa  229  2e-59  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0126  glutathione S-transferase domain-containing protein  53.7 
 
 		 215 aa  226  3e-58  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4697  glutathione S-transferase  56.22 
 
 		 215 aa  223  1e-57  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4063  glutathione S-transferase domain-containing protein  47.85 
 
 		 233 aa  203  1e-51  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0803873  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3548  glutathione S-transferase  53 
 
 		 217 aa  203  2e-51  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2295  Glutathione S-transferase domain protein  32.67 
 
 		 228 aa  112  4.0000000000000004e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.902832 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6889  putative glutathione S-transferase  33.66 
 
 		 391 aa  111  7.000000000000001e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0839725  normal  0.0391413 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3436  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.73 
 
 		 215 aa  107  2e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.226272  normal  0.877498 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2062  Glutathione S-transferase domain  30.54 
 
 		 228 aa  106  3e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5077  Glutathione S-transferase domain protein  29.06 
 
 		 211 aa  100  1e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5354  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.35 
 
 		 219 aa  94  2e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4813  glutathione S-transferase domain-containing protein  33.33 
 
 		 219 aa  93.6  2e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0488854  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3477  glutathione S-transferase domain-containing protein  29.21 
 
 		 217 aa  93.2  3e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3314  glutathione S-transferase domain-containing protein  29.7 
 
 		 248 aa  92.8  3e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.443514  normal  0.158342 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0183  glutathione S-transferase-like protein  30.35 
 
 		 219 aa  92.8  4e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.220885 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3446  putative glutathione S-transferase  34.12 
 
 		 219 aa  92.4  4e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1033  Glutathione S-transferase domain  30.59 
 
 		 219 aa  90.1  2e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.372971 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1953  glutathione S-transferase domain-containing protein  26.32 
 
 		 224 aa  89.4  4e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.428029  normal  0.0851297 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4798  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.37 
 
 		 219 aa  89  5e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.427555  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5390  glutathione S-transferase-like  33.92 
 
 		 219 aa  87.8  1e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.602647  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5471  glutathione S-transferase domain-containing protein  33.92 
 
 		 219 aa  87.8  1e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.375006 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2930  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.24 
 
 		 217 aa  87.4  1e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000195248  hitchhiker  0.000964394 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0009  glutathione S-transferase-like protein  32.75 
 
 		 220 aa  85.5  6e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.607663  normal  0.0509198 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3491  glutathione S-transferase  30 
 
 		 217 aa  83.6  0.000000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1768  glutathione S-transferase, putative  28.82 
 
 		 219 aa  83.6  0.000000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00268696  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2204  glutathione S-transferase-like protein  29.41 
 
 		 219 aa  82.8  0.000000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  unclonable  0.0000000000939621  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0044  putative glutathione S-transferase  29.34 
 
 		 303 aa  82  0.000000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000000000123051  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0858  putative glutathione S-transferase  29.34 
 
 		 303 aa  82.4  0.000000000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.211682  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0827  putative glutathione S-transferase  29.41 
 
 		 219 aa  82  0.000000000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.000433785  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0951  putative glutathione S-transferase  29.41 
 
 		 219 aa  82  0.000000000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000000550052  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1576  putative glutathione S-transferase  29.41 
 
 		 219 aa  82  0.000000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00035479  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3110  putative glutathione S-transferase  30 
 
 		 218 aa  79  0.00000000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  decreased coverage  0.000803235  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1312  putative glutathione S-transferase  30.54 
 
 		 246 aa  79  0.00000000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.503911  normal  0.626751 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2570  glutathione S-transferase domain-containing protein  28.99 
 
 		 228 aa  79  0.00000000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00976958 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3839  glutathione S-transferase domain-containing protein  29.94 
 
 		 226 aa  78.2  0.00000000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.595735  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5453  glutathione S-transferase domain-containing protein  27.67 
 
 		 217 aa  76.6  0.0000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0448477 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2116  glutathione S-transferase-like protein  26.73 
 
 		 203 aa  74.7  0.000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.489753  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2818  Glutathione S-transferase domain protein  25.9 
 
 		 219 aa  70.1  0.00000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5294  glutathione S-transferase domain-containing protein  27.81 
 
 		 219 aa  65.9  0.0000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.95189  normal  0.556954 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1512  Glutathione S-transferase domain  27.75 
 
 		 210 aa  65.5  0.0000000007  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.553363 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0885  glutathione S-transferase  25.62 
 
 		 224 aa  61.2  0.00000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0233753  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1132  glutathione S-transferase family protein  25.62 
 
 		 224 aa  61.2  0.00000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0319  glutathione S-transferase domain-containing protein  26.19 
 
 		 206 aa  59.7  0.00000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2965  Glutathione S-transferase domain  24.76 
 
 		 202 aa  57.4  0.0000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2555  Glutathione S-transferase domain protein  24.76 
 
 		 202 aa  57.8  0.0000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.736156 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2548  glutathione S-transferase domain-containing protein  25.48 
 
