More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_1665 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012917  PC1_1665  Glutathione S-transferase domain protein  100 
 
 		 214 aa  438  9.999999999999999e-123  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.192716  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1936  Glutathione S-transferase domain protein  92.99 
 
 		 214 aa  416  9.999999999999999e-116  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.247506  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3813  glutathione S-transferase domain-containing protein  61.21 
 
 		 221 aa  267  1e-70  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.340281  normal  0.596227 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2947  glutathione S-transferase domain-containing protein  55.81 
 
 		 222 aa  252  2.0000000000000002e-66  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.282557  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5570  glutathione S-transferase domain-containing protein  55.66 
 
 		 222 aa  244  4.9999999999999997e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.509468  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3744  glutathione S-transferase domain-containing protein  55.19 
 
 		 222 aa  243  1.9999999999999999e-63  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.66674  normal  0.0935446 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2249  glutathione S-transferase-like protein  54.25 
 
 		 222 aa  240  1e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0626984 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3680  glutathione S-transferase domain-containing protein  54.25 
 
 		 233 aa  239  2e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.382886  normal  0.017552 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4517  glutathione S-transferase-like  54.25 
 
 		 233 aa  239  2e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.370294  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3847  glutathione S-transferase domain-containing protein  54.25 
 
 		 233 aa  239  2e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.948042  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0273  putative glutathione S-transferase  54.46 
 
 		 225 aa  233  1.0000000000000001e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4433  glutathione S-transferase domain-containing protein  50 
 
 		 222 aa  227  1e-58  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7159  Glutathione S-transferase domain  53.05 
 
 		 225 aa  226  2e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.218915  normal  0.479865 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4634  Glutathione transferase  51.63 
 
 		 224 aa  225  5.0000000000000005e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1626  Glutathione S-transferase domain  50.93 
 
 		 229 aa  224  8e-58  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.506745  normal  0.230633 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00398  glutathione S-transferase  48.4 
 
 		 232 aa  221  4.9999999999999996e-57  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.995047  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1800  glutathione S-transferase domain-containing protein  50.68 
 
 		 232 aa  218  3.9999999999999997e-56  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1922  Glutathione S-transferase domain protein  50.23 
 
 		 232 aa  217  8.999999999999998e-56  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3957  glutathione S-transferase-like  48.13 
 
 		 221 aa  217  1e-55  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0268  glutathione S-transferase domain-containing protein  49.53 
 
 		 221 aa  217  1e-55  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1107  glutathione S-transferase  47.42 
 
 		 223 aa  214  5.9999999999999996e-55  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.300035  normal  0.477541 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2125  glutathione S-transferase-like protein  47.66 
 
 		 224 aa  211  4.9999999999999996e-54  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.850832  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4480  glutathione S-transferase domain-containing protein  50.68 
 
 		 229 aa  207  8e-53  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0622605 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4290  glutathione S-transferase domain-containing protein  46.7 
 
 		 220 aa  201  6e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.380653 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0019  glutathione S-transferase-like  48.37 
 
 		 222 aa  199  1.9999999999999998e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0024  Glutathione S-transferase domain  47.91 
 
 		 222 aa  198  6e-50  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4662  glutathione S-transferase, N- domain  50.93 
 
 		 222 aa  196  2.0000000000000003e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0261  glutathione S-transferase domain-containing protein  53.52 
 
 		 221 aa  195  3e-49  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0252994  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00195  Glutathione S-transferase-like protein  47.22 
 
 		 222 aa  194  6e-49  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4611  glutathione S-transferase, N- domain  50.47 
 
 		 222 aa  194  8.000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.931981  normal  0.250578 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4518  glutathione S-transferase, N- domain  50.47 
 
 		 222 aa  194  8.000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4612  glutathione S-transferase, N- domain  50.47 
 
 		 222 aa  194  8.000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0520156  normal  0.373731 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3675  glutathione S-transferase-like protein  46.7 
 
 		 220 aa  194  9e-49  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4526  glutathione S-transferase, N- domain  50.47 
 
 		 222 aa  194  1e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0318  putative glutathione S-transferase III (GST-III)  49.3 
 
 		 221 aa  189  2e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.894729  normal  0.561156 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0021  glutathione S-transferase-like protein  46.48 
 
 		 222 aa  189  2.9999999999999997e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0724  glutathione S-transferase-like  48.13 
 
 		 222 aa  189  2.9999999999999997e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.4337 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1542  glutathione S-transferase  46.3 
 
 		 222 aa  182  3e-45  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.172585 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3116  Glutathione S-transferase protein  47.49 
 
 		 227 aa  182  4.0000000000000006e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.324582  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1722  glutathione S-transferase-like  46.54 
 
 		 222 aa  179  2e-44  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.226504  normal  0.784305 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1175  glutathione S-transferase  44.86 
 
 		 208 aa  173  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.275426  normal  0.372199 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3917  Glutathione S-transferase domain  42.65 
 
 		 218 aa  172  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0306349  normal  0.123136 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00629  glutathione S-transferase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G17010)  40.68 
 
 		 255 aa  169  2e-41  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0806169  normal  0.869816 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0874  glutathione S-transferase domain-containing protein  40.97 
 
 		 234 aa  170  2e-41  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000650083 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1365  glutathione S-transferase  44.39 
 
 		 208 aa  169  3e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.290536  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2196  glutathione S-transferase domain-containing protein  41.51 
 
 		 208 aa  169  3e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.827244 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3634  glutathione S-transferase domain-containing protein  41.23 
 
