More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_0024 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011004  Rpal_0024  Glutathione S-transferase domain  100 
 
 
222 aa  456  1e-127  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0724  glutathione S-transferase-like  87.39 
 
 
222 aa  406  1.0000000000000001e-112  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.4337 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0021  glutathione S-transferase-like protein  87.39 
 
 
222 aa  402  1e-111  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0019  glutathione S-transferase-like  80.63 
 
 
222 aa  379  1e-104  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0318  putative glutathione S-transferase III (GST-III)  78.28 
 
 
221 aa  352  2.9999999999999997e-96  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.894729  normal  0.561156 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4290  glutathione S-transferase domain-containing protein  70.78 
 
 
220 aa  322  3e-87  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.380653 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0273  putative glutathione S-transferase  66.52 
 
 
225 aa  303  1.0000000000000001e-81  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7159  Glutathione S-transferase domain  65.61 
 
 
225 aa  300  9e-81  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.218915  normal  0.479865 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2249  glutathione S-transferase-like protein  65.02 
 
 
222 aa  292  3e-78  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0626984 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3680  glutathione S-transferase domain-containing protein  64.13 
 
 
233 aa  290  2e-77  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.382886  normal  0.017552 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4517  glutathione S-transferase-like  64.13 
 
 
233 aa  290  2e-77  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.370294  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3847  glutathione S-transferase domain-containing protein  64.13 
 
 
233 aa  290  2e-77  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.948042  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5570  glutathione S-transferase domain-containing protein  65.02 
 
 
222 aa  288  5.0000000000000004e-77  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.509468  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3744  glutathione S-transferase domain-containing protein  64.57 
 
 
222 aa  286  1e-76  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.66674  normal  0.0935446 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3927  Glutathione S-transferase domain  64.68 
 
 
218 aa  281  4.0000000000000003e-75  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.253948  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4634  Glutathione transferase  61.82 
 
 
224 aa  281  7.000000000000001e-75  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3634  glutathione S-transferase domain-containing protein  64.22 
 
 
218 aa  279  3e-74  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.890005  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3917  Glutathione S-transferase domain  64.22 
 
 
218 aa  278  4e-74  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0306349  normal  0.123136 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3675  glutathione S-transferase-like protein  58.72 
 
 
220 aa  273  1.0000000000000001e-72  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2947  glutathione S-transferase domain-containing protein  53.6 
 
 
222 aa  256  2e-67  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.282557  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00398  glutathione S-transferase  54.87 
 
 
232 aa  252  3e-66  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.995047  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0261  glutathione S-transferase domain-containing protein  60.09 
 
 
221 aa  250  1e-65  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0252994  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1107  glutathione S-transferase  57.01 
 
 
223 aa  248  6e-65  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.300035  normal  0.477541 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4433  glutathione S-transferase domain-containing protein  54.75 
 
 
222 aa  243  9.999999999999999e-64  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3116  Glutathione S-transferase protein  51.77 
 
 
227 aa  241  9e-63  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.324582  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2329  glutathione S-transferase domain-containing protein  60.55 
 
 
218 aa  239  2e-62  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.435459 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2125  glutathione S-transferase-like protein  53 
 
 
224 aa  235  4e-61  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.850832  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0268  glutathione S-transferase domain-containing protein  48.64 
 
 
221 aa  222  3e-57  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3957  glutathione S-transferase-like  49.55 
 
 
221 aa  218  3.9999999999999997e-56  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1626  Glutathione S-transferase domain  52.04 
 
 
229 aa  218  3.9999999999999997e-56  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.506745  normal  0.230633 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4480  glutathione S-transferase domain-containing protein  49.56 
 
 
229 aa  214  5.9999999999999996e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0622605 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1175  glutathione S-transferase  50 
 
 
208 aa  207  1e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.275426  normal  0.372199 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1800  glutathione S-transferase domain-containing protein  47.32 
 
 
232 aa  203  2e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2668  glutathione S-transferase-like  50.45 
 
 
226 aa  202  3e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.111492  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4662  glutathione S-transferase, N- domain  50 
 
 
222 aa  202  4e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1922  Glutathione S-transferase domain protein  46.88 
 
 
232 aa  202  4e-51  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4611  glutathione S-transferase, N- domain  49.55 
 
 
222 aa  199  1.9999999999999998e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.931981  normal  0.250578 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4518  glutathione S-transferase, N- domain  49.55 
 
 
222 aa  199  1.9999999999999998e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2196  glutathione S-transferase domain-containing protein  47.75 
 
 
208 aa  200  1.9999999999999998e-50  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.827244 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4612  glutathione S-transferase, N- domain  49.55 
 
 
222 aa  199  1.9999999999999998e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0520156  normal  0.373731 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1722  glutathione S-transferase-like protein  47.93 
 
 
208 aa  198  3.9999999999999996e-50  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4526  glutathione S-transferase, N- domain  49.55 
 
 
222 aa  198  5e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1665  Glutathione S-transferase domain protein  47.91 
 
 
214 aa  198  6e-50  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.192716  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00195  Glutathione S-transferase-like protein  46.36 
 
 
222 aa  197  7.999999999999999e-50  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1060  glutathione S-transferase domain-containing protein  47.75 
 
 
208 aa  196  2.0000000000000003e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.927457 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2631  glutathione S-transferase-like protein  50 
 
 
208 aa  196  3e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.763244 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1365  glutathione S-transferase  47.75 
 
 
208 aa  194  9e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.290536  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2251  Glutathione transferase  49.53 
 
