More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_0739 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007954  Sden_0739  glutathione S-transferase-like protein  100 
 
 		 214 aa  437  9.999999999999999e-123  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000125702  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2968  glutathione S-transferase domain-containing protein  66.82 
 
 		 211 aa  297  1e-79  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.167267  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3181  glutathione S-transferase domain-containing protein  68.27 
 
 		 207 aa  285  5e-76  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0907  glutathione S-transferase domain-containing protein  64.11 
 
 		 207 aa  278  6e-74  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3183  glutathione S-transferase domain-containing protein  63.85 
 
 		 209 aa  278  6e-74  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.413955  normal  0.024534 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0783  glutathione S-transferase domain-containing protein  63.38 
 
 		 209 aa  276  2e-73  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.469767 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3561  Glutathione S-transferase domain protein  61.43 
 
 		 210 aa  270  1e-71  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.134068  normal  0.24035 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3513  glutathione S-transferase domain-containing protein  62.2 
 
 		 207 aa  270  1e-71  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.72335  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0755  glutathione S-transferase domain-containing protein  61.97 
 
 		 209 aa  270  1e-71  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.76216  normal  0.189515 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0681  glutathione S-transferase domain-containing protein  61.43 
 
 		 210 aa  270  2e-71  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.052324  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3752  glutathione S-transferase domain-containing protein  61.43 
 
 		 210 aa  268  4e-71  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0132369  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3629  glutathione S-transferase domain-containing protein  61.43 
 
 		 210 aa  268  4e-71  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.395815  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0838  glutathione S-transferase domain-containing protein  61.79 
 
 		 227 aa  257  1e-67  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0531264  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03306  putative glutathione S-transferase protein  41.04 
 
 		 210 aa  154  1e-36  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.00013946  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5300  glutathione S-transferase domain-containing protein  38.97 
 
 		 205 aa  145  7.0000000000000006e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.217524  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3706  glutathione S-transferase domain-containing protein  40.4 
 
 		 210 aa  144  9e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3478  glutathione S-transferase domain-containing protein  38.5 
 
 		 205 aa  142  4e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.556825  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5110  glutathione S-transferase domain-containing protein  40.31 
 
 		 205 aa  142  5e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0347901 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3954  glutathione S-transferase domain-containing protein  38.5 
 
 		 205 aa  141  6e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.251267 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2557  glutathione S-transferase-like protein  38.79 
 
 		 205 aa  141  7e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.630075 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2769  glutathione S-transferase domain-containing protein  34.8 
 
 		 195 aa  127  2.0000000000000002e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0408  glutathione S-transferase-like  36.18 
 
 		 200 aa  122  3e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.53035  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2509  glutathione S-transferase-like protein  34.67 
 
 		 208 aa  120  9.999999999999999e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.640237  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0054  glutathione S-transferase like protein  37.1 
 
 		 196 aa  115  5e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000644124 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0014  glutathione S-transferase-like protein  36.82 
 
 		 223 aa  114  1.0000000000000001e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.198681  normal  0.0539534 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0042  glutathione S-transferase-like  35.68 
 
 		 196 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.422861 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2005  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.19 
 
 		 202 aa  109  4.0000000000000004e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2200  Glutathione S-transferase domain  31.71 
 
 		 202 aa  107  2e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1924  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.71 
 
 		 202 aa  105  5e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.896239 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3528  glutathione S-transferase  32.23 
 
 		 210 aa  103  1e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0847  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.81 
 
 		 200 aa  97.8  1e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.154484 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2015  glutathione S-transferase-like  30.6 
 
 		 221 aa  95.5  5e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1991  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.48 
 
 		 206 aa  93.2  3e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.175013  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0253  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.66 
 
 		 205 aa  91.3  9e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.617633 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4110  Glutathione S-transferase domain protein  31.43 
 
 		 186 aa  90.5  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4150  glutathione S-transferase domain protein  31.43 
 
 		 186 aa  90.5  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.432751 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2967  glutathione S-transferase-like protein  31.22 
 
 		 214 aa  89.4  4e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0897  glutathione S-transferase  30.15 
 
 		 210 aa  88.2  8e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2556  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.15 
 
 		 210 aa  87.8  1e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5855  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.62 
 
 		 213 aa  86.7  2e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2935  glutathione S-transferase domain-containing protein  32.88 
 
 		 210 aa  87  2e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3380  glutathione S-transferase-like protein  31.31 
 
 		 201 aa  86.3  3e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0537  Glutathione S-transferase domain  30.09 
 
 		 222 aa  85.5  5e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.213809  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4356  glutathione S-transferase domain-containing protein  28.21 
 
 		 205 aa  85.5  6e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3382  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.96 
 
 		 219 aa  85.5  6e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.485104  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3640  glutathione S-transferase domain-containing protein  33.33 
 
 		 217 aa  85.5  6e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.390438 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0065  glutathione S-transferase domain-containing protein  29.47 
 
 		 213 aa  84.3  0.000000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.167606  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5803  Glutathione S-transferase domain protein  30.29 
 
 		 181 aa  84.3  0.000000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3463  glutathione S-transferase domain protein  30.81 
 
 		 201 aa  84.3  0.000000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0942071  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0524  Glutathione S-transferase domain protein  28.86 
 
 		 222 aa  83.6  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3527  Glutathione S-transferase domain protein  30.81 
 
 		 201 aa  83.6  0.000000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.11732  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5220  glutathione S-transferase domain-containing protein  29.59 
 