 		 218 aa  169  3e-41  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.890005  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3927  Glutathione S-transferase domain  41.23 
 
 		 218 aa  169  4e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.253948  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0806  glutathione S-transferase domain-containing protein  42.25 
 
 		 206 aa  169  4e-41  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1060  glutathione S-transferase domain-containing protein  42.06 
 
 		 208 aa  165  4e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.927457 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2329  glutathione S-transferase domain-containing protein  44.86 
 
 		 218 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.435459 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05193  glutathione S-transferase III  41.71 
 
 		 205 aa  161  6e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2668  glutathione S-transferase-like  40.93 
 
 		 226 aa  157  1e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.111492  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2631  glutathione S-transferase-like protein  40.47 
 
 		 208 aa  155  3e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.763244 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001312  glutathione S-transferase  39.34 
 
 		 205 aa  151  5.9999999999999996e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1722  glutathione S-transferase-like protein  40.76 
 
 		 208 aa  151  7e-36  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0510  glutathione S-transferase domain-containing protein  42.06 
 
 		 208 aa  151  8e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.585126 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6917  putative glutathione S-transferase  38.36 
 
 		 213 aa  149  2e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.522901 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2251  Glutathione transferase  36.97 
 
 		 201 aa  148  5e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0966  Glutathione S-transferase domain protein  40.48 
 
 		 209 aa  148  6e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.262392  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0265  Glutathione S-transferase domain protein  41.71 
 
 		 208 aa  148  7e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.850678 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3593  glutathione S-transferase-like  40.09 
 
 		 221 aa  147  1.0000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.404871  normal  0.859314 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0269  glutathione S-transferase domain-containing protein  42.45 
 
 		 208 aa  147  1.0000000000000001e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0269  glutathione S-transferase domain-containing protein  42.45 
 
 		 208 aa  146  2.0000000000000003e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0261  glutathione S-transferase domain-containing protein  42.45 
 
 		 208 aa  146  3e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1276  glutathione S-transferase-like  39.05 
 
 		 208 aa  139  1.9999999999999998e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.398915  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1385  glutathione S-transferase-like protein  39.52 
 
 		 205 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.742051  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1093  glutathione S-transferase domain-containing protein  38.5 
 
 		 209 aa  139  3e-32  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2474  glutathione S-transferase family protein  39.17 
 
 		 206 aa  135  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00158542  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3541  glutathione S-transferase  35.35 
 
 		 215 aa  132  5e-30  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.136471  normal  0.509105 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1010  glutathione S-transferase-like  41.4 
 
 		 211 aa  131  6e-30  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1353  Glutathione S-transferase domain protein  35.21 
 
 		 209 aa  127  2.0000000000000002e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.959522  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_35190  glutathione S-transferase  36.82 
 
 		 245 aa  122  4e-27  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0548873  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2005  glutathione S-transferase domain-containing protein  34.88 
 
 		 202 aa  112  5e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0375  glutathione S-transferase domain-containing protein  62.24 
 
 		 121 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0508  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.73 
 
 		 213 aa  106  3e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.553974 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1924  glutathione S-transferase domain-containing protein  34.27 
 
 		 202 aa  104  1e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.896239 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2200  Glutathione S-transferase domain  33.8 
 
 		 202 aa  103  2e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_56049  Glutathione S-transferase  26.99 
 
 		 265 aa  92  6e-18  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3513  glutathione S-transferase domain-containing protein  32.74 
 
 		 207 aa  88.2  8e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.72335  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2436  putative glutathione S-transferase  28.9 
 
 		 209 aa  87.8  1e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.117632  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND00620  glutathione transferase, putative  30.04 
 
 		 249 aa  84.7  9e-16  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.295755  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2222  glutathione S-transferase domain-containing protein  28.1 
 
 		 207 aa  84.3  0.000000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.186295 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2002  glutathione S-transferase-like protein  30.41 
 
 		 185 aa  82.8  0.000000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3767  glutathione S-transferase domain-containing protein  27.78 
 
 		 222 aa  83.2  0.000000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4165  glutathione S-transferase-like  28.7 
 
 		 225 aa  82  0.000000000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4150  glutathione S-transferase domain protein  27.98 
 
 		 186 aa  80.1  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.432751 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5977  glutathione S-transferase domain-containing protein  27.49 
 
 		 221 aa  80.1  0.00000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.9261 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4110  Glutathione S-transferase domain protein  27.98 
 
 		 186 aa  80.1  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3181  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.94 
 
 		 207 aa  79.7  0.00000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5735  Glutathione S-transferase domain protein  28.57 
 
 		 225 aa  80.1  0.00000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3640  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.52 
 
 		 217 aa  79.7  0.00000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.390438 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3752  glutathione S-transferase domain-containing protein  32.41 
 
 		 210 aa  79.3  0.00000000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0132369  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1302  glutathione S-transferase domain protein  29.73 
 
 		 222 aa  79.3  0.00000000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0568234  normal  0.0901172 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3629  glutathione S-transferase domain-containing protein  32.41 
 
 		 210 aa  79.3  0.00000000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.395815  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3561  Glutathione S-transferase domain protein  32.41 
 
 		 210 aa  79  0.00000000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.134068  normal  0.24035 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3310  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.56 
 
 		 210 aa  79  0.00000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.141117  normal  0.680332 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3119  putative glutathione S-transferase  29.25 
 
 		 207 aa  79  0.00000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.427542  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0681  glutathione S-transferase domain-containing protein  32.41 
 
 		 210 aa  79  0.00000000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.052324  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0907  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.65 
 
 		 207 aa  78.6  0.00000000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>