More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_0897 on replicon NC_007493
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007493  RSP_0897  glutathione S-transferase  100 
 
 
210 aa  428  1e-119  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2556  glutathione S-transferase domain-containing protein  99.52 
 
 
210 aa  426  1e-118  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0253  glutathione S-transferase domain-containing protein  82.27 
 
 
205 aa  349  2e-95  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.617633 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1991  glutathione S-transferase domain-containing protein  60.68 
 
 
206 aa  262  2e-69  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.175013  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0995  glutathione S-transferase domain-containing protein  56.78 
 
 
213 aa  240  1e-62  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.59438 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1955  Glutathione S-transferase domain  56.85 
 
 
208 aa  234  7e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0193951  normal  0.329521 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2166  Glutathione S-transferase domain protein  56.85 
 
 
208 aa  231  7.000000000000001e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.193029  normal  0.0802991 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2778  glutathione S-transferase-like protein  57.71 
 
 
211 aa  230  1e-59  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.910721 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4025  glutathione S-transferase domain-containing protein  58.17 
 
 
213 aa  223  2e-57  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.519007  normal  0.381422 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1911  glutathione S-transferase  54.08 
 
 
207 aa  221  9e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.429964  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4394  Glutathione S-transferase domain  57.21 
 
 
213 aa  219  3e-56  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.297541 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4505  Glutathione S-transferase domain  57.42 
 
 
213 aa  217  7.999999999999999e-56  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.542768  normal  0.527562 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2958  glutathione S-transferase domain-containing protein  53.69 
 
 
211 aa  214  7e-55  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2889  glutathione S-transferase-like  49.28 
 
 
209 aa  185  5e-46  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.737778  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2090  glutathione S-transferase domain-containing protein  48.02 
 
 
227 aa  182  4.0000000000000006e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.403275  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5702  glutathione S-transferase domain-containing protein  44.12 
 
 
214 aa  174  9.999999999999999e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.366134  normal  0.106893 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0847  glutathione S-transferase domain-containing protein  49.22 
 
 
200 aa  172  2.9999999999999996e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.154484 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0537  Glutathione S-transferase domain  43.78 
 
 
222 aa  156  2e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.213809  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3382  glutathione S-transferase domain-containing protein  43.62 
 
 
219 aa  152  4e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.485104  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1820  glutathione S-transferase-like protein  39.6 
 
 
201 aa  151  5.9999999999999996e-36  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.631165 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0607  putative glutathione S-transferase protein  41.75 
 
 
213 aa  149  2e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.254773 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0524  Glutathione S-transferase domain protein  43.01 
 
 
222 aa  149  2e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5220  glutathione S-transferase domain-containing protein  43.09 
 
 
219 aa  150  2e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0962693  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3564  glutathione S-transferase domain-containing protein  43.23 
 
 
211 aa  146  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.146055  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3695  Glutathione S-transferase domain  38.58 
 
 
215 aa  145  4.0000000000000006e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0434501  hitchhiker  0.00000154046 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2508  Glutathione S-transferase domain  42.19 
 
 
214 aa  143  2e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0065  glutathione S-transferase domain-containing protein  36.02 
 
 
213 aa  142  3e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.167606  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4826  glutathione S-transferase domain-containing protein  40.7 
 
 
211 aa  141  6e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.3512  normal  0.0149427 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6685  glutathione S-transferase  38.19 
 
 
214 aa  141  6e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.50271  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1699  Glutathione S-transferase domain protein  41.71 
 
 
211 aa  138  4.999999999999999e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0031  glutathione S-transferase  42.27 
 
 
198 aa  132  5e-30  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.243263 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1358  Glutathione S-transferase domain  36.97 
 
 
206 aa  123  2e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.462445  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1689  glutathione S-transferase-like  36.59 
 
 
213 aa  121  6e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0039  glutathione S-transferase-like  39.69 
 
 
198 aa  120  9.999999999999999e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3463  glutathione S-transferase domain protein  37.81 
 
 
201 aa  117  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0942071  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2222  glutathione S-transferase domain-containing protein  34.74 
 
 
207 aa  115  3.9999999999999997e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.186295 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3527  Glutathione S-transferase domain protein  36.82 
 
 
201 aa  114  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.11732  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3380  glutathione S-transferase-like protein  36.32 
 
 
201 aa  113  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0014  glutathione S-transferase-like protein  34.18 
 
 
223 aa  108  8.000000000000001e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.198681  normal  0.0539534 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2964  glutathione S-transferase domain-containing protein  33.5 
 
 
204 aa  105  7e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0783  glutathione S-transferase domain-containing protein  34.6 
 
 
209 aa  104  9e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.469767 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3183  glutathione S-transferase domain-containing protein  34.93 
 
 
209 aa  104  1e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.413955  normal  0.024534 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0145  glutathione S-transferase domain-containing protein  33.18 
 
 
203 aa  104  1e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.397548  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2389  Glutathione S-transferase domain protein  31.96 
 
 
183 aa  103  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.587961 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2329  glutathione S-transferase-like  33.33 
 
 
204 aa  103  2e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.209551  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2005  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.34 
 
 
202 aa  103  2e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2943  glutathione S-transferase domain-containing protein  33.33 
 
 
204 aa  103  2e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0755  glutathione S-transferase domain-containing protein  35.07 
 
 
209 aa  103  2e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.76216  normal  0.189515 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6295  glutathione S-transferase-like protein  32.99 
 
