More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_3116 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_3116  Glutathione S-transferase protein  100 
 
 		 227 aa  468  1.0000000000000001e-131  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.324582  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0724  glutathione S-transferase-like  53.98 
 
 		 222 aa  249  3e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.4337 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0021  glutathione S-transferase-like protein  53.54 
 
 		 222 aa  248  4e-65  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0019  glutathione S-transferase-like  52.65 
 
 		 222 aa  242  3e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0273  putative glutathione S-transferase  55.8 
 
 		 225 aa  241  9e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0024  Glutathione S-transferase domain  51.77 
 
 		 222 aa  241  9e-63  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4290  glutathione S-transferase domain-containing protein  53.54 
 
 		 220 aa  237  9e-62  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.380653 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0318  putative glutathione S-transferase III (GST-III)  52.7 
 
 		 221 aa  235  5.0000000000000005e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.894729  normal  0.561156 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7159  Glutathione S-transferase domain  53.12 
 
 		 225 aa  231  8.000000000000001e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.218915  normal  0.479865 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3917  Glutathione S-transferase domain  54.42 
 
 		 218 aa  226  2e-58  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0306349  normal  0.123136 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2947  glutathione S-transferase domain-containing protein  50.66 
 
 		 222 aa  223  2e-57  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.282557  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3927  Glutathione S-transferase domain  53.1 
 
 		 218 aa  222  4e-57  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.253948  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4634  Glutathione transferase  52.44 
 
 		 224 aa  222  4.9999999999999996e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3634  glutathione S-transferase domain-containing protein  53.1 
 
 		 218 aa  221  6e-57  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.890005  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4517  glutathione S-transferase-like  52.63 
 
 		 233 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.370294  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3847  glutathione S-transferase domain-containing protein  52.63 
 
 		 233 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.948042  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3680  glutathione S-transferase domain-containing protein  52.63 
 
 		 233 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.382886  normal  0.017552 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2249  glutathione S-transferase-like protein  50.88 
 
 		 222 aa  219  1.9999999999999999e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0626984 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3744  glutathione S-transferase domain-containing protein  50.88 
 
 		 222 aa  217  1e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.66674  normal  0.0935446 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5570  glutathione S-transferase domain-containing protein  50.88 
 
 		 222 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.509468  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2125  glutathione S-transferase-like protein  53.28 
 
 		 224 aa  214  5.9999999999999996e-55  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.850832  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4433  glutathione S-transferase domain-containing protein  52.23 
 
 		 222 aa  208  5e-53  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00398  glutathione S-transferase  46.43 
 
 		 232 aa  204  1e-51  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.995047  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0261  glutathione S-transferase domain-containing protein  53.1 
 
 		 221 aa  202  3e-51  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0252994  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1800  glutathione S-transferase domain-containing protein  50.22 
 
 		 232 aa  202  4e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1922  Glutathione S-transferase domain protein  50.22 
 
 		 232 aa  201  6e-51  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3675  glutathione S-transferase-like protein  46.9 
 
 		 220 aa  199  1.9999999999999998e-50  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4480  glutathione S-transferase domain-containing protein  47.98 
 
 		 229 aa  199  3e-50  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0622605 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0268  glutathione S-transferase domain-containing protein  44.84 
 
 		 221 aa  197  1.0000000000000001e-49  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2329  glutathione S-transferase domain-containing protein  51.77 
 
 		 218 aa  196  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.435459 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1107  glutathione S-transferase  44.2 
 
 		 223 aa  191  6e-48  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.300035  normal  0.477541 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1626  Glutathione S-transferase domain  47.98 
 
 		 229 aa  191  7e-48  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.506745  normal  0.230633 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3957  glutathione S-transferase-like  42.73 
 
 		 221 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1936  Glutathione S-transferase domain protein  46.58 
 
 		 214 aa  183  2.0000000000000003e-45  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.247506  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1665  Glutathione S-transferase domain protein  47.49 
 
 		 214 aa  182  4.0000000000000006e-45  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.192716  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3813  glutathione S-transferase domain-containing protein  50 
 
 		 221 aa  178  7e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.340281  normal  0.596227 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00195  Glutathione S-transferase-like protein  39.91 
 
 		 222 aa  175  5e-43  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4662  glutathione S-transferase, N- domain  45.58 
 
 		 222 aa  174  9.999999999999999e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1276  glutathione S-transferase-like  43.24 
 
 		 208 aa  174  9.999999999999999e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.398915  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4612  glutathione S-transferase, N- domain  46.19 
 
 		 222 aa  174  9.999999999999999e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0520156  normal  0.373731 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4518  glutathione S-transferase, N- domain  46.19 
 
 		 222 aa  174  9.999999999999999e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4611  glutathione S-transferase, N- domain  46.19 
 
 		 222 aa  174  9.999999999999999e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.931981  normal  0.250578 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2196  glutathione S-transferase domain-containing protein  43.17 
 
 		 208 aa  173  1.9999999999999998e-42  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.827244 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4526  glutathione S-transferase, N- domain  46.19 
 
 		 222 aa  173  1.9999999999999998e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2668  glutathione S-transferase-like  44.39 
 
 		 226 aa  169  2e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.111492  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0874  glutathione S-transferase domain-containing protein  40.43 
 
 		 234 aa  169  3e-41  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000650083 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1722  glutathione S-transferase-like  38.94 
 
 		 222 aa  167  1e-40  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.226504  normal  0.784305 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2251  Glutathione transferase  41.67 
 
 		 201 aa  161  6e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1542  glutathione S-transferase  37.17 
 
