More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_1302 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009952  Dshi_1302  glutathione S-transferase domain protein  100 
 
 
222 aa  452  1.0000000000000001e-126  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0568234  normal  0.0901172 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0508  glutathione S-transferase domain-containing protein  45.24 
 
 
213 aa  175  5e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.553974 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3640  glutathione S-transferase domain-containing protein  48.13 
 
 
217 aa  167  1e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.390438 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1148  glutathione S-transferase-like  41.52 
 
 
219 aa  157  1e-37  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.289477 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2005  glutathione S-transferase domain-containing protein  32.51 
 
 
202 aa  101  9e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1924  glutathione S-transferase domain-containing protein  34.8 
 
 
202 aa  100  2e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.896239 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1060  glutathione S-transferase domain-containing protein  33.49 
 
 
208 aa  99.4  4e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.927457 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001312  glutathione S-transferase  30.88 
 
 
205 aa  99.4  4e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2200  Glutathione S-transferase domain  34.31 
 
 
202 aa  98.6  6e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0273  putative glutathione S-transferase  31.51 
 
 
225 aa  97.8  1e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05193  glutathione S-transferase III  33.01 
 
 
205 aa  97.8  1e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5735  Glutathione S-transferase domain protein  33.33 
 
 
225 aa  96.3  3e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0806  glutathione S-transferase domain-containing protein  29.91 
 
 
206 aa  96.7  3e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1365  glutathione S-transferase  33.17 
 
 
208 aa  94  1e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.290536  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1276  glutathione S-transferase-like  34.43 
 
 
208 aa  94.7  1e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.398915  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1722  glutathione S-transferase-like protein  33.33 
 
 
208 aa  94.4  1e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2573  glutathione S-transferase domain-containing protein  33.66 
 
 
221 aa  93.6  2e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.748409  normal  0.500264 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0269  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.07 
 
 
208 aa  93.6  2e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0261  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.07 
 
 
208 aa  92.4  4e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0269  glutathione S-transferase domain-containing protein  33.71 
 
 
208 aa  92.4  4e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2249  glutathione S-transferase-like protein  32.57 
 
 
222 aa  92.4  5e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0626984 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7159  Glutathione S-transferase domain  30.59 
 
 
225 aa  92.4  5e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.218915  normal  0.479865 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0265  Glutathione S-transferase domain protein  30.58 
 
 
208 aa  92  6e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.850678 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4517  glutathione S-transferase-like  33.03 
 
 
233 aa  92  6e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.370294  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3680  glutathione S-transferase domain-containing protein  33.03 
 
 
233 aa  92  6e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.382886  normal  0.017552 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3847  glutathione S-transferase domain-containing protein  33.03 
 
 
233 aa  92  6e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.948042  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2631  glutathione S-transferase-like protein  31.6 
 
 
208 aa  90.5  2e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.763244 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1385  glutathione S-transferase-like protein  30.5 
 
 
205 aa  90.5  2e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.742051  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4821  Glutathione S-transferase domain protein  30.39 
 
 
221 aa  90.1  3e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.236344  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1010  glutathione S-transferase-like  48.51 
 
 
211 aa  89.7  3e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3310  glutathione S-transferase domain-containing protein  35.91 
 
 
210 aa  90.1  3e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.141117  normal  0.680332 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4165  glutathione S-transferase-like  34.76 
 
 
225 aa  89.4  4e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3205  glutathione S-transferase-like  31.1 
 
 
219 aa  89  6e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.877532  normal  0.459209 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2200  glutathione S-transferase-like  29.41 
 
 
216 aa  88.6  6e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.313039 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1175  glutathione S-transferase  31.25 
 
 
208 aa  87  2e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.275426  normal  0.372199 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3541  glutathione S-transferase  31.25 
 
 
215 aa  87.4  2e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.136471  normal  0.509105 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0670  putative glutathione S-transferase (GST)  31.03 
 
 
218 aa  87  2e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.804169  normal  0.0458182 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1093  glutathione S-transferase domain-containing protein  44.66 
 
 
209 aa  86.7  3e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3264  glutathione S-transferase-like protein  27.94 
 
 
216 aa  86.7  3e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0652587  normal  0.563491 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3634  glutathione S-transferase domain-containing protein  33.19 
 
 
218 aa  86.3  4e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.890005  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2431  Glutathione S-transferase domain  28.99 
 
 
216 aa  85.9  5e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.342495  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1626  Glutathione S-transferase domain  34.56 
 
 
229 aa  85.5  6e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.506745  normal  0.230633 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3917  Glutathione S-transferase domain  31.98 
 
 
218 aa  84.3  0.000000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0306349  normal  0.123136 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2668  glutathione S-transferase-like  31.16 
 
 
226 aa  84.7  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.111492  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1722  glutathione S-transferase-like  28.64 
 
 
222 aa  84.7  0.000000000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.226504  normal  0.784305 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2196  glutathione S-transferase domain-containing protein  29.81 
 
 
208 aa  84.7  0.000000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.827244 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2967  glutathione S-transferase-like protein  30.54 
 
 
214 aa  84.7  0.000000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0539  Glutathione S-transferase domain protein  31.34 
 
 
224 aa  84.7  0.000000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.333365  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2474  glutathione S-transferase family protein  32.78 
 
 
206 aa  84  0.000000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00158542  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3927  Glutathione S-transferase domain  32.75 
 
