More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_2769 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008686  Pden_2769  glutathione S-transferase domain-containing protein  100 
 
 
195 aa  401  1e-111  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0408  glutathione S-transferase-like  57.22 
 
 
200 aa  229  3e-59  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.53035  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0042  glutathione S-transferase-like  56.54 
 
 
196 aa  227  7e-59  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.422861 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0054  glutathione S-transferase like protein  57.54 
 
 
196 aa  210  1e-53  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000644124 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03306  putative glutathione S-transferase protein  34.17 
 
 
210 aa  135  4e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.00013946  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3181  glutathione S-transferase domain-containing protein  36.14 
 
 
207 aa  129  2.0000000000000002e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0739  glutathione S-transferase-like protein  34.8 
 
 
214 aa  127  1.0000000000000001e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000125702  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2968  glutathione S-transferase domain-containing protein  36.59 
 
 
211 aa  118  3.9999999999999996e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.167267  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0783  glutathione S-transferase domain-containing protein  35.5 
 
 
209 aa  118  3.9999999999999996e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.469767 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0907  glutathione S-transferase domain-containing protein  33.17 
 
 
207 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3752  glutathione S-transferase domain-containing protein  38.6 
 
 
210 aa  116  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0132369  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3629  glutathione S-transferase domain-containing protein  38.6 
 
 
210 aa  116  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.395815  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0681  glutathione S-transferase domain-containing protein  38.6 
 
 
210 aa  115  3e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.052324  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3513  glutathione S-transferase domain-containing protein  34.65 
 
 
207 aa  115  3.9999999999999997e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.72335  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3183  glutathione S-transferase domain-containing protein  34.5 
 
 
209 aa  115  3.9999999999999997e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.413955  normal  0.024534 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0755  glutathione S-transferase domain-containing protein  34.5 
 
 
209 aa  115  3.9999999999999997e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.76216  normal  0.189515 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3561  Glutathione S-transferase domain protein  38.01 
 
 
210 aa  112  3e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.134068  normal  0.24035 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0838  glutathione S-transferase domain-containing protein  35.86 
 
 
227 aa  110  1.0000000000000001e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0531264  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3706  glutathione S-transferase domain-containing protein  35.57 
 
 
210 aa  104  6e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2557  glutathione S-transferase-like protein  35.42 
 
 
205 aa  97.4  1e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.630075 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5110  glutathione S-transferase domain-containing protein  35.6 
 
 
205 aa  95.1  5e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0347901 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5300  glutathione S-transferase domain-containing protein  35.94 
 
 
205 aa  94.7  8e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.217524  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3954  glutathione S-transferase domain-containing protein  35.42 
 
 
205 aa  94  1e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.251267 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3478  glutathione S-transferase domain-containing protein  34.55 
 
 
205 aa  93.2  2e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.556825  normal 
 
 
-
 
NC_011694  PHATRDRAFT_50056  predicted protein  31.46 
 
 
233 aa  89  4e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.466232  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0014  glutathione S-transferase-like protein  34.67 
 
 
223 aa  88.2  8e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.198681  normal  0.0539534 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1256  glutathione S-transferase  35.15 
 
 
184 aa  84.3  0.000000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.522192  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2509  glutathione S-transferase-like protein  29.35 
 
 
208 aa  82.8  0.000000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.640237  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2005  glutathione S-transferase domain-containing protein  28.22 
 
 
202 aa  76.6  0.0000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6295  glutathione S-transferase-like protein  33.67 
 
 
204 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.14476  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2329  glutathione S-transferase-like  33.16 
 
 
204 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.209551  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2964  glutathione S-transferase domain-containing protein  33.16 
 
 
204 aa  76.6  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2990  glutathione S-transferase domain-containing protein  33.16 
 
 
204 aa  76.3  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2943  glutathione S-transferase domain-containing protein  33.16 
 
 
204 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2853  glutathione S-transferase domain-containing protein  33.16 
 
 
204 aa  76.3  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.606213 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2937  glutathione S-transferase domain-containing protein  33.16 
 
 
204 aa  75.9  0.0000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3634  glutathione S-transferase domain-containing protein  33.33 
 
 
218 aa  75.1  0.0000000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.890005  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1924  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.03 
 
 
202 aa  75.1  0.0000000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.896239 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1820  glutathione S-transferase-like protein  30.61 
 
 
201 aa  74.3  0.000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.631165 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2200  Glutathione S-transferase domain  31.37 
 
 
202 aa  72.8  0.000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3640  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.79 
 
 
217 aa  72.4  0.000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.390438 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6162  Glutathione S-transferase domain  35.59 
 
 
227 aa  72  0.000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5803  Glutathione S-transferase domain protein  29.65 
 
 
181 aa  72  0.000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3927  Glutathione S-transferase domain  32.84 
 
 
218 aa  72  0.000000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.253948  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4988  glutathione S-transferase-like protein  30.43 
 
 
215 aa  71.2  0.000000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2015  glutathione S-transferase-like  27.23 
 
 
221 aa  70.5  0.00000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0144  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.1 
 
 
205 aa  70.9  0.00000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.764911  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5570  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.22 
 
 
222 aa  70.9  0.00000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.509468  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3744  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.22 
 
 
222 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.66674  normal  0.0935446 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4194  glutathione S-transferase  33.66 
 
