More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_3513 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_3513  glutathione S-transferase domain-containing protein  100 
 
 		 207 aa  422  1e-117  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.72335  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0907  glutathione S-transferase domain-containing protein  86.47 
 
 		 207 aa  379  1e-104  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3181  glutathione S-transferase domain-containing protein  76.7 
 
 		 207 aa  333  1e-90  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2968  glutathione S-transferase domain-containing protein  68.93 
 
 		 211 aa  302  2.0000000000000002e-81  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.167267  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3561  Glutathione S-transferase domain protein  68.16 
 
 		 210 aa  294  7e-79  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.134068  normal  0.24035 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0681  glutathione S-transferase domain-containing protein  68.16 
 
 		 210 aa  293  9e-79  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.052324  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0783  glutathione S-transferase domain-containing protein  69.15 
 
 		 209 aa  292  2e-78  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.469767 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3629  glutathione S-transferase domain-containing protein  68.16 
 
 		 210 aa  293  2e-78  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.395815  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3752  glutathione S-transferase domain-containing protein  68.16 
 
 		 210 aa  293  2e-78  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0132369  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3183  glutathione S-transferase domain-containing protein  68.66 
 
 		 209 aa  289  2e-77  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.413955  normal  0.024534 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0755  glutathione S-transferase domain-containing protein  67.66 
 
 		 209 aa  289  2e-77  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.76216  normal  0.189515 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0739  glutathione S-transferase-like protein  62.2 
 
 		 214 aa  270  9e-72  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000125702  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0838  glutathione S-transferase domain-containing protein  60.62 
 
 		 227 aa  256  2e-67  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0531264  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03306  putative glutathione S-transferase protein  39.02 
 
 		 210 aa  159  3e-38  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.00013946  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5110  glutathione S-transferase domain-containing protein  40.38 
 
 		 205 aa  153  1e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0347901 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3954  glutathione S-transferase domain-containing protein  41.45 
 
 		 205 aa  152  4e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.251267 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3706  glutathione S-transferase domain-containing protein  39.23 
 
 		 210 aa  150  2e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2557  glutathione S-transferase-like protein  40.93 
 
 		 205 aa  149  4e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.630075 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5300  glutathione S-transferase domain-containing protein  40.51 
 
 		 205 aa  147  9e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.217524  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3478  glutathione S-transferase domain-containing protein  40 
 
 		 205 aa  146  2.0000000000000003e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.556825  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0014  glutathione S-transferase-like protein  38.19 
 
 		 223 aa  132  3e-30  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.198681  normal  0.0539534 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2509  glutathione S-transferase-like protein  39.3 
 
 		 208 aa  126  2.0000000000000002e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.640237  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2005  glutathione S-transferase domain-containing protein  36.5 
 
 		 202 aa  124  7e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0042  glutathione S-transferase-like  36.63 
 
 		 196 aa  118  4.9999999999999996e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.422861 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0408  glutathione S-transferase-like  35.68 
 
 		 200 aa  116  3e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.53035  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0847  glutathione S-transferase domain-containing protein  35.86 
 
 		 200 aa  116  3e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.154484 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2769  glutathione S-transferase domain-containing protein  34.65 
 
 		 195 aa  115  5e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0537  Glutathione S-transferase domain  37.62 
 
 		 222 aa  115  6e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.213809  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3382  glutathione S-transferase domain-containing protein  36 
 
 		 219 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.485104  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3463  glutathione S-transferase domain protein  35 
 
 		 201 aa  109  3e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0942071  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3380  glutathione S-transferase-like protein  34.5 
 
 		 201 aa  109  3e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0524  Glutathione S-transferase domain protein  37.37 
 
 		 222 aa  108  6e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5220  glutathione S-transferase domain-containing protein  35.5 
 
 		 219 aa  108  7.000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0962693  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2200  Glutathione S-transferase domain  31.53 
 
 		 202 aa  108  8.000000000000001e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3527  Glutathione S-transferase domain protein  34.5 
 
 		 201 aa  107  1e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.11732  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1924  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.53 
 
 		 202 aa  107  1e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.896239 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0031  glutathione S-transferase  37.5 
 
 		 198 aa  106  3e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.243263 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2222  glutathione S-transferase domain-containing protein  35.35 
 
 		 207 aa  104  8e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.186295 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5702  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.34 
 
 		 214 aa  103  1e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.366134  normal  0.106893 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1699  Glutathione S-transferase domain protein  33.99 
 
 		 211 aa  104  1e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0607  putative glutathione S-transferase protein  34.13 
 
 		 213 aa  103  2e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.254773 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4826  glutathione S-transferase domain-containing protein  34.98 
 
 		 211 aa  102  3e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.3512  normal  0.0149427 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5803  Glutathione S-transferase domain protein  33.01 
 
 		 181 aa  101  6e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3695  Glutathione S-transferase domain  30.88 
 
 		 215 aa  101  9e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0434501  hitchhiker  0.00000154046 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3640  glutathione S-transferase domain-containing protein  37.62 
 
 		 217 aa  99.8  2e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.390438 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2015  glutathione S-transferase-like  30.77 
 
 		 221 aa  100  2e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2358  Glutathione S-transferase domain protein  32.65 
 
 		 205 aa  100  2e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.426471  normal  0.105862 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0054  glutathione S-transferase like protein  37.79 
 
