More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_2668 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_2668  glutathione S-transferase-like  100 
 
 		 226 aa  456  1e-127  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.111492  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2631  glutathione S-transferase-like protein  88.94 
 
 		 208 aa  372  1e-102  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.763244 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1060  glutathione S-transferase domain-containing protein  66.35 
 
 		 208 aa  293  2e-78  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.927457 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1175  glutathione S-transferase  59.51 
 
 		 208 aa  261  8e-69  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.275426  normal  0.372199 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2196  glutathione S-transferase domain-containing protein  59.13 
 
 		 208 aa  260  1e-68  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.827244 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1365  glutathione S-transferase  59.51 
 
 		 208 aa  258  5.0000000000000005e-68  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.290536  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1276  glutathione S-transferase-like  56.86 
 
 		 208 aa  233  1.0000000000000001e-60  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.398915  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1722  glutathione S-transferase-like protein  54.9 
 
 		 208 aa  231  8.000000000000001e-60  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3744  glutathione S-transferase domain-containing protein  50.68 
 
 		 222 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.66674  normal  0.0935446 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0273  putative glutathione S-transferase  49.55 
 
 		 225 aa  212  3.9999999999999995e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0724  glutathione S-transferase-like  51.35 
 
 		 222 aa  212  4.9999999999999996e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.4337 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4517  glutathione S-transferase-like  49.13 
 
 		 233 aa  211  4.9999999999999996e-54  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.370294  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3680  glutathione S-transferase domain-containing protein  49.13 
 
 		 233 aa  211  4.9999999999999996e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.382886  normal  0.017552 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3847  glutathione S-transferase domain-containing protein  49.13 
 
 		 233 aa  211  4.9999999999999996e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.948042  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5570  glutathione S-transferase domain-containing protein  50.23 
 
 		 222 aa  211  5.999999999999999e-54  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.509468  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2249  glutathione S-transferase-like protein  49.77 
 
 		 222 aa  210  1e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0626984 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4290  glutathione S-transferase domain-containing protein  49.08 
 
 		 220 aa  208  7e-53  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.380653 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7159  Glutathione S-transferase domain  48.2 
 
 		 225 aa  206  2e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.218915  normal  0.479865 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1107  glutathione S-transferase  46.82 
 
 		 223 aa  206  3e-52  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.300035  normal  0.477541 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0021  glutathione S-transferase-like protein  50.9 
 
 		 222 aa  204  1e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4634  Glutathione transferase  48.87 
 
 		 224 aa  203  2e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0024  Glutathione S-transferase domain  50.45 
 
 		 222 aa  203  2e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2947  glutathione S-transferase domain-containing protein  47.73 
 
 		 222 aa  201  5e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.282557  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0019  glutathione S-transferase-like  50.9 
 
 		 222 aa  200  1.9999999999999998e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3675  glutathione S-transferase-like protein  49.55 
 
 		 220 aa  198  5e-50  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3957  glutathione S-transferase-like  46.58 
 
 		 221 aa  198  5e-50  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4433  glutathione S-transferase domain-containing protein  46.15 
 
 		 222 aa  194  9e-49  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05193  glutathione S-transferase III  44.5 
 
 		 205 aa  192  3e-48  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0806  glutathione S-transferase domain-containing protein  45.5 
 
 		 206 aa  187  2e-46  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001312  glutathione S-transferase  43.43 
 
 		 205 aa  185  5e-46  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3917  Glutathione S-transferase domain  49.08 
 
 		 218 aa  185  6e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0306349  normal  0.123136 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1385  glutathione S-transferase-like protein  44.95 
 
 		 205 aa  184  9e-46  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.742051  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1800  glutathione S-transferase domain-containing protein  45.61 
 
 		 232 aa  182  4.0000000000000006e-45  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00398  glutathione S-transferase  41.78 
 
 		 232 aa  181  7e-45  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.995047  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0318  putative glutathione S-transferase III (GST-III)  45.09 
 
 		 221 aa  181  7e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.894729  normal  0.561156 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1922  Glutathione S-transferase domain protein  45.18 
 
 		 232 aa  179  2.9999999999999997e-44  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0269  glutathione S-transferase domain-containing protein  43.5 
 
 		 208 aa  179  4e-44  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3927  Glutathione S-transferase domain  47.71 
 
 		 218 aa  179  4e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.253948  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0265  Glutathione S-transferase domain protein  43.5 
 
 		 208 aa  178  4.999999999999999e-44  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.850678 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0269  glutathione S-transferase domain-containing protein  43.5 
 
 		 208 aa  179  4.999999999999999e-44  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0261  glutathione S-transferase domain-containing protein  43.5 
 
 		 208 aa  177  1e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2125  glutathione S-transferase-like protein  44.8 
 
 		 224 aa  175  5e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.850832  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3634  glutathione S-transferase domain-containing protein  46.79 
 
 		 218 aa  174  7e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.890005  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4480  glutathione S-transferase domain-containing protein  43.42 
 
 		 229 aa  173  1.9999999999999998e-42  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0622605 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1093  glutathione S-transferase domain-containing protein  43.96 
 
 		 209 aa  173  1.9999999999999998e-42  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0268  glutathione S-transferase domain-containing protein  42.08 
 
 		 221 aa  171  1e-41  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3116  Glutathione S-transferase protein  44.39 
 
 		 227 aa  169  2e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.324582  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00195  Glutathione S-transferase-like protein  41.82 
 
 		 222 aa  169  3e-41  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0261  glutathione S-transferase domain-containing protein  49.77 
 
 		 221 aa  168  6e-41  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0252994  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2329  glutathione S-transferase domain-containing protein  47.71 
 
