More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_3264 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007778  RPB_3264  glutathione S-transferase-like protein  100 
 
 
216 aa  448  1e-125  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0652587  normal  0.563491 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2200  glutathione S-transferase-like  93.98 
 
 
216 aa  426  1e-118  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.313039 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2431  Glutathione S-transferase domain  85.19 
 
 
216 aa  384  1e-106  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.342495  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0670  putative glutathione S-transferase (GST)  76.39 
 
 
218 aa  348  3e-95  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.804169  normal  0.0458182 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3205  glutathione S-transferase-like  81.82 
 
 
219 aa  344  6e-94  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.877532  normal  0.459209 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3767  glutathione S-transferase domain-containing protein  61.32 
 
 
222 aa  281  5.000000000000001e-75  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0539  Glutathione S-transferase domain protein  60.66 
 
 
224 aa  270  1e-71  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.333365  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5735  Glutathione S-transferase domain protein  62.24 
 
 
225 aa  265  4e-70  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4165  glutathione S-transferase-like  56.48 
 
 
225 aa  254  6e-67  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4821  Glutathione S-transferase domain protein  58.69 
 
 
221 aa  247  1e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.236344  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5977  glutathione S-transferase domain-containing protein  57.65 
 
 
221 aa  244  6.999999999999999e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.9261 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2573  glutathione S-transferase domain-containing protein  56.74 
 
 
221 aa  235  4e-61  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.748409  normal  0.500264 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3310  glutathione S-transferase domain-containing protein  50.25 
 
 
210 aa  216  2.9999999999999998e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.141117  normal  0.680332 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2436  putative glutathione S-transferase  50.99 
 
 
209 aa  214  5.9999999999999996e-55  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.117632  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3114  glutathione S-transferase-like  49.75 
 
 
218 aa  207  1e-52  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1863  glutathione S-transferase-like protein  47.74 
 
 
206 aa  177  1e-43  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.546298  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1924  glutathione S-transferase domain-containing protein  38.69 
 
 
202 aa  150  2e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.896239 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2200  Glutathione S-transferase domain  38.19 
 
 
202 aa  148  7e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0508  glutathione S-transferase domain-containing protein  34.83 
 
 
213 aa  124  8.000000000000001e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.553974 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2005  glutathione S-transferase domain-containing protein  32.5 
 
 
202 aa  112  5e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2967  glutathione S-transferase-like protein  34.63 
 
 
214 aa  107  2e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3119  putative glutathione S-transferase  34.72 
 
 
207 aa  101  8e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.427542  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1175  glutathione S-transferase  32.35 
 
 
208 aa  100  1e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.275426  normal  0.372199 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2196  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.95 
 
 
208 aa  101  1e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.827244 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2947  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.49 
 
 
222 aa  100  2e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.282557  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1365  glutathione S-transferase  33.33 
 
 
208 aa  99  4e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.290536  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1107  glutathione S-transferase  31.48 
 
 
223 aa  99  6e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.300035  normal  0.477541 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0907  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.28 
 
 
207 aa  96.7  2e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001312  glutathione S-transferase  29.52 
 
 
205 aa  95.9  5e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3181  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.24 
 
 
207 aa  94.4  1e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2968  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.58 
 
 
211 aa  93.6  2e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.167267  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0897  glutathione S-transferase  33 
 
 
210 aa  93.6  2e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2556  glutathione S-transferase domain-containing protein  33 
 
 
210 aa  93.2  3e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0021  glutathione S-transferase-like protein  29.77 
 
 
222 aa  93.2  3e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1820  glutathione S-transferase-like protein  31.07 
 
 
201 aa  93.2  3e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.631165 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05193  glutathione S-transferase III  27.65 
 
 
205 aa  92.4  5e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3541  glutathione S-transferase  34.63 
 
 
215 aa  92  6e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.136471  normal  0.509105 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0806  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.29 
 
 
206 aa  91.7  7e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3957  glutathione S-transferase-like  28.17 
 
 
221 aa  91.7  8e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0724  glutathione S-transferase-like  30.23 
 
 
222 aa  91.3  9e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.4337 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3629  glutathione S-transferase domain-containing protein  28.91 
 
 
210 aa  90.9  1e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.395815  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3752  glutathione S-transferase domain-containing protein  28.91 
 
 
210 aa  90.9  1e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0132369  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3561  Glutathione S-transferase domain protein  29.38 
 
 
210 aa  91.3  1e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.134068  normal  0.24035 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4634  Glutathione transferase  29.03 
 
 
224 aa  91.3  1e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3513  glutathione S-transferase domain-containing protein  29.86 
 
 
207 aa  91.3  1e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.72335  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1626  Glutathione S-transferase domain  28.88 
 
 
229 aa  91.3  1e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.506745  normal  0.230633 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0681  glutathione S-transferase domain-containing protein  29.38 
 
 
210 aa  91.3  1e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.052324  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1060  glutathione S-transferase domain-containing protein  27.59 
 
 
208 aa  90.5  2e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.927457 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03306  putative glutathione S-transferase protein  30.24 
 
 
210 aa  90.5  2e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.00013946  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1353  Glutathione S-transferase domain protein  32.65 
 
 
209 aa  89  5e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.959522  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0019  glutathione S-transferase-like  29.09 
 