 		 196 aa  98.2  7e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000644124 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1358  Glutathione S-transferase domain  31.25 
 
 		 206 aa  97.4  1e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.462445  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2749  putative glutathione S-transferase  28.1 
 
 		 216 aa  96.7  2e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.414425  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4150  glutathione S-transferase domain protein  32.37 
 
 		 186 aa  96.7  2e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.432751 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0359  glutathione S-transferase domain-containing protein  36.5 
 
 		 201 aa  97.1  2e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  hitchhiker  0.00589351  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4110  Glutathione S-transferase domain protein  32.37 
 
 		 186 aa  96.7  2e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2508  Glutathione S-transferase domain  30.3 
 
 		 214 aa  96.3  3e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0039  glutathione S-transferase-like  35 
 
 		 198 aa  95.9  3e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0065  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.39 
 
 		 213 aa  95.9  4e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.167606  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2967  glutathione S-transferase-like protein  34.85 
 
 		 214 aa  95.5  4e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1256  glutathione S-transferase  31.22 
 
 		 184 aa  95.5  6e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.522192  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0897  glutathione S-transferase  31.82 
 
 		 210 aa  95.1  7e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2200  glutathione S-transferase-like  31.28 
 
 		 216 aa  95.1  7e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.313039 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2556  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.82 
 
 		 210 aa  94  1e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3564  glutathione S-transferase domain-containing protein  33.5 
 
 		 211 aa  94.4  1e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.146055  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2221  glutathionine S-transferase  34.47 
 
 		 201 aa  94.4  1e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0005501 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0995  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.81 
 
 		 213 aa  93.6  2e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.59438 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2436  putative glutathione S-transferase  32.69 
 
 		 209 aa  92.4  4e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.117632  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6685  glutathione S-transferase  31.75 
 
 		 214 aa  92.4  4e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.50271  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2573  glutathione S-transferase domain-containing protein  32.54 
 
 		 221 aa  92.4  4e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.748409  normal  0.500264 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2477  glutathione S-transferase domain-containing protein  34.15 
 
 		 201 aa  92.4  4e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0406  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.41 
 
 		 235 aa  92.4  4e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.157624  normal  0.164436 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5855  glutathione S-transferase domain-containing protein  34.36 
 
 		 213 aa  92.4  5e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1991  glutathione S-transferase domain-containing protein  32.37 
 
 		 206 aa  92  5e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.175013  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2958  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.63 
 
 		 211 aa  91.7  7e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1883  glutathionine S-transferase  33.97 
 
 		 201 aa  91.7  8e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1911  glutathione S-transferase  31.68 
 
 		 207 aa  91.7  8e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.429964  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1775  glutathionine S-transferase  33.97 
 
 		 201 aa  91.7  8e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2552  glutathionine S-transferase  33.97 
 
 		 201 aa  91.7  8e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.183983  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4603  glutathione S-transferase-like protein  34.13 
 
 		 204 aa  91.3  9e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0513  Glutathione S-transferase domain protein  30.56 
 
 		 236 aa  91.3  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0574717 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1936  Glutathione S-transferase domain protein  33.18 
 
 		 214 aa  90.9  1e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.247506  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3264  glutathione S-transferase-like protein  29.86 
 
 		 216 aa  91.3  1e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0652587  normal  0.563491 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2653  Glutathione S-transferase domain  30.54 
 
 		 211 aa  90.9  1e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.520035  normal  0.305227 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3310  glutathione S-transferase domain-containing protein  34.1 
 
 		 210 aa  90.9  1e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.141117  normal  0.680332 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2002  glutathione S-transferase-like protein  29.7 
 
 		 185 aa  90.1  2e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0888  Glutathione S-transferase domain  33.81 
 
 		 204 aa  90.1  2e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2389  Glutathione S-transferase domain protein  28.71 
 
 		 183 aa  90.1  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.587961 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2090  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.4 
 
 		 227 aa  90.5  2e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.403275  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3528  glutathione S-transferase  28.65 
 
 		 210 aa  89.4  4e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2594  glutathione S-transferase  32.68 
 
 		 204 aa  88.6  5e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.287653  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2223  Glutathione S-transferase domain  32.68 
 
 		 204 aa  88.6  5e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.809628  normal  0.501649 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4394  Glutathione S-transferase domain  32.09 
 
 		 213 aa  89  5e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.297541 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0243  glutathione S-transferase-like  31.51 
 
 		 220 aa  88.6  6e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2166  Glutathione S-transferase domain protein  31.82 
 
 		 208 aa  88.6  7e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.193029  normal  0.0802991 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1665  Glutathione S-transferase domain protein  32.74 
 
 		 214 aa  88.2  7e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.192716  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4025  glutathione S-transferase domain-containing protein  32.09 
 
 		 213 aa  88.2  8e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.519007  normal  0.381422 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0253  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.88 
 
 		 205 aa  86.7  2e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.617633 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2431  Glutathione S-transferase domain  28.1 
 
 		 216 aa  87  2e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.342495  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1529  glutathione S-transferase domain-containing protein  32.09 
 
 		 235 aa  86.7  2e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.623828  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0144  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.88 
 
 		 205 aa  87  2e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.764911  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3957  glutathione S-transferase-like  30.18 
 
 		 221 aa  86.3  3e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1820  glutathione S-transferase-like protein  30.29 
 
 		 201 aa  86.3  3e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.631165 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>