More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_0966 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012917  PC1_0966  Glutathione S-transferase domain protein  100 
 
 		 209 aa  426  1e-118  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.262392  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1353  Glutathione S-transferase domain protein  66.5 
 
 		 209 aa  302  2.0000000000000002e-81  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.959522  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2474  glutathione S-transferase family protein  61.46 
 
 		 206 aa  266  2e-70  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00158542  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1385  glutathione S-transferase-like protein  57.49 
 
 		 205 aa  237  1e-61  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.742051  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0269  glutathione S-transferase domain-containing protein  53.88 
 
 		 208 aa  224  5.0000000000000005e-58  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0261  glutathione S-transferase domain-containing protein  53.88 
 
 		 208 aa  224  6e-58  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0269  glutathione S-transferase domain-containing protein  53.88 
 
 		 208 aa  224  8e-58  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0265  Glutathione S-transferase domain protein  53.4 
 
 		 208 aa  223  2e-57  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.850678 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0806  glutathione S-transferase domain-containing protein  55.12 
 
 		 206 aa  221  4e-57  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05193  glutathione S-transferase III  50 
 
 		 205 aa  211  7e-54  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001312  glutathione S-transferase  49.03 
 
 		 205 aa  206  2e-52  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1093  glutathione S-transferase domain-containing protein  51.94 
 
 		 209 aa  204  8e-52  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1010  glutathione S-transferase-like  52.66 
 
 		 211 aa  189  2e-47  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2249  glutathione S-transferase-like protein  43.6 
 
 		 222 aa  179  2.9999999999999997e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0626984 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1107  glutathione S-transferase  43.27 
 
 		 223 aa  178  4e-44  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.300035  normal  0.477541 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3680  glutathione S-transferase domain-containing protein  43.13 
 
 		 233 aa  178  4.999999999999999e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.382886  normal  0.017552 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3847  glutathione S-transferase domain-containing protein  43.13 
 
 		 233 aa  178  4.999999999999999e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.948042  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4517  glutathione S-transferase-like  43.13 
 
 		 233 aa  178  4.999999999999999e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.370294  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1722  glutathione S-transferase-like protein  42.86 
 
 		 208 aa  175  4e-43  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5570  glutathione S-transferase domain-containing protein  42.18 
 
 		 222 aa  174  9e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.509468  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3744  glutathione S-transferase domain-containing protein  42.18 
 
 		 222 aa  172  2.9999999999999996e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.66674  normal  0.0935446 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1175  glutathione S-transferase  42.57 
 
 		 208 aa  169  3e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.275426  normal  0.372199 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1365  glutathione S-transferase  45.1 
 
 		 208 aa  169  4e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.290536  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2668  glutathione S-transferase-like  43.07 
 
 		 226 aa  167  9e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.111492  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1060  glutathione S-transferase domain-containing protein  42.93 
 
 		 208 aa  167  1e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.927457 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4290  glutathione S-transferase domain-containing protein  40.48 
 
 		 220 aa  166  2e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.380653 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2196  glutathione S-transferase domain-containing protein  41.71 
 
 		 208 aa  166  2e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.827244 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0273  putative glutathione S-transferase  38.86 
 
 		 225 aa  163  1.0000000000000001e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2251  Glutathione transferase  39.2 
 
 		 201 aa  164  1.0000000000000001e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2631  glutathione S-transferase-like protein  43.56 
 
 		 208 aa  163  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.763244 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2947  glutathione S-transferase domain-containing protein  39.62 
 
 		 222 aa  163  2.0000000000000002e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.282557  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7159  Glutathione S-transferase domain  39.81 
 
 		 225 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.218915  normal  0.479865 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4634  Glutathione transferase  41.51 
 
 		 224 aa  162  3e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0724  glutathione S-transferase-like  38.1 
 
 		 222 aa  159  3e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.4337 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3957  glutathione S-transferase-like  39.52 
 
 		 221 aa  158  6e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1276  glutathione S-transferase-like  39.71 
 
 		 208 aa  155  3e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.398915  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0024  Glutathione S-transferase domain  37.62 
 
 		 222 aa  154  8e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3675  glutathione S-transferase-like protein  41.05 
 
 		 220 aa  154  1e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0268  glutathione S-transferase domain-containing protein  41.04 
 
 		 221 aa  153  2e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1936  Glutathione S-transferase domain protein  42.65 
 
 		 214 aa  152  2e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.247506  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0021  glutathione S-transferase-like protein  36.19 
 
 		 222 aa  152  5e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00398  glutathione S-transferase  36.15 
 
 		 232 aa  150  1e-35  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.995047  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1665  Glutathione S-transferase domain protein  40.48 
 
 		 214 aa  148  6e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.192716  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3917  Glutathione S-transferase domain  40.44 
 
 		 218 aa  146  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0306349  normal  0.123136 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0019  glutathione S-transferase-like  36.67 
 
 		 222 aa  146  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3927  Glutathione S-transferase domain  40.31 
 
 		 218 aa  144  1e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.253948  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3634  glutathione S-transferase domain-containing protein  40.44 
 
 		 218 aa  143  2e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.890005  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4480  glutathione S-transferase domain-containing protein  35.19 
 
 		 229 aa  142  3e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0622605 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2125  glutathione S-transferase-like protein  37.91 
 
 		 224 aa  140  9.999999999999999e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.850832  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1922  Glutathione S-transferase domain protein  36.24 
 
 		 232 aa  140  1.9999999999999998e-32  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1800  glutathione S-transferase domain-containing protein  35.78 
 