 
204 aa  103  3e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.14476  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3561  Glutathione S-transferase domain protein  34.6 
 
 
210 aa  102  5e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.134068  normal  0.24035 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0681  glutathione S-transferase domain-containing protein  34.6 
 
 
210 aa  101  8e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.052324  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2990  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.98 
 
 
204 aa  100  1e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3954  glutathione S-transferase domain-containing protein  34.38 
 
 
205 aa  100  1e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.251267 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3478  glutathione S-transferase domain-containing protein  33.33 
 
 
205 aa  99.8  2e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.556825  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2557  glutathione S-transferase-like protein  33.33 
 
 
205 aa  100  2e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.630075 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2937  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.98 
 
 
204 aa  100  2e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5110  glutathione S-transferase domain-containing protein  33.33 
 
 
205 aa  99.8  3e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0347901 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2853  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.47 
 
 
204 aa  99.8  3e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.606213 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4150  glutathione S-transferase domain protein  33.51 
 
 
186 aa  99  4e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.432751 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4110  Glutathione S-transferase domain protein  33.51 
 
 
186 aa  99  4e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3752  glutathione S-transferase domain-containing protein  34.12 
 
 
210 aa  98.2  7e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0132369  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3629  glutathione S-transferase domain-containing protein  34.12 
 
 
210 aa  98.2  7e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.395815  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5300  glutathione S-transferase domain-containing protein  32.81 
 
 
205 aa  98.6  7e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.217524  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0838  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.68 
 
 
227 aa  97.8  9e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0531264  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3513  glutathione S-transferase domain-containing protein  32.38 
 
 
207 aa  97.4  1e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.72335  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0907  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.16 
 
 
207 aa  97.4  1e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5977  glutathione S-transferase domain-containing protein  35.94 
 
 
221 aa  96.7  3e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.9261 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0539  Glutathione S-transferase domain protein  35.68 
 
 
224 aa  95.1  6e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.333365  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2002  glutathione S-transferase-like protein  33.16 
 
 
185 aa  95.1  7e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3767  glutathione S-transferase domain-containing protein  36.65 
 
 
222 aa  94.4  1e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2573  glutathione S-transferase domain-containing protein  35.35 
 
 
221 aa  94  1e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.748409  normal  0.500264 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3264  glutathione S-transferase-like protein  33 
 
 
216 aa  94  2e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0652587  normal  0.563491 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4821  Glutathione S-transferase domain protein  35.86 
 
 
221 aa  93.2  2e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.236344  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3181  glutathione S-transferase domain-containing protein  29.76 
 
 
207 aa  92.8  3e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0144  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.3 
 
 
205 aa  92.4  5e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.764911  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0243  glutathione S-transferase-like  30.41 
 
 
220 aa  92.4  5e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3706  glutathione S-transferase domain-containing protein  32.29 
 
 
210 aa  92.4  5e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4165  glutathione S-transferase-like  32.18 
 
 
225 aa  91.7  8e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0739  glutathione S-transferase-like protein  29.58 
 
 
214 aa  91.3  8e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000125702  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4186  glutathione S-transferase domain-containing protein  34.95 
 
 
202 aa  91.7  8e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.367804  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2968  glutathione S-transferase domain-containing protein  27.96 
 
 
211 aa  91.3  9e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.167267  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2200  glutathione S-transferase-like  32.16 
 
 
216 aa  89.7  3e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.313039 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2423  putative glutathione S-transferase  32.2 
 
 
217 aa  89  5e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.171803  normal  0.428132 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1256  glutathione S-transferase  32.11 
 
 
184 aa  88.2  7e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.522192  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2509  glutathione S-transferase-like protein  34.15 
 
 
208 aa  87.8  1e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.640237  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3205  glutathione S-transferase-like  32.32 
 
 
219 aa  86.7  2e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.877532  normal  0.459209 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22620  Glutathione S-transferase protein  31.25 
 
 
201 aa  85.5  5e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.453028  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0039  glutathione S-transferase-like protein  30.77 
 
 
218 aa  85.5  5e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3680  glutathione S-transferase  30.92 
 
 
215 aa  84.7  9e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0670  putative glutathione S-transferase (GST)  30.05 
 
 
218 aa  84.3  0.000000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.804169  normal  0.0458182 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5803  Glutathione S-transferase domain protein  30.53 
 
 
181 aa  82.8  0.000000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5735  Glutathione S-transferase domain protein  33.16 
 
 
225 aa  82.4  0.000000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03306  putative glutathione S-transferase protein  29.44 
 
 
210 aa  82  0.000000000000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.00013946  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2653  Glutathione S-transferase domain  42.86 
 
 
211 aa  82  0.000000000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.520035  normal  0.305227 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1626  Glutathione S-transferase domain  29.78 
 
 
229 aa  80.5  0.00000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.506745  normal  0.230633 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2628  Glutathione S-transferase domain  33.83 
 
 
200 aa  80.5  0.00000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0359  glutathione S-transferase domain-containing protein  35.86 
 
 
201 aa  80.1  0.00000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  hitchhiker  0.00589351  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2967  glutathione S-transferase-like protein  31.07 
 
 
214 aa  80.1  0.00000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0407  glutathione S-transferase  30.85 
 
 
197 aa  79  0.00000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.830597 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0724  glutathione S-transferase-like  29.19 
 
 
222 aa  79  0.00000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.4337 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>