 		 219 aa  82.8  0.000000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0962693  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2200  glutathione S-transferase-like  30.73 
 
 		 216 aa  82.4  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.313039 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3564  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.1 
 
 		 211 aa  82.4  0.000000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.146055  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3114  glutathione S-transferase-like  29.95 
 
 		 218 aa  82  0.000000000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0539  Glutathione S-transferase domain protein  31.46 
 
 		 224 aa  82  0.000000000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.333365  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1946  Glutathione S-transferase domain protein  30.15 
 
 		 205 aa  82  0.000000000000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.243361  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3310  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.7 
 
 		 210 aa  81.3  0.00000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.141117  normal  0.680332 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0359  glutathione S-transferase domain-containing protein  32.83 
 
 		 201 aa  81.3  0.00000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  hitchhiker  0.00589351  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1820  glutathione S-transferase-like protein  28.91 
 
 		 201 aa  80.9  0.00000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.631165 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1834  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.13 
 
 		 219 aa  81.3  0.00000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.371565 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2222  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.15 
 
 		 207 aa  80.5  0.00000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.186295 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2747  glutathione S-transferase domain-containing protein  33.33 
 
 		 206 aa  80.1  0.00000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2573  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.2 
 
 		 221 aa  80.1  0.00000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.748409  normal  0.500264 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2665  putative glutathione S-transferase  33.33 
 
 		 206 aa  80.1  0.00000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1542  putative glutathione S-transferase  32.76 
 
 		 206 aa  79.7  0.00000000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.908985 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4826  glutathione S-transferase domain-containing protein  29.8 
 
 		 211 aa  79  0.00000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.3512  normal  0.0149427 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2238  glutathione S-transferase domain-containing protein  29.41 
 
 		 206 aa  79  0.00000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.237736  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2389  Glutathione S-transferase domain protein  29.65 
 
 		 183 aa  79  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.587961 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2653  Glutathione S-transferase domain  28.57 
 
 		 211 aa  79  0.00000000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.520035  normal  0.305227 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5702  glutathione S-transferase domain-containing protein  26.92 
 
 		 214 aa  78.6  0.00000000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.366134  normal  0.106893 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4505  Glutathione S-transferase domain  29.84 
 
 		 213 aa  78.6  0.00000000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.542768  normal  0.527562 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0508  glutathione S-transferase domain-containing protein  27.67 
 
 		 213 aa  78.6  0.00000000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.553974 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4025  glutathione S-transferase domain-containing protein  29.32 
 
 		 213 aa  78.6  0.00000000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.519007  normal  0.381422 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4895  Glutathione S-transferase domain  33.14 
 
 		 208 aa  78.2  0.00000000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.123273 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1679  Glutathione S-transferase domain protein  30.65 
 
 		 205 aa  78.2  0.0000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.000555439  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0607  putative glutathione S-transferase protein  27.91 
 
 		 213 aa  77.8  0.0000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.254773 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6685  glutathione S-transferase  29.8 
 
 		 214 aa  77.8  0.0000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.50271  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1256  glutathione S-transferase  28.5 
 
 		 184 aa  77.4  0.0000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.522192  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0243  glutathione S-transferase-like  28.64 
 
 		 220 aa  77.8  0.0000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4394  Glutathione S-transferase domain  29.32 
 
 		 213 aa  77.8  0.0000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.297541 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3264  glutathione S-transferase-like protein  28.29 
 
 		 216 aa  77  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0652587  normal  0.563491 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0670  putative glutathione S-transferase (GST)  30.05 
 
 		 218 aa  76.6  0.0000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.804169  normal  0.0458182 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2946  glutathione S-transferase-like  27.44 
 
 		 207 aa  76.3  0.0000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.138304  hitchhiker  0.0000427807 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1775  glutathione S-transferase  30.81 
 
 		 208 aa  76.3  0.0000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000137039 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2166  Glutathione S-transferase domain protein  27.91 
 
 		 208 aa  75.9  0.0000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.193029  normal  0.0802991 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2300  Glutathione S-transferase domain protein  30.35 
 
 		 205 aa  76.3  0.0000000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2344  glutathione S-transferase  29.41 
 
 		 206 aa  75.9  0.0000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.305132  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1576  glutathione S-transferase family protein  29.94 
 
 		 222 aa  75.5  0.0000000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0144  glutathione S-transferase domain-containing protein  28.5 
 
 		 205 aa  75.9  0.0000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.764911  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2958  glutathione S-transferase domain-containing protein  29.91 
 
 		 211 aa  75.5  0.0000000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2436  putative glutathione S-transferase  28.57 
 
 		 209 aa  75.1  0.0000000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.117632  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2221  glutathionine S-transferase  31.58 
 
 		 201 aa  75.1  0.0000000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0005501 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2002  glutathione S-transferase-like protein  26.37 
 
 		 185 aa  75.1  0.0000000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1148  Glutathione S-transferase protein  29.56 
 
 		 213 aa  75.1  0.0000000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2749  putative glutathione S-transferase  26.21 
 
 		 216 aa  74.3  0.000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.414425  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0039  glutathione S-transferase-like protein  28.57 
 
 		 218 aa  74.3  0.000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3119  putative glutathione S-transferase  27.4 
 
 		 207 aa  74.7  0.000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.427542  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3205  glutathione S-transferase-like  29.44 
 
 		 219 aa  74.7  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.877532  normal  0.459209 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0907  Glutathione S-transferase domain protein  28.77 
 
 		 221 aa  74.3  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0411393  normal  0.132395 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>