 		 222 aa  161  8.000000000000001e-39  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.172585 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00629  glutathione S-transferase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G17010)  38.82 
 
 		 255 aa  159  3e-38  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0806169  normal  0.869816 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2631  glutathione S-transferase-like protein  42.6 
 
 		 208 aa  158  6e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.763244 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0510  glutathione S-transferase domain-containing protein  45.78 
 
 		 208 aa  157  1e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.585126 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1175  glutathione S-transferase  40.53 
 
 		 208 aa  153  2e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.275426  normal  0.372199 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1365  glutathione S-transferase  40.53 
 
 		 208 aa  152  4e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.290536  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1722  glutathione S-transferase-like protein  39.46 
 
 		 208 aa  150  2e-35  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1060  glutathione S-transferase domain-containing protein  39.21 
 
 		 208 aa  144  1e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.927457 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0269  glutathione S-transferase domain-containing protein  39.64 
 
 		 208 aa  142  4e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0269  glutathione S-transferase domain-containing protein  39.64 
 
 		 208 aa  142  5e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0261  glutathione S-transferase domain-containing protein  39.19 
 
 		 208 aa  142  6e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0265  Glutathione S-transferase domain protein  39.19 
 
 		 208 aa  141  9.999999999999999e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.850678 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1093  glutathione S-transferase domain-containing protein  37.44 
 
 		 209 aa  137  2e-31  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1385  glutathione S-transferase-like protein  37.27 
 
 		 205 aa  134  9.999999999999999e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.742051  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0806  glutathione S-transferase domain-containing protein  37.9 
 
 		 206 aa  134  9.999999999999999e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3593  glutathione S-transferase-like  38.01 
 
 		 221 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.404871  normal  0.859314 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001312  glutathione S-transferase  37.04 
 
 		 205 aa  128  7.000000000000001e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05193  glutathione S-transferase III  37.16 
 
 		 205 aa  128  7.000000000000001e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3541  glutathione S-transferase  34.84 
 
 		 215 aa  126  2.0000000000000002e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.136471  normal  0.509105 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2474  glutathione S-transferase family protein  33.33 
 
 		 206 aa  125  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00158542  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0966  Glutathione S-transferase domain protein  33.8 
 
 		 209 aa  125  4.0000000000000003e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.262392  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_35190  glutathione S-transferase  38.27 
 
 		 245 aa  122  4e-27  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0548873  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6917  putative glutathione S-transferase  35.56 
 
 		 213 aa  120  9.999999999999999e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.522901 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1353  Glutathione S-transferase domain protein  32.88 
 
 		 209 aa  112  6e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.959522  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1010  glutathione S-transferase-like  34.98 
 
 		 211 aa  108  9.000000000000001e-23  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2005  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.96 
 
 		 202 aa  104  9e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0375  glutathione S-transferase domain-containing protein  60.49 
 
 		 121 aa  103  2e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1924  glutathione S-transferase domain-containing protein  32.72 
 
 		 202 aa  93.2  3e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.896239 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2200  Glutathione S-transferase domain  31.8 
 
 		 202 aa  91.7  8e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_56049  Glutathione S-transferase  34.67 
 
 		 265 aa  91.3  1e-17  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3640  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.94 
 
 		 217 aa  89  5e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.390438 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0348  glutathione S-transferase  40.34 
 
 		 124 aa  81.3  0.00000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3119  putative glutathione S-transferase  30.05 
 
 		 207 aa  79.7  0.00000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.427542  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3528  glutathione S-transferase  30.77 
 
 		 210 aa  79.3  0.00000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006686  CND00620  glutathione transferase, putative  29.58 
 
 		 249 aa  78.2  0.0000000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.295755  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2222  glutathione S-transferase domain-containing protein  28.04 
 
 		 207 aa  76.3  0.0000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.186295 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3114  glutathione S-transferase-like  28.82 
 
 		 218 aa  75.1  0.0000000000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3310  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.09 
 
 		 210 aa  73.6  0.000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.141117  normal  0.680332 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1302  glutathione S-transferase domain protein  25.76 
 
 		 222 aa  72.8  0.000000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0568234  normal  0.0901172 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3561  Glutathione S-transferase domain protein  28.63 
 
 		 210 aa  70.9  0.00000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.134068  normal  0.24035 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3752  glutathione S-transferase domain-containing protein  28.19 
 
 		 210 aa  68.9  0.00000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0132369  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4165  glutathione S-transferase-like  26.7 
 
 		 225 aa  68.9  0.00000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3629  glutathione S-transferase domain-containing protein  28.19 
 
 		 210 aa  68.9  0.00000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.395815  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2431  Glutathione S-transferase domain  27.63 
 
 		 216 aa  68.6  0.00000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.342495  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1689  glutathione S-transferase-like  26.7 
 
 		 213 aa  68.6  0.00000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0681  glutathione S-transferase domain-containing protein  28.19 
 
 		 210 aa  68.9  0.00000000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.052324  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2573  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.49 
 
 		 221 aa  68.6  0.00000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.748409  normal  0.500264 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2436  putative glutathione S-transferase  24.35 
 
 		 209 aa  67.4  0.0000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.117632  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2967  glutathione S-transferase-like protein  28.04 
 
 		 214 aa  67.4  0.0000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2968  glutathione S-transferase domain-containing protein  35.58 
 
 		 211 aa  67  0.0000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.167267  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3183  glutathione S-transferase domain-containing protein  35.58 
 
 		 209 aa  66.6  0.0000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.413955  normal  0.024534 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3380  glutathione S-transferase-like protein  29.95 
 
 		 201 aa  66.2  0.0000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>