More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyc_1542 on replicon NC_007204
Organism: Psychrobacter arcticus 273-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007204  Psyc_1542  glutathione S-transferase  100 
 
 
222 aa  464  9.999999999999999e-131  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.172585 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1722  glutathione S-transferase-like  92.79 
 
 
222 aa  438  9.999999999999999e-123  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.226504  normal  0.784305 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0874  glutathione S-transferase domain-containing protein  55.41 
 
 
234 aa  265  2.9999999999999995e-70  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000650083 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4433  glutathione S-transferase domain-containing protein  45.91 
 
 
222 aa  189  4e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2947  glutathione S-transferase domain-containing protein  44.2 
 
 
222 aa  187  1e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.282557  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1626  Glutathione S-transferase domain  43.36 
 
 
229 aa  185  5e-46  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.506745  normal  0.230633 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1665  Glutathione S-transferase domain protein  46.3 
 
 
214 aa  182  3e-45  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.192716  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1936  Glutathione S-transferase domain protein  44.91 
 
 
214 aa  181  7e-45  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.247506  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0019  glutathione S-transferase-like  41.28 
 
 
222 aa  180  1e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00398  glutathione S-transferase  42.36 
 
 
232 aa  179  4e-44  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.995047  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3675  glutathione S-transferase-like protein  42.47 
 
 
220 aa  179  4e-44  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0724  glutathione S-transferase-like  40.83 
 
 
222 aa  177  2e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.4337 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0268  glutathione S-transferase domain-containing protein  42.6 
 
 
221 aa  175  6e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0024  Glutathione S-transferase domain  38.99 
 
 
222 aa  174  9.999999999999999e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4634  Glutathione transferase  40.27 
 
 
224 aa  171  9e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1107  glutathione S-transferase  37.73 
 
 
223 aa  169  2e-41  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.300035  normal  0.477541 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0021  glutathione S-transferase-like protein  38.99 
 
 
222 aa  169  3e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7159  Glutathione S-transferase domain  37.95 
 
 
225 aa  168  5e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.218915  normal  0.479865 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3957  glutathione S-transferase-like  41.23 
 
 
221 aa  168  5e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0273  putative glutathione S-transferase  37.95 
 
 
225 aa  168  7e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3813  glutathione S-transferase domain-containing protein  44.8 
 
 
221 aa  166  2.9999999999999998e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.340281  normal  0.596227 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0318  putative glutathione S-transferase III (GST-III)  39.45 
 
 
221 aa  163  2.0000000000000002e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.894729  normal  0.561156 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4517  glutathione S-transferase-like  38.91 
 
 
233 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.370294  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3680  glutathione S-transferase domain-containing protein  38.91 
 
 
233 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.382886  normal  0.017552 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3847  glutathione S-transferase domain-containing protein  38.91 
 
 
233 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.948042  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1922  Glutathione S-transferase domain protein  39.21 
 
 
232 aa  162  3e-39  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2249  glutathione S-transferase-like protein  39.09 
 
 
222 aa  162  3e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0626984 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4290  glutathione S-transferase domain-containing protein  35.87 
 
 
220 aa  162  4.0000000000000004e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.380653 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3917  Glutathione S-transferase domain  39.55 
 
 
218 aa  162  4.0000000000000004e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0306349  normal  0.123136 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3744  glutathione S-transferase domain-containing protein  38.18 
 
 
222 aa  161  7e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.66674  normal  0.0935446 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5570  glutathione S-transferase domain-containing protein  38.18 
 
 
222 aa  161  7e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.509468  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3116  Glutathione S-transferase protein  37.17 
 
 
227 aa  161  8.000000000000001e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.324582  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2125  glutathione S-transferase-like protein  38.84 
 
 
224 aa  161  9e-39  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.850832  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1800  glutathione S-transferase domain-containing protein  38.77 
 
 
232 aa  160  2e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00195  Glutathione S-transferase-like protein  40 
 
 
222 aa  159  3e-38  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3634  glutathione S-transferase domain-containing protein  38.18 
 
 
218 aa  159  4e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.890005  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3927  Glutathione S-transferase domain  37.73 
 
 
218 aa  157  1e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.253948  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4611  glutathione S-transferase, N- domain  42.01 
 
 
222 aa  150  1e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.931981  normal  0.250578 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4662  glutathione S-transferase, N- domain  42.01 
 
 
222 aa  150  1e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4518  glutathione S-transferase, N- domain  42.01 
 
 
222 aa  150  1e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4612  glutathione S-transferase, N- domain  42.01 
 
 
222 aa  150  1e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0520156  normal  0.373731 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4526  glutathione S-transferase, N- domain  42.01 
 
 
222 aa  149  3e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2668  glutathione S-transferase-like  37.44 
 
 
226 aa  149  4e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.111492  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2631  glutathione S-transferase-like protein  36.07 
 
 
208 aa  142  4e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.763244 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4480  glutathione S-transferase domain-containing protein  37.05 
 
 
229 aa  141  8e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0622605 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00629  glutathione S-transferase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G17010)  35.44 
 
 
255 aa  139  1.9999999999999998e-32  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0806169  normal  0.869816 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0261  glutathione S-transferase domain-containing protein  37.67 
 
 
221 aa  136  2e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0252994  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1365  glutathione S-transferase  35.87 
 
 
208 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.290536  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1175  glutathione S-transferase  35.87 
 
