More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_4962 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_4962  Glutathione S-transferase domain protein  100 
 
 		 219 aa  436  1e-121  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.601689  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0645  glutathione S-transferase-like  66.67 
 
 		 225 aa  297  7e-80  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.722095  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3224  glutathione S-transferase domain-containing protein  61.61 
 
 		 208 aa  262  3e-69  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.395203  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4250  glutathione S-transferase domain-containing protein  58.1 
 
 		 209 aa  257  7e-68  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1196  glutathione S-transferase domain-containing protein  58.1 
 
 		 209 aa  253  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1162  glutathione S-transferase family protein  57.62 
 
 		 209 aa  253  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0102114 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1180  glutathione S-transferase domain-containing protein  60 
 
 		 207 aa  252  4.0000000000000004e-66  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.610567  normal  0.0747789 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3670  glutathione S-transferase domain-containing protein  59.62 
 
 		 214 aa  245  3e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.630105  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0125  glutathione S-transferase  60.95 
 
 		 266 aa  246  3e-64  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2817  glutathione S-transferase  60.95 
 
 		 300 aa  245  3e-64  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4693  glutathione S-transferase-like  59.62 
 
 		 214 aa  245  3e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.358965  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3851  glutathione S-transferase domain-containing protein  59.62 
 
 		 214 aa  245  4e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.216591  normal  0.461755 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0107  glutathione S-transferase  60.95 
 
 		 214 aa  244  6e-64  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1267  glutathione S-transferase  60.95 
 
 		 214 aa  244  6e-64  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.261228  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2670  putative glutathione S-transferase  60.48 
 
 		 297 aa  243  1.9999999999999999e-63  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5690  glutathione S-transferase-like protein  57.14 
 
 		 227 aa  243  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.529075 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1071  glutathione S-transferase  60.48 
 
 		 214 aa  242  3.9999999999999997e-63  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.292672  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2439  glutathione S-transferase-like protein  58.69 
 
 		 214 aa  242  3.9999999999999997e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.414826  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5079  Glutathione S-transferase domain  56.87 
 
 		 213 aa  241  5e-63  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.242731  hitchhiker  0.00740675 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5040  glutathione S-transferase domain-containing protein  57.67 
 
 		 221 aa  239  2e-62  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.222458  normal  0.367084 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0407  glutathione S-transferase  59.52 
 
 		 217 aa  237  1e-61  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3573  glutathione S-transferase domain-containing protein  57.75 
 
 		 214 aa  234  6e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.242235  normal  0.0117224 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1347  glutathione S-transferase domain-containing protein  57.49 
 
 		 205 aa  231  5e-60  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0485026 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5417  glutathione S-transferase domain-containing protein  56.81 
 
 		 214 aa  231  5e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.556283  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4686  glutathione S-transferase domain-containing protein  56.52 
 
 		 205 aa  231  9e-60  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0910  Glutathione S-transferase domain  53.66 
 
 		 203 aa  229  2e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3325  glutathione S-transferase domain-containing protein  56.52 
 
 		 205 aa  229  4e-59  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4489  glutathione S-transferase domain-containing protein  53.66 
 
 		 208 aa  228  5e-59  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8513  Glutathione S-transferase domain protein  52.17 
 
 		 205 aa  228  5e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.700179  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0661  Glutathione S-transferase domain protein  55.12 
 
 		 203 aa  228  8e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4952  Glutathione S-transferase domain  52.68 
 
 		 208 aa  224  9e-58  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.624143  normal  0.246161 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1057  Glutathione S-transferase domain protein  52.2 
 
 		 203 aa  223  2e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0628244  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2762  glutathione S-transferase-like  54.81 
 
 		 206 aa  221  7e-57  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5005  Glutathione S-transferase domain  53.4 
 
 		 208 aa  221  8e-57  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.286975  normal  0.574785 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4051  putative glutathione S-transferase  53.05 
 
 		 223 aa  221  8e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.838028 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4125  glutathione S-transferase domain-containing protein  53.66 
 
 		 203 aa  220  1.9999999999999999e-56  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0925  putative glutathione S-transferase  52.68 
 
 		 203 aa  218  7e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.324873  normal  0.354622 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3433  glutathione S-transferase family protein  47.42 
 
 		 214 aa  218  7.999999999999999e-56  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000284771 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2245  glutathione S-transferase-like  55.35 
 
 		 220 aa  217  8.999999999999998e-56  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.556118  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3323  glutathione S-transferase domain-containing protein  51.71 
 
 		 227 aa  214  5.9999999999999996e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0187385  normal  0.129432 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6230  putative glutathione S-transferase  57.5 
 
 		 207 aa  214  9e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0344917  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1106  Glutathione S-transferase domain  50.24 
 
 		 203 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5568  glutathione S-transferase domain-containing protein  49.27 
 
 		 205 aa  206  2e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.446565  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0797  glutathione S-transferase domain-containing protein  52.04 
 
 		 205 aa  195  4.0000000000000005e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.360126 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3092  glutathione S-transferase domain-containing protein  51.49 
 
 		 205 aa  195  5.000000000000001e-49  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.061874 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4729  glutathione S-transferase  47.32 
 
 		 203 aa  191  9e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0556098  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1128  glutathione S-transferase-like  46.38 
 
 		 206 aa  189  2e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0462  glutathione S-transferase domain-containing protein  50.5 
 
