More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_1175 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007005  Psyr_1175  glutathione S-transferase  100 
 
 
208 aa  423  1e-118  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.275426  normal  0.372199 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1365  glutathione S-transferase  93.75 
 
 
208 aa  399  9.999999999999999e-111  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.290536  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1060  glutathione S-transferase domain-containing protein  64.42 
 
 
208 aa  283  1.0000000000000001e-75  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.927457 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2196  glutathione S-transferase domain-containing protein  60.1 
 
 
208 aa  265  2.9999999999999995e-70  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.827244 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2631  glutathione S-transferase-like protein  60.98 
 
 
208 aa  263  2e-69  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.763244 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2668  glutathione S-transferase-like  59.51 
 
 
226 aa  260  8.999999999999999e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.111492  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1722  glutathione S-transferase-like protein  55.67 
 
 
208 aa  237  9e-62  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2249  glutathione S-transferase-like protein  50.9 
 
 
222 aa  225  3e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0626984 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0273  putative glutathione S-transferase  51.58 
 
 
225 aa  222  4e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5570  glutathione S-transferase domain-containing protein  50.45 
 
 
222 aa  219  1.9999999999999999e-56  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.509468  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3744  glutathione S-transferase domain-containing protein  50 
 
 
222 aa  218  3.9999999999999997e-56  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.66674  normal  0.0935446 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1276  glutathione S-transferase-like  52.71 
 
 
208 aa  218  5e-56  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.398915  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4517  glutathione S-transferase-like  50.45 
 
 
233 aa  218  5e-56  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.370294  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3680  glutathione S-transferase domain-containing protein  50.45 
 
 
233 aa  218  5e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.382886  normal  0.017552 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3847  glutathione S-transferase domain-containing protein  50.45 
 
 
233 aa  218  5e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.948042  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7159  Glutathione S-transferase domain  50.23 
 
 
225 aa  216  1e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.218915  normal  0.479865 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0021  glutathione S-transferase-like protein  49.55 
 
 
222 aa  209  2e-53  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0024  Glutathione S-transferase domain  50 
 
 
222 aa  207  9e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2947  glutathione S-transferase domain-containing protein  47.3 
 
 
222 aa  206  2e-52  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.282557  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4290  glutathione S-transferase domain-containing protein  48.87 
 
 
220 aa  204  1e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.380653 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1107  glutathione S-transferase  49.32 
 
 
223 aa  204  1e-51  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.300035  normal  0.477541 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0724  glutathione S-transferase-like  48.2 
 
 
222 aa  203  2e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.4337 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4634  Glutathione transferase  48.2 
 
 
224 aa  202  3e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0019  glutathione S-transferase-like  50 
 
 
222 aa  201  6e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3957  glutathione S-transferase-like  45.7 
 
 
221 aa  200  9.999999999999999e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05193  glutathione S-transferase III  47.24 
 
 
205 aa  197  1.0000000000000001e-49  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001312  glutathione S-transferase  46.34 
 
 
205 aa  196  3e-49  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0806  glutathione S-transferase domain-containing protein  46.57 
 
 
206 aa  195  3e-49  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0265  Glutathione S-transferase domain protein  49.25 
 
 
208 aa  195  5.000000000000001e-49  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.850678 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1385  glutathione S-transferase-like protein  50.25 
 
 
205 aa  193  1e-48  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.742051  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0269  glutathione S-transferase domain-containing protein  49.25 
 
 
208 aa  193  1e-48  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0269  glutathione S-transferase domain-containing protein  48.74 
 
 
208 aa  193  2e-48  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0261  glutathione S-transferase domain-containing protein  49.25 
 
 
208 aa  192  2e-48  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3675  glutathione S-transferase-like protein  44.55 
 
 
220 aa  191  6e-48  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4433  glutathione S-transferase domain-containing protein  46.61 
 
 
222 aa  189  2.9999999999999997e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3917  Glutathione S-transferase domain  49.33 
 
 
218 aa  187  7e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0306349  normal  0.123136 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00398  glutathione S-transferase  44.25 
 
 
232 aa  185  5e-46  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.995047  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3927  Glutathione S-transferase domain  47.51 
 
 
218 aa  182  3e-45  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.253948  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1093  glutathione S-transferase domain-containing protein  45.93 
 
 
209 aa  182  4.0000000000000006e-45  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3634  glutathione S-transferase domain-containing protein  47.06 
 
 
218 aa  181  9.000000000000001e-45  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.890005  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2125  glutathione S-transferase-like protein  42.99 
 
 
224 aa  179  2.9999999999999997e-44  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.850832  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3541  glutathione S-transferase  43.56 
 
 
215 aa  177  7e-44  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.136471  normal  0.509105 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1353  Glutathione S-transferase domain protein  45 
 
 
209 aa  177  1e-43  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.959522  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2329  glutathione S-transferase domain-containing protein  49.55 
 
 
218 aa  177  1e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.435459 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1626  Glutathione S-transferase domain  47.06 
 
 
229 aa  176  2e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.506745  normal  0.230633 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0318  putative glutathione S-transferase III (GST-III)  43.3 
 
 
221 aa  176  2e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.894729  normal  0.561156 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1800  glutathione S-transferase domain-containing protein  44.39 
 
 
232 aa  176  2e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1922  Glutathione S-transferase domain protein  43.95 
 
 
232 aa  174  9e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00195  Glutathione S-transferase-like protein  42.79 
 