 		 202 aa  57  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.24256  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3308  glutathione S-transferase  31.15 
 
 		 221 aa  57  0.0000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2887  glutathione S-transferase-like  28.07 
 
 		 226 aa  56.2  0.0000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.862789  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2385  glutathione S-transferase domain-containing protein  28 
 
 		 216 aa  56.2  0.0000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.167846  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0647  glutathione S-transferase domain-containing protein  23.58 
 
 		 230 aa  55.8  0.0000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.474841  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0500  Glutathione S-transferase domain  29.44 
 
 		 222 aa  55.5  0.0000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0342057 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3336  Glutathione S-transferase domain  25.24 
 
 		 204 aa  54.3  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.287023  normal  0.088058 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1651  glutathione S-transferase domain-containing protein  23.08 
 
 		 261 aa  53.5  0.000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.491053  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2820  glutathione S-transferase  24.59 
 
 		 204 aa  53.5  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.294123  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0663  glutathione S-transferase domain-containing protein  27.17 
 
 		 205 aa  53.5  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0212  glutathione S-transferase-like  27.17 
 
 		 205 aa  53.5  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0696  glutathione S-transferase domain-containing protein  27.17 
 
 		 205 aa  53.5  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1159  glutathione S-transferase domain-containing protein  24.41 
 
 		 206 aa  53.5  0.000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2721  putative glutathione S-transferase protein  23.92 
 
 		 202 aa  53.5  0.000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.199713 
 
 
-
 
NC_004310  BR0839  glutathione S-transferase family protein  26.86 
 
 		 215 aa  53.1  0.000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1795  glutathione S-transferase domain-containing protein  26.79 
 
 		 221 aa  53.1  0.000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.277101  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2783  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.34 
 
 		 225 aa  53.1  0.000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD1058  glutathione S-transferase family protein  24.18 
 
 		 217 aa  52.8  0.000004  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.407682  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0624  glutathione S-transferase  24.51 
 
 		 206 aa  52.8  0.000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.531247  normal  0.512939 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2663  Glutathione S-transferase domain  25.51 
 
 		 230 aa  52.8  0.000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.657394  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2347  Glutathione S-transferase domain protein  26.35 
 
 		 237 aa  52.8  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2386  glutathione S-transferase domain-containing protein  25.51 
 
 		 230 aa  52.8  0.000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.10495  normal  0.984704 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3289  glutathione S-transferase  24.87 
 
 		 202 aa  52.4  0.000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0615  glutathione S-transferase domain-containing protein  26.23 
 
 		 203 aa  52.4  0.000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.715776  normal  0.218032 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0846  glutathione S-transferase  25.98 
 
 		 202 aa  52  0.000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.289081  normal  0.806951 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0275  glutathione S-transferase-like  28.49 
 
 		 221 aa  52  0.000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0888177 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0589  glutathione S-transferase domain-containing protein  26.23 
 
 		 204 aa  52  0.000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0069  Glutathione S-transferase domain protein  22.37 
 
 		 218 aa  52  0.000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3133  glutathione S-transferase domain-containing protein  25 
 
 		 230 aa  51.2  0.00001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.05587  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2343  Glutathione S-transferase domain  25 
 
 		 230 aa  51.2  0.00001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.77446  normal  0.656048 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4668  glutathione S-transferase domain-containing protein  23.92 
 
 		 204 aa  51.2  0.00001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0199  glutathione S-transferase domain-containing protein  25.36 
 
 		 226 aa  51.2  0.00001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3681  Glutathione S-transferase domain protein  24.89 
 
 		 230 aa  50.4  0.00002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.158502 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1144  glutathione S-transferase  29.71 
 
 		 241 aa  50.4  0.00002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2688  glutathione S-transferase domain-containing protein  25.14 
 
 		 204 aa  50.4  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.761571  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2873  Glutathione S-transferase domain  25 
 
 		 260 aa  50.8  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.606982  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2825  glutathione S-transferase-like  26.99 
 
 		 221 aa  50.1  0.00002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2123  glutathione S-transferase-like protein  23.15 
 
 		 270 aa  50.4  0.00002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.394042 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2805  glutathione S-transferase domain-containing protein  29.71 
 
 		 225 aa  50.4  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.383982  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3962  putative glutathione S-transferase  26.89 
 
 		 223 aa  50.1  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1255  glutathione S-transferase  25.15 
 
 		 203 aa  50.1  0.00003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0662  glutathione S-transferase-like protein  25.62 
 
 		 230 aa  50.1  0.00003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.165169 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2778  Glutathione S-transferase domain protein  26.4 
 
 		 261 aa  49.7  0.00003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2361  glutathione S-transferase  24.54 
 
 		 203 aa  48.9  0.00005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3398  glutathione S-transferase  24.54 
 
 		 202 aa  48.9  0.00005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3782  glutathione S-transferase-like protein  24.63 
 
 		 204 aa  49.3  0.00005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>