 
201 aa  194  9e-49  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00629  glutathione S-transferase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G17010)  44.68 
 
 
255 aa  192  4e-48  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0806169  normal  0.869816 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0510  glutathione S-transferase domain-containing protein  53.21 
 
 
208 aa  192  4e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.585126 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3813  glutathione S-transferase domain-containing protein  47.49 
 
 
221 aa  191  1e-47  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.340281  normal  0.596227 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1936  Glutathione S-transferase domain protein  45.12 
 
 
214 aa  189  4e-47  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.247506  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0874  glutathione S-transferase domain-containing protein  40.26 
 
 
234 aa  188  5.999999999999999e-47  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000650083 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1276  glutathione S-transferase-like  47 
 
 
208 aa  182  4.0000000000000006e-45  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.398915  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1722  glutathione S-transferase-like  39.91 
 
 
222 aa  177  8e-44  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.226504  normal  0.784305 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1542  glutathione S-transferase  38.99 
 
 
222 aa  174  9.999999999999999e-43  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.172585 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3541  glutathione S-transferase  40 
 
 
215 aa  165  5e-40  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.136471  normal  0.509105 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1385  glutathione S-transferase-like protein  40.76 
 
 
205 aa  162  3e-39  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.742051  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3593  glutathione S-transferase-like  42.86 
 
 
221 aa  160  1e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.404871  normal  0.859314 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0806  glutathione S-transferase domain-containing protein  38.71 
 
 
206 aa  159  4e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0265  Glutathione S-transferase domain protein  40.38 
 
 
208 aa  158  7e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.850678 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0269  glutathione S-transferase domain-containing protein  39.91 
 
 
208 aa  155  4e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0269  glutathione S-transferase domain-containing protein  39.91 
 
 
208 aa  155  6e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0261  glutathione S-transferase domain-containing protein  39.91 
 
 
208 aa  155  6e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0966  Glutathione S-transferase domain protein  37.62 
 
 
209 aa  154  9e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.262392  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001312  glutathione S-transferase  38.39 
 
 
205 aa  154  1e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6917  putative glutathione S-transferase  40.45 
 
 
213 aa  148  6e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.522901 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1353  Glutathione S-transferase domain protein  37.62 
 
 
209 aa  148  7e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.959522  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1093  glutathione S-transferase domain-containing protein  36.94 
 
 
209 aa  147  1.0000000000000001e-34  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05193  glutathione S-transferase III  37.33 
 
 
205 aa  147  2.0000000000000003e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2474  glutathione S-transferase family protein  35.68 
 
 
206 aa  142  3e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00158542  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2005  glutathione S-transferase domain-containing protein  36.67 
 
 
202 aa  138  6e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_35190  glutathione S-transferase  34.78 
 
 
245 aa  129  3e-29  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0548873  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1010  glutathione S-transferase-like  33.64 
 
 
211 aa  111  1.0000000000000001e-23  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0375  glutathione S-transferase domain-containing protein  56.67 
 
 
121 aa  108  6e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_56049  Glutathione S-transferase  31.28 
 
 
265 aa  107  2e-22  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2200  Glutathione S-transferase domain  33.8 
 
 
202 aa  98.2  8e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1924  glutathione S-transferase domain-containing protein  33.33 
 
 
202 aa  97.8  1e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.896239 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3640  glutathione S-transferase domain-containing protein  33.49 
 
 
217 aa  97.4  2e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.390438 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2222  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.34 
 
 
207 aa  95.5  5e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.186295 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2573  glutathione S-transferase domain-containing protein  33.02 
 
 
221 aa  94.7  1e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.748409  normal  0.500264 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0348  glutathione S-transferase  44.74 
 
 
124 aa  93.6  2e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0508  glutathione S-transferase domain-containing protein  28.64 
 
 
213 aa  92.4  5e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.553974 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3767  glutathione S-transferase domain-containing protein  29.44 
 
 
222 aa  92  6e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2200  glutathione S-transferase-like  30.23 
 
 
216 aa  92  7e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.313039 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3310  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.51 
 
 
210 aa  90.9  1e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.141117  normal  0.680332 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2431  Glutathione S-transferase domain  27.91 
 
 
216 aa  89.7  3e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.342495  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2967  glutathione S-transferase-like protein  30.92 
 
 
214 aa  89.4  4e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4821  Glutathione S-transferase domain protein  32.41 
 
 
221 aa  88.6  6e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.236344  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3264  glutathione S-transferase-like protein  28.84 
 
 
216 aa  88.2  1e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0652587  normal  0.563491 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3119  putative glutathione S-transferase  33.01 
 
 
207 aa  84.7  0.000000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.427542  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0847  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.56 
 
 
200 aa  83.6  0.000000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.154484 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0065  glutathione S-transferase domain-containing protein  28.3 
 
 
213 aa  83.6  0.000000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.167606  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2968  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.48 
 
 
211 aa  83.2  0.000000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.167267  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3205  glutathione S-transferase-like  27.36 
 
 
219 aa  83.2  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.877532  normal  0.459209 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3380  glutathione S-transferase-like protein  30.81 
 
 
201 aa  82.8  0.000000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0539  Glutathione S-transferase domain protein  28.57 
 
 
224 aa  82  0.000000000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.333365  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0995  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.03 
 
 
213 aa  82  0.000000000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.59438 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3527  Glutathione S-transferase domain protein  30.33 
 
 
201 aa  81.3  0.00000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.11732  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3114  glutathione S-transferase-like  30.14 
 
 
218 aa  80.9  0.00000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>