 
218 aa  83.6  0.000000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.253948  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1820  glutathione S-transferase-like protein  26.96 
 
 
201 aa  83.2  0.000000000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.631165 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1107  glutathione S-transferase  32.74 
 
 
223 aa  82.8  0.000000000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.300035  normal  0.477541 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1353  Glutathione S-transferase domain protein  31.55 
 
 
209 aa  82.4  0.000000000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.959522  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0724  glutathione S-transferase-like  29.55 
 
 
222 aa  82  0.000000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.4337 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0268  glutathione S-transferase domain-containing protein  25.57 
 
 
221 aa  82  0.000000000000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0021  glutathione S-transferase-like protein  29.6 
 
 
222 aa  82  0.000000000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1936  Glutathione S-transferase domain protein  29.95 
 
 
214 aa  81.3  0.00000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.247506  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5570  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.19 
 
 
222 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.509468  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3744  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.19 
 
 
222 aa  80.1  0.00000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.66674  normal  0.0935446 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4290  glutathione S-transferase domain-containing protein  29.39 
 
 
220 aa  80.1  0.00000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.380653 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0375  glutathione S-transferase domain-containing protein  45.78 
 
 
121 aa  79.3  0.00000000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3114  glutathione S-transferase-like  26.92 
 
 
218 aa  79.3  0.00000000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1665  Glutathione S-transferase domain protein  29.73 
 
 
214 aa  79.3  0.00000000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.192716  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0966  Glutathione S-transferase domain protein  29.41 
 
 
209 aa  79.3  0.00000000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.262392  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0318  putative glutathione S-transferase III (GST-III)  28.64 
 
 
221 aa  79  0.00000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.894729  normal  0.561156 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0995  glutathione S-transferase domain-containing protein  29.9 
 
 
213 aa  78.6  0.00000000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.59438 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3593  glutathione S-transferase-like  29.63 
 
 
221 aa  78.6  0.00000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.404871  normal  0.859314 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1542  glutathione S-transferase  26.82 
 
 
222 aa  78.2  0.00000000000008  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.172585 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3957  glutathione S-transferase-like  28.18 
 
 
221 aa  78.6  0.00000000000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2436  putative glutathione S-transferase  27.4 
 
 
209 aa  77.8  0.0000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.117632  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3675  glutathione S-transferase-like protein  31.53 
 
 
220 aa  77.4  0.0000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3181  glutathione S-transferase domain-containing protein  29.67 
 
 
207 aa  77.8  0.0000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1955  Glutathione S-transferase domain  26.6 
 
 
208 aa  77  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0193951  normal  0.329521 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2125  glutathione S-transferase-like protein  29.82 
 
 
224 aa  77  0.0000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.850832  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5977  glutathione S-transferase domain-containing protein  29.06 
 
 
221 aa  77  0.0000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.9261 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3767  glutathione S-transferase domain-containing protein  27.59 
 
 
222 aa  76.3  0.0000000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4356  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.1 
 
 
205 aa  75.9  0.0000000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2166  Glutathione S-transferase domain protein  27.64 
 
 
208 aa  75.5  0.0000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.193029  normal  0.0802991 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3380  glutathione S-transferase-like protein  31.19 
 
 
201 aa  75.1  0.0000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4110  Glutathione S-transferase domain protein  31.4 
 
 
186 aa  74.7  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6917  putative glutathione S-transferase  29.17 
 
 
213 aa  74.3  0.000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.522901 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4150  glutathione S-transferase domain protein  31.4 
 
 
186 aa  74.7  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.432751 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0019  glutathione S-transferase-like  28.64 
 
 
222 aa  73.6  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3463  glutathione S-transferase domain protein  31.78 
 
 
201 aa  73.9  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0942071  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2778  glutathione S-transferase-like protein  29 
 
 
211 aa  72.8  0.000000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.910721 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0847  glutathione S-transferase domain-containing protein  28.85 
 
 
200 aa  73.6  0.000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.154484 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2251  Glutathione transferase  30.05 
 
 
201 aa  72.8  0.000000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3527  Glutathione S-transferase domain protein  29.03 
 
 
201 aa  72.8  0.000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.11732  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3116  Glutathione S-transferase protein  25.76 
 
 
227 aa  72.8  0.000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.324582  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3077  glutathione S-transferase-like  30.65 
 
 
214 aa  72.4  0.000000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.187241  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1991  glutathione S-transferase domain-containing protein  26.13 
 
 
206 aa  72  0.000000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.175013  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3183  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.54 
 
 
209 aa  72  0.000000000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.413955  normal  0.024534 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0783  glutathione S-transferase domain-containing protein  28.64 
 
 
209 aa  72  0.000000000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.469767 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00398  glutathione S-transferase  31.62 
 
 
232 aa  71.6  0.000000000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.995047  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2968  glutathione S-transferase domain-containing protein  28.57 
 
 
211 aa  71.6  0.000000000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.167267  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4480  glutathione S-transferase domain-containing protein  35.19 
 
 
229 aa  71.2  0.00000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0622605 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0510  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.63 
 
 
208 aa  70.9  0.00000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.585126 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0145  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.19 
 
 
203 aa  71.6  0.00000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.397548  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1689  glutathione S-transferase-like  25.94 
 
 
213 aa  71.2  0.00000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0755  glutathione S-transferase domain-containing protein  28.64 
 
 
209 aa  71.2  0.00000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.76216  normal  0.189515 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>