 
222 aa  174  9.999999999999999e-43  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1665  Glutathione S-transferase domain protein  44.86 
 
 
214 aa  173  1.9999999999999998e-42  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.192716  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1936  Glutathione S-transferase domain protein  43.46 
 
 
214 aa  171  9e-42  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.247506  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0966  Glutathione S-transferase domain protein  42.57 
 
 
209 aa  169  3e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.262392  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0510  glutathione S-transferase domain-containing protein  47.37 
 
 
208 aa  169  4e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.585126 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4480  glutathione S-transferase domain-containing protein  40.62 
 
 
229 aa  167  1e-40  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0622605 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4662  glutathione S-transferase, N- domain  44.59 
 
 
222 aa  162  4.0000000000000004e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0268  glutathione S-transferase domain-containing protein  44.14 
 
 
221 aa  161  6e-39  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3593  glutathione S-transferase-like  41.78 
 
 
221 aa  161  6e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.404871  normal  0.859314 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2474  glutathione S-transferase family protein  42.44 
 
 
206 aa  161  8.000000000000001e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00158542  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4611  glutathione S-transferase, N- domain  44.8 
 
 
222 aa  160  9e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.931981  normal  0.250578 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4518  glutathione S-transferase, N- domain  44.8 
 
 
222 aa  160  9e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4612  glutathione S-transferase, N- domain  44.8 
 
 
222 aa  160  9e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0520156  normal  0.373731 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0261  glutathione S-transferase domain-containing protein  46.15 
 
 
221 aa  160  1e-38  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0252994  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4526  glutathione S-transferase, N- domain  44.8 
 
 
222 aa  160  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3116  Glutathione S-transferase protein  40.53 
 
 
227 aa  153  2e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.324582  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2251  Glutathione transferase  39.9 
 
 
201 aa  153  2e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3813  glutathione S-transferase domain-containing protein  43.18 
 
 
221 aa  149  2e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.340281  normal  0.596227 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1010  glutathione S-transferase-like  44.23 
 
 
211 aa  149  3e-35  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6917  putative glutathione S-transferase  37.86 
 
 
213 aa  144  9e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.522901 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0874  glutathione S-transferase domain-containing protein  35.65 
 
 
234 aa  139  3.9999999999999997e-32  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000650083 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1722  glutathione S-transferase-like  38.39 
 
 
222 aa  138  6e-32  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.226504  normal  0.784305 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1542  glutathione S-transferase  35.87 
 
 
222 aa  132  3e-30  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.172585 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2005  glutathione S-transferase domain-containing protein  35.27 
 
 
202 aa  123  2e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0375  glutathione S-transferase domain-containing protein  65.93 
 
 
121 aa  122  4e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00629  glutathione S-transferase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G17010)  35.15 
 
 
255 aa  116  1.9999999999999998e-25  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0806169  normal  0.869816 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_35190  glutathione S-transferase  34.6 
 
 
245 aa  114  6.9999999999999995e-25  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0548873  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1924  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.85 
 
 
202 aa  105  7e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.896239 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2200  Glutathione S-transferase domain  30.35 
 
 
202 aa  103  2e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2573  glutathione S-transferase domain-containing protein  32.39 
 
 
221 aa  102  5e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.748409  normal  0.500264 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2431  Glutathione S-transferase domain  33.33 
 
 
216 aa  102  5e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.342495  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2200  glutathione S-transferase-like  33.33 
 
 
216 aa  102  5e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.313039 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3640  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.8 
 
 
217 aa  102  5e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.390438 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0348  glutathione S-transferase  43.8 
 
 
124 aa  101  8e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3264  glutathione S-transferase-like protein  32.35 
 
 
216 aa  100  1e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0652587  normal  0.563491 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0508  glutathione S-transferase domain-containing protein  32.67 
 
 
213 aa  98.6  5e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.553974 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3310  glutathione S-transferase domain-containing protein  32.86 
 
 
210 aa  98.2  8e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.141117  normal  0.680332 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4821  Glutathione S-transferase domain protein  30.99 
 
 
221 aa  95.1  7e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.236344  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0670  putative glutathione S-transferase (GST)  32.67 
 
 
218 aa  93.6  2e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.804169  normal  0.0458182 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3767  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.05 
 
 
222 aa  92.4  4e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5735  Glutathione S-transferase domain protein  31.5 
 
 
225 aa  92.4  5e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4165  glutathione S-transferase-like  31.43 
 
 
225 aa  92  6e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3205  glutathione S-transferase-like  31.34 
 
 
219 aa  91.7  7e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.877532  normal  0.459209 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0079  glutathione S-transferase-like  31.96 
 
 
221 aa  91.7  7e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2967  glutathione S-transferase-like protein  32 
 
 
214 aa  90.9  1e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0539  Glutathione S-transferase domain protein  31.55 
 
 
224 aa  88.6  6e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.333365  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0145  glutathione S-transferase domain-containing protein  32.66 
 
 
203 aa  87.4  1e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.397548  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3380  glutathione S-transferase-like protein  32.52 
 
 
201 aa  87.4  1e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1302  glutathione S-transferase domain protein  31.25 
 
 
222 aa  87  2e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0568234  normal  0.0901172 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0847  glutathione S-transferase domain-containing protein  33.67 
 
 
200 aa  85.9  4e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.154484 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4891  glutathione S-transferase domain-containing protein  29.9 
 
 
216 aa  85.1  7e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.479159 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0031  glutathione S-transferase  32.16 
 
 
198 aa  84.3  0.000000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.243263 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>