 		 218 aa  168  7e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.435459 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0966  Glutathione S-transferase domain protein  43.07 
 
 		 209 aa  167  9e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.262392  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1626  Glutathione S-transferase domain  45.5 
 
 		 229 aa  165  5.9999999999999996e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.506745  normal  0.230633 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1353  Glutathione S-transferase domain protein  42.29 
 
 		 209 aa  165  5.9999999999999996e-40  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.959522  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2474  glutathione S-transferase family protein  39.32 
 
 		 206 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00158542  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1936  Glutathione S-transferase domain protein  40.93 
 
 		 214 aa  159  5e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.247506  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1665  Glutathione S-transferase domain protein  40.93 
 
 		 214 aa  157  2e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.192716  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4518  glutathione S-transferase, N- domain  41.18 
 
 		 222 aa  154  7e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4612  glutathione S-transferase, N- domain  41.18 
 
 		 222 aa  154  7e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0520156  normal  0.373731 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4611  glutathione S-transferase, N- domain  41.18 
 
 		 222 aa  154  7e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.931981  normal  0.250578 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4526  glutathione S-transferase, N- domain  41.18 
 
 		 222 aa  154  9e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4662  glutathione S-transferase, N- domain  41.18 
 
 		 222 aa  154  1e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3541  glutathione S-transferase  39.41 
 
 		 215 aa  153  2e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.136471  normal  0.509105 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3593  glutathione S-transferase-like  39.44 
 
 		 221 aa  149  2e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.404871  normal  0.859314 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3813  glutathione S-transferase domain-containing protein  42.92 
 
 		 221 aa  150  2e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.340281  normal  0.596227 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1542  glutathione S-transferase  37.44 
 
 		 222 aa  149  3e-35  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.172585 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0874  glutathione S-transferase domain-containing protein  38.6 
 
 		 234 aa  149  4e-35  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000650083 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1722  glutathione S-transferase-like  37.9 
 
 		 222 aa  146  2.0000000000000003e-34  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.226504  normal  0.784305 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6917  putative glutathione S-transferase  40.49 
 
 		 213 aa  145  3e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.522901 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2251  Glutathione transferase  37.19 
 
 		 201 aa  143  2e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0510  glutathione S-transferase domain-containing protein  41.95 
 
 		 208 aa  142  5e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.585126 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1010  glutathione S-transferase-like  41.83 
 
 		 211 aa  138  6e-32  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_35190  glutathione S-transferase  36.17 
 
 		 245 aa  125  7e-28  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0548873  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00629  glutathione S-transferase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G17010)  35.86 
 
 		 255 aa  117  9.999999999999999e-26  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0806169  normal  0.869816 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0375  glutathione S-transferase domain-containing protein  57.61 
 
 		 121 aa  115  6e-25  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2005  glutathione S-transferase domain-containing protein  33.49 
 
 		 202 aa  108  6e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3640  glutathione S-transferase domain-containing protein  34.63 
 
 		 217 aa  100  2e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.390438 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0348  glutathione S-transferase  44.54 
 
 		 124 aa  99  6e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3310  glutathione S-transferase domain-containing protein  34.3 
 
 		 210 aa  98.2  9e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.141117  normal  0.680332 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3527  Glutathione S-transferase domain protein  35.89 
 
 		 201 aa  96.3  4e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.11732  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0508  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.84 
 
 		 213 aa  94  2e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.553974 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3463  glutathione S-transferase domain protein  35.41 
 
 		 201 aa  92.8  4e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0942071  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2431  Glutathione S-transferase domain  29.76 
 
 		 216 aa  92.4  5e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.342495  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3380  glutathione S-transferase-like protein  34.93 
 
 		 201 aa  91.7  8e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2200  glutathione S-transferase-like  30.73 
 
 		 216 aa  90.9  1e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.313039 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2967  glutathione S-transferase-like protein  33.17 
 
 		 214 aa  90.9  1e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3205  glutathione S-transferase-like  30.24 
 
 		 219 aa  89.7  3e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.877532  normal  0.459209 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2222  glutathione S-transferase domain-containing protein  33.5 
 
 		 207 aa  89.4  4e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.186295 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4821  Glutathione S-transferase domain protein  34.3 
 
 		 221 aa  89  5e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.236344  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5735  Glutathione S-transferase domain protein  32.34 
 
 		 225 aa  89  6e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4165  glutathione S-transferase-like  31.25 
 
 		 225 aa  88.2  8e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2573  glutathione S-transferase domain-containing protein  34.43 
 
 		 221 aa  87.4  1e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.748409  normal  0.500264 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1924  glutathione S-transferase domain-containing protein  27.57 
 
 		 202 aa  87.8  1e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.896239 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2200  Glutathione S-transferase domain  27.1 
 
 		 202 aa  86.7  3e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006686  CND00620  glutathione transferase, putative  31.25 
 
 		 249 aa  85.9  5e-16  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.295755  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0926  glutathione S-transferase domain-containing protein  32 
 
 		 217 aa  85.5  6e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.017472  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1863  glutathione S-transferase-like protein  30 
 
 		 206 aa  85.5  7e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.546298  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2330  glutathione S-transferase domain-containing protein  32.98 
 
 		 210 aa  85.1  9e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.639612  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1302  glutathione S-transferase domain protein  31.16 
 
 		 222 aa  84.7  0.000000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0568234  normal  0.0901172 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0079  glutathione S-transferase-like  31.79 
 
 		 221 aa  84.3  0.000000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1820  glutathione S-transferase-like protein  30.73 
 
 		 201 aa  84.7  0.000000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.631165 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>