More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_1936 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013421  Pecwa_1936  Glutathione S-transferase domain protein  100 
 
 
214 aa  436  1e-121  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.247506  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1665  Glutathione S-transferase domain protein  92.99 
 
 
214 aa  416  9.999999999999999e-116  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.192716  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3813  glutathione S-transferase domain-containing protein  61.21 
 
 
221 aa  262  3e-69  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.340281  normal  0.596227 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2947  glutathione S-transferase domain-containing protein  55.35 
 
 
222 aa  252  3e-66  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.282557  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5570  glutathione S-transferase domain-containing protein  54.21 
 
 
222 aa  244  9e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.509468  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3744  glutathione S-transferase domain-containing protein  53.74 
 
 
222 aa  242  3e-63  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.66674  normal  0.0935446 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2249  glutathione S-transferase-like protein  53.27 
 
 
222 aa  241  6e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0626984 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3680  glutathione S-transferase domain-containing protein  53.27 
 
 
233 aa  240  1e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.382886  normal  0.017552 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4517  glutathione S-transferase-like  53.27 
 
 
233 aa  240  1e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.370294  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3847  glutathione S-transferase domain-containing protein  53.27 
 
 
233 aa  240  1e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.948042  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0273  putative glutathione S-transferase  53.52 
 
 
225 aa  234  6e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7159  Glutathione S-transferase domain  52.11 
 
 
225 aa  226  2e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.218915  normal  0.479865 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4634  Glutathione transferase  50.69 
 
 
224 aa  224  9e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4433  glutathione S-transferase domain-containing protein  48.6 
 
 
222 aa  223  1e-57  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00398  glutathione S-transferase  48.4 
 
 
232 aa  221  4.9999999999999996e-57  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.995047  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1800  glutathione S-transferase domain-containing protein  50.23 
 
 
232 aa  221  9e-57  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1626  Glutathione S-transferase domain  50.23 
 
 
229 aa  220  9.999999999999999e-57  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.506745  normal  0.230633 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1922  Glutathione S-transferase domain protein  49.77 
 
 
232 aa  219  1.9999999999999999e-56  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3957  glutathione S-transferase-like  47.66 
 
 
221 aa  217  8.999999999999998e-56  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0268  glutathione S-transferase domain-containing protein  48.13 
 
 
221 aa  214  7e-55  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1107  glutathione S-transferase  46.76 
 
 
223 aa  214  7e-55  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.300035  normal  0.477541 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2125  glutathione S-transferase-like protein  46.73 
 
 
224 aa  210  1e-53  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.850832  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4480  glutathione S-transferase domain-containing protein  48.42 
 
 
229 aa  204  6e-52  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0622605 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4290  glutathione S-transferase domain-containing protein  44.34 
 
 
220 aa  197  7e-50  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.380653 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00195  Glutathione S-transferase-like protein  47.25 
 
 
222 aa  197  1.0000000000000001e-49  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3675  glutathione S-transferase-like protein  45.33 
 
 
220 aa  194  1e-48  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0261  glutathione S-transferase domain-containing protein  51.63 
 
 
221 aa  194  1e-48  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0252994  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0019  glutathione S-transferase-like  46.76 
 
 
222 aa  191  5e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4662  glutathione S-transferase, N- domain  48.6 
 
 
222 aa  191  6e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4611  glutathione S-transferase, N- domain  48.6 
 
 
222 aa  191  9e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.931981  normal  0.250578 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4612  glutathione S-transferase, N- domain  48.6 
 
 
222 aa  191  9e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0520156  normal  0.373731 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4518  glutathione S-transferase, N- domain  48.6 
 
 
222 aa  191  9e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4526  glutathione S-transferase, N- domain  48.6 
 
 
222 aa  190  1e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0024  Glutathione S-transferase domain  45.12 
 
 
222 aa  189  4e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0021  glutathione S-transferase-like protein  44.19 
 
 
222 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0724  glutathione S-transferase-like  44.19 
 
 
222 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.4337 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3116  Glutathione S-transferase protein  46.58 
 
 
227 aa  183  2.0000000000000003e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.324582  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0318  putative glutathione S-transferase III (GST-III)  46.05 
 
 
221 aa  182  3e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.894729  normal  0.561156 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1542  glutathione S-transferase  44.91 
 
 
222 aa  181  6e-45  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.172585 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1722  glutathione S-transferase-like  44.7 
 
 
222 aa  176  3e-43  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.226504  normal  0.784305 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00629  glutathione S-transferase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G17010)  41.95 
 
 
255 aa  172  2.9999999999999996e-42  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0806169  normal  0.869816 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2196  glutathione S-transferase domain-containing protein  41.04 
 
 
208 aa  172  2.9999999999999996e-42  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.827244 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1175  glutathione S-transferase  43.46 
 
 
208 aa  171  1e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.275426  normal  0.372199 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0806  glutathione S-transferase domain-containing protein  42.72 
 
 
206 aa  170  1e-41  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3917  Glutathione S-transferase domain  40.85 
 
 
218 aa  169  3e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0306349  normal  0.123136 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1365  glutathione S-transferase  42.99 
 
 
208 aa  166  2e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.290536  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3927  Glutathione S-transferase domain  40.65 
 
 
218 aa  166  2e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.253948  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3634  glutathione S-transferase domain-containing protein  40.65 
 
 
218 aa  166  2e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.890005  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0874  glutathione S-transferase domain-containing protein  39.21 
 
