More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_2330 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008686  Pden_2330  glutathione S-transferase domain-containing protein  100 
 
 
210 aa  422  1e-117  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.639612  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8292  Glutathione S-transferase domain protein  53.37 
 
 
213 aa  210  1e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0033  glutathione S-transferase domain-containing protein  50.72 
 
 
216 aa  206  3e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2579  glutathione S-transferase domain-containing protein  50 
 
 
217 aa  201  8e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.983145  normal  0.664042 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1407  Glutathione S-transferase domain protein  51.44 
 
 
212 aa  201  9.999999999999999e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0606838  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1043  glutathione S-transferase domain-containing protein  51.21 
 
 
212 aa  198  3.9999999999999996e-50  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.562576  normal  0.573525 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5257  glutathione S-transferase domain-containing protein  50.24 
 
 
220 aa  192  2e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.619423 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2245  glutathione S-transferase domain-containing protein  49.28 
 
 
207 aa  187  1e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.597175 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0016  glutathione S-transferase-like protein  47.14 
 
 
224 aa  179  4e-44  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.0486825 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3077  glutathione S-transferase-like  46.23 
 
 
214 aa  177  8e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.187241  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3840  glutathione S-transferase domain-containing protein  46.12 
 
 
232 aa  176  2e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  decreased coverage  0.00883028  normal  0.988624 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3111  putative glutathione S-transferase  46.58 
 
 
232 aa  176  3e-43  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0175451  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2883  glutathione S-transferase domain-containing protein  47.6 
 
 
223 aa  170  2e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.527212  normal  0.219041 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0789  Glutathione S-transferase domain  42.33 
 
 
216 aa  154  7e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.100128 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3560  Glutathione S-transferase domain  41.59 
 
 
213 aa  154  1e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.945145  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0966  glutathione S-transferase domain-containing protein  43 
 
 
219 aa  153  2e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4891  glutathione S-transferase domain-containing protein  40.93 
 
 
216 aa  152  4e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.479159 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5781  Glutathione S-transferase domain protein  41.63 
 
 
217 aa  148  5e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0926  glutathione S-transferase domain-containing protein  38.6 
 
 
217 aa  148  6e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.017472  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1077  Glutathione S-transferase domain protein  40 
 
 
216 aa  148  7e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.147439  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0079  glutathione S-transferase-like  40.76 
 
 
221 aa  145  3e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2824  glutathione S-transferase domain-containing protein  41.23 
 
 
216 aa  144  9e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.480753  normal  0.31564 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1469  glutathione S-transferase-like  39.35 
 
 
217 aa  142  4e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.368467  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3950  glutathione S-transferase domain-containing protein  37.68 
 
 
227 aa  133  1.9999999999999998e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.532798  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5855  glutathione S-transferase domain-containing protein  36.41 
 
 
213 aa  108  5e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3527  Glutathione S-transferase domain protein  38.54 
 
 
201 aa  104  1e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.11732  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3380  glutathione S-transferase-like protein  37.5 
 
 
201 aa  102  5e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3463  glutathione S-transferase domain protein  38.54 
 
 
201 aa  102  5e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0942071  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0240  glutathione S-transferase domain protein  35.57 
 
 
232 aa  97.1  2e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0359  glutathione S-transferase domain-containing protein  38.78 
 
 
201 aa  93.2  3e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  hitchhiker  0.00589351  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2631  glutathione S-transferase-like protein  34.04 
 
 
208 aa  91.7  7e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.763244 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2389  Glutathione S-transferase domain protein  32.61 
 
 
183 aa  90.9  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.587961 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2002  glutathione S-transferase-like protein  32.97 
 
 
185 aa  90.1  2e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1060  glutathione S-transferase domain-containing protein  33.16 
 
 
208 aa  87  2e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.927457 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5865  glutathione S-transferase-like protein  40.87 
 
 
166 aa  86.7  2e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2668  glutathione S-transferase-like  32.98 
 
 
226 aa  85.5  5e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.111492  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3983  glutathione S-transferase-like  33.52 
 
 
219 aa  85.1  8e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.409574  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4150  glutathione S-transferase domain protein  30.56 
 
 
186 aa  84.3  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.432751 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1256  glutathione S-transferase  32.97 
 
 
184 aa  84.3  0.000000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.522192  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3706  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.73 
 
 
210 aa  84  0.000000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4110  Glutathione S-transferase domain protein  30.56 
 
 
186 aa  84.3  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5803  Glutathione S-transferase domain protein  33.51 
 
 
181 aa  82.4  0.000000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5300  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.22 
 
 
205 aa  82.4  0.000000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.217524  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1633  Glutathione S-transferase domain protein  31.13 
 
 
209 aa  82.4  0.000000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0604815 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1087  glutathione S-transferase family protein  30.48 
 
 
222 aa  82.4  0.000000000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.983271 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2166  Glutathione S-transferase domain protein  31.11 
 
 
208 aa  80.9  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.193029  normal  0.0802991 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3478  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.22 
 
 
205 aa  80.9  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.556825  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0513  Glutathione S-transferase domain protein  29.95 
 
 
236 aa  80.1  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0574717 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2509  glutathione S-transferase-like protein  30.15 
 
