More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_3706 on replicon NC_009620
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009620  Smed_3706  glutathione S-transferase domain-containing protein  100 
 
 		 210 aa  427  1e-119  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5110  glutathione S-transferase domain-containing protein  69.31 
 
 		 205 aa  303  1.0000000000000001e-81  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0347901 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3954  glutathione S-transferase domain-containing protein  67.16 
 
 		 205 aa  291  4e-78  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.251267 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5300  glutathione S-transferase domain-containing protein  65.67 
 
 		 205 aa  290  1e-77  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.217524  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2557  glutathione S-transferase-like protein  65.17 
 
 		 205 aa  288  4e-77  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.630075 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3478  glutathione S-transferase domain-containing protein  65.17 
 
 		 205 aa  288  5.0000000000000004e-77  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.556825  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0014  glutathione S-transferase-like protein  50.25 
 
 		 223 aa  212  2.9999999999999995e-54  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.198681  normal  0.0539534 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3181  glutathione S-transferase domain-containing protein  43.07 
 
 		 207 aa  167  1e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3566  glutathione S-transferase domain-containing protein  65.45 
 
 		 224 aa  166  2e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.147749  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0907  glutathione S-transferase domain-containing protein  42.56 
 
 		 207 aa  154  1e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3513  glutathione S-transferase domain-containing protein  39.23 
 
 		 207 aa  150  2e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.72335  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0755  glutathione S-transferase domain-containing protein  40.85 
 
 		 209 aa  148  6e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.76216  normal  0.189515 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3183  glutathione S-transferase domain-containing protein  40.74 
 
 		 209 aa  146  2.0000000000000003e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.413955  normal  0.024534 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0783  glutathione S-transferase domain-containing protein  40.85 
 
 		 209 aa  146  2.0000000000000003e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.469767 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3629  glutathione S-transferase domain-containing protein  40.31 
 
 		 210 aa  145  3e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.395815  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3752  glutathione S-transferase domain-containing protein  40.31 
 
 		 210 aa  145  3e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0132369  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0681  glutathione S-transferase domain-containing protein  40.82 
 
 		 210 aa  145  4.0000000000000006e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.052324  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3561  Glutathione S-transferase domain protein  40.31 
 
 		 210 aa  145  5e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.134068  normal  0.24035 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0838  glutathione S-transferase domain-containing protein  41.84 
 
 		 227 aa  144  8.000000000000001e-34  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0531264  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0739  glutathione S-transferase-like protein  40.4 
 
 		 214 aa  144  9e-34  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000125702  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2968  glutathione S-transferase domain-containing protein  40.82 
 
 		 211 aa  142  3e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.167267  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03306  putative glutathione S-transferase protein  36.27 
 
 		 210 aa  132  3e-30  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.00013946  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3527  Glutathione S-transferase domain protein  38.92 
 
 		 201 aa  117  9e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.11732  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2015  glutathione S-transferase-like  32.37 
 
 		 221 aa  115  5e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0042  glutathione S-transferase-like  36.14 
 
 		 196 aa  115  6e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.422861 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3380  glutathione S-transferase-like protein  37.93 
 
 		 201 aa  114  8.999999999999998e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3463  glutathione S-transferase domain protein  38.42 
 
 		 201 aa  114  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0942071  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2509  glutathione S-transferase-like protein  43.09 
 
 		 208 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.640237  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2389  Glutathione S-transferase domain protein  35.29 
 
 		 183 aa  109  4.0000000000000004e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.587961 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0794  Glutathione S-transferase domain  34.47 
 
 		 221 aa  104  7e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.730011  normal  0.341274 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2769  glutathione S-transferase domain-containing protein  35.57 
 
 		 195 aa  104  8e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0769  glutathione S-transferase  34.76 
 
 		 219 aa  102  3e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.608104  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2427  glutathione S-transferase domain-containing protein  34.29 
 
 		 219 aa  102  6e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.340237  normal  0.0428234 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1170  glutathione S-transferase  31.43 
 
 		 217 aa  102  6e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.859877  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0907  Glutathione S-transferase domain protein  33.65 
 
 		 221 aa  101  7e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0411393  normal  0.132395 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0805  putative glutathione S-transferase  30.6 
 
 		 216 aa  101  1e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.671378  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4356  glutathione S-transferase domain-containing protein  33.13 
 
 		 205 aa  99.4  3e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0573  glutathione S-transferase domain-containing protein  33.49 
 
 		 219 aa  99.4  4e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.210533  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4150  glutathione S-transferase domain protein  32.37 
 
 		 186 aa  98.6  6e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.432751 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4110  Glutathione S-transferase domain protein  32.37 
 
 		 186 aa  98.6  6e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5803  Glutathione S-transferase domain protein  35.57 
 
 		 181 aa  98.6  6e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0359  glutathione S-transferase domain-containing protein  39.69 
 
 		 201 aa  98.6  7e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  hitchhiker  0.00589351  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2200  Glutathione S-transferase domain  31.82 
 
 		 202 aa  98.6  7e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1924  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.82 
 
 		 202 aa  97.4  1e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.896239 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2005  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.28 
 
 		 202 aa  96.7  2e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3947  Glutathione S-transferase domain protein  31.98 
 
 		 207 aa  96.7  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5855  glutathione S-transferase domain-containing protein  33.98 
 
 		 213 aa  97.1  2e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0277  Glutathione S-transferase domain  34.2 
 
