More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_1924 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010172  Mext_1924  glutathione S-transferase domain-containing protein  100 
 
 
202 aa  412  1e-114  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.896239 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2200  Glutathione S-transferase domain  98.51 
 
 
202 aa  407  1e-113  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3119  putative glutathione S-transferase  47.37 
 
 
207 aa  178  5.999999999999999e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.427542  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2431  Glutathione S-transferase domain  40.7 
 
 
216 aa  157  1e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.342495  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0539  Glutathione S-transferase domain protein  41.62 
 
 
224 aa  155  5.0000000000000005e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.333365  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3264  glutathione S-transferase-like protein  38.69 
 
 
216 aa  150  2e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0652587  normal  0.563491 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2200  glutathione S-transferase-like  38.69 
 
 
216 aa  148  4e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.313039 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3310  glutathione S-transferase domain-containing protein  39.2 
 
 
210 aa  146  2.0000000000000003e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.141117  normal  0.680332 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2573  glutathione S-transferase domain-containing protein  43.5 
 
 
221 aa  145  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.748409  normal  0.500264 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3767  glutathione S-transferase domain-containing protein  39.7 
 
 
222 aa  145  5e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5735  Glutathione S-transferase domain protein  40.1 
 
 
225 aa  142  2e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4165  glutathione S-transferase-like  39.11 
 
 
225 aa  142  3e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3205  glutathione S-transferase-like  37.88 
 
 
219 aa  142  4e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.877532  normal  0.459209 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0670  putative glutathione S-transferase (GST)  35.68 
 
 
218 aa  140  9.999999999999999e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.804169  normal  0.0458182 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5977  glutathione S-transferase domain-containing protein  37.76 
 
 
221 aa  139  3.9999999999999997e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.9261 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3114  glutathione S-transferase-like  39.7 
 
 
218 aa  137  8.999999999999999e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2967  glutathione S-transferase-like protein  38.31 
 
 
214 aa  137  1e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4821  Glutathione S-transferase domain protein  39.2 
 
 
221 aa  136  2e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.236344  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2005  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.85 
 
 
202 aa  127  2.0000000000000002e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2436  putative glutathione S-transferase  30.81 
 
 
209 aa  119  3.9999999999999996e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.117632  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6917  putative glutathione S-transferase  34.45 
 
 
213 aa  115  6e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.522901 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2947  glutathione S-transferase domain-containing protein  32.59 
 
 
222 aa  113  2.0000000000000002e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.282557  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7159  Glutathione S-transferase domain  33.64 
 
 
225 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.218915  normal  0.479865 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3593  glutathione S-transferase-like  35.21 
 
 
221 aa  109  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.404871  normal  0.859314 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1107  glutathione S-transferase  32.72 
 
 
223 aa  109  2.0000000000000002e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.300035  normal  0.477541 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2968  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.88 
 
 
211 aa  108  5e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.167267  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0907  glutathione S-transferase domain-containing protein  32.02 
 
 
207 aa  108  6e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3561  Glutathione S-transferase domain protein  33.82 
 
 
210 aa  108  7.000000000000001e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.134068  normal  0.24035 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0681  glutathione S-transferase domain-containing protein  33.82 
 
 
210 aa  107  1e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.052324  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3629  glutathione S-transferase domain-containing protein  33.82 
 
 
210 aa  107  1e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.395815  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3513  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.53 
 
 
207 aa  107  1e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.72335  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3752  glutathione S-transferase domain-containing protein  33.82 
 
 
210 aa  107  1e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0132369  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0021  glutathione S-transferase-like protein  32.86 
 
 
222 aa  106  2e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0273  putative glutathione S-transferase  32.72 
 
 
225 aa  106  2e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0838  glutathione S-transferase domain-containing protein  32.14 
 
 
227 aa  106  2e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0531264  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1936  Glutathione S-transferase domain protein  34.27 
 
 
214 aa  105  3e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.247506  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0739  glutathione S-transferase-like protein  31.71 
 
 
214 aa  105  4e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000125702  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0724  glutathione S-transferase-like  35.65 
 
 
222 aa  105  4e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.4337 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1175  glutathione S-transferase  30.85 
 
 
208 aa  105  7e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.275426  normal  0.372199 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2222  glutathione S-transferase domain-containing protein  34.34 
 
 
207 aa  104  8e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.186295 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1665  Glutathione S-transferase domain protein  34.27 
 
 
214 aa  104  9e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.192716  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1365  glutathione S-transferase  30.85 
 
 
208 aa  104  1e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.290536  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2125  glutathione S-transferase-like protein  33.49 
 
 
224 aa  103  1e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.850832  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3181  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.53 
 
 
207 aa  103  2e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3183  glutathione S-transferase domain-containing protein  33.82 
 
 
209 aa  103  2e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.413955  normal  0.024534 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0783  glutathione S-transferase domain-containing protein  33.82 
 
 
209 aa  103  2e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.469767 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05193  glutathione S-transferase III  31.34 
 
 
205 aa  103  2e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0755  glutathione S-transferase domain-containing protein  33.82 
 
 
209 aa  103  2e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.76216  normal  0.189515 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1800  glutathione S-transferase domain-containing protein  35.62 
 
 
232 aa  102  3e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03306  putative glutathione S-transferase protein  33.99 
 