 
208 aa  132  3e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.275426  normal  0.372199 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2196  glutathione S-transferase domain-containing protein  33.64 
 
 
208 aa  131  1.0000000000000001e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.827244 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2251  Glutathione transferase  37.38 
 
 
201 aa  131  1.0000000000000001e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3593  glutathione S-transferase-like  36.7 
 
 
221 aa  125  4.0000000000000003e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.404871  normal  0.859314 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2329  glutathione S-transferase domain-containing protein  35 
 
 
218 aa  125  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.435459 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1060  glutathione S-transferase domain-containing protein  33.79 
 
 
208 aa  122  4e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.927457 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05193  glutathione S-transferase III  33.8 
 
 
205 aa  120  1.9999999999999998e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0510  glutathione S-transferase domain-containing protein  36.57 
 
 
208 aa  119  4.9999999999999996e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.585126 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1276  glutathione S-transferase-like  34.55 
 
 
208 aa  117  9.999999999999999e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.398915  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0806  glutathione S-transferase domain-containing protein  34.72 
 
 
206 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1722  glutathione S-transferase-like protein  34.84 
 
 
208 aa  114  8.999999999999998e-25  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001312  glutathione S-transferase  33.8 
 
 
205 aa  114  1.0000000000000001e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3541  glutathione S-transferase  36.36 
 
 
215 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.136471  normal  0.509105 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0265  Glutathione S-transferase domain protein  34.56 
 
 
208 aa  113  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.850678 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1353  Glutathione S-transferase domain protein  31.78 
 
 
209 aa  114  2.0000000000000002e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.959522  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1385  glutathione S-transferase-like protein  33.64 
 
 
205 aa  112  4.0000000000000004e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.742051  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0269  glutathione S-transferase domain-containing protein  34.1 
 
 
208 aa  112  6e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2474  glutathione S-transferase family protein  31.34 
 
 
206 aa  111  7.000000000000001e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00158542  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0269  glutathione S-transferase domain-containing protein  48.74 
 
 
208 aa  111  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0261  glutathione S-transferase domain-containing protein  34.1 
 
 
208 aa  110  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0966  Glutathione S-transferase domain protein  33.89 
 
 
209 aa  108  5e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.262392  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_35190  glutathione S-transferase  32.64 
 
 
245 aa  107  1e-22  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0548873  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6917  putative glutathione S-transferase  28.64 
 
 
213 aa  102  6e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.522901 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1093  glutathione S-transferase domain-containing protein  44.54 
 
 
209 aa  101  8e-21  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2005  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.46 
 
 
202 aa  93.2  3e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0508  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.41 
 
 
213 aa  90.1  3e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.553974 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1924  glutathione S-transferase domain-containing protein  29.68 
 
 
202 aa  89.7  3e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.896239 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1010  glutathione S-transferase-like  45.63 
 
 
211 aa  90.1  3e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2200  Glutathione S-transferase domain  29.22 
 
 
202 aa  88.6  6e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0375  glutathione S-transferase domain-containing protein  43.75 
 
 
121 aa  85.1  7e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND00620  glutathione transferase, putative  30.47 
 
 
249 aa  84.7  9e-16  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.295755  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2967  glutathione S-transferase-like protein  27.84 
 
 
214 aa  82.4  0.000000000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3767  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.84 
 
 
222 aa  82.4  0.000000000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0348  glutathione S-transferase  41.23 
 
 
124 aa  81.6  0.000000000000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2200  glutathione S-transferase-like  28.7 
 
 
216 aa  80.1  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.313039 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1302  glutathione S-transferase domain protein  26.82 
 
 
222 aa  78.2  0.00000000000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0568234  normal  0.0901172 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4165  glutathione S-transferase-like  29.03 
 
 
225 aa  77  0.0000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2431  Glutathione S-transferase domain  27.78 
 
 
216 aa  77  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.342495  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1863  glutathione S-transferase-like protein  28.97 
 
 
206 aa  76.6  0.0000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.546298  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5977  glutathione S-transferase domain-containing protein  29.38 
 
 
221 aa  75.9  0.0000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.9261 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2573  glutathione S-transferase domain-containing protein  29.49 
 
 
221 aa  75.5  0.0000000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.748409  normal  0.500264 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_56049  Glutathione S-transferase  30.11 
 
 
265 aa  74.3  0.000000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0539  Glutathione S-transferase domain protein  28.05 
 
 
224 aa  74.3  0.000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.333365  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3310  glutathione S-transferase domain-containing protein  28.77 
 
 
210 aa  72.8  0.000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.141117  normal  0.680332 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3640  glutathione S-transferase domain-containing protein  27.06 
 
 
217 aa  72  0.000000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.390438 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3264  glutathione S-transferase-like protein  26.98 
 
 
216 aa  71.2  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0652587  normal  0.563491 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3114  glutathione S-transferase-like  27.73 
 
 
218 aa  71.2  0.00000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2222  glutathione S-transferase domain-containing protein  25.12 
 
 
207 aa  70.9  0.00000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.186295 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3205  glutathione S-transferase-like  27.83 
 
 
219 aa  70.9  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.877532  normal  0.459209 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3463  glutathione S-transferase domain protein  30 
 
 
201 aa  70.5  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0942071  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4821  Glutathione S-transferase domain protein  28.57 
 
 
221 aa  69.3  0.00000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.236344  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0789  Glutathione S-transferase domain  29.47 
 
 
216 aa  68.2  0.00000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.100128 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>