 		 205 aa  188  4e-47  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.269396 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1904  Glutathione S-transferase domain protein  43.43 
 
 		 199 aa  174  9.999999999999999e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.142458  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1873  Glutathione S-transferase domain protein  46.91 
 
 		 200 aa  171  9e-42  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24830  putative glutathione S-transferase  45.69 
 
 		 198 aa  169  4e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3947  Glutathione S-transferase domain protein  43.56 
 
 		 207 aa  167  8e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2104  putative glutathione S-transferase  43.65 
 
 		 198 aa  167  1e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1708  Glutathione S-transferase domain  41.92 
 
 		 199 aa  144  8.000000000000001e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3285  putative glutathione S-transferase  39.29 
 
 		 197 aa  144  1e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.549218  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1704  Glutathione S-transferase domain protein  39.71 
 
 		 212 aa  131  7.999999999999999e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0690203  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2738  glutathione S-transferase domain-containing protein  41.43 
 
 		 216 aa  130  1.0000000000000001e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2349  glutathione S-transferase-like protein  40.1 
 
 		 208 aa  129  3e-29  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0771783 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1387  Glutathione S-transferase domain protein  36.82 
 
 		 201 aa  125  4.0000000000000003e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2670  glutathione S-transferase domain-containing protein  38.61 
 
 		 200 aa  123  2e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.237361  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3617  putative glutathione S-transferase  37.93 
 
 		 200 aa  122  6e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2032  glutathione S-transferase family protein  37.56 
 
 		 200 aa  121  9e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.22229  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2981  glutathione S-transferase  38.61 
 
 		 216 aa  119  1.9999999999999998e-26  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.897939  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43110  putative glutathione S-transferase  37.44 
 
 		 200 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000318488  normal  0.203151 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1821  glutathione S-transferase family protein  39.41 
 
 		 200 aa  119  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0623474  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5869  glutathione S-transferase domain-containing protein  37.07 
 
 		 215 aa  119  3.9999999999999996e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3893  glutathione S-transferase-like protein  34.45 
 
 		 210 aa  119  3.9999999999999996e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1421  glutathione S-transferase domain protein  35.32 
 
 		 201 aa  119  3.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1842  glutathione S-transferase  37.86 
 
 		 200 aa  119  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.260742  normal  0.324274 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1399  glutathione S-transferase domain-containing protein  39.41 
 
 		 200 aa  119  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.250488  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1799  putative glutathione S-transferase (GST)  36.79 
 
 		 216 aa  118  6e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.602523  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1429  glutathione S-transferase domain-containing protein  39.41 
 
 		 200 aa  118  9e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.114439  normal  0.299107 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3890  glutathione S-transferase domain-containing protein  38.92 
 
 		 200 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.19285 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3211  glutathione S-transferase domain-containing protein  36.63 
 
 		 198 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3511  glutathione S-transferase-like protein  35.96 
 
 		 198 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1296  glutathione S-transferase-like protein  37.85 
 
 		 228 aa  116  3e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.041604  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1101  glutathione S-transferase-like  38.61 
 
 		 256 aa  116  3e-25  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4810  Glutathione S-transferase domain  36.97 
 
 		 217 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0196  glutathione S-transferase-like  35.96 
 
 		 204 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2296  glutathione S-transferase domain-containing protein  37.02 
 
 		 204 aa  114  1.0000000000000001e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.879102 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4124  glutathione S-transferase-like  36.49 
 
 		 217 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.590461  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3927  glutathione S-transferase-like  36.19 
 
 		 228 aa  113  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4794  Glutathione S-transferase domain  39.6 
 
 		 197 aa  111  9e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.915466  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1311  glutathione S-transferase-like protein  38.66 
 
 		 196 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.55458  normal  0.181696 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3827  putative glutathione S-transferase  35.64 
 
 		 208 aa  111  1.0000000000000001e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04799  glutathione S-transferase  34.48 
 
 		 209 aa  109  4.0000000000000004e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04080  probable glutathione S-transferase  32.18 
 
 		 199 aa  109  4.0000000000000004e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2641  Glutathione S-transferase domain  35.47 
 
 		 218 aa  108  5e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.213293 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6467  Glutathione S-transferase domain protein  36.95 
 
 		 219 aa  108  5e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0503  Glutathione S-transferase domain protein  32.51 
 
 		 208 aa  108  7.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0544052  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1493  glutathione S-transferase family protein  36.54 
 
 		 203 aa  107  1e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.695225  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2139  glutathione S-transferase  31.53 
 
 		 203 aa  107  1e-22  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.041384 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1447  glutathione S-transferase family protein  36.54 
 
 		 203 aa  107  1e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.277938  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4463  Glutathione S-transferase domain  36.45 
 
 		 220 aa  106  3e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0595447 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003296  glutathione transferase  32.34 
 
 		 198 aa  105  6e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5423  Gst12 glutathione-S-transferase  33.82 
 
 		 210 aa  105  6e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.355245  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1471  glutathione S-transferase domain-containing protein  37.13 
 
 		 200 aa  105  6e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2587  Glutathione S-transferase domain  39.29 
 
 		 195 aa  104  9e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.751074  normal  0.31258 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3910  glutathione S-transferase-like  38.14 
 
 		 201 aa  104  9e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.768312 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2312  glutathione S-transferase domain-containing protein  38.69 
 
 		 195 aa  103  2e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0196665 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>