 
209 aa  69.3  0.00000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.718748  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2389  Glutathione S-transferase domain protein  31.84 
 
 
183 aa  68.2  0.00000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.587961 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1911  glutathione S-transferase  30.32 
 
 
207 aa  68.2  0.00000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.429964  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0897  glutathione S-transferase  28.42 
 
 
210 aa  68.2  0.00000000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3641  Glutathione S-transferase domain protein  29.67 
 
 
218 aa  68.2  0.00000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2556  glutathione S-transferase domain-containing protein  28.95 
 
 
210 aa  68.2  0.00000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2090  glutathione S-transferase domain-containing protein  34.01 
 
 
227 aa  68.2  0.00000000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.403275  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0539  Glutathione S-transferase domain protein  32.84 
 
 
224 aa  67.8  0.00000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.333365  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2958  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.93 
 
 
211 aa  67.4  0.0000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3463  glutathione S-transferase domain protein  30.77 
 
 
201 aa  67  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0942071  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3528  glutathione S-transferase  29.8 
 
 
210 aa  67.4  0.0000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4110  Glutathione S-transferase domain protein  28.22 
 
 
186 aa  67.8  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4150  glutathione S-transferase domain protein  28.22 
 
 
186 aa  67.8  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.432751 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3917  Glutathione S-transferase domain  30.73 
 
 
218 aa  66.6  0.0000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0306349  normal  0.123136 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0253  glutathione S-transferase domain-containing protein  29.02 
 
 
205 aa  67  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.617633 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0847  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.81 
 
 
200 aa  66.6  0.0000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.154484 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3380  glutathione S-transferase-like protein  30.77 
 
 
201 aa  67  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3310  glutathione S-transferase domain-containing protein  29.95 
 
 
210 aa  67  0.0000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.141117  normal  0.680332 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0273  putative glutathione S-transferase  30.33 
 
 
225 aa  67  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5316  Glutathione S-transferase domain  28.5 
 
 
220 aa  66.6  0.0000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.591495  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3527  Glutathione S-transferase domain protein  30.77 
 
 
201 aa  66.2  0.0000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.11732  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2249  glutathione S-transferase-like protein  29.86 
 
 
222 aa  65.9  0.0000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0626984 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0418  glutathione S-transferase  31.61 
 
 
226 aa  65.5  0.0000000005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.0882437 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2222  glutathione S-transferase domain-containing protein  29.84 
 
 
207 aa  65.5  0.0000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.186295 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5179  glutathione S-transferase-like  29.65 
 
 
231 aa  64.7  0.0000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0776734  normal  0.437986 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1722  glutathione S-transferase-like protein  29.81 
 
 
208 aa  64.7  0.0000000009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3680  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.32 
 
 
233 aa  63.9  0.000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.382886  normal  0.017552 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0269  glutathione S-transferase domain-containing protein  29.94 
 
 
208 aa  64.3  0.000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0065  glutathione S-transferase domain-containing protein  27.27 
 
 
213 aa  64.3  0.000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.167606  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4517  glutathione S-transferase-like  30.32 
 
 
233 aa  63.9  0.000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.370294  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0269  glutathione S-transferase domain-containing protein  29.34 
 
 
208 aa  64.3  0.000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3847  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.32 
 
 
233 aa  63.9  0.000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.948042  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2573  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.35 
 
 
221 aa  63.5  0.000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.748409  normal  0.500264 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4356  glutathione S-transferase domain-containing protein  32.5 
 
 
205 aa  63.5  0.000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0261  glutathione S-transferase domain-containing protein  29.76 
 
 
208 aa  63.5  0.000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2166  Glutathione S-transferase domain protein  29.44 
 
 
208 aa  63.5  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.193029  normal  0.0802991 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1955  Glutathione S-transferase domain  28.57 
 
 
208 aa  63.5  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0193951  normal  0.329521 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1689  glutathione S-transferase-like  28.65 
 
 
213 aa  63.5  0.000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1834  glutathione S-transferase domain-containing protein  28.44 
 
 
219 aa  63.2  0.000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.371565 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0573  glutathione S-transferase domain-containing protein  28.44 
 
 
219 aa  62.8  0.000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.210533  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5702  glutathione S-transferase domain-containing protein  29.47 
 
 
214 aa  62.8  0.000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.366134  normal  0.106893 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0995  glutathione S-transferase domain-containing protein  29.17 
 
 
213 aa  62.8  0.000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.59438 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1254  glutathione S-transferase-like  30.89 
 
 
229 aa  62.4  0.000000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0201238  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49100  glutathione S-transferase  32.18 
 
 
209 aa  62.4  0.000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000404937 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2474  glutathione S-transferase family protein  28 
 
 
206 aa  62  0.000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00158542  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3695  Glutathione S-transferase domain  27.08 
 
 
215 aa  62  0.000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0434501  hitchhiker  0.00000154046 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3675  glutathione S-transferase-like protein  28.02 
 
 
220 aa  62  0.000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6685  glutathione S-transferase  29.74 
 
 
214 aa  62  0.000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.50271  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0265  Glutathione S-transferase domain protein  28.74 
 
 
208 aa  62  0.000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.850678 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3767  glutathione S-transferase domain-containing protein  32.51 
 
 
222 aa  61.6  0.000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2508  Glutathione S-transferase domain  30.73 
 
 
214 aa  61.2  0.000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>