More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_1834 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008686  Pden_1834  glutathione S-transferase domain-containing protein  100 
 
 
219 aa  449  1e-125  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.371565 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0769  glutathione S-transferase  57.53 
 
 
219 aa  240  1e-62  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.608104  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2427  glutathione S-transferase domain-containing protein  57.08 
 
 
219 aa  240  2e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.340237  normal  0.0428234 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0573  glutathione S-transferase domain-containing protein  54.79 
 
 
219 aa  236  1e-61  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.210533  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1170  glutathione S-transferase  54.84 
 
 
217 aa  234  9e-61  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.859877  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3641  Glutathione S-transferase domain protein  55.25 
 
 
218 aa  225  3e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0907  Glutathione S-transferase domain protein  50.46 
 
 
221 aa  222  3e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0411393  normal  0.132395 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0794  Glutathione S-transferase domain  48.62 
 
 
221 aa  219  3e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.730011  normal  0.341274 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2015  glutathione S-transferase-like  36.16 
 
 
221 aa  133  1.9999999999999998e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4356  glutathione S-transferase domain-containing protein  36.97 
 
 
205 aa  103  1e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0014  glutathione S-transferase-like protein  36.67 
 
 
223 aa  103  1e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.198681  normal  0.0539534 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3706  glutathione S-transferase domain-containing protein  33.5 
 
 
210 aa  98.6  6e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5110  glutathione S-transferase domain-containing protein  34.91 
 
 
205 aa  98.6  6e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0347901 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4110  Glutathione S-transferase domain protein  35.32 
 
 
186 aa  93.6  2e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4150  glutathione S-transferase domain protein  35.32 
 
 
186 aa  93.6  2e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.432751 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2200  Glutathione S-transferase domain  26.64 
 
 
202 aa  90.5  2e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4748  glutathione S-transferase domain-containing protein  36.42 
 
 
222 aa  89.4  4e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1924  glutathione S-transferase domain-containing protein  26.64 
 
 
202 aa  89  6e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.896239 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2245  glutathione S-transferase domain-containing protein  34.13 
 
 
207 aa  88.2  9e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.597175 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3463  glutathione S-transferase domain protein  31.6 
 
 
201 aa  87.4  2e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0942071  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2557  glutathione S-transferase-like protein  31.88 
 
 
205 aa  86.7  2e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.630075 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3380  glutathione S-transferase-like protein  30.66 
 
 
201 aa  87.4  2e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3527  Glutathione S-transferase domain protein  31.13 
 
 
201 aa  86.7  3e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.11732  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3954  glutathione S-transferase domain-containing protein  32.52 
 
 
205 aa  85.5  6e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.251267 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1175  glutathione S-transferase  30.41 
 
 
208 aa  84.7  9e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.275426  normal  0.372199 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5855  glutathione S-transferase domain-containing protein  32.59 
 
 
213 aa  84.7  9e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3513  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.53 
 
 
207 aa  84.7  0.000000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.72335  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2002  glutathione S-transferase-like protein  30.48 
 
 
185 aa  83.6  0.000000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3593  glutathione S-transferase-like  28.57 
 
 
221 aa  84  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.404871  normal  0.859314 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5300  glutathione S-transferase domain-containing protein  32.52 
 
 
205 aa  83.6  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.217524  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0907  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.39 
 
 
207 aa  83.2  0.000000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0739  glutathione S-transferase-like protein  31.63 
 
 
214 aa  82.4  0.000000000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000125702  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3478  glutathione S-transferase domain-containing protein  32.04 
 
 
205 aa  82.8  0.000000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.556825  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1365  glutathione S-transferase  30.28 
 
 
208 aa  82  0.000000000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.290536  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1800  glutathione S-transferase domain-containing protein  29.82 
 
 
232 aa  81.6  0.000000000000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2968  glutathione S-transferase domain-containing protein  33.01 
 
 
211 aa  81.3  0.00000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.167267  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0755  glutathione S-transferase domain-containing protein  32.21 
 
 
209 aa  81.3  0.00000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.76216  normal  0.189515 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1922  Glutathione S-transferase domain protein  29.39 
 
 
232 aa  80.5  0.00000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2330  glutathione S-transferase domain-containing protein  29.67 
 
 
210 aa  80.1  0.00000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.639612  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0783  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.73 
 
 
209 aa  80.5  0.00000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.469767 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3183  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.73 
 
 
209 aa  79.7  0.00000000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.413955  normal  0.024534 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2389  Glutathione S-transferase domain protein  31.13 
 
 
183 aa  79  0.00000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.587961 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0838  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.81 
 
 
227 aa  78.6  0.00000000000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0531264  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3325  glutathione S-transferase domain-containing protein  29.09 
 
 
211 aa  77.4  0.0000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0807444 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2579  glutathione S-transferase domain-containing protein  34.48 
 
 
217 aa  77.8  0.0000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.983145  normal  0.664042 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2200  putative glutathione S-transferase-like protein  31.16 
 
 
225 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.801388  hitchhiker  0.00721495 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7159  Glutathione S-transferase domain  30.04 
 
 
225 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.218915  normal  0.479865 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0681  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.65 
 
 
210 aa  76.6  0.0000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.052324  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0508  glutathione S-transferase domain-containing protein  27.7 
 
