More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_3593 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007925  RPC_3593  glutathione S-transferase-like  100 
 
 
221 aa  452  1.0000000000000001e-126  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.404871  normal  0.859314 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6917  putative glutathione S-transferase  56.56 
 
 
213 aa  249  2e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.522901 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4433  glutathione S-transferase domain-containing protein  43.48 
 
 
222 aa  169  2e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7159  Glutathione S-transferase domain  41.59 
 
 
225 aa  170  2e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.218915  normal  0.479865 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0019  glutathione S-transferase-like  43.84 
 
 
222 aa  165  5.9999999999999996e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4290  glutathione S-transferase domain-containing protein  41.33 
 
 
220 aa  163  2.0000000000000002e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.380653 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0273  putative glutathione S-transferase  40.53 
 
 
225 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2947  glutathione S-transferase domain-containing protein  39.64 
 
 
222 aa  161  6e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.282557  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1175  glutathione S-transferase  41.78 
 
 
208 aa  161  7e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.275426  normal  0.372199 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0024  Glutathione S-transferase domain  42.86 
 
 
222 aa  160  1e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2249  glutathione S-transferase-like protein  40.79 
 
 
222 aa  159  3e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0626984 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0724  glutathione S-transferase-like  42.86 
 
 
222 aa  158  6e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.4337 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3680  glutathione S-transferase domain-containing protein  40.27 
 
 
233 aa  158  8e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.382886  normal  0.017552 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0021  glutathione S-transferase-like protein  42.86 
 
 
222 aa  158  8e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4517  glutathione S-transferase-like  40.27 
 
 
233 aa  158  8e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.370294  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3847  glutathione S-transferase domain-containing protein  40.27 
 
 
233 aa  158  8e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.948042  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4634  Glutathione transferase  40.27 
 
 
224 aa  156  3e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1626  Glutathione S-transferase domain  41.81 
 
 
229 aa  152  2.9999999999999998e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.506745  normal  0.230633 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5570  glutathione S-transferase domain-containing protein  40 
 
 
222 aa  152  5.9999999999999996e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.509468  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3744  glutathione S-transferase domain-containing protein  40 
 
 
222 aa  151  7e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.66674  normal  0.0935446 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2668  glutathione S-transferase-like  39.44 
 
 
226 aa  149  2e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.111492  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00398  glutathione S-transferase  38.2 
 
 
232 aa  149  4e-35  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.995047  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3541  glutathione S-transferase  40 
 
 
215 aa  149  4e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.136471  normal  0.509105 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1365  glutathione S-transferase  39.53 
 
 
208 aa  148  5e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.290536  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2125  glutathione S-transferase-like protein  39.04 
 
 
224 aa  147  1.0000000000000001e-34  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.850832  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1665  Glutathione S-transferase domain protein  40.09 
 
 
214 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.192716  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1936  Glutathione S-transferase domain protein  38.36 
 
 
214 aa  145  3e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.247506  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3957  glutathione S-transferase-like  38.53 
 
 
221 aa  144  7.0000000000000006e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2196  glutathione S-transferase domain-containing protein  37.26 
 
 
208 aa  144  8.000000000000001e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.827244 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0318  putative glutathione S-transferase III (GST-III)  38.99 
 
 
221 aa  144  8.000000000000001e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.894729  normal  0.561156 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1107  glutathione S-transferase  38.84 
 
 
223 aa  143  2e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.300035  normal  0.477541 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00195  Glutathione S-transferase-like protein  36.2 
 
 
222 aa  142  5e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3675  glutathione S-transferase-like protein  36.44 
 
 
220 aa  139  1.9999999999999998e-32  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3917  Glutathione S-transferase domain  38.84 
 
 
218 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0306349  normal  0.123136 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1800  glutathione S-transferase domain-containing protein  37.18 
 
 
232 aa  140  1.9999999999999998e-32  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1922  Glutathione S-transferase domain protein  36.97 
 
 
232 aa  138  6e-32  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2631  glutathione S-transferase-like protein  38.6 
 
 
208 aa  137  1e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.763244 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3927  Glutathione S-transferase domain  37.95 
 
 
218 aa  137  2e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.253948  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1060  glutathione S-transferase domain-containing protein  37.33 
 
 
208 aa  136  2e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.927457 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3634  glutathione S-transferase domain-containing protein  37.67 
 
 
218 aa  135  5e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.890005  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2329  glutathione S-transferase domain-containing protein  39.91 
 
 
218 aa  134  9.999999999999999e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.435459 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0268  glutathione S-transferase domain-containing protein  34.84 
 
 
221 aa  132  5e-30  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4480  glutathione S-transferase domain-containing protein  35.9 
 
 
229 aa  132  6e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0622605 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1722  glutathione S-transferase-like protein  36.15 
 
 
208 aa  131  7.999999999999999e-30  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3116  Glutathione S-transferase protein  38.01 
 
 
227 aa  130  2.0000000000000002e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.324582  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3813  glutathione S-transferase domain-containing protein  39.09 
 
 
221 aa  130  2.0000000000000002e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.340281  normal  0.596227 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05193  glutathione S-transferase III  34.93 
 
 
205 aa  129  4.0000000000000003e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2005  glutathione S-transferase domain-containing protein  37.14 
 
 
202 aa  127  9.000000000000001e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2251  Glutathione transferase  36.54 
 
 
201 aa  127  1.0000000000000001e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4662  glutathione S-transferase, N- domain  39.46 
 