 
208 aa  80.5  0.00000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.640237  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3750  glutathione S-transferase domain-containing protein  32.14 
 
 
234 aa  79.3  0.00000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.5505  normal  0.556027 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1486  glutathione S-transferase  29.33 
 
 
204 aa  79.3  0.00000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2557  glutathione S-transferase-like protein  30.69 
 
 
205 aa  79.3  0.00000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.630075 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5110  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.89 
 
 
205 aa  79.3  0.00000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0347901 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3976  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.1 
 
 
232 aa  79  0.00000000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.84686 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1529  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.1 
 
 
235 aa  79  0.00000000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.623828  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1580  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.12 
 
 
234 aa  78.6  0.00000000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.758866  normal  0.296422 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0508  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.61 
 
 
213 aa  78.6  0.00000000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.553974 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0468  Glutathione S-transferase domain  28.93 
 
 
236 aa  78.6  0.00000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.489326  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2264  glutathione S-transferase domain-containing protein  30 
 
 
238 aa  78.6  0.00000000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.344237 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1443  glutathione S-transferase  30.98 
 
 
207 aa  77.4  0.0000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4962  Glutathione S-transferase domain protein  32.6 
 
 
219 aa  77.8  0.0000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.601689  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0014  glutathione S-transferase  30.98 
 
 
207 aa  77.4  0.0000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0018  glutathione S-transferase  30.98 
 
 
207 aa  77.4  0.0000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0019  glutathione S-transferase family protein  30.98 
 
 
207 aa  77.4  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.207851  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22620  Glutathione S-transferase protein  32.24 
 
 
201 aa  77.4  0.0000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.453028  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1521  glutathione S-transferase  30.98 
 
 
207 aa  77.4  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3752  glutathione S-transferase-like protein  27.27 
 
 
235 aa  77.8  0.0000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0129793  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1164  glutathione S-transferase  30.98 
 
 
207 aa  77.4  0.0000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0017  glutathione S-transferase family protein  30.98 
 
 
207 aa  77.4  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.934023  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4356  glutathione S-transferase domain-containing protein  33.84 
 
 
205 aa  76.6  0.0000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4686  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.76 
 
 
205 aa  76.6  0.0000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0906  hypothetical protein  31.15 
 
 
228 aa  77  0.0000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.719726  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3650  hypothetical protein  31.91 
 
 
220 aa  77  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.328113  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1349  Glutathione S-transferase domain protein  29.95 
 
 
236 aa  76.3  0.0000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1375  glutathione S-transferase-like  30.73 
 
 
234 aa  76.3  0.0000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0512396 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3310  glutathione S-transferase domain-containing protein  32.66 
 
 
210 aa  76.3  0.0000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.141117  normal  0.680332 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1722  glutathione S-transferase-like protein  32.84 
 
 
208 aa  76.6  0.0000000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3798  glutathione S-transferase domain-containing protein  29.17 
 
 
236 aa  76.6  0.0000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.59415  normal  0.718162 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1834  glutathione S-transferase domain-containing protein  29.67 
 
 
219 aa  76.6  0.0000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.371565 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3954  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.16 
 
 
205 aa  75.9  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.251267 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2602  glutathione S-transferase domain-containing protein  26.92 
 
 
231 aa  75.9  0.0000000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.550233 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5541  glutathione S-transferase domain-containing protein  29.69 
 
 
215 aa  75.9  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2222  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.19 
 
 
207 aa  75.9  0.0000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.186295 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0910  Glutathione S-transferase domain  30.59 
 
 
203 aa  75.5  0.0000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43530  hypothetical protein  31.38 
 
 
220 aa  75.5  0.0000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1057  Glutathione S-transferase domain protein  30 
 
 
203 aa  75.5  0.0000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0628244  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2090  glutathione S-transferase domain-containing protein  32.6 
 
 
227 aa  75.5  0.0000000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.403275  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3395  putative glutathione S-transferase  32.98 
 
 
207 aa  74.7  0.0000000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.482598  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00391  glutathione S-transferase  28.42 
 
 
255 aa  75.1  0.0000000000008  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3625  glutathione S-transferase-like  29.69 
 
 
215 aa  74.7  0.0000000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0643687  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4742  glutathione S-transferase domain-containing protein  29.69 
 
 
215 aa  74.7  0.0000000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.917928  hitchhiker  0.00649205 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1237  glutathione S-transferase, putative  30.57 
 
 
234 aa  74.7  0.0000000000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00250185  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40070  putative glutathione S-transferase  32.98 
 
 
207 aa  74.7  0.0000000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.151976  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1347  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.28 
 
 
205 aa  74.3  0.000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0485026 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1170  glutathione S-transferase  34.36 
 
 
217 aa  74.7  0.000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.859877  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3623  Glutathione S-transferase domain  31.32 
 
 
211 aa  73.9  0.000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0234  glutathione S-transferase domain-containing protein  29.47 
 
 
234 aa  74.7  0.000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.697932  normal  0.439898 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0907  Glutathione S-transferase domain protein  28.97 
 
 
221 aa  74.3  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0411393  normal  0.132395 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5301  Glutathione S-transferase domain  29.86 
 
 
211 aa  73.6  0.000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0528  putative glutathione S-transferase  30.98 
 
 
222 aa  73.6  0.000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>