 
222 aa  88.6  7e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00398  glutathione S-transferase  30.36 
 
 
232 aa  88.2  8e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.995047  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0024  Glutathione S-transferase domain  28.84 
 
 
222 aa  88.2  9e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0838  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.26 
 
 
227 aa  87.4  1e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0531264  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1302  glutathione S-transferase domain protein  27.94 
 
 
222 aa  86.7  3e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0568234  normal  0.0901172 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2958  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.34 
 
 
211 aa  86.7  3e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1991  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.35 
 
 
206 aa  86.3  3e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.175013  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4356  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.61 
 
 
205 aa  85.5  5e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1800  glutathione S-transferase domain-containing protein  27.68 
 
 
232 aa  84.7  9e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4290  glutathione S-transferase domain-containing protein  28.25 
 
 
220 aa  84.7  0.000000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.380653 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5110  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.19 
 
 
205 aa  83.6  0.000000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0347901 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2631  glutathione S-transferase-like protein  28.78 
 
 
208 aa  83.6  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.763244 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0273  putative glutathione S-transferase  28.11 
 
 
225 aa  83.6  0.000000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3706  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.15 
 
 
210 aa  83.2  0.000000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1922  Glutathione S-transferase domain protein  27.68 
 
 
232 aa  82.8  0.000000000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5702  glutathione S-transferase domain-containing protein  32.99 
 
 
214 aa  82.4  0.000000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.366134  normal  0.106893 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7159  Glutathione S-transferase domain  28.51 
 
 
225 aa  82.4  0.000000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.218915  normal  0.479865 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1722  glutathione S-transferase-like protein  28.23 
 
 
208 aa  82  0.000000000000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2166  Glutathione S-transferase domain protein  31.87 
 
 
208 aa  81.6  0.000000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.193029  normal  0.0802991 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0265  Glutathione S-transferase domain protein  28.5 
 
 
208 aa  81.6  0.000000000000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.850678 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0261  glutathione S-transferase domain-containing protein  29.33 
 
 
208 aa  81.6  0.000000000000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0269  glutathione S-transferase domain-containing protein  28.85 
 
 
208 aa  81.3  0.00000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1955  Glutathione S-transferase domain  30.46 
 
 
208 aa  80.9  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0193951  normal  0.329521 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2474  glutathione S-transferase family protein  27.01 
 
 
206 aa  80.5  0.00000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00158542  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0794  Glutathione S-transferase domain  28.96 
 
 
221 aa  80.5  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.730011  normal  0.341274 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0269  glutathione S-transferase domain-containing protein  28.85 
 
 
208 aa  80.5  0.00000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2015  glutathione S-transferase-like  28.65 
 
 
221 aa  80.5  0.00000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1385  glutathione S-transferase-like protein  26.73 
 
 
205 aa  80.5  0.00000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.742051  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2668  glutathione S-transferase-like  28.29 
 
 
226 aa  80.1  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.111492  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0907  Glutathione S-transferase domain protein  28.77 
 
 
221 aa  80.5  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0411393  normal  0.132395 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0318  putative glutathione S-transferase III (GST-III)  27.73 
 
 
221 aa  80.9  0.00000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.894729  normal  0.561156 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0966  Glutathione S-transferase domain protein  27.69 
 
 
209 aa  80.5  0.00000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.262392  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0253  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.39 
 
 
205 aa  79.7  0.00000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.617633 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2937  glutathione S-transferase domain-containing protein  27.98 
 
 
204 aa  79.7  0.00000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1148  glutathione S-transferase-like  31.82 
 
 
219 aa  79.3  0.00000000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.289477 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0995  glutathione S-transferase domain-containing protein  29.74 
 
 
213 aa  79  0.00000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.59438 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2557  glutathione S-transferase-like protein  28.64 
 
 
205 aa  78.6  0.00000000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.630075 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3954  glutathione S-transferase domain-containing protein  28.64 
 
 
205 aa  78.6  0.00000000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.251267 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5570  glutathione S-transferase domain-containing protein  27.31 
 
 
222 aa  78.2  0.00000000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.509468  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3680  glutathione S-transferase domain-containing protein  26.39 
 
 
233 aa  78.2  0.00000000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.382886  normal  0.017552 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4517  glutathione S-transferase-like  26.39 
 
 
233 aa  78.2  0.00000000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.370294  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3847  glutathione S-transferase domain-containing protein  26.39 
 
 
233 aa  78.2  0.00000000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.948042  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2222  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.1 
 
 
207 aa  77.4  0.0000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.186295 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3478  glutathione S-transferase domain-containing protein  28.5 
 
 
205 aa  77.8  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.556825  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2249  glutathione S-transferase-like protein  27.65 
 
 
222 aa  77.8  0.0000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0626984 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1936  Glutathione S-transferase domain protein  26.39 
 
 
214 aa  77.4  0.0000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.247506  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2509  glutathione S-transferase-like protein  29.9 
 
 
208 aa  77.8  0.0000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.640237  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3744  glutathione S-transferase domain-containing protein  27.31 
 
 
222 aa  77.4  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.66674  normal  0.0935446 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3593  glutathione S-transferase-like  25.84 
 
 
221 aa  77  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.404871  normal  0.859314 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0739  glutathione S-transferase-like protein  28.29 
 
 
214 aa  77  0.0000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000125702  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>