 		 232 aa  139  3e-32  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1626  Glutathione S-transferase domain  36.57 
 
 		 229 aa  139  3e-32  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.506745  normal  0.230633 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0318  putative glutathione S-transferase III (GST-III)  41.3 
 
 		 221 aa  136  2e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.894729  normal  0.561156 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0261  glutathione S-transferase domain-containing protein  40.87 
 
 		 221 aa  130  1.0000000000000001e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0252994  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00195  Glutathione S-transferase-like protein  38.81 
 
 		 222 aa  129  4.0000000000000003e-29  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4611  glutathione S-transferase, N- domain  36.24 
 
 		 222 aa  128  7.000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.931981  normal  0.250578 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4612  glutathione S-transferase, N- domain  36.24 
 
 		 222 aa  128  7.000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0520156  normal  0.373731 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4662  glutathione S-transferase, N- domain  36.24 
 
 		 222 aa  128  7.000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4518  glutathione S-transferase, N- domain  36.24 
 
 		 222 aa  128  7.000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0348  glutathione S-transferase  56.48 
 
 		 124 aa  128  8.000000000000001e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4526  glutathione S-transferase, N- domain  36.24 
 
 		 222 aa  127  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4433  glutathione S-transferase domain-containing protein  36.02 
 
 		 222 aa  127  1.0000000000000001e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3116  Glutathione S-transferase protein  33.8 
 
 		 227 aa  125  3e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.324582  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0510  glutathione S-transferase domain-containing protein  33.5 
 
 		 208 aa  123  2e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.585126 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0375  glutathione S-transferase domain-containing protein  64.84 
 
 		 121 aa  123  2e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3541  glutathione S-transferase  36 
 
 		 215 aa  122  3e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.136471  normal  0.509105 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2005  glutathione S-transferase domain-containing protein  34.63 
 
 		 202 aa  122  3e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2329  glutathione S-transferase domain-containing protein  37.7 
 
 		 218 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.435459 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3593  glutathione S-transferase-like  33.18 
 
 		 221 aa  119  3.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.404871  normal  0.859314 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1722  glutathione S-transferase-like  36.11 
 
 		 222 aa  118  7e-26  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.226504  normal  0.784305 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0874  glutathione S-transferase domain-containing protein  34.55 
 
 		 234 aa  118  7.999999999999999e-26  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000650083 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3813  glutathione S-transferase domain-containing protein  35.85 
 
 		 221 aa  114  1.0000000000000001e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.340281  normal  0.596227 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6917  putative glutathione S-transferase  33.5 
 
 		 213 aa  109  3e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.522901 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1542  glutathione S-transferase  33.89 
 
 		 222 aa  108  4.0000000000000004e-23  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.172585 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00629  glutathione S-transferase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G17010)  31.43 
 
 		 255 aa  108  7.000000000000001e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0806169  normal  0.869816 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3640  glutathione S-transferase domain-containing protein  34.52 
 
 		 217 aa  104  1e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.390438 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0374  glutathione S-transferase-like protein  45.61 
 
 		 120 aa  103  2e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_35190  glutathione S-transferase  32.75 
 
 		 245 aa  99  5e-20  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0548873  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2967  glutathione S-transferase-like protein  30.81 
 
 		 214 aa  97.1  2e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2573  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.28 
 
 		 221 aa  94.7  9e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.748409  normal  0.500264 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1924  glutathione S-transferase domain-containing protein  29.85 
 
 		 202 aa  93.6  2e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.896239 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4165  glutathione S-transferase-like  29.73 
 
 		 225 aa  91.7  7e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0031  glutathione S-transferase  32.04 
 
 		 198 aa  91.3  9e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.243263 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2200  Glutathione S-transferase domain  28.86 
 
 		 202 aa  90.9  1e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4821  Glutathione S-transferase domain protein  29.19 
 
 		 221 aa  89  5e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.236344  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0539  Glutathione S-transferase domain protein  29.17 
 
 		 224 aa  88.6  5e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.333365  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3380  glutathione S-transferase-like protein  30 
 
 		 201 aa  86.7  3e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0039  glutathione S-transferase-like  31.55 
 
 		 198 aa  86.3  3e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1820  glutathione S-transferase-like protein  29.47 
 
 		 201 aa  85.1  6e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.631165 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3527  Glutathione S-transferase domain protein  29.52 
 
 		 201 aa  85.1  7e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.11732  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3463  glutathione S-transferase domain protein  30 
 
 		 201 aa  84.7  9e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0942071  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0508  glutathione S-transferase domain-containing protein  28.99 
 
 		 213 aa  83.2  0.000000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.553974 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2436  putative glutathione S-transferase  30.18 
 
 		 209 aa  82.4  0.000000000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.117632  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3767  glutathione S-transferase domain-containing protein  26.73 
 
 		 222 aa  82.8  0.000000000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1689  glutathione S-transferase-like  30.1 
 
 		 213 aa  82.4  0.000000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5735  Glutathione S-transferase domain protein  28.5 
 
 		 225 aa  82.4  0.000000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2778  glutathione S-transferase-like protein  28.43 
 
 		 211 aa  81.6  0.000000000000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.910721 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5977  glutathione S-transferase domain-containing protein  25.74 
 
 		 221 aa  80.9  0.00000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.9261 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5855  glutathione S-transferase domain-containing protein  27.69 
 
 		 213 aa  80.9  0.00000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3264  glutathione S-transferase-like protein  27.69 
 
 		 216 aa  80.5  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0652587  normal  0.563491 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>