 		 222 aa  95.5  5e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2556  glutathione S-transferase domain-containing protein  32.81 
 
 		 210 aa  95.5  5e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4031  putative glutathione S-transferase  31.82 
 
 		 213 aa  93.6  2e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.39864  normal  0.426189 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1834  glutathione S-transferase domain-containing protein  33.5 
 
 		 219 aa  93.6  2e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.371565 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3292  putative glutathione S-transferase  28.08 
 
 		 222 aa  92.8  3e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000024408 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2002  glutathione S-transferase-like protein  32.06 
 
 		 185 aa  92.4  4e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3641  Glutathione S-transferase domain protein  35.48 
 
 		 218 aa  92.4  4e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0897  glutathione S-transferase  32.29 
 
 		 210 aa  92.4  5e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0508  glutathione S-transferase domain-containing protein  28.72 
 
 		 213 aa  92.4  5e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.553974 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2440  glutathione S-transferase-like  29.13 
 
 		 239 aa  92  5e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1256  glutathione S-transferase  33.5 
 
 		 184 aa  91.7  7e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.522192  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05193  glutathione S-transferase III  31.16 
 
 		 205 aa  91.3  9e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0253  glutathione S-transferase domain-containing protein  32.61 
 
 		 205 aa  90.9  1e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.617633 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0016  glutathione S-transferase  32 
 
 		 207 aa  91.3  1e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0408  glutathione S-transferase-like  31.41 
 
 		 200 aa  91.3  1e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.53035  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3623  Glutathione S-transferase domain  32.99 
 
 		 211 aa  90.1  2e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5079  Glutathione S-transferase domain  31.15 
 
 		 213 aa  89.4  3e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.242731  hitchhiker  0.00740675 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2228  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.14 
 
 		 230 aa  89.7  3e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2712  glutathione S-transferase-like  35.68 
 
 		 241 aa  89.7  3e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1616  glutathione S-transferase-like  30.14 
 
 		 230 aa  89.7  3e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3310  glutathione S-transferase domain-containing protein  32.31 
 
 		 210 aa  89.4  4e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.141117  normal  0.680332 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2145  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.14 
 
 		 230 aa  88.6  6e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0715733  normal  0.478827 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2266  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.14 
 
 		 230 aa  88.6  6e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1775  glutathione S-transferase  32.51 
 
 		 208 aa  88.2  8e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000137039 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0407  glutathione S-transferase  33.52 
 
 		 217 aa  87.8  9e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3352  glutathione S-transferase domain-containing protein  31 
 
 		 208 aa  87.8  1e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.148422  hitchhiker  0.0000403309 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1904  Glutathione S-transferase domain protein  30.2 
 
 		 199 aa  87.8  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.142458  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3457  glutathione S-transferase domain-containing protein  29.35 
 
 		 232 aa  87.8  1e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0220469  normal  0.0243961 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2696  glutathione S-transferase domain-containing protein  25.73 
 
 		 222 aa  87.4  1e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0036581 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1087  glutathione S-transferase family protein  27.67 
 
 		 222 aa  87.8  1e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.983271 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2859  Glutathione S-transferase domain protein  29.44 
 
 		 215 aa  86.7  2e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0152845  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0107  glutathione S-transferase  33.52 
 
 		 214 aa  87  2e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3102  glutathione S-transferase domain-containing protein  32.67 
 
 		 205 aa  87.4  2e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.480753  normal  0.323994 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2670  putative glutathione S-transferase  33.52 
 
 		 297 aa  86.7  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1267  glutathione S-transferase  33.52 
 
 		 214 aa  87  2e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.261228  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1071  glutathione S-transferase  33.52 
 
 		 214 aa  87  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.292672  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5556  glutathione S-transferase-like protein  30.59 
 
 		 230 aa  87  2e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.165995 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2935  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.31 
 
 		 210 aa  86.7  2e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2303  Glutathione S-transferase domain protein  30.85 
 
 		 234 aa  86.7  2e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0188012  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0125  glutathione S-transferase  33.52 
 
 		 266 aa  86.7  2e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2200  glutathione S-transferase-like  32.66 
 
 		 216 aa  87  2e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.313039 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2514  glutathione S-transferase-like protein  31.22 
 
 		 214 aa  86.7  2e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0225019  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2764  glutathione S-transferase domain-containing protein  25.85 
 
 		 222 aa  87  2e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1576  glutathione S-transferase family protein  25.85 
 
 		 222 aa  86.7  3e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4241  glutathione S-transferase-like  30.91 
 
 		 206 aa  86.7  3e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4773  glutathione S-transferase-like  31.79 
 
 		 206 aa  86.3  3e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.122319  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3077  glutathione S-transferase-like  32.09 
 
 		 214 aa  86.3  3e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.187241  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2817  glutathione S-transferase  33.52 
 
 		 300 aa  86.7  3e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1416  glutathione S-transferase domain-containing protein  27.18 
 
 		 222 aa  85.9  4e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0418  glutathione S-transferase  32.32 
 
 		 226 aa  85.9  4e-16  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0882437 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2966  Glutathione S-transferase domain protein  27.05 
 
 		 222 aa  85.9  4e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.183097  normal  0.112262 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1393  glutathione S-transferase domain-containing protein  27.05 
 
 		 222 aa  85.9  4e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00663  Glutathione S-transferase  30.65 
 
 		 219 aa  85.9  4e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>