 
234 aa  166  2.9999999999999998e-40  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000650083 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1060  glutathione S-transferase domain-containing protein  40.19 
 
 
208 aa  162  4.0000000000000004e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.927457 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2329  glutathione S-transferase domain-containing protein  42.99 
 
 
218 aa  160  1e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.435459 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2668  glutathione S-transferase-like  40.93 
 
 
226 aa  158  5e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.111492  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05193  glutathione S-transferase III  40.76 
 
 
205 aa  158  7e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2631  glutathione S-transferase-like protein  40 
 
 
208 aa  155  6e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.763244 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0966  Glutathione S-transferase domain protein  42.65 
 
 
209 aa  152  2e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.262392  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1722  glutathione S-transferase-like protein  39.9 
 
 
208 aa  150  1e-35  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001312  glutathione S-transferase  38.86 
 
 
205 aa  149  4e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0265  Glutathione S-transferase domain protein  41.23 
 
 
208 aa  146  2.0000000000000003e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.850678 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0510  glutathione S-transferase domain-containing protein  40.65 
 
 
208 aa  146  2.0000000000000003e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.585126 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6917  putative glutathione S-transferase  36.99 
 
 
213 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.522901 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3593  glutathione S-transferase-like  38.36 
 
 
221 aa  145  3e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.404871  normal  0.859314 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0269  glutathione S-transferase domain-containing protein  41.98 
 
 
208 aa  146  3e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0269  glutathione S-transferase domain-containing protein  41.98 
 
 
208 aa  145  4.0000000000000006e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0261  glutathione S-transferase domain-containing protein  41.98 
 
 
208 aa  145  5e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2251  Glutathione transferase  36.32 
 
 
201 aa  145  5e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1093  glutathione S-transferase domain-containing protein  39.91 
 
 
209 aa  144  1e-33  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2474  glutathione S-transferase family protein  40.09 
 
 
206 aa  140  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00158542  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1276  glutathione S-transferase-like  38.1 
 
 
208 aa  139  1.9999999999999998e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.398915  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1385  glutathione S-transferase-like protein  39.34 
 
 
205 aa  136  2e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.742051  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3541  glutathione S-transferase  35.35 
 
 
215 aa  133  1.9999999999999998e-30  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.136471  normal  0.509105 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1010  glutathione S-transferase-like  40.93 
 
 
211 aa  132  3.9999999999999996e-30  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1353  Glutathione S-transferase domain protein  36.15 
 
 
209 aa  131  6.999999999999999e-30  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.959522  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_35190  glutathione S-transferase  36.17 
 
 
245 aa  125  5e-28  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0548873  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0375  glutathione S-transferase domain-containing protein  63.54 
 
 
121 aa  111  1.0000000000000001e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2005  glutathione S-transferase domain-containing protein  34.27 
 
 
202 aa  108  8.000000000000001e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0508  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.16 
 
 
213 aa  107  1e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.553974 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1924  glutathione S-transferase domain-containing protein  34.27 
 
 
202 aa  105  4e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.896239 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2200  Glutathione S-transferase domain  33.8 
 
 
202 aa  105  6e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_56049  Glutathione S-transferase  27.88 
 
 
265 aa  96.7  3e-19  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3513  glutathione S-transferase domain-containing protein  33.18 
 
 
207 aa  90.9  1e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.72335  normal 
 
 
-
 
NC_006686  CND00620  glutathione transferase, putative  29.36 
 
 
249 aa  87.4  1e-16  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.295755  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2436  putative glutathione S-transferase  27.52 
 
 
209 aa  86.3  3e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.117632  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2002  glutathione S-transferase-like protein  30.56 
 
 
185 aa  84.7  9e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2222  glutathione S-transferase domain-containing protein  27.96 
 
 
207 aa  84.3  0.000000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.186295 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3561  Glutathione S-transferase domain protein  31.65 
 
 
210 aa  82.8  0.000000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.134068  normal  0.24035 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3310  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.8 
 
 
210 aa  82.8  0.000000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.141117  normal  0.680332 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0681  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.65 
 
 
210 aa  82.4  0.000000000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.052324  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3119  putative glutathione S-transferase  30.05 
 
 
207 aa  82.4  0.000000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.427542  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3752  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.65 
 
 
210 aa  81.6  0.000000000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0132369  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3629  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.65 
 
 
210 aa  81.6  0.000000000000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.395815  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3640  glutathione S-transferase domain-containing protein  28.44 
 
 
217 aa  81.6  0.000000000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.390438 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1302  glutathione S-transferase domain protein  29.95 
 
 
222 aa  81.3  0.00000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0568234  normal  0.0901172 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5735  Glutathione S-transferase domain protein  29.17 
 
 
225 aa  80.9  0.00000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4150  glutathione S-transferase domain protein  27.52 
 
 
186 aa  80.5  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.432751 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4110  Glutathione S-transferase domain protein  27.52 
 
 
186 aa  80.5  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4165  glutathione S-transferase-like  26.39 
 
 
225 aa  80.1  0.00000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0907  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.65 
 
 
207 aa  79.7  0.00000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3767  glutathione S-transferase domain-containing protein  26.39 
 
 
222 aa  80.1  0.00000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0838  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.31 
 
 
227 aa  79.3  0.00000000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0531264  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2200  glutathione S-transferase-like  27.65 
 
 
216 aa  78.6  0.00000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.313039 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>