More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_3205 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007925  RPC_3205  glutathione S-transferase-like  100 
 
 
219 aa  449  1e-125  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.877532  normal  0.459209 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2200  glutathione S-transferase-like  83.09 
 
 
216 aa  359  2e-98  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.313039 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2431  Glutathione S-transferase domain  80.86 
 
 
216 aa  357  7e-98  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.342495  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3264  glutathione S-transferase-like protein  79.71 
 
 
216 aa  350  1e-95  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0652587  normal  0.563491 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0670  putative glutathione S-transferase (GST)  77.17 
 
 
218 aa  345  3e-94  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.804169  normal  0.0458182 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3767  glutathione S-transferase domain-containing protein  61.35 
 
 
222 aa  271  6e-72  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5735  Glutathione S-transferase domain protein  63.45 
 
 
225 aa  268  4e-71  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4165  glutathione S-transferase-like  60.48 
 
 
225 aa  258  3e-68  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0539  Glutathione S-transferase domain protein  60.98 
 
 
224 aa  258  5.0000000000000005e-68  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.333365  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4821  Glutathione S-transferase domain protein  59.33 
 
 
221 aa  245  4e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.236344  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5977  glutathione S-transferase domain-containing protein  58.67 
 
 
221 aa  240  2e-62  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.9261 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2573  glutathione S-transferase domain-containing protein  57.42 
 
 
221 aa  234  9e-61  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.748409  normal  0.500264 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3114  glutathione S-transferase-like  55.07 
 
 
218 aa  227  1e-58  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3310  glutathione S-transferase domain-containing protein  52.45 
 
 
210 aa  224  1e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.141117  normal  0.680332 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2436  putative glutathione S-transferase  49.02 
 
 
209 aa  213  9.999999999999999e-55  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.117632  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1863  glutathione S-transferase-like protein  46.83 
 
 
206 aa  173  1.9999999999999998e-42  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.546298  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1924  glutathione S-transferase domain-containing protein  38.19 
 
 
202 aa  143  2e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.896239 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2200  Glutathione S-transferase domain  37.69 
 
 
202 aa  141  9e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2005  glutathione S-transferase domain-containing protein  33.66 
 
 
202 aa  120  1.9999999999999998e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2967  glutathione S-transferase-like protein  38.16 
 
 
214 aa  116  3e-25  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0508  glutathione S-transferase domain-containing protein  34.31 
 
 
213 aa  112  3e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.553974 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1820  glutathione S-transferase-like protein  33.01 
 
 
201 aa  107  2e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.631165 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3119  putative glutathione S-transferase  35.08 
 
 
207 aa  103  2e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.427542  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3593  glutathione S-transferase-like  27.6 
 
 
221 aa  98.2  8e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.404871  normal  0.859314 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1353  Glutathione S-transferase domain protein  31.53 
 
 
209 aa  94.7  9e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.959522  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1991  glutathione S-transferase domain-containing protein  32.39 
 
 
206 aa  94  2e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.175013  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1175  glutathione S-transferase  31.53 
 
 
208 aa  93.6  2e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.275426  normal  0.372199 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2196  glutathione S-transferase domain-containing protein  28.99 
 
 
208 aa  94  2e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.827244 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1365  glutathione S-transferase  31.53 
 
 
208 aa  92.8  3e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.290536  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0806  glutathione S-transferase domain-containing protein  29.63 
 
 
206 aa  93.2  3e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2166  Glutathione S-transferase domain protein  31.98 
 
 
208 aa  92.8  4e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.193029  normal  0.0802991 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2947  glutathione S-transferase domain-containing protein  27.65 
 
 
222 aa  92.4  5e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.282557  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3463  glutathione S-transferase domain protein  30.85 
 
 
201 aa  92.4  5e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0942071  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2668  glutathione S-transferase-like  30.43 
 
 
226 aa  92  7e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.111492  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1107  glutathione S-transferase  31.16 
 
 
223 aa  91.7  7e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.300035  normal  0.477541 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0021  glutathione S-transferase-like protein  29.3 
 
 
222 aa  91.3  9e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3527  Glutathione S-transferase domain protein  30.35 
 
 
201 aa  90.9  1e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.11732  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0838  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.28 
 
 
227 aa  90.9  1e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0531264  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3541  glutathione S-transferase  33.5 
 
 
215 aa  90.1  2e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.136471  normal  0.509105 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3380  glutathione S-transferase-like protein  30.35 
 
 
201 aa  90.9  2e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2937  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.75 
 
 
204 aa  90.5  2e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2968  glutathione S-transferase domain-containing protein  28.57 
 
 
211 aa  89.7  3e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.167267  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2329  glutathione S-transferase-like  32.23 
 
 
204 aa  89.7  3e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.209551  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2943  glutathione S-transferase domain-containing protein  32.23 
 
 
204 aa  89.7  3e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6917  putative glutathione S-transferase  28.64 
 
 
213 aa  89.4  4e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.522901 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1302  glutathione S-transferase domain protein  31.1 
 
 
222 aa  88.6  7e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0568234  normal  0.0901172 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00398  glutathione S-transferase  29.86 
 
 
232 aa  88.6  7e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.995047  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2964  glutathione S-transferase domain-containing protein  32.23 
 
 
204 aa  88.2  8e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2474  glutathione S-transferase family protein  29.13 
 