 
222 aa  125  3e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1542  glutathione S-transferase  36.7 
 
 
222 aa  125  4.0000000000000003e-28  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.172585 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0265  Glutathione S-transferase domain protein  35.58 
 
 
208 aa  125  6e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.850678 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4612  glutathione S-transferase, N- domain  39.46 
 
 
222 aa  125  6e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0520156  normal  0.373731 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4611  glutathione S-transferase, N- domain  39.46 
 
 
222 aa  125  6e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.931981  normal  0.250578 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4518  glutathione S-transferase, N- domain  39.46 
 
 
222 aa  125  6e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4526  glutathione S-transferase, N- domain  39.21 
 
 
222 aa  124  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1722  glutathione S-transferase-like  36.24 
 
 
222 aa  124  1e-27  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.226504  normal  0.784305 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0806  glutathione S-transferase domain-containing protein  36.19 
 
 
206 aa  124  1e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1353  Glutathione S-transferase domain protein  37.09 
 
 
209 aa  124  1e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.959522  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0261  glutathione S-transferase domain-containing protein  35.58 
 
 
208 aa  123  2e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0269  glutathione S-transferase domain-containing protein  35.1 
 
 
208 aa  123  2e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0269  glutathione S-transferase domain-containing protein  35.58 
 
 
208 aa  123  2e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0966  Glutathione S-transferase domain protein  33.18 
 
 
209 aa  119  4.9999999999999996e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.262392  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0874  glutathione S-transferase domain-containing protein  33.04 
 
 
234 aa  118  6e-26  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000650083 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0510  glutathione S-transferase domain-containing protein  37.17 
 
 
208 aa  117  1.9999999999999998e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.585126 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1093  glutathione S-transferase domain-containing protein  33.96 
 
 
209 aa  115  5e-25  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0261  glutathione S-transferase domain-containing protein  35.09 
 
 
221 aa  114  1.0000000000000001e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0252994  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001312  glutathione S-transferase  33.33 
 
 
205 aa  112  3e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1276  glutathione S-transferase-like  33.02 
 
 
208 aa  112  5e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.398915  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1010  glutathione S-transferase-like  34.6 
 
 
211 aa  110  2.0000000000000002e-23  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1924  glutathione S-transferase domain-containing protein  35.21 
 
 
202 aa  109  3e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.896239 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2474  glutathione S-transferase family protein  31.02 
 
 
206 aa  108  9.000000000000001e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00158542  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1385  glutathione S-transferase-like protein  32.54 
 
 
205 aa  107  2e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.742051  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2200  Glutathione S-transferase domain  34.27 
 
 
202 aa  105  4e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0375  glutathione S-transferase domain-containing protein  52.08 
 
 
121 aa  98.2  9e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3114  glutathione S-transferase-like  32.26 
 
 
218 aa  95.1  6e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3205  glutathione S-transferase-like  28.02 
 
 
219 aa  95.1  8e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.877532  normal  0.459209 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2431  Glutathione S-transferase domain  29.19 
 
 
216 aa  94.7  9e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.342495  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3310  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.84 
 
 
210 aa  94.4  1e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.141117  normal  0.680332 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4165  glutathione S-transferase-like  29.58 
 
 
225 aa  92  6e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3767  glutathione S-transferase domain-containing protein  28.71 
 
 
222 aa  92  6e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4821  Glutathione S-transferase domain protein  31.9 
 
 
221 aa  91.7  7e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.236344  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5735  Glutathione S-transferase domain protein  28.16 
 
 
225 aa  90.5  2e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00629  glutathione S-transferase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G17010)  26.58 
 
 
255 aa  89.7  3e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0806169  normal  0.869816 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3119  putative glutathione S-transferase  32.86 
 
 
207 aa  88.6  6e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.427542  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2967  glutathione S-transferase-like protein  32.24 
 
 
214 aa  87.8  1e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2222  glutathione S-transferase domain-containing protein  32.02 
 
 
207 aa  87.4  2e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.186295 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0670  putative glutathione S-transferase (GST)  27.14 
 
 
218 aa  86.3  3e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.804169  normal  0.0458182 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2573  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.33 
 
 
221 aa  84.7  9e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.748409  normal  0.500264 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2200  glutathione S-transferase-like  27.27 
 
 
216 aa  84.7  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.313039 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5977  glutathione S-transferase domain-containing protein  29.05 
 
 
221 aa  84  0.000000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.9261 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0508  glutathione S-transferase domain-containing protein  27.14 
 
 
213 aa  83.2  0.000000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.553974 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2436  putative glutathione S-transferase  26.01 
 
 
209 aa  82  0.000000000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.117632  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_35190  glutathione S-transferase  30.38 
 
 
245 aa  80.9  0.00000000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0548873  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1329  glutathione S-transferase domain-containing protein  28.64 
 
 
208 aa  80.5  0.00000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.923957  normal  0.630065 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1689  glutathione S-transferase-like  29.72 
 
 
213 aa  79  0.00000000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5803  Glutathione S-transferase domain protein  30.61 
 
 
181 aa  78.6  0.00000000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0079  glutathione S-transferase-like  31.73 
 
 
221 aa  78.6  0.00000000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1302  glutathione S-transferase domain protein  29.63 
 
 
222 aa  78.6  0.00000000000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0568234  normal  0.0901172 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1834  glutathione S-transferase domain-containing protein  28.57 
 
 
219 aa  78.6  0.00000000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.371565 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>