 
213 aa  76.3  0.0000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.553974 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00398  glutathione S-transferase  27.68 
 
 
232 aa  76.3  0.0000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.995047  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3752  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.65 
 
 
210 aa  75.9  0.0000000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0132369  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3629  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.65 
 
 
210 aa  75.9  0.0000000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.395815  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3077  glutathione S-transferase-like  31.37 
 
 
214 aa  75.5  0.0000000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.187241  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2009  Glutathione S-transferase domain  30.28 
 
 
207 aa  75.5  0.0000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.500519  normal  0.375789 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0273  putative glutathione S-transferase  29.6 
 
 
225 aa  75.5  0.0000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3541  glutathione S-transferase  29.25 
 
 
215 aa  75.5  0.0000000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.136471  normal  0.509105 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4925  Glutathione S-transferase domain protein  30.14 
 
 
223 aa  75.5  0.0000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.18954  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0016  glutathione S-transferase-like protein  34.95 
 
 
224 aa  75.1  0.0000000000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.0486825 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0039  glutathione S-transferase-like protein  32.95 
 
 
218 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0021  glutathione S-transferase-like protein  27.15 
 
 
222 aa  74.3  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6622  glutathione S-transferase domain-containing protein  28.5 
 
 
214 aa  74.3  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.25172  normal  0.643167 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0724  glutathione S-transferase-like  27.27 
 
 
222 aa  74.3  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.4337 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3181  glutathione S-transferase domain-containing protein  28.91 
 
 
207 aa  74.3  0.000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2947  glutathione S-transferase domain-containing protein  27.15 
 
 
222 aa  74.3  0.000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.282557  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0797  glutathione S-transferase domain-containing protein  33.13 
 
 
205 aa  74.7  0.000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.360126 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4710  glutathione S-transferase domain-containing protein  29.95 
 
 
207 aa  74.3  0.000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.131353  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4480  glutathione S-transferase domain-containing protein  27.75 
 
 
229 aa  74.3  0.000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0622605 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6142  glutathione S-transferase domain-containing protein  28.1 
 
 
214 aa  73.6  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.563999 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1174  Glutathione S-transferase domain protein  30.37 
 
 
207 aa  73.6  0.000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1256  glutathione S-transferase  29.72 
 
 
184 aa  73.9  0.000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.522192  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3556  Glutathione S-transferase domain protein  26.42 
 
 
215 aa  73.6  0.000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5777  glutathione S-transferase-like  28.1 
 
 
214 aa  73.6  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.184007  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40070  putative glutathione S-transferase  29.72 
 
 
207 aa  73.6  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.151976  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1387  Glutathione S-transferase domain protein  28.74 
 
 
201 aa  73.6  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2222  glutathione S-transferase domain-containing protein  29.25 
 
 
207 aa  73.2  0.000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.186295 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0024  Glutathione S-transferase domain  26.7 
 
 
222 aa  73.2  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3561  Glutathione S-transferase domain protein  31.19 
 
 
210 aa  73.2  0.000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.134068  normal  0.24035 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3587  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.86 
 
 
203 aa  73.2  0.000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0707812  hitchhiker  0.000377551 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2005  glutathione S-transferase domain-containing protein  28.91 
 
 
202 aa  73.2  0.000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2090  glutathione S-transferase domain-containing protein  29.67 
 
 
227 aa  72.4  0.000000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.403275  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2668  glutathione S-transferase-like  29.25 
 
 
226 aa  72.4  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.111492  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1948  hypothetical protein  27.31 
 
 
207 aa  72.4  0.000000000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3104  Glutathione S-transferase domain protein  29.91 
 
 
207 aa  72  0.000000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0203  glutathione S-transferase-like protein  28.57 
 
 
207 aa  72  0.000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.645095 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3767  glutathione S-transferase domain-containing protein  28.38 
 
 
222 aa  72  0.000000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2641  Glutathione S-transferase domain  29.05 
 
 
218 aa  72  0.000000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.213293 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4634  Glutathione transferase  26.79 
 
 
224 aa  72  0.000000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5257  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.34 
 
 
220 aa  72  0.000000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.619423 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5413  glutathione S-transferase-like  28.44 
 
 
207 aa  71.6  0.000000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.763921  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4290  glutathione S-transferase domain-containing protein  27.27 
 
 
220 aa  71.6  0.000000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.380653 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5448  glutathione S-transferase domain-containing protein  28.44 
 
 
207 aa  71.6  0.000000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.504175 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4821  glutathione S-transferase domain-containing protein  28.44 
 
 
207 aa  71.6  0.000000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.62479  normal  0.686923 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1521  glutathione S-transferase  29.05 
 
 
207 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0019  glutathione S-transferase family protein  29.05 
 
 
207 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.207851  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7686  glutathione S-transferase-like protein  27.23 
 
 
214 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.474064  normal  0.495812 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1164  glutathione S-transferase  29.05 
 
 
207 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2631  glutathione S-transferase-like protein  28.77 
 
 
208 aa  71.2  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.763244 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1443  glutathione S-transferase  29.05 
 
 
207 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0019  glutathione S-transferase-like  25.91 
 
 
222 aa  70.9  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4773  glutathione S-transferase-like  33.56 
 
 
206 aa  71.2  0.00000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.122319  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>