 
206 aa  88.2  9e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00158542  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1955  Glutathione S-transferase domain  28.7 
 
 
208 aa  87.8  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0193951  normal  0.329521 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6295  glutathione S-transferase-like protein  31.75 
 
 
204 aa  87.8  1e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.14476  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03306  putative glutathione S-transferase protein  30.43 
 
 
210 aa  87.8  1e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.00013946  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0847  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.54 
 
 
200 aa  87.4  2e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.154484 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2853  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.28 
 
 
204 aa  87  2e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.606213 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2958  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.71 
 
 
211 aa  87.4  2e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2990  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.81 
 
 
204 aa  86.7  2e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0897  glutathione S-transferase  32.32 
 
 
210 aa  86.7  3e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3181  glutathione S-transferase domain-containing protein  29.05 
 
 
207 aa  86.7  3e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0019  glutathione S-transferase-like  30 
 
 
222 aa  86.7  3e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0724  glutathione S-transferase-like  29.22 
 
 
222 aa  86.7  3e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.4337 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2556  glutathione S-transferase domain-containing protein  32.32 
 
 
210 aa  85.9  5e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0907  glutathione S-transferase domain-containing protein  28.78 
 
 
207 aa  85.9  5e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001312  glutathione S-transferase  29.11 
 
 
205 aa  85.5  6e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2015  glutathione S-transferase-like  31.52 
 
 
221 aa  85.1  7e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3561  Glutathione S-transferase domain protein  27.49 
 
 
210 aa  85.1  7e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.134068  normal  0.24035 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2222  glutathione S-transferase domain-containing protein  32.04 
 
 
207 aa  85.1  7e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.186295 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1060  glutathione S-transferase domain-containing protein  27.45 
 
 
208 aa  84.7  9e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.927457 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0024  Glutathione S-transferase domain  27.57 
 
 
222 aa  84.7  9e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0681  glutathione S-transferase domain-containing protein  27.49 
 
 
210 aa  84.3  0.000000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.052324  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5702  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.79 
 
 
214 aa  84.3  0.000000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.366134  normal  0.106893 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0995  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.61 
 
 
213 aa  84.3  0.000000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.59438 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4634  Glutathione transferase  27.31 
 
 
224 aa  84  0.000000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3629  glutathione S-transferase domain-containing protein  27.49 
 
 
210 aa  84  0.000000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.395815  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3752  glutathione S-transferase domain-containing protein  27.49 
 
 
210 aa  84  0.000000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0132369  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05193  glutathione S-transferase III  27.7 
 
 
205 aa  83.2  0.000000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3706  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.3 
 
 
210 aa  83.2  0.000000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0253  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.6 
 
 
205 aa  82.8  0.000000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.617633 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2778  glutathione S-transferase-like protein  30.85 
 
 
211 aa  82.8  0.000000000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.910721 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0269  glutathione S-transferase domain-containing protein  28.04 
 
 
208 aa  82  0.000000000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3640  glutathione S-transferase domain-containing protein  32.67 
 
 
217 aa  81.6  0.000000000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.390438 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0261  glutathione S-transferase domain-containing protein  28.5 
 
 
208 aa  81.6  0.000000000000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1626  Glutathione S-transferase domain  27.93 
 
 
229 aa  81.6  0.000000000000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.506745  normal  0.230633 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0269  glutathione S-transferase domain-containing protein  28.04 
 
 
208 aa  80.5  0.00000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0265  Glutathione S-transferase domain protein  27.23 
 
 
208 aa  80.5  0.00000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.850678 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0318  putative glutathione S-transferase III (GST-III)  28.96 
 
 
221 aa  80.5  0.00000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.894729  normal  0.561156 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3680  glutathione S-transferase domain-containing protein  28.37 
 
 
233 aa  80.1  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.382886  normal  0.017552 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1148  glutathione S-transferase-like  34.13 
 
 
219 aa  79.7  0.00000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.289477 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3695  Glutathione S-transferase domain  31.82 
 
 
215 aa  79.7  0.00000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0434501  hitchhiker  0.00000154046 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1722  glutathione S-transferase-like protein  27.09 
 
 
208 aa  79.7  0.00000000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4517  glutathione S-transferase-like  28.37 
 
 
233 aa  80.1  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.370294  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2090  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.46 
 
 
227 aa  79.7  0.00000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.403275  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3847  glutathione S-transferase domain-containing protein  28.37 
 
 
233 aa  80.1  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.948042  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4290  glutathione S-transferase domain-containing protein  29.28 
 
 
220 aa  79  0.00000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.380653 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1385  glutathione S-transferase-like protein  27.88 
 
 
205 aa  79  0.00000000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.742051  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5110  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.33 
 
 
205 aa  79  0.00000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0347901 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3513  glutathione S-transferase domain-containing protein  27.8 
 
 
207 aa  78.6  0.00000000000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.72335  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1093  glutathione S-transferase domain-containing protein  27.52 
 
 
209 aa  78.2  0.00000000000008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2631  glutathione S-transferase-like protein  27.94 
 
 
208 aa  78.2  0.00000000000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.763244 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1800  glutathione S-transferase domain-containing protein  26.91 
 
 
232 aa  77.8  0.0000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2249  glutathione S-transferase-like protein  26.98 
 
 
222 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0626984 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>