 
210 aa  102  3e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.00013946  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4290  glutathione S-transferase domain-containing protein  34.72 
 
 
220 aa  102  5e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.380653 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1060  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.62 
 
 
208 aa  101  6e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.927457 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1863  glutathione S-transferase-like protein  30.96 
 
 
206 aa  101  7e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.546298  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3541  glutathione S-transferase  32.69 
 
 
215 aa  100  1e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.136471  normal  0.509105 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0318  putative glutathione S-transferase III (GST-III)  31.78 
 
 
221 aa  100  1e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.894729  normal  0.561156 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1302  glutathione S-transferase domain protein  34.8 
 
 
222 aa  100  1e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0568234  normal  0.0901172 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3957  glutathione S-transferase-like  30.18 
 
 
221 aa  100  1e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1922  Glutathione S-transferase domain protein  35.16 
 
 
232 aa  99.8  2e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4634  Glutathione transferase  32.09 
 
 
224 aa  99.4  3e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0508  glutathione S-transferase domain-containing protein  29.21 
 
 
213 aa  99.8  3e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.553974 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2557  glutathione S-transferase-like protein  33.33 
 
 
205 aa  99.4  3e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.630075 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3954  glutathione S-transferase domain-containing protein  34.04 
 
 
205 aa  99.8  3e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.251267 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1722  glutathione S-transferase-like protein  30.43 
 
 
208 aa  99.8  3e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0024  Glutathione S-transferase domain  33.33 
 
 
222 aa  97.8  1e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3380  glutathione S-transferase-like protein  32.66 
 
 
201 aa  97.8  1e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0019  glutathione S-transferase-like  35.19 
 
 
222 aa  97.8  1e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3706  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.82 
 
 
210 aa  97.4  1e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3527  Glutathione S-transferase domain protein  32.66 
 
 
201 aa  96.7  2e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.11732  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5300  glutathione S-transferase domain-containing protein  33.69 
 
 
205 aa  96.7  2e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.217524  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2196  glutathione S-transferase domain-containing protein  27.36 
 
 
208 aa  95.9  3e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.827244 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3680  glutathione S-transferase domain-containing protein  33.02 
 
 
233 aa  95.9  3e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.382886  normal  0.017552 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2958  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.3 
 
 
211 aa  96.3  3e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4517  glutathione S-transferase-like  33.02 
 
 
233 aa  95.9  3e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.370294  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3463  glutathione S-transferase domain protein  32.16 
 
 
201 aa  96.3  3e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0942071  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3847  glutathione S-transferase domain-containing protein  33.02 
 
 
233 aa  95.9  3e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.948042  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3478  glutathione S-transferase domain-containing protein  33.16 
 
 
205 aa  95.5  4e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.556825  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2251  Glutathione transferase  31.37 
 
 
201 aa  95.5  5e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1626  Glutathione S-transferase domain  32.58 
 
 
229 aa  95.1  6e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.506745  normal  0.230633 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5110  glutathione S-transferase domain-containing protein  33.51 
 
 
205 aa  95.1  7e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0347901 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1353  Glutathione S-transferase domain protein  32.02 
 
 
209 aa  94.7  8e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.959522  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0806  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.71 
 
 
206 aa  94.7  9e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1385  glutathione S-transferase-like protein  31.07 
 
 
205 aa  94.4  1e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.742051  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1093  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.53 
 
 
209 aa  94  1e-18  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1955  Glutathione S-transferase domain  30.15 
 
 
208 aa  94.4  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0193951  normal  0.329521 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0966  Glutathione S-transferase domain protein  29.85 
 
 
209 aa  93.6  2e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.262392  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3116  Glutathione S-transferase protein  32.72 
 
 
227 aa  93.2  2e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.324582  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0031  glutathione S-transferase  32.18 
 
 
198 aa  92.8  3e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.243263 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1991  glutathione S-transferase domain-containing protein  29.15 
 
 
206 aa  92.4  4e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.175013  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3528  glutathione S-transferase  30.96 
 
 
210 aa  92.4  4e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4480  glutathione S-transferase domain-containing protein  33.64 
 
 
229 aa  92.4  4e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0622605 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0039  glutathione S-transferase-like  32 
 
 
198 aa  91.7  6e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0014  glutathione S-transferase-like protein  32.5 
 
 
223 aa  91.7  7e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.198681  normal  0.0539534 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2249  glutathione S-transferase-like protein  32.08 
 
 
222 aa  91.7  8e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0626984 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00398  glutathione S-transferase  33.19 
 
 
232 aa  91.3  1e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.995047  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1820  glutathione S-transferase-like protein  31.31 
 
 
201 aa  90.5  1e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.631165 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2509  glutathione S-transferase-like protein  33.82 
 
 
208 aa  90.5  1e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.640237  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3744  glutathione S-transferase domain-containing protein  32.55 
 
 
222 aa  90.1  2e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.66674  normal  0.0935446 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0145  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.19 
 
 
203 aa  90.1  2e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.397548  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0265  Glutathione S-transferase domain protein  33.94 
 
 
208 aa  90.1  2e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.850678 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1542  glutathione S-transferase  29.68 
 
 
222 aa  89